EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-27427 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr6:134608900-134611160 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4896038chr6134609291hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:134611070-134611085GAGATCAAGAGTTCA+6.25
RUNX1MA0002.2chr6:134610576-134610587AAACCACAGAC-6.62
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04175chr6:134608819-134610778Brain_Anterior_Caudate
SE_05019chr6:134608781-134610660Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07062chr6:134608762-134610701Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08100chr6:134608788-134610625Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_34896chr6:134607631-134618801HeLa
SE_36862chr6:134608039-134611351HMEC
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr6134609640134610343
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I134286chr6134607645134618737
Enhancer Sequence
CATGTATTAG AGTTTTTTTA TGGAAAGTAA TTTTGTACTA TGCAAGAGAC ATAGGGGACC 60
CTGTGCTCTA TTTTGTTTTG TTGTTAAAGT ATCTTTTGGA GAGCTGTATG TTGTCACAGA 120
GTCAGGAGCT TTGTGAAGTT ACTTTGTTGG CAAGCAGAAA TGAGTAAACA TAGCTTTTCA 180
TGTTTGTTAT TTTGTCTTAC ACAAAGATGC CATCTCCTTA CCTAACCTAA GATGTGACTC 240
TAATAGATAA AATGATAAGG AACATAAACT AAGACAAGAG ATCTCTTGGG ATGTCTTCAG 300
ATCATGAGGG CTAAACATGA CTCAGACCGG AAGGTTAGTG TTTACCAAGA CCCTTCTTAC 360
AGCTGGGGAA AATGAAGGCA AATTAAGTTT AGCCTAAGCT AAAACAGGAG CAACTTGGTT 420
ATGGTAAAAA GAGATATTGC CCTATGGGAA GGGCTACTAC AAGAATTCTT TCCATACTTA 480
AACTTCAGTA GCAATCTGAC AAGTTTTTAA GTGGAGTCTG AATGTAAAAC ATTCAGAGAG 540
AACCCTTGGT CAGTAGCAGG ATAGAGGTTG CAATAAACAC AGAGAACTAG TGGCATTTCA 600
AGGAACAGTG AGGAGACAGG TCTGGTTGAA GCAGAAGCTC TTTTGTGAGA TCAGTAGAAA 660
ATACGCCTGG AGAAAAAGCC TGTTTAAAAC TAAACATCTT TTCCAAGGGT AAAACATAAA 720
ATCCTTGAAA TTAGGCTTTC TAATGGGCAA AGAGATGTCT TCAACCATTT TATGATGAGA 780
AATACATTGG TTCATCCTCA GAGGTCTCTG AACAAAAAGG GGAACACATG TGAAGGTAGT 840
CATGAGGGAG CCTCTGTGAA TCATAAGGAG AACTGATTGC AAAACCAGAA GCCAGCAGAA 900
ACAAAACAAT TCATAAAATT ACAGAGGCGG TATTCGGAAG TTCTAAATAC TTTTTTTTCC 960
ATCTCAGAAA TGCTTGGTAT CCTAATAATA TTTTCTTTGT GATACGTTTT CTATACTCTT 1020
AGTAATTTTC CCTGGTCTTG ATCTCATCAT TAAAGAGGAT GAAACCAACA CCAGGAAATG 1080
TCCATAAGCA GGAAACCACA TTTTTATTCC ATCACTCATA AAGCATCATT CATAATAATC 1140
AGTGTCAGTT TAGCTATAGC AACAGATGCT AACATACACA TAGTAAGAGC CTACAAAGGC 1200
TCTTTTAAAT GTCAGTTTAA TTTAAACCTT AACCTCAGAT TTTTTCCACA GATACAGTGA 1260
GAAACCACAA AGATCCTCCT GTCCTAATGC TCCCTCCATA CTCTGCAATA AAAGTTCTTG 1320
TTTTGGAAAT AGAGAAACCT GTCTGAATCA GCAGTCTTGG CTTGCTGTGT CCTCCATGAC 1380
CACACCACAT GTTCCATACC TTTAGCCTTC ATAGGGGCTG GAAAAAACTC TGTCTCCCTT 1440
GTCTACCCAT TTTCACTGTG GAGTTCGGCT GCACATTTCA GGTGGAAAGG AGGTAGTGTA 1500
CTAAAATTGC AAAGTATTTC TTTTAATTGG CAATGAATTT AAACAATATT CATTGATTCT 1560
TCCACTATGA ACAAGCTAGT GTTCCCTGGG GGATAAACAG ATGAATAATT GGATAAGCCT 1620
TTACTACTCA GGAAGTGTAT AGTCTAGAGG AGTGCAGTCC AATAGGAATA GAATATAAAC 1680
CACAGACACA ATGTAAATGT TCTAATGGAC ACATTAAGTG AAGTAAAAAG AAACATGAAA 1740
TTAATTTCAA ACATATACTT TATTTAACTC AATGTACCCC CAACATTATC ATTCTAAATT 1800
GTACTTAATA TAAAATTATT AATGAAATAT TTTATATTCT CTTTTTTTTT CCATACTGTG 1860
TTTAAAATCT GGTATGTATT TTACATCTAA AGTACATCTC GATTCAGACT AGCCACAATT 1920
CAGGTGCTCA ATAGTCACAT GTAGCTGGTG GCTACCACAT CAGACCCTAT AGGTCTCATA 1980
TGTAGCAGAG AAAAAGACAT ACAGAGGCTG AGGCGAGCGG ATCACTTGAG CACAGGAGTT 2040
CAAGACCAGC CTGGGCGACA CAGTGAGACC TCTGTCTCTA CAAAAAATAA AAAAGTAGCT 2100
ATGTGGCCTG GTGCAGTGGT TCATGCTTGT AATCCCAGCA CTTTGGGAGG CTGAGGCGGG 2160
TGGATCACAT GAGATCAAGA GTTCAAGACC AGCCTTACCA ACATGGTGAA ACCCCATCTC 2220
TACTAAAAAA ATACAAAAAT TAGCTGGGCG TGGTGGCAGG 2260