EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-12272 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr18:32624460-32626390 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr18:32626150-32626163GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr18:32626151-32626164AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr18:32626152-32626162ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:32626152-32626162ATTAATTAAT-6.02
SPICMA0687.1chr18:32625000-32625014GAAAAGAGTAAGTA+6.03
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10641chr18:32624338-32625619CD19_Primary
SE_11219chr18:32615380-32634881CD20
SE_13218chr18:32625055-32627050CD34_Primary_RO01480
SE_14012chr18:32624168-32628261CD34_Primary_RO01536
SE_18765chr18:32619997-32625754CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18765chr18:32625861-32627311CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20265chr18:32617393-32627388CD56
SE_22664chr18:32624502-32626924CD8_primiary
SE_31264chr18:32624444-32625938Fetal_Thymus
SE_41431chr18:32624360-32625493Left_Ventricle
SE_41431chr18:32625534-32627379Left_Ventricle
SE_58663chr18:32606291-32632097Ly1
SE_60246chr18:32609135-32631901Ly4
SE_63019chr18:32608812-32631969Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr183262461932624914
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH18I035044chr183262432432627189
Enhancer Sequence
TGGGATTACA GGCGTGCCCC ACTGCACCCA GCCTTAGGCT TTATTTTCTA CCTTTGCCTG 60
TTGTATATAA AAATATCTAG CCCCCGTTGT TAGAGAGATA TTGTGAGGCT AAACTCCATA 120
TTTAAACCAA GTAATTTCCT AAAAGAGCTA TGTAACATAA GAATACTGTT GTTACTGAAA 180
AAGGGCTCTT GCAGGGGCTC TTGGACAAGA ACATGTCTCA CCTTGCTGGC AGCACAGGTG 240
AGAAGAGGAG GGAACACCTA GAGGATAGGG TGGCTCTCCT GAGCATTGTT AATGGGCAAG 300
CAGTCACTCT TTGGAGAAGG AGACATTACT GTTATAGCAT TTGCACCATA TTGTTCATAA 360
GTATGTCAAA TTTGGTTCCT GACCCACATC TCTTAACCCA GGTATCTGAT AGTGTAAACA 420
AAGCCCATTT TCACAGCATG GAACAGAGTG GGTGGCAGCT CATTATTGAA ACTAGCTTGC 480
ACCTTGATTA GAAAAGCAAG CTTCCTTTAG AAAATTACCC CTGGATTAGT AATTCCAATT 540
GAAAAGAGTA AGTACAAAAA TGGCTTAGCA GACTCATAGA GACATGTTTT CACTCCTGTG 600
TGATTTCCTT CTCAGCCTCA GCTTCCTCAC TGTGTTTATG AATGCTAGAA ATCTATGTAT 660
TTTAAGACCT GCTTAAAAAA TAAATGTGGT GTGGGCCATC CGAGGTGACA CTGTTTAATT 720
CACAGAGCGA ATGAGTCGTG CTCTGGATCT CCCTGGAGAG GATGCTCCCC ATAGCTCTGT 780
TTCATGCAGA TGCTAGTTGG AAATGAGATT TATTAACTGG CTCTCTGCCC ACTGCATCTT 840
TGTTTGTATA CTCCAGGCTT TTAAGAATGA ATGTATAAGT CTAGAGGACT ATTTCCACAT 900
GGGTGTTTTG AGCATGCGAC TACAGTAGCA CATGTTTCTG AATACTTTAA AAAAAAAAAT 960
TACTTGGCCC CAGGAAATGG ATTGCAGAGA AAAGCAAAAC TAAAATTTAA GCCTAAAGCA 1020
TTGGCCATAA CATCCAGCTT TGCCAGTTTT AAAAAACATG CTGTTGTTAA GGAAAACAAA 1080
GAGAAATATC GTAATATTGT GCATGTGTGT GTGTTTTTTT GTGCACGTGT GTGTATAAAA 1140
GAGTTGTGAA AGTGTGTTCC ATTCAATAGA GGCTATTGTA ACATGGCTCA CTTTTATCAG 1200
AACATAGGCT TCACATCACA TTCCCCAAAA CAGCAGTTAT AGATTGCAAA AGTCTACGTT 1260
CATGTCTTTA TTATGTATTT GTTAGTATCA TCTAGGTTTA ATACTGTCAA AGGAGGTTTT 1320
CCAAAAATAA AGATTTTTGT CCTTACTATT TTTCTTAGTG TTTGTAAAAA TCAGAAGATT 1380
ACTTGATGCT TTAGTACATG CCCAACTCTG GAACTTCTTT TACGGATTTT CAGAGCTTCT 1440
GTTAATGGAA TGGTCTTCCG GGTGCTCTTG CTTTGGGGAG AGGCTCACTC CTGCTCTGTA 1500
GCTGGTATCT GTTGACAGTG CATTATCTTA GAGCAGTGCT GTGAGATTGT CCTCTGGAAT 1560
TCAGAAGGTT GATTTCCTTA TGCAGCATCT TTTCTTTATT TACAGGGACC TCTTGAAGCT 1620
GCAGTGAATA ATTCTAGATT AATTGGAAGG GGAAATTTGG GACTAATTTA AATATTCTGT 1680
TTGGTTTAGA GAATTAATTA ATTTTACAAA TATTTGAAAG TCTGCTCTGG CCAAGGTCTG 1740
TGCTAGATGC CCCTTGAAGG ATCTTGAGTC CTAGTAAAGT CCGATGGAAA ACCGCTCATT 1800
TTGTAAAAGA CTTACAGTGT TGGTATTTTG CTTAGTCTGA TAGCGAAAGT GGTTTGCATT 1860
TCCTGAACCC CCAGTGACCC AAAGGGGGAA AAAAAGTTTC TCTGAAGTCC AGTGTGCTGT 1920
AGGAAGCTAA 1930