EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-18994 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr19:39155910-39159700 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr19:39157345-39157356TTAATTAAAAC-6.14
MEOX2MA0706.1chr19:39157553-39157563AGTAATTAAC+6.02
SOX10MA0442.2chr19:39157759-39157770GTCTTTGTTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr19:39156780-39156801TCCATTCCCTTTTCCTCCTTC-6.44
ZNF263MA0528.1chr19:39156784-39156805TTCCCTTTTCCTCCTTCCTCC-6.81
ZNF263MA0528.1chr19:39157573-39157594GGGGGAGGGGGTGAAGGAGAA+7.56
Number of super-enhancer constituents: 79             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39152475-39162940Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39152638-39159265Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39152471-39162993Aorta
SE_02393chr19:39153944-39159110Astrocytes
SE_02946chr19:39155086-39157682Bladder
SE_03166chr19:39153782-39156800Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39156876-39159036Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39152487-39159178Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39153820-39163196Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39137791-39163220Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39152418-39159241Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39152344-39163078Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39152357-39162990CD14
SE_13194chr19:39155958-39156682CD34_Primary_RO01480
SE_13194chr19:39156987-39159064CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39153767-39159377CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39153578-39156671CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14624chr19:39156755-39158872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39156360-39159158CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19537chr19:39159295-39161239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39154025-39159199CD56
SE_20865chr19:39154299-39156301CD8_Memory_7pool
SE_20865chr19:39156686-39158406CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39154161-39159169CD8_primiary
SE_23062chr19:39153787-39159013Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39155479-39156334Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39156445-39157671Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39158513-39158952Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39156323-39158180Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39138146-39159498Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39151219-39159772Esophagus
SE_27614chr19:39137681-39163004Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39147858-39163235Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39152459-39161422Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39153668-39161967Gastric
SE_34299chr19:39156593-39157741HCT-116
SE_34681chr19:39154095-39159230HeLa
SE_35812chr19:39151229-39162882HMEC
SE_36926chr19:39137778-39163235HSMMtube
SE_38012chr19:39153914-39159481HUVEC
SE_38896chr19:39153790-39159154IMR90
SE_40018chr19:39157500-39158261K562
SE_40594chr19:39152445-39163189Left_Ventricle
SE_41601chr19:39155516-39156427LNCaP
SE_41601chr19:39156502-39157518LNCaP
SE_42097chr19:39152460-39159813Lung
SE_44161chr19:39153875-39159192NHDF-Ad
SE_44161chr19:39159210-39161006NHDF-Ad
SE_44797chr19:39154153-39159187NHLF
SE_45660chr19:39153677-39159204Osteoblasts
SE_45660chr19:39159240-39162946Osteoblasts
SE_46686chr19:39154904-39158101Ovary
SE_46686chr19:39158510-39158977Ovary
SE_47108chr19:39136358-39164169Panc1
SE_47461chr19:39153806-39158493Pancreas
SE_48075chr19:39152482-39161384Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39152466-39159169Right_Atrium
SE_48555chr19:39159227-39159793Right_Atrium
SE_49449chr19:39155511-39157647Right_Ventricle
SE_50056chr19:39152482-39159167Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39137722-39163232Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39154051-39159183Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39152479-39159130Small_Intestine
SE_52339chr19:39159220-39159797Small_Intestine
SE_53291chr19:39152528-39163195Spleen
SE_54534chr19:39152596-39161466Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39156918-39157346Thymus
SE_55638chr19:39157659-39158272Thymus
SE_56336chr19:39157103-39158786u87
SE_56725chr19:39153774-39159133VACO_400
SE_56725chr19:39159282-39159750VACO_400
SE_57359chr19:39155511-39157683VACO_503
SE_58002chr19:39153735-39157662VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39153763-39159204HSMM
SE_64225chr19:39154092-39158984NHEK
SE_65266chr19:39153703-39158125Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39153706-39158870H9
SE_68725chr19:39159222-39161420H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr193915626639158933
chr193915598039156191
Enhancer Sequence
CCGGCTGGCT GTGCGACCCT GGGCAGGTGG CGGGGGTTAA GCCTCAGTGT CCTTCTTTGA 60
AAAGGGGCAT CATCCTATCC TCAGTTTGAG GATTAGACGT GATAGTGCGC AGGAAGCACT 120
CTGGTGCCTG GTACATTGTA AGTGCTCAAT AAATGCAGCT TCCCAAAATG ATTTCAATGG 180
CACATGGTCC TGCATCCAGG TGGGATCTGC TACTTGAGTC TCCCCCTCAA AGGGGCCTGC 240
TGAAATACGC AGCTCAGTGG GAAACCAAAA CATACACCCC TTTCCTCCAG TGCTCCCCAG 300
GAAGCGCCAA GTCCTGAGCC CAGCCAGCAA CTTCGAAGAA GTGCCCTCCA ACAAGTGGCA 360
GTGGGCACTT GAGCAAGTGA CTTAACGCAG CCCTCTCCCC AGCCCCTGCA TCCATCTGGG 420
CCTCATTATC TGGGAGGTGG CTTCTTGTTT CAGAGTTACA GGCCCTGAAC AATTTTGTGT 480
TGGGATGTGC CATAGGCAGT GCCAGGAAGG TTCTTTCATG AGTAATTTAA CTTGTTACTA 540
AGTTTGCTAT CAGCCGGGGG GCTCTTTCCC CGGGTTCCCT TCTTTCCCTG GGTCCCCTTC 600
CCCGCAAAGC AAAGTCCAAC TCAAGTTAGA AACATCCCAC AGCCTGGAGT CAGGCTGCCC 660
TCTCTTCAGT TGGTGTGTGA TGTAGAAGCA GGAAGGGCTT CCCACTGATA ACCCTAAAAA 720
TAACTGCCCA GAAATGCTGT CAGATGGGGC CAAGAGGTGC ACAGGAGCCT GTGCCCAGCT 780
GCCGACCTGG AACGTGGGAC TTTCTAGAGG GCTTGGAGGA GCCCTGCCCC TTCCAGGCCT 840
CTTCCCAACA GTGCTTCTCA CGCCTGCTGC TCCATTCCCT TTTCCTCCTT CCTCCCGCGC 900
CCCCCCCTTT CCTGGGGTCA CTTCCTGATG CCATTCTTCA ACTTCGCCCC TGTCCCCCCC 960
AAAAGCAATC AAATCCACAA CCTAATAAGG CAAAAGAATG AGGAGAATGT CCGCCTCCCA 1020
GCCTCTCCCC TAACAGGGTG CAGGCCTGAA GCAAATTTGG AAAATGTTAC AACGGAGTGA 1080
CAACCGATGG GGGCTGGGGG TGGGGCGGTG CAGCCTTGTT CAGGAGCTGC CCATTGTTGG 1140
CCTGAGGCAG GACCCTAAGG GAAGGCCACC CGGTTTGCGC TTTCCTGATC AGGCTGTTGA 1200
CACCCTTCTA GCACAAGAAA ATGTATGGAA AGTAACTGCC TGAGTCAGCT GCATCTCCAG 1260
TTGTGGGATC CACGTGCCAG GAGAACACGA AGTACACACA GGTCCGCAGT GGGAGCCCGC 1320
TCGGAGACAC CTCCCCGCCA TCACGGCTGG GACTGTGCAT ATCCAAACAC TTCTTGCCTC 1380
TGAGATGAGC AGTTTTCTTC CCCTTGACTG TGCCAGGGTT CAATTAGCCT GGGCATTAAT 1440
TAAAACTTGT CAACACTTAG AGTGGGGCCC CCAGAAATCT GTCACCCCTC CTAGATCATT 1500
ATCCCAGGCT AATCAACCCT CTCTAAGGCA GTTTCCATTC TTGACTTAGT GGGAGGGAGG 1560
AACAAGCCCC TCGGTGCTGG GGAGCTCTGG GGGAGGTAGG GACTGACTGG GCCCAACCCA 1620
CTTTGTTTTG GAAGGTCAAG CTTAGTAATT AACCTGAATG CTTGGGGGAG GGGGTGAAGG 1680
AGAAAGAACT GAGTCTAGGG ATGTGCCAGG TCTTTCAAAT TGCTAATTAT CAGCGAGCAT 1740
GAGGTCATCC GTAAATATAT CTAATTCTTT AGCTTGTAAT TAAGGTGCTC ATTAAAAGTG 1800
CAGGGAAGTC TTGTTTTCCT AAAAGGGGAA AAAAACAACA ACACAAAAAG TCTTTGTTTT 1860
GACCTGACAC GATGGCTCAG AACAGGGGGA GGACTCAAGG CACAGGACTA GTTTCCTGCC 1920
TTAAAGAGCC TTTACAGGAA ATTGACTGCA AACAGTATTG GTGACCCTGC CAAGGAGGCA 1980
AACCTAGGGT GATGTCATTG TTCGAAGCTG TCACCGCCAA GCCTCTGGCC TTGGGGCGAG 2040
GAGAGTTGGT GGGATTAAAA AATGAGTGTG TGTATGTGTG TGTGTGTTTA GCAGTCTCTA 2100
AAGAGGCGAG TCAAGGGAAA ATCCTAGCGG GAGAAAAATC ACAAGGGGTG GGGGGTGTCT 2160
CAGAAATATT CTTAGCTGGG TTCAACTTTC CTCGTTTTTC TAAGTTTAAA AAATCCTCTC 2220
TTACTATTTT TGCTCATCAA AATGCTGCTG CTTTTTCAGA GACAGCCTTT TTTGAGCCAT 2280
TCCCTATTTA GTGTTTTGGG TAATTGGCTG TTACAGTATG GAATTTGTGG CCCAAAGGCA 2340
GCGTGGTAAG TTAGACACTA GGTGCACGGT GCCCCATTGT TATGAAGTGT GGAAACTGAG 2400
ACGCTGGACT AGTCTGATGT ATCTGTTTCT TCCACCAAAA AAAAAAAAAA ACCATTTTGG 2460
AGAACTACCC AATGCCAGTG ACTTGGCATC TCTGAGTCGC TAATCTTCCC ATGTGCCTCC 2520
AGGAACCGTC TGGAGCGTCC CTGAAAAAAG GACAAGGTTT GTATCTTGTC ATTTTTCCTC 2580
TGGCTGGAAG TCTAAGAGGT ATAAACACAG TCTTAAAATG AAAGCAACAA AAATAAACTC 2640
AAAGCAGCCC TGCGTGAAGG CATTAATGCA AAATATGCAA GCTGGCTTCC TATTTATACG 2700
GCGGAAGGCA GTCAGAAGAG CCAGGCCTGG TTAAGGAAGG AGTTATGTCT CTGGAGGTGC 2760
CTGTTCCTTA GAATTACAAA TAAACCCTGG GTGATTACTC AGATGAGGTT GTAATGTGGT 2820
GTCTCATTTC ATGCTTTGCA CAGTCCAGTT TCTTGATGGA ACCAACGGCC TCTGAAATGC 2880
TAATGCAGGA TCAGGATACA GTTAGAGTGC CCCCCTTCCT GTGCCCCTCC TAACATCCTA 2940
ACAGCTTTAG AAGGAAGTTT GAAGATTAAA CAGGAGAGCC ATGTAAGTTT CCTGTGATCC 3000
TAGATCCTGT GATTTGTTAA TATTCTTTCT CTTCAATCCA CCTGACATTT ACCCAGATAC 3060
CATATTAGGC TTGGAGATAC AACAAGAAAG AAAACCAACC CAACCCTGTC CTTAAAGAAA 3120
AGATGGACGA TGAAGGGCCA GGCGCAGTGG CTCACTCCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG 3180
GCCAAGGCGC ACAGATCACG AGGTCGGGAG TTTGAGACCA TCCTGGCCAA CATGGTGATA 3240
CCCCGTCTCT ACTAAAATAC AAAACATTAG CTGGGCATGG TGGTGCGCGC CTGTAGTCCC 3300
AGCTACTCAG GAGGCTGAGG CAGGGGAATT GCTTGAACCT GAGAGGCGGA GGTTGCAGTG 3360
AGCCGAGGTC GTGCCACTGC ACTCCAGCCT GGCAAGAGAG TGAGACTCCA TCGCAAAAAA 3420
AGAAAAAAGA AAAAAAGAAA AGATGGACAA TGAATTGCAT GATGGAAGTG AACAGTGTTA 3480
GGGCGATATG CAGATGTAAA TGTGGTCTTG TTTTACTGCT CACTGACTTA CTGAAGTAAA 3540
CCCATTGACT TCGCCTTCAT GGGTTTGAAA AGGGTTTTTC CAATGTGCTC TGTGTGTCTC 3600
GGAGCTCAGG TGTTCAGAGC TGCCTCCCTT ATAAATCGAC CTCCAGGAGA GTTGTGTGTT 3660
TGGTTCTTGG TGTATGGTTT CGTAGGCTCC CCAGGGCTGA GGAGTCACCT TGGGATCCAG 3720
CTTTTTTTCT TTTTTCGAGA CAGTCTCTCC CTGTCGCCCA GGCTGAAATG CAGTGGTATG 3780
CACTTGGCTC 3790