EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-18662 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr3:42065370-42068130 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:42067595-42067613CCCTCCATCCCTCCTTTC-6.17
MyogMA0500.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.02
SOX10MA0442.2chr3:42065867-42065878TTCTTTGTTTT-6.62
Tcf12MA0521.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr3:42067591-42067612CTCTCCCTCCATCCCTCCTTT-6.38
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42060660-42068971Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42066131-42066552Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42066556-42067516Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42067617-42068091Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42066168-42066949Aorta
SE_02512chr3:42065459-42068129Astrocytes
SE_10226chr3:42065877-42068137CD19_Primary
SE_10922chr3:42060609-42068638CD20
SE_23272chr3:42066116-42066919Colon_Crypt_1
SE_23272chr3:42066976-42067316Colon_Crypt_1
SE_24262chr3:42066235-42066832Colon_Crypt_2
SE_24991chr3:42066143-42066941Colon_Crypt_3
SE_24991chr3:42067525-42067991Colon_Crypt_3
SE_25861chr3:42065366-42068715Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42066043-42067298Esophagus
SE_29565chr3:42065389-42069132Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42065344-42069055HSMMtube
SE_38230chr3:42065373-42068528HUVEC
SE_40683chr3:42065370-42065953Left_Ventricle
SE_40683chr3:42066021-42068361Left_Ventricle
SE_42248chr3:42064544-42066038Lung
SE_42248chr3:42066070-42068146Lung
SE_44658chr3:42065460-42068844NHDF-Ad
SE_44918chr3:42065870-42068385NHLF
SE_45733chr3:42065416-42068758Osteoblasts
SE_48185chr3:42065430-42065908Psoas_Muscle
SE_48185chr3:42066028-42068146Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42065428-42065902Right_Atrium
SE_48670chr3:42066166-42067443Right_Atrium
SE_48670chr3:42067563-42068128Right_Atrium
SE_49555chr3:42066577-42066889Right_Ventricle
SE_50309chr3:42066089-42067441Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42060817-42068845Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42065989-42068136Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42066102-42067523Small_Intestine
SE_52625chr3:42067553-42068124Small_Intestine
SE_53513chr3:42065347-42065894Spleen
SE_53513chr3:42066102-42068146Spleen
SE_54717chr3:42065389-42068637Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42065927-42068150HSMM
SE_65769chr3:42064935-42066082Pancreatic_islets
SE_65769chr3:42066166-42068375Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr34206596042068007
chr34206711042067525
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042019chr34206049442069114
Enhancer Sequence
GAGTATCTGG GGATTACAGG CGCCTGCCAC CACGCCTGGC TAATTTTTAT ATTTTTAGTA 60
GGGATGGGGT TTCGCCATGT TGGCCAGGCT GGTCTCGAAT TCCTGACCTC AGGTGATTCG 120
CCCTCCTTGG CCCCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCACCGTGA CCGGCTACTC 180
CTGAGATTTC TAAGTGGAGA TGTTTAGGGC AGTGGGACGT CTGGGCCTGA CACTTCGAAG 240
AGGGATAGGA GTTTGAGGCA AGGGTTTGGG GACCATTCCT GTGTAGTGAT ATCCATGTGT 300
AGGAGAACTC ACAGAGGAGT AGTGACTAGA GATTGGGAGA AGACCAGAAT TGCTGGGGGA 360
GGGAGTGTTC TTTTGGTGAA GGGTAGGGTT CACAGGGTTA CTCTGCTGTG AGAGGCCAAG 420
TGAGATAGAA GCTAAAATAT CTTTTGGGTT TGTTTATACA TAGTAGGTAT GCAGATATTT 480
CTAGTTGTAT CATTTGGTTC TTTGTTTTTC AGAAGAGATG CTGGCTTAGC CTTGTAAACA 540
TCGCAGTTGC ATAAAAGTAT TTATGATAGT CCTTAAAATG CTGTAATTAT CTTTGAAGTT 600
TTATAATTTT GCAGTGTTTA ACTTATGGCA GCAATAGCAT TGGTATTTTA AATCAAAACA 660
GAACACTGTC AAGGGTTACA TAACTTATTC ATGATATTAA CAAGATATAA AGCACCATGT 720
TTTTGTGTGT AACTGTTTAA CAGTAGATGA AGTTAATGAT TGCCCACTTT CAGCTAATCA 780
TATGATTGCT ATTGAAATAA GTACTTGCTA GACAGGGATA GAATCTAGTA ATTTGTTAGC 840
TTCAGTACTT CATGCTTGCA TACACACCCA TGCTATTGTG TTACCAAGCC TGAGTTTTGA 900
AATGTGGCGT TCTTTGTCTT TTTCTGGTGA ATAAACCCCA TACGTCTTAC CATAGCCATT 960
TGACTCTTCC TGGCTGTCAG GATGTGTTGC CCTGGACTGA GAGTGAGAGA TCCCAGATTT 1020
TTCAGCTTCT CTTCCAATTG CTAGGGATAC CACATCAGTG CCAACGTGAG TCTCCTCTTG 1080
TCACTTTCTG CTAGGCTTCC CCTTAGAAGC TGAAATTCTT TCCCTTCCTG ATGCTAAGTT 1140
GCAGTTTCTT AAAATGCTAG AGAGCTTTTA AAAGCATACC GTGATGGGAA TTAGTTTCAA 1200
AAGATTATAC CAGAGGGGGT TAAAACTTGC CAACCTTGTA AAAACCTAAC TTCTTTGTTT 1260
ACGTCCTCCC TGCCCCGCTT TCTGCTGTGC TTGGTTTCCT CCTAGCAATA TGCCTTGGTC 1320
AGGGGGAGAG TCTTCCTGTC AGACATAACT TCCCAGACCA GCACTCCTGG AGGGGCCTGT 1380
ACCTCAGACC CTGGCAACGA GGCACGCTGG GGCACGCTGG CCTTTCGTTG TGGTGTAGAA 1440
AATTTTTCAT TTGGAATTCC ATTTTAAAAA TAAGTATAGG GTTATTTATA TCTTCTTACA 1500
TTAATTTTGA TAAGTTGTGT ATTTTAAGGG CTTTATCCAC TTTATCTAAG CTACTGAATT 1560
AATTGGCACA ATTATTACTC TTTCAATGTC CATAAGACCT GTAGTGATGT CCCCATATTT 1620
TATTTCTGGT ATTTGCCTTT CATGTTAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGGAG AGGGGAAGGA 1680
GAAAAGAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGACT GCTGGATCAG GGTAACTTAG CTCAAGAAAA 1740
TGAGAAGGGG TGGTTTCTGG AAGGGGAGAA TGAAAGCCGT GGAGGAAATA AAGCATGAAT 1800
GTGGGGGAGG GCGGGGGCGG GGACTGCTTC TCTTGCTGGC TGCCTTCTCT CTCTGGAGAA 1860
TCTGCTGGAG AAGGAGCAGT CACGTGGGTG GTGAGCTCAT TAGGCTGGGG ACACCAGCTG 1920
TGCTATTATT AGGGCTTTTA AAGTCCGTGG CAGATGTTCT TAGGCGGTGT TCCAGCCTTG 1980
TTCACTTCCC ACATATGGCA TGATACTGTA CACAGAAAAA AGAGGGACTC TTTAACAAAT 2040
AGCTTTTCCA TGAAATGCAT CACTATTTTT TTCCCATGAA CTTTTTTCTT TTCTTTCTTC 2100
CTCTGTCTCT GTTTCTTTGT TTCTCTCTCT GCTGTTTGTT CTTTCTTCTT TCTCCGTTTA 2160
TCTTTCTCCC TCTGTCTCTT TCTTGCTTTC CTCTATTTTT CTGTATTCTC ATTCTCCCTG 2220
TCTCTCCCTC CATCCCTCCT TTCTATACTT CCTTCTTTTG TCCTTTGAGG CCCTTTTTAT 2280
TTAATCCTTT GTGAAACTAG AAGAGGACTC AGAGGCACAT GAAGAAAGTT TGTCTATTTT 2340
AGATTAAAAG TGAGCCTTAG CATTTCATAG AAAGTATAAG AAATGTGGGT AAGTCTCAGG 2400
GTGATCATAT ACTAGAGAAT TTTTTTGACA AGAGCCTGTT TTGAATTGCG TGGTTAGCTT 2460
GCTGCCTCTT CACTCCTCTG GCACAGTGGT AGTTTTTGTA CAGGATCGCT TTTACCTCAA 2520
TGGACTGATA AGCTAGCCAG GGCACCGATT ATTTTTACAT ACCAATTTGT GTGTTGTTTG 2580
TTTGGCTAAT CACCTCTTCT GCAGCTGTTA TCCTGGATCT CAGTGATCAA AGAGATCAGT 2640
GATCTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGACA GAGTCTCACT CTGTTGCCCA GGCTAGAGTG 2700
CAGTGGCATG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCCA GGTTCAAGTG ATTCTCCTGC 2760