EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-17169 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr20:30298940-30302430 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT+6.41
ArMA0007.3chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT-6.4
NR3C1MA0113.3chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT-6.63
NR3C1MA0113.3chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT+6.66
NR3C2MA0727.1chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT+6.63
NR3C2MA0727.1chr20:30300522-30300539AGGGACACTATGTTCCT-6.6
ONECUT3MA0757.1chr20:30301472-30301486CAAAAATCAATATG+6.07
SCRT2MA0744.1chr20:30300917-30300930AAGCAACAGGTTT+6.03
Tcf12MA0521.1chr20:30300386-30300397CAGCAGCTGTT-6.32
ZNF263MA0528.1chr20:30301121-30301142GAAGGAGGAAAGGGTAGGGAG+6.9
Number of super-enhancer constituents: 80             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30297989-30306428Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30297659-30302555Aorta
SE_02627chr20:30298935-30302240Astrocytes
SE_03109chr20:30298888-30300295Bladder
SE_03109chr20:30300340-30302004Bladder
SE_03156chr20:30297719-30302896Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30298709-30300518Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08789chr20:30300568-30301374Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08789chr20:30301412-30301896Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30299177-30301644CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30297906-30302187CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30297786-30302524CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30298286-30301513CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30299233-30301855CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30297928-30299605CD8_primiary
SE_22440chr20:30300078-30302154CD8_primiary
SE_23622chr20:30299616-30301375Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30297507-30302930DND41
SE_25933chr20:30297736-30302988Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30297523-30302354Esophagus
SE_27731chr20:30299207-30301978Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30299623-30301886Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30292078-30302768Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30297531-30302933Gastric
SE_33407chr20:30292055-30302718H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30297602-30302928HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30298314-30302759HUVEC
SE_39144chr20:30299659-30302488IMR90
SE_39443chr20:30298623-30299813Jurkat
SE_39853chr20:30298553-30299512K562
SE_39853chr20:30299665-30302194K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30298968-30299485LNCaP
SE_41648chr20:30299812-30300298LNCaP
SE_41648chr20:30300375-30301533LNCaP
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30298619-30302402NHDF-Ad
SE_44995chr20:30298915-30302371NHLF
SE_45708chr20:30298153-30302531Osteoblasts
SE_47264chr20:30298232-30302938Panc1
SE_47861chr20:30298999-30301565Pancreas
SE_48182chr20:30295496-30302360Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30297662-30302553Right_Atrium
SE_49684chr20:30298969-30299630Right_Ventricle
SE_49684chr20:30300304-30301507Right_Ventricle
SE_49886chr20:30297701-30302560RPMI-8402
SE_50155chr20:30297660-30302903Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30293396-30302434Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30299095-30302135Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30297674-30302904Small_Intestine
SE_53471chr20:30299501-30302915Spleen
SE_55108chr20:30297545-30299627Thymus
SE_55108chr20:30299660-30301480Thymus
SE_55770chr20:30298196-30302906u87
SE_56767chr20:30298139-30302861VACO_400
SE_57375chr20:30298201-30299628VACO_503
SE_57375chr20:30299655-30302830VACO_503
SE_57919chr20:30298236-30302326VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30298991-30302255HSMM
SE_64478chr20:30297660-30302800NHEK
SE_65412chr20:30299870-30301847Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30298623-30299813Jurkat
SE_66898chr20:30292055-30302718H2171
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30298196-30302906u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203029963030301917
chr203030100030302000
Enhancer Sequence
AGCACCTGGC ACAGAGCAAG TAACTACTCA ACCCATAGTA TCTGTTATTA TTACCAAAAA 60
ACACACTTAC ATTTCACTTT CTCATTCATG CCTCACTTAC TCTGGTGGCT TGGCATTATT 120
CTCTCAGGCT TATGGATGAG AATTTGAAGC TGATTTGCTT TGTGTTATGC CACCAGCAAG 180
GAGTCAAGCT GTCTCAAATG TGAGGCCAGA GTTTTGTCTG TGTATGTGTT GAAGGTGATT 240
AATACATATC AACTATAATG AATCTTGCCT GGTGTGTCTG GCAGCTGAGG AGAAGGATGG 300
ATGGCACATG TAGACTGATT CAGATGGCAG AGGGACACCA GCAAGACCCA AGGTGTGGAG 360
TATGGAAACA GACCATTGAG GGATGGGACT CAGTCTCAGT TACCACAATA TCCACAGTAT 420
CACTAGCATT TAGCACATTA CAAAGCATTT GTCAATATTT GCTGATTTAA CAAAAGAAAT 480
GAAACTCCAA GGACAGCTCC AAGCCACACA TCCAGCTTTA GGAGAGGCAG ACAGTATTGA 540
TAATACTGTG TTAAAAGCCA GAACATGAAT TCTAAGTCTG ATGCTGCCAT TTACTGTGGG 600
ACAAGACCCC TTATCTTAGT TTCCCCTCTG GAAACAGGGC TGAACATACC CACCTCTCCT 660
ACTTCACTGG GAAATAACTT ATAAAAGGAG TTTGGTAAAT TGAAAGTATT ATCATGCACA 720
TAAAAAGAAT AATCATGACA ATACAGACTA CTAAGACAGT AGAGTGTGAA TCCCAGCTCT 780
TCTTGGTACT AGCCTGTGAA GCTCTGGGTA TATCACTTTT CTCTGAGCCT CAATTTTCTC 840
AACCATAAAA TGAAGGTAAC AACACCTACT TTGCAAGATT TTTAAGGACT GGAGATAAAA 900
AGGACAGGCT TCAGAGTAAG AGAGACCTGG TTTCAAATGC TGACTCTGCC TCTGGCTAAC 960
TATAAGCCCT CCCAAATCTC AGTGCCTATA ACGATAAGGT TGTTGGGATA GTAACAAAAA 1020
CAGCGTCACT AAAGGCTGTC ACATAGTGAG CACTGGATTA ATGCCAGCAG TCACCTAGAC 1080
AATAGCGCAC TGGACGAGGG AACACAGTGG AGCGTTTAAA AGGGGGAGGT TGGAAGCTAC 1140
CCTCCCAGGC TTTGCCTCTT ACTAACTGTG CTACTTTGCA TAAATTGCTT AACCTCTCTG 1200
TACCTCAGTT TCCTCATGTG TGAAACAGGG ATAAAAGAAC CTACTTCAGA GTGCTGCTGT 1260
GAGAATGAAA TCTATTAATA CATGTAAAGC ACTTTGAACA ATGGCTGGCA TAGAGTAAGC 1320
ACTCAATAAG TGTTAGATAC TATTAATAGT AATGTTAACA ATAATATTAA TCACCAACTG 1380
GAGTAAGAGG GAGGGACTGT TTATCCTGGG ACATGGGTGT CCCATGAAAT AATTACAGAG 1440
AAGTCTCAGC AGCTGTTTGT AGGCAAGTTT TTAGCCTCGA AGACTCTATG GAAAGGACAC 1500
GAGGCTGGGG GCTCCTGAGC AAATATCCCA GTCCCACTGA CCAGGAGGCC AGTCTCTAGG 1560
GAAGCGAGTC AGGCTCCTTG GAAGGGACAC TATGTTCCTA TCCCTGCCTG ACTCGGGGGA 1620
ACAAAGGCAC GTGTGTATGT GTGTGTGGCC AGGGAGGAGG GAGGGGAATG TTTCCCTTTC 1680
AAGAGAGGAA CAAAGGATCT GAGGCATAGT TGAGTGCGTT CCAATCCCCT CCCAGGCCAG 1740
CTCCCATTCC TCAGATGATT GTCCAACAAG GTTTTCAACC TTCTAGCTTC CTCCTCAAAG 1800
GTGACTGGGG GAGGGGAAGG CAGGCTCTGT TTCACTCCAC CCTTTATCAT CAATTTCCAA 1860
GAGGCAGGAT TTATATGTGC CAAACCTCAA GTTATCTCTT AAGAATCCCA TCCTATGCAG 1920
GGGTGGGGTG GAATCTCCTA GGGGAACTCA GGGTTAATGG ATGACACAGG GCACCGCAAG 1980
CAACAGGTTT AATGCATCTC CAGGGGAAGT CCAGGACTGA AACTGCTAAT GCGTGATGGA 2040
GCCAAGGAGA GAACCCAGGA ATTCTAACTG ACCTCCCTCA CAGCCTAGCC TAGGGTAGGG 2100
GGTAATGGCC TGGCAGAACC AAGTAGAAAG GCATTTTCTA AATCTTGAAG GGATGATCAC 2160
AGCTGGAGGC AGAAGCCAGG TGAAGGAGGA AAGGGTAGGG AGCAAAGAAA GTAATGGACA 2220
AGAGGAAAGG CAGGGACACG TCCAAAAAAA GTAGTTTTTG GGGGGCGGAC CTCTAGGGAC 2280
ATTGCTTTCC AGTTTCCACA CTCTTGCCGG CAGGGCTGGG ACAGGAAGCA GTCCATGGAA 2340
GTCATCGCAA TGGCATTTCC TGAAGAGCTG GAGAAAAACC TCCAGTTCCG AGGGGAGCAC 2400
TGGAGGCTGC CCAAAAAGCT GTGTGGCTCA GAGTTCACTG TAAGGCTCAA GCTTGGCCCG 2460
AGAGTCTCAT CAGGGATGAA ACCAAATAGC AGACGGTCCC AAAGGCAGTT TCTTTATACA 2520
AAACCACAAT TTCAAAAATC AATATGTAAA AAAAGAGAAG CCAGATGATG TGAGTGAAGA 2580
GCCCTAGGAT GATATGAAAG CCTTAAAAGA ATGAATTAAT TCACCCAATC TTCAGAAAAA 2640
GGTGGCATTA CTATAGCCAT TTACAAGTTA AAAGACTTGC CCAAGGTCAC ACAGCAAGCT 2700
AGTAGTCAAG TTCCAATTTG AAAGTCCAAA AACTGCCTCT TCCTCCTGAT GTAACCTTGG 2760
GCAAGTCAAT TCATCTTTCT CACCTGATTT CTCTCCTTTG AAACGGAGAT GTCATCCTTC 2820
CTGCTCACCT CTCTGGGTGG TTATAAGGAT CAAAAAGGCA AGGTGGATCT GAAAGTGCTT 2880
TGGAAGCTGT AAGGTGTTAC ATAAATATAG GGTAGCACTA TTGTGGGCTC AGTGATAAAC 2940
TAGCCTGCCT TGACACTGGG TTTAGTTAAG GTGCTGACAT ATCTGTCAAC AGGAGAGAGC 3000
CATTTTAAAA TATAACTAAT GTGAAATATG CTGTAATGGT GGAATCCGCC ACAAGGCCTA 3060
AGGATAGAGA GAACCAGCAT TCCTTTATTG CCTACTTCAA ACCCTCCATC TTGCATAAAG 3120
GGAAACTGGG GACTGGGGGT GAAGTGACTT GGCCAAGGTG AGACTGAGAG TAGAACTGGG 3180
ATTCCAACTC CAAGACCAGT GCTTACACCA CCATTGCACA CAAACACTGT GGAGCTCCTA 3240
CTACAACAGA AATGCTGCAA GGGCCTGCTC TGAGATGTGC TGATGGGTCA CTATGGTATT 3300
TAGAAAAAGG AGAGTGGATG CTCAAGATTC CGTGAATGGG TCTCTGACAT GCGTTCTGTG 3360
GAAAGATAAT AAGAATAATG ATACCAACAT GGCTCCAGTC TTTATGCATC TCAGGTATAC 3420
CTCACTGTGT CTTTACCATC GCCCCCTGTG AGGCAGGTAT TATTATTTGT CCCAAGATTC 3480
AGAGAGGTAA 3490