EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-19349 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr19:53494640-53496730 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSCMA0648.1chr19:53496429-53496439GGGGATTAGC-6.02
LMX1BMA0703.2chr19:53494835-53494846TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr19:53494832-53494845TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr19:53494829-53494842ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr19:53494836-53494847TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr19:53494836-53494847TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr19:53494836-53494847TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr19:53494836-53494847TAATTAAATTA-6.62
ZNF263MA0528.1chr19:53495612-53495633CCCTCCTCCTCTCCCTCACTC-7.15
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr195349511353495337
chr195349537153495549
Enhancer Sequence
AAAAAACAAA AACAAAAAAA CAAAAAAAAA CAAAACTAGC CGGGCTTGGT GGCTCACGCC 60
TGTGGTCCCA ACTACTTGGT AGGCTGAGGT AGGAGGACAG CTTGAGCCCA GGAGGTCGAG 120
GCTACAGTTA GAGATCACGC CACTGCACTC CAGCCTGGGT GATAGAGCCA GACACTGTTT 180
CAAAATATTA TTTAATTAAT TAAATTAAAA GTCACATGTA ATAACAGAAA GTGCTTTTGT 240
CTCCCCACTT CACTGCCCCA CTTCCTATGC CACCCTGGGA AAAGGGAAGA GAGTGACTCA 300
CAACTGAATA AGTCACTGCC CTCTGGCTGA ATAGGGATTC CAAGTGGAAG CTGACCTCTG 360
ATGCCAAGAT TTATAGAATG TACATGACTC ATAGATAGGA ATTTTAAAAT TCTCAATCTC 420
ATCTGTATAA TTTAAACAAG TTTTTAGTTA TTAGATTATA TACACAGAAG TCAACATGTC 480
ACACTAATCA TATCCAATGA ACTCACCCAC TCATCTGAAC CCAAAGTCCC CACCCCTTTT 540
ATTCTTTTGA GACAGGGTCT CACTCTGTTG ACCAGGTTGG AGTGCAGTGG CATATCTCGG 600
CTCACTGCAG CCTGGATCTC CTGGGCTCAA GTGATCCTCC TGCCTCAGCC TCCAGAGTAG 660
TTGGGATTAC AAGTGCGCAC CATCCCCTTC TTTGGTCTAT TTCTTCTCTT CCACCTCTTC 720
TGCTCCATCC TCACAACTTA CTTAACCTCT TGTTGCTTCT TCTTCCCAGT CTTTCGATCG 780
TCCTCAATCT CCATACATTA CCACCTCTTC TCCCACCTCT GCGCCTCCTC TGCTCTCCCT 840
GTTAAACTCT CTCTTCCCTG TTAAACCCCC TGTCCCCACT CTCTGGCACC CCCGACCTCC 900
AGGTGTCCTC CCTGCTGTGG TTCTCCCTCT TGCCACCAGC ACCACTCTGC TCTGTCTGCC 960
CTGGCTCCAA ATCCCTCCTC CTCTCCCTCA CTCTGATGAG CCAGGTCCCC CTCTTTGCTG 1020
CCCCTCTCCC TACCTTGCTG TCCTTCATCT CTCTGTACAT CTAGCTTCTC TCCACATTTC 1080
TCCAGTTTTC TCCTCCTGCT ATCTTAACTT TTTCTTTTCA CTCTTGCTGT CTCTTGGCAA 1140
ATCCCTCACC CATCCTCCAC CTTGCCATCT GTTATGGGCC TTTCTCATTG TTCTATTCTC 1200
TGTCTCGAGT TTTCTACTGC CCTTGCTCGG TCTCCTGATT CCTTTGGCCC ACACAATCAC 1260
AGGAGAGTTT TGAGTAAGAC GCCTGCATCC CAGAGGAGTG CATTTTCCAG GGGCTGGGGC 1320
TGGGCAGGCA AGAACACCCC TTGTCACAGG ACAAGCCCTG GGCACCTCCC CAACGCGGAC 1380
TCAGAGGAAG CGGCGACTGC TGAGGGGAGA CCTGGCGAGC AGCAGGGCCC GGCACGAGGA 1440
GGGAGTTAGG GGGCGACGGC TCCTTAAGAC AAGGGTGGGG TCTGCAGGAT CCCAGGACCA 1500
GGCAGAGGAT GCGGCCTCCT CGGGACGGGG GAGGCGGCGC TGCGCTCCAG GGACCGACGA 1560
GGGTGAGGGT GGGAGGCGCC CAGGGTGGGA ATCCACCTCT CGGGTGAGGA CTTTAAAAAG 1620
CACGGGGTGG AGGGAGTCAG AAAATAGTTA CAAACAGGAA AACTACGAGA TACGAAGTGT 1680
ATACGTTGCC CTATAGCAGA AAGACCGGGG ACGGGTCTAG CCTCAGGGCG ACTTTAAACC 1740
CAAAAGGAAG CGACTTCTGG ACTCTCACCG GGACGTCAAA TTTTGCTCTG GGGATTAGCC 1800
GGGCCTGGTG GCGCATGCCT GTAATCCCAG CTACTCAGGA GGCTGAGGCA GGAGAATCGC 1860
TTGAACCCAG GAGGCGGAGG TTGCAGTGAG CCAAGACCGA GCCACTGCAC TCCAGCCTGG 1920
CGACAGAGCG AGACTCCGTC TCAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAT TTGCTCTGGG 1980
CGAAGGAAGA ATGGTAGAAA TTTCCAGGTA TGTGGGGACC CCACGTCCCC TGGGACAGAA 2040
GTCCCAGGGA CCTGCGGAGC GCAGACATAA CACAACACAG AGCAAAACTC 2090