EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS176-03478 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-SH 
Coordinate
chr1:209942120-209945880 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12131636chr1209942435hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SRFMA0083.3chr1:209945752-209945768TCTCCAAATATGGTCA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:209943535-209943546TTTCTGGGAAG+6.02
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09790chr1:209938236-209944363CD14
SE_09790chr1:209945220-209949860CD14
SE_11378chr1:209927731-209944431CD20
SE_11378chr1:209944954-209959453CD20
SE_14909chr1:209940313-209944329CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15749chr1:209940943-209944108CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16097chr1:209941298-209944193CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16793chr1:209940932-209944127CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17570chr1:209938627-209954094CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18085chr1:209940512-209944756CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18085chr1:209945261-209948856CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18418chr1:209938609-209944535CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18418chr1:209944617-209959246CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19526chr1:209940698-209944196CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19526chr1:209945195-209946436CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22177chr1:209940956-209944640CD8_Naive_8pool
SE_22622chr1:209938680-209944016CD8_primiary
SE_22622chr1:209945268-209947165CD8_primiary
SE_55395chr1:209941017-209944205Thymus
SE_55395chr1:209945113-209945681Thymus
SE_63048chr1:209920681-209949475Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1209942503209943709
chr1209942351209943721
chr1209942657209943400
Enhancer Sequence
TCTTCCCACA TACTGTAACA CTGGGCTTCA GTGTGGGGGA CCCTGGGGCT CAGACCAGGA 60
AACTACATGC CCGATTTGCA ACAACTTGGC TGCGACTTTT ATGACGTTTT GGGGAGTCCA 120
GAAAAGCAGA GCTGTGGAAA GAGGTTTCAT TCAAGCTCCA GACTTGGGTG GCCCTTCATC 180
CCCACTGAAG TGGCTATGGT AAATTGTCTT CCGTTGCAAC ACGAATGGAA AAGTAATTTG 240
GGGTTGGGCC AATACAAAAA CAGTTGAAAG AGGCAAAATA TTGGATTAAA GCCATACTAT 300
GGAATGGGGA GAGAGGAGGT ACCCCAAAAG GGTAGGAGAC TGGGAAAATT TTAAGAATAT 360
TGCCTTAGGC CTGCTATATT CCCAAAATAC AGCAAGATAA ACCTTAAATT TGGTAGGTTT 420
GATTGCATTC TGCATAGAAA GAGTTTGGGC AAAGGCAAAT GTGTGGAACC GAAGATGTGA 480
ACCAGAGGAG GTAGGTGTAG AGCCAGTTGA TTTCAGGACC TGTGGATTGA CAATGAACAG 540
GCCACAGTGG AATGCAGCCG TTTTACCAGT TACTTCAAAG CTCAAACAGT AGAAGTCTTT 600
GTCCACGTCT TCCATCGGTC CCAAAGCCCT CTGCTTATTG TAGATGCCAA ATCCCTGACT 660
CTCTGCTCTC CCTCACATGA GACGTTAGGA AAAACATTAA TAGCAGGAGG CACTTTAAAA 720
AATTATTTTT GGCAACACTT TTTGCTTTTG CAAGCCCCAG CTGAGTAACA CAGGAAGCTG 780
AAAGGGTGGG GGCACCCCCT GGCTCCCATG GTTAGAAGAA TAAGCCAAAC AAGATCAAAA 840
CAGGAGCTGC GAGATACCAC TTCCTGCCTC TCCCAGGCAC CCTGAAACTC ACTGAGGGAG 900
GCGGACCTCA AAGCCGAGCC CCCTCCTCTA CCCCCAGACC ATTACAAACC GGAAATGTTA 960
TAAGAGATGG AAATGTCCAG GCCATCTGGC TGAGAGAGCC CATGGCGTCT CGGGCCTAAA 1020
GAGAGGTGGA ATTTCAAGAC CTCACAAGCG TCCCACTTGG CCTGGTTGGA AAAAGCCAGA 1080
GAAAAGATAG GAAAACCGGT CACTGCCCTT TCTCTGGAAA ACTTGCTCTC ATTGATGGCT 1140
CCTCCGCCCC CTCCCCTACA CAGATACACC CTACACAAAA CTCCAGGCTG GAAGAACAAA 1200
ACCCCTACCT GGGCAAAAGG GGCAAGTCTA CAAAGGGAGG GGACAAAAAA GTGGCAGGGA 1260
AGCTGTAGCT ACTAAGCTGA AATACTGAAA AACCGAGAAA CAGATTGGCT CTTCATGCCG 1320
GCCTTGCTCC CCTCTCGCCC TTGAGATTAG CATCTTTCTT GGAATGTCGA AAATACCATT 1380
AGACAGCCCC AGCTTATGAA TAAATAGAAT GTGACTTTCT GGGAAGCTCC CTTACACCCC 1440
CTGCCGCCCT CACTCTGCTT TAATATCTCT CCGTTTCTTG CTTTCTTAAA GAAGTTCTCA 1500
TCTTGAGTCT AGTATGTACG TGTGCATGTG GAAATGTATG TATGCAGGTG GAGGTGTGTG 1560
TGTGGAGATG GAAGTGTGTA TGTCCAGATG GAATTGTGCG TGTGCATGTG GAGGTGTGTG 1620
TGTGCAGGTG GAGGTGTGTG TGTGCATGTG GAGGTGTGTG TGTGCAGGTG GAGGTATGTG 1680
TGTGCATGTG GAGGTGTGTG TGTGCATGTG GAAGTGTGCG TGTGCATGTG AAAGTATGTG 1740
TGTGCAGGTG GAAGTGTGCG TGTGCAGGTG GAGGTGTGTG TGTCCAGGTA GAATGTGTGT 1800
GCATGTGGAG GTGTATCTGT GCATGTGGAG GTGTGTGTGC AGCTGGAAGT TGTGTGCAGG 1860
TGGAGGTGCA CATGTGCATG TGAAGGTGTG TGTGTGCATA TGGAGGTGTG TGTGTGCATG 1920
TGGAGGTGTG TGTGTGCAGG TGGAGGTGTG CGTGTGCAGG TGGAGGTGTG CGTGTGCAGG 1980
TGGAGGTGTG CGTGTGCCTA TGGAGGTGTG TGTGTGTGCA TATGGAGGTG TGTGTGTGCA 2040
GGTGGAGGTG TGTGTCTATA TAGAAGTGTG TGTGTGCATG TGAAAGTGTG TGTGTGCCAT 2100
GTGGAGGTGT GCGTGTGCAG GTGAAGGTGT GCGTGTGCAG GTGAAGGTGT GCGTGTGCAG 2160
GTGGAGGTGT GCGTGTGCAT GTGGAGGGGT GCGTGTGCAT GTGGAGGTGT GTGTGTGCAG 2220
GTGGAGGTGT GCGTGTGCAT GTGGATGTGT GTGTGTGCTC AGGTGGAAGT GTGCGTGTGC 2280
ATGTGGAGGT GTGTGTGCAG GTGGAGGTGT GTGTGTGCAG GTGGAAGTGT GCATGCATGT 2340
GGAAGTGTGC GTGTGCATAT GGATGTGTGT GCATGTGAAG GTTGTGTGCA TGTGGAGGTG 2400
TGCGTGCGCA TGTGGAGGTG TGCGTGTTCA TGTGAAGGTG TGTGTGTGCA TGTGAAGGTA 2460
TGTGTGTGCA GGTGGAGGTG TGTGTCCCTA CGGAGGTGTG CATCTGCATG TGAAGGTGTG 2520
CGTGTGCATG TGAAGGTGTG TGTGTGCATG TGGAGGTGTA TCTGTGCATG TGGAGGTGTG 2580
CGTGTGCAGC TGGAGGTGTG TGTGCAGGTG GAAGTGTGCA TGTGCATGTG AAGGTATGCA 2640
TGTGCAGGTG GAGGTGTGTG CATGTGGAGG TGTGTGTGCA TGTGAAGGTG TGCGTGTGCA 2700
TATGGAGGTG TGCGTGTGCA TGTGAAGGTG TGTGTGAAGG TGTGTGTGTG CAGGTGGAGG 2760
TACGTGTATG CAGGTGGAGG TGTATGTGTG CAGTGGAAGT GTACGTGTGC ATGTGGAGGT 2820
GTGTGTGCGC ATGTGGTGTG CGTGTGCATA TGGAGGTGTG CGTGTGCATG TGAAGGTGTG 2880
CATGTGAAGG TGTGTGTTCA GGTGGAGGTA CGTGTGTGCA GGTGGAGGTG TATGTGTGCA 2940
GGTGGAAGTG TACGTGTGCA TGTGGAGGTG TGTGCGCGCA TGTGAAGGTG TGTGTGTATA 3000
TGGAGGTGTG CGTGTGCATA TGCAGGTGTG CGTGTGCATG TGAAGGTGTG TGTGTGCAGG 3060
TGGAGGTACG TGTGTGCAGG TGGAAGTGTA CGTGTGCATG TGGAGGTGTG TGCGCGCATG 3120
TGAAGGTGTG TGTGTATATG GAGGTGTGCG TGTGCATATG CAGGTGTGCG TGTGCATGTG 3180
AAGGTGTGTG TGTGCAGGTG GAGGTACGTG TGTGCAGGTG GAAGTGTATG TGTGCAGGTG 3240
GAAGTGTACG TGTGCATGTG GAGGTGTGTG TGCACATGTG AAGGTGTGTG TATATGGAGG 3300
TGTGTGTGTG CATGTGGAGG TGTGTGTGGC AGGGAGGGGA GTGTATTAAT CTCCTAGGGC 3360
TGCTATGACA AAGTACCACA GTCAGGGGAA CTTCAAAAAC AAACTTATTT TCTCATAGTT 3420
CTGGAGGCTA AAAGTCTGAG ATCGAGGTGT CAGCAGAGTT CGTTTCTCCT GCGGTCTCTC 3480
TTCCTGGCTT ACAGATTGCC ATCTCTCTCT GTGTCTCCAC ATGGCCTTCC TGCAGTGCCC 3540
TGATCTCCTC TTTTAATAAG GACATCCATC ATATTGGATT AGGGCCAGCT TAATGGCCTC 3600
ATTTTAACTT AACTACATCT TTAAAGACCC TTTCTCCAAA TATGGTCACA TTCTGGGGCA 3660
CTCGGGGCTT AGGACTTCAA CATAGAAATG TTGAGGAGAT ATAAATGAGC TCATAACCGA 3720
GGGCAAGGGA GGGAATAAAC ATTCTCCCGG GAGGGGAGAC 3760