EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-18997 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr19:39180700-39185000 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs34105297chr1939184669hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184056-39184074GGAAGGCAGGAAGAAAAG+6.98
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184712-39184730ACATCCTTCCTTCCTCCC-7.11
Foxd3MA0041.1chr19:39182542-39182554AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39182546-39182558AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39184184-39184196GAATGTTTGTTT+7.22
IRF9MA0653.1chr19:39182019-39182034AACAAAAGTGAAACT+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39181299-39181314TGAACTCCTGACCTC-6.22
RUNX1MA0002.2chr19:39184668-39184679CTCTGTGGTTT+6.14
YY1MA0095.2chr19:39181221-39181233GCTGCCATCTTG-6.32
Number of super-enhancer constituents: 68             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39182076-39185083Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39180666-39181982Aorta
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_02408chr19:39181342-39185560Astrocytes
SE_02946chr19:39182825-39183824Bladder
SE_03166chr19:39182673-39184911Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39182386-39185093Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39182350-39185068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39182428-39185106Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39182077-39185225Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_13194chr19:39183611-39184401CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39182874-39185111CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39183423-39184854CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39182491-39185050CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_20865chr19:39183372-39185109CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39182731-39184965Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39183074-39184903Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39182754-39183899Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39183955-39185064Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39181947-39185064Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39182626-39185071Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34681chr19:39184216-39184943HeLa
SE_35430chr19:39183365-39184979HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_38896chr19:39182466-39184917IMR90
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39181143-39185634NHDF-Ad
SE_44797chr19:39181919-39184905NHLF
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_46686chr19:39182759-39183893Ovary
SE_46686chr19:39184055-39184894Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39182677-39185005Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39181288-39181899Right_Atrium
SE_48555chr19:39182415-39185026Right_Atrium
SE_49449chr19:39182454-39184953Right_Ventricle
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39182066-39185548Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39180720-39181485VACO_400
SE_56725chr19:39181511-39182336VACO_400
SE_56725chr19:39182441-39185071VACO_400
SE_57359chr19:39183289-39184322VACO_503
SE_57359chr19:39184333-39185048VACO_503
SE_58038chr19:39182547-39184962VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39182024-39185548HSMM
SE_64225chr19:39181233-39181937NHEK
SE_64225chr19:39182411-39185099NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39182386-39185068H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chr193918122239181305
chr193918259439182977
chr193918203739182274
chr193918414839184440
chr193918132139181446
chr193918154339181788
chr193918249139184907
chr193918194839182010
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
AATAGTCAAA TCATCTATCA TCTGAGAGCA CAGGAGGAGG GACAATGATT GGGATATAAA 60
CCCCAGGCAT TTGAGGCGGG AGTGGGCCAC CCCCTTTGGT TCCCCTCCCA CTGTATGGAA 120
GCTCTGTTTT CACTCTATTA AATCTTGCAA CTGCACACTC TTCTGGTCCA CGTTTGTTTT 180
GGCTTGAGCT GAGCTTTCGC TCACCATCCT TCACTGCTGT TCACCGCCAT CACAGACCCA 240
CTGTTGACTT CCACCCCTCC GGATCCAGCA GGGTGTCTGC TGCATTTCTG ATCCAGCGAG 300
GCGCCCATTG CTGCTCATTC GGGCTAGAGG CTCGCCATTG TTCCTGTGCG GCTCAGTGCT 360
CGAGTTTGTC CTAATCGAGC TAAACACTAG TCGCTGGGTT CCATGGTTCT CTTCCATGAC 420
CCACGGCTTC TAATAGAGCT ATAACACTCA CTGCATGGCC CAAGGTTCAA TTCCTTGGAA 480
TCCGTGAGGC CAAGAATGTT AGGTCAGAGA ACAAAAGGCT TGCTGCCATC TTGGGAGCAG 540
CCACTACCAA CTTGGGAGCT CTAAGAACAA AGACCCACCG GTAACAGCCA GGCTGGTCTT 600
GAACTCCTGA CCTCGTGATC TGCCCGCCTT GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT 660
GAGCCACCTT GCCTAGCCTT GTTCTGGAAT TAGTGGTGAT TGTTGCACGA TCTTGTGAAT 720
ATACTAAAAC TCCCTGAATT TTATGTAAAA GGGTGAATTT TTTGGTATGT TATGTGAATT 780
ACATTTCAAT TTTTAAAAAT TGATTCTCCA AATTATGTAC ATATTTAAAG AGTACATGAA 840
AGAGAGGGAG AGAAAGAAAA GCTGGATGCG AGATGCCGCA ACCTGATTCC ACTCACTCCT 900
AGATTTGTTG AGTACCTGCT ATGTGAAAGG TACCAGTCCA GGCAGTGGGT TCCCACAGCA 960
AACAGAACCC TCCTCTGGGG AGCTTATGCT GCACTTGGGA GGGAGACTGG TTATGAACAA 1020
AGAACATAGT TTTTGATGAT GAAAAGTGCA GTGAGTAAAA CAATGCAGTG TGAGGCCGGG 1080
TGTGTTGGCT CACGCCTGTA ATTCCAGCAC TTTGGGAGGC CGAGGTGGGC GGATCACCTG 1140
AGGTTGGGAG TTCGAGACTA GCCTGACCAA CATGGAGAAA CTCCGTCTCT ACTAAAAATA 1200
AAAAATTAGC CAGGCCTGTA ATCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGCCAGA GAATAGCTTG 1260
AACTCAGGAG GCAGAAGTTG CGTTGAGCTG AGATCATGCC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA 1320
ACAAAAGTGA AACTCCGTCT CAAAAAAAAA AAAACAAAAA AAACAAAAAA AAAAACCCAA 1380
CAACGCAGAG TGGAGTGATA GCCTAGGGGA GATGACAGAG TCCAGGAAGG CCTCCTGGGT 1440
TGCTGACATT TGAGGCAAGT CCTGAGTGAT GAGACAAAAC CAGCTCTATA AAGAGCTAGA 1500
CGAAAGTCTT AGACCAGTAT TTCTCATGAG GAGGAGACAG CACTCCAAAA TCCATCCTTT 1560
GGCCTGGCGC GGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCTGA GGCGGGTGGA 1620
TTACCTGAGA TCAGGAGTTC GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGCAGAAACC CGTCTCTACT 1680
GAAAATATAA AAATTAGCCG GGTGTGATGG TGGGTGCCTG TAATGCCAGC TACTCGGGAG 1740
GCTGAGGCAG GAGAATCACT TGAACCCGGG AGGTGGAGGC TGCAGTGAGC CGAGATCATG 1800
CCACCGCACT CCAACCTGGC GACACAGCGA GACTCTGTCT CAAAACAAAC AAACAAACAA 1860
AATCCGTCCT TTGCAGCAGC AACACGCACG CTTTCTGGCA CCTCAAAGGG GATTGTCCAA 1920
GACTGGAACA CTGGCTGCAG GGAGGGGGCC GGGTGCAAAG AGCTGGTTTC TGGGTGGACA 1980
CGCAGGACCT TTGGAATGCT CGCTACCCCA CTCAGCAGTA TTTATACCTC TTCTCCAACT 2040
GCGAAGTCAG AGCTTTTTCA TGCAGGCTGA GAAAACTCCG AATAAGGCAA CTTCAGGCCA 2100
GGACATAAGA CGCATTCCAT ATTTCACTGT AATTGCTTTC AAATTAGGTT ATGTCGTCAT 2160
GTAACAGGCA CACACAGTGC ACTTGCTTTG CCCCTGGCTG GGGTTGGGTC CTGGACAGGC 2220
TGCCCCGTGT GTCGCTGAAC TGCCGCAGTG CTAGCCCTGA TTGCCTGGGC AGTAGGGCTG 2280
TCTGCGTCCC ACGTTGCTGC ACCCATCTAA TTTGTGGCTG TGTTATTGTG ACCTGCTCGT 2340
TTTCTGTTCT TTCAACCTGC TTCCTGGCTT TTATCTCCTT CAGAATCTGG TGGCAGTGGA 2400
TCTTCAAAAA GTGCTCAGGT GTGCAGTCTC ACAGGCCAGA GGCTCCACGG GCCCCCTTGC 2460
CAGGGCGAGC ATCTCTGCCT GTGCCGCTGG TAACCCAGAT TCCAGAAGGC TTAGCCGTCT 2520
GGCCCTGAAA GCGCCTTTAT AGTTGGTGAT GAAGCCCATG GGCTGGGGAG CCGTTTCTGC 2580
TTTCAGGAAC TGAAAAGATG CCCCAGTGGG GCTAGGCCTT GCCTGAGGTC TGGCAATAGC 2640
CTGCCAGATG GGTGATAAGA AGGCCTACCC AGGTGATAAG CCTACCCAGG AATAAATAGC 2700
TGTACCTCCC CTGTGTCCAA GCCCTGGACA CCCTTCCCTA GGACCCATGG AAGCAGGAAC 2760
CATGGGCAGC GTCAGAGGCC ACAGCAGGCA AGGTGGAAGT TCAGGAGGTG GGACGGCGCC 2820
CTCCCCCTCA AAGCAACTGA TGCCCCAGCG GAGCGACAAA CCCTACACGG TATTTCAGAG 2880
CCAAGGTTTG AAAACTCCCA GGGTGCTAGG GAGCTCCGTC TGGCCTCCGG GTACCTGGGG 2940
TTGGGGCTGG CTGTGGCCAG TTGCAGTCAA CCCTGAGCCT GGGCAAAATG CATGCAGGCT 3000
GGTCCTCCTG GGTGATATCC TGCTAGGCGG GTGGGCAGTG TACACGGCAG AAGAGGGTTG 3060
CGGCATGAGG CAGCAAACGT TTTTTTCTAA AATCTTGTCA AGCGTGGGGT CCGTGGAATC 3120
CACATGTGAG CATCAGCCTG GTGGGTGGGG AGAGTGAAGC CTGCGATCCA GTCTGGATCA 3180
TGTGCTACAC AGTGCAGAGC CGGCATGCTC ACCCCTCCTG AGGGATCGCT CGAGCCTATT 3240
TCTAGGCCCA AAGCGACTTT GCAAGAGACT CCCTTTATTC TGGGCTTAGT GGAATTCCAG 3300
CTTCCAACAG CCATTTCCCT CCACCCCCTT CAGTTCTGAG AACATGTTTT GTAACAGGAA 3360
GGCAGGAAGA AAAGAGAAGG CGAGTTTGTT CAGCTGGGTC AGCCGCATCC CACCAAGGCC 3420
CTTTCTTCCC TCCAGCTCAC CATCGCTCTG CCCACTGGAA CCACTCGGTT GCCCTGTGTC 3480
TGCCGAATGT TTGTTTCTTA ATCAGCGCCC CAGAGTAGAG AGGGCTTTGC CTCTTCGGGT 3540
TGAGGGAGGG AATCATTGAT GAATGGCTCA TTAAAGCCCA CTGCTGCCAC ATTCCTGGGT 3600
GCTTAGGTCA CCTCCTGAAC AATATCCATC ATTCATTCAC CTACCGCCCC ACATCCTGGC 3660
GGCTGGGAGG GGTCCCTGTG ACGCAGGAAG GACTTTATGA CCAGAGATGC TAGGTCTCCG 3720
TCTCCCTCCT GCAGCCCACA GTGACAAAGC AGAAACTGCT CTTGGGGCCC CCTGAAGCCC 3780
GCCTTAGCTG GGTCACCATG GGCCTTGGCA CACGGAGGGG TGACAGTGGA TCCCAACTCA 3840
ACTGACAAGC TTGCCTTTCT CTGTTCTTCC ACCCCCCTTC CCCGCACTCA CACCCTGTGC 3900
TATTTTAGCA ACCAGAGAAG CCTCTTTAAT AGGCTGCCCG TGTGCAGGGG CAAGCTCTGA 3960
AGCCTCCTCT CTGTGGTTTG GTTCACATGT GTTCTCAAAG ACAGATGAGT CCACATCCTT 4020
CCTTCCTCCC TAGATAGGTC AAGGGCTGGG TGCAGGCTGC CTTCACAGGA GGGCCAGGGA 4080
CAGGCTGGGA GGAGCGGGGC CACCTTTTGC GAAGCGGGTG ATCTGCTGGG GCGTTGCTCT 4140
GCCTGCCTGC CTTGTTCTCT GAGTTTACCT CTAGCTTGGG GACCAAGGGT GGGCTGGGGC 4200
CTTCTTTTTT TTTTTTTGAA ACCGAGTCTT ACTCTGTCTC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC 4260
GCGATCTTGG CTCACTGCAA CCTCTACCTC CCAGGTTCAA 4300