EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-18998 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr19:39185630-39189640 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11083475chr1939188112hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39187120-39187138GAGAGGAAGGATGGAAGC+6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39186290-39186308CTTTACTCCCTTCCTTCT-6.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39187124-39187142GGAAGGATGGAAGCAGAG+6.35
ZNF263MA0528.1chr19:39186013-39186034CTTTTTGCCTTTCCCTCCTCC-6.12
ZfxMA0146.2chr19:39185758-39185772CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 56             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39185510-39187918Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39188085-39193891Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_03166chr19:39185728-39189384Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39185394-39193508Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39185423-39189876Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39186740-39189302Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39185584-39193917Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_14624chr19:39188044-39189097CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39185726-39186655Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39186752-39190129Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39185750-39186483Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39187149-39187658Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39188124-39189025Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39185730-39186728Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39187116-39190124Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39185825-39186549Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39188832-39190235Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39185422-39186593Gastric
SE_31384chr19:39186799-39187735Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34299chr19:39187789-39188976HCT-116
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_41601chr19:39188166-39189312LNCaP
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39186536-39189303NHDF-Ad
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_45660chr19:39188825-39189523Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39185655-39186661Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39185073-39190229Right_Atrium
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39185122-39189741VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_64225chr19:39185744-39186682NHEK
SE_64225chr19:39186925-39190261NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39188604-39190006Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39186614-39190205H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr193918773339187838
chr193918733839187648
chr193918644739186795
chr193918563039186442
chr193918682939186989
chr193918791339188715
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CAGCCTCTCG AGTAGCTGGG ACTACAGGCG CTCAGTACCA CGCCTGGCTA ATTTTTGTAG 60
TTTTTGTAGA GATGGGGTTT TGCCATGTTG CCTAGGCTGA TCTCAAACTC CTGTGCTAAA 120
GCAATCCTCC CGCCTCGGCC TCCTAAAGTG CTGGGATTAC ATGGTGTGTG CCACCATGCC 180
TGGCTGGCCA GAATGTAAAT GATAACTGTT TTGCTTCCTC CTGTGTCCAG TACATAATAG 240
GGCTCCAAGT CAGTATTTGT GAGGCAGGTG CATGCCTCTT AGTTGCGGTC CTGAGGGCAT 300
GGCCACTGCC ACGTTCTGGA CAGTCAGAGT CGCTGCTGCC CCTGGAAGAT GACCGCGATC 360
ATGAAGCCCA GGAGAGCTCG ATGCTTTTTG CCTTTCCCTC CTCCCACAGA GGGCTGGCAG 420
CTCTGGTTCC TCCCAAATGA AATAGAAACC TTGAGTTTGC ATTTCTTCTT TGGCGTGCCG 480
GCAGGGCACC TCTGCCTTCC TCTTCCTGCC AGGGGGAGGA AGTTTCTCTC AGGGGCTCTT 540
CACCCTGCTT TATTCCTGGC CATCACACAT TGACCCTTGT CCCCTTCGGC TCTTTCCCTG 600
CATGGCAGGG ACAGCATGAC CGTTTAATGG CTTTGTGAGG CCAGCATGCC AGCCTCACTT 660
CTTTACTCCC TTCCTTCTCG GAGTGGGCTC TGTCCCTTCT GCAGGAGGGC TTTGGCACAT 720
GCTCTTCCCA GTATCTGGAA GGTCTCCCTC ATTTTTATCT TATTAACTCC TCATCCTTCA 780
GCTCAGAGTT TGAGAATGAC TTCTTCAAGG ACACCTTTCT GTGTCTGCCT CACCAGTCGC 840
TTGGTGCCCC CCCACCCCGC CACCATGCTG ACCGCACTCT TCAGCTCCCA TCCCAGGGGA 900
GGTGACACAA ACTCGGCCCC AGGAGCCCAG CACCTGGCTT TAAACCCAGC TCTGTAACTT 960
TCTAGGTGTG TGACTGATGG GAGCAAGCCA CTTCACCTCT CAGGCCCTCC GTTTCCTCAT 1020
CTGCAAAATG GAGGCAGTAC TAGCACCTCC CTCCAGAGAT GATTACGAGG GTGACAGAAT 1080
TAGTAAGTGA CCAAGTGCCT CGAGCAGTGC CCGCCCCTAG TAGACTCTAT GGAAGTGTCT 1140
GCTGCAGTTA TTGCTGTTAT TATTACCACT TTTCCTAAGG GCGTTATTTC TGGAGTGGAC 1200
TGATCGCTTG ATTAATGAGA TCAGACCTGG AGCCTCATGA GAGTGTCTGC TTTTGCTCAC 1260
TGTTATGGAT TCAGCACAGG GCCTGGCCCT CTGCTGACCC CCAGCATATG CTTGTCCAGA 1320
GAATGAATAT GTACGGACCC ATGGTGGCCT GGGGCATCAT GAGGTCGGCT GCCCACATTC 1380
TGAGAATTTT GCATGGTGGA GGGCGGCGTG GTGGGCGCAT AGGGCCCCCA TCTATAGAAA 1440
CCACCTCTCC ACACCATCCA CCCCACGCAG CGTAGTCTAA ACCGGGTAGG GAGAGGAAGG 1500
ATGGAAGCAG AGTGTTATTT TTGTAACCAA GTAGAAGAAG CGATGAATTT TTAATGTCCC 1560
ATTCGAACTC CAGCTCCTAC TCACCAGTCT CTCCGCATGG AGAAGTGGCC GTCATGGTCG 1620
ACCTGTTCCC AAGGGTGGCC TTGTGAGTGC AGGCTCTCCT CACCAGAGCT GAGGGCTTTG 1680
TGAACCTCTG ATGTCAATAG ATGCCCCTCA TCTTCCAGGA GGACAAAACA GGGCAAAGCA 1740
AGACATGGGG TGAGAACAGG AGTGCATCAG TGGGGTTCCC CAAGCCTGTG TCAGGTCCGG 1800
ATCTGGGTGG GAGTTCCCTT CTGCGTCATC CAGGCCAGGC GAGTGGGCAT CCTCCCTGAG 1860
CACCTGTGCT TGGGGCTTTG CCTGTGTCAG TCAGGAAGAC AGAGTACACG GAAGAGTTAC 1920
CATTGCTTTC AGAGCAAACC TTCCTTTGAC ATGCATTTAA CACAGCACGG AGTGATTGAC 1980
ATGTGTCCTT GTGTTTAATC CCTATCTTAA CCTCTCGGTT ACTGTCCTGT TTATCAGTGA 2040
GGAAACTGAG GCTTATTGCT TGCCTGAGGC CTCAGTGGCA GAAGCAAGAT GTGAATCCGC 2100
ACCTGTGTGA TGCCCAAGCC AGAGCTCTTG TTTACTACCC AGAGAAGATG AGCACAGGTG 2160
GGATGTACGT ATGGAGGGCG GGTAGGGCAG CAGCCCCTCT GAGGACAGGT GGCCAGAACC 2220
CAAGCGGCGA GGTTTGTTCA CAGCCTCCAC AGGGTGGGGT GGGGCCATCC GCAGAGGGTC 2280
TCCTGCCATC CCATTTTCCC TGCATACCAG TGGGTGGTCT GAGAGCCTTT GCAGAGAAGA 2340
GACTGGATCT CAGCACGTGC TTATGTGCGT GTGTACATGC ACACACATGC GTGTGATTCA 2400
TCTGGCTCTT ACTTTATGCC AAGGAGCCTG TCACATGCTT TAAATGTATT TTCCCTAGTT 2460
TAATTCTTAG AGCACACTGC AGGAGGTAGA TTCTGATAAA TCCATCTTAC AGGGAAGGAA 2520
ACAGACTTAA GTAGGTAAAG TCACTTGGTT GAAAACATGG AATGAGTAAG CCAAGGGGCA 2580
GGTATTCAAA CCCAAACCCA GGTCTGTGCC CCTGCAGAGC CTGCAGGAGC AGCCCACACA 2640
GGCCAAGGCT GTGAGGGGTG CTGTTTGCAC GCGTGCGTGG CCCTCCCTGC AGCCCAGGTG 2700
CCTAGGTCTG GGCCTGGCAA CACCAGAGCA CGGGGCCTTG CCCTCGGGGA ACAGCCCTCT 2760
TTTGTCCTCA GGCTGTGGGA TGTGTCTTGG CTACTTTGCT GCCCAGCAGT GCCTGCTCTC 2820
AGGCACATGT GAGAGTAGAG GCCTAGCATC CGTGGCCACT TCCTTCCCAG CCCATTTGCT 2880
GCTGCCCTTT GCTCTGCAGG GCTGCTGGGC TCCTGGGCTC CACGCCTGCT TGCTGCCTGC 2940
CATCAAGGCT GGCAGTGCTC TGGGGCTGTA AAGGTGCAGG CGCCGTACTT CCCAACCCCT 3000
GGAGCTCGCA CATGGTAGGA GAGAAAGCTC ATGTGCATGC AACATCCAAT AAGACTAAAA 3060
GTGACTGGGG GTTGCTACGG GAGAGGTGCT GAGGGTGGGC CGGGGACAGA GCAGGCACAC 3120
TGTGGAGGGG GTGGGCAGGA CTCCTGAGAC CAGGGCAGGG AGGGAGGAGA TGCTGGGAGG 3180
CACAGGGCCA TCCAGAGAGC TGCCACTTCC TGAGCATTGC CATGCACGCT GCAGGCATGG 3240
CCATCTTGAG TCCTCACACT GCCCGTGGCC TAGGTGGGGT CTTCATCCCC ACGTTGCAGA 3300
GGAGGAAATG GAAGTTAGGA AGGTTAGGTG ACGTGCCCAC ATGAGTGGTG TAAGCATGGT 3360
TCCCGCCCTG GGCTCTCTGA ATTCAGTATT GTATGGGGGA GGCTGGGAAG GTGAGTTAGT 3420
ACTCTCCGCA GTGAGAACCT GCCTTGGCTC CCCTCCCCTC AAGGAGTTCA TAGCCGTGGG 3480
AGGGAGGGAG ACAAGAACTG TTGGAGACAA GAACTGTTAG AGACCAGAGA GCAAGGGCGT 3540
GATGTGGTCT GCAGGGAGGA GGCTGTCTGA GGCAGAACCG GGTCAGGGAG GCCATGGTGC 3600
GGGTACCCTC CAGGCACGGC ATTTGGCCTG ACTTTTGAGG GGTGCCCAGG GTTGGCTACA 3660
TGGCGGGGCG GAGGTATCTT TAGTGGGGGA ACAGCGTTGT GCCACCAGGA GGGGTCTCTG 3720
TCTCCCAGGT AGAGGAATTC TCCATGGTGA GAGGTGGTGG TGGGGGATGG TCTAGCTGTC 3780
CACTCTTGCC CCCTTTCGGA TTTGGAAGGA AGCCCCATGC TGGGTCCACA CTGGTATGGC 3840
GTATTAATTA GGCAGCTGCT TTGTCTGGGA GGGGGCTTTG TGTCGAGTCT CCCTGAATGA 3900
GCAGGGCTGG CGACAGTTGT CAAAACACAT GGTGCTTGGT CAGAGCCCCC GTAGAAGCCC 3960
CTTGTCCTCC GCATGGCCTC CGCCTGCACC CGGGGCGTGG AATGTGCTCT 4010