EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-06643 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr12:89738370-89741600 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:89740527-89740548AAAAAGAAAGAGAAAAGAAAT-6.07
IRF1MA0050.2chr12:89740521-89740542AGAAAGAAAAAGAAAGAGAAA-6.27
RFX5MA0510.2chr12:89739671-89739687GGTTGCCCTAGTAACC+6.25
SPICMA0687.1chr12:89740280-89740294TACTTCCCCTTTGT-6.47
SPICMA0687.1chr12:89741405-89741419TACTTCCTCTTTGG-6.51
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00690chr12:89736686-89749897Adipose_Nuclei
SE_25495chr12:89737202-89749426DND41
SE_26301chr12:89738766-89749678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27644chr12:89739368-89741580Fetal_Intestine
SE_28566chr12:89739453-89741345Fetal_Intestine_Large
SE_30143chr12:89738982-89742175Fetal_Muscle
SE_31980chr12:89739391-89740790Gastric
SE_34489chr12:89739228-89741819HCT-116
SE_35929chr12:89740392-89750597HMEC
SE_38477chr12:89738992-89749161HUVEC
SE_41177chr12:89739166-89741735Left_Ventricle
SE_42423chr12:89739274-89741688Lung
SE_43823chr12:89737701-89749582MM1S
SE_45220chr12:89740269-89741084NHLF
SE_48925chr12:89739317-89741128Right_Atrium
SE_50215chr12:89739271-89741701Sigmoid_Colon
SE_52692chr12:89739104-89741673Small_Intestine
SE_53425chr12:89738103-89741838Spleen
SE_57109chr12:89739987-89741122VACO_400
SE_57109chr12:89741142-89741558VACO_400
SE_67349chr12:89737701-89749582MM1S
SE_67873chr12:89740020-89749518u87
SE_68915chr12:89739205-89740987H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr128973919489741546
chr128974008489740418
chr128974042789740813
Enhancer Sequence
TTGCTAATTT GCTGGTCAGT TTACCTCTCT TCTTCTGTAG ACCTGCACCA TATATATGTC 60
TTCTGCCTCT CCTCCTTGCT TCTTCACACC CTTCCCCTTT CCCCTGACCC ACCTCCCTCT 120
CCCAGTTTGC CTCTAGGAGG GATAAGAGTG AGGAAGTGAA CTTCTTTGGG GCCAGTTTAG 180
TTGTGTCATC CTGAAAGGGG AGTATGGGCA AGGGTCAGGG TCAGGCCCTA TGCTAGCTGG 240
TAGCCATTTT AGAGATACTT AGGAAAAGTA GTTTTATAAT TTAAGTGCCA ATGGGACCAA 300
GGAAGAGCAA CTTCTCTGCG GAGAAGGAGG ATGGAAGTTT ACCCCCGGTG GACACCTCTC 360
TGACAGCACA CCAGCTGGGG CCTCCCATGT GGCTGTGGAA TTCACATGGA ATTTGGCTAG 420
TCATTTAACC TCTGCTTCCT CCACTTCCTC AGCTGTATAA TGGGGACAGC ATTTCCTAGC 480
CGACATCATG AGACTTTATA AAGGGGAGCA AATACTGATG ACAAGCAGTT TCCAACAGGA 540
AGAGCCAAAG GCTCAAGGTT CAGTTCTGCA GTAACAAGCA CTGGATATGC AAACCTTCTC 600
TAACATTATG TGTCAGGTGT CCCATAAAGG TGGCTTTAGG CTTTATTGGC CTTTCTCTGC 660
CTCAGTTTCC TCTTTGCAAA ATAAAGATAA TAATAGGACC TATCTCACAG AGCTGTTTTG 720
AAGATTAAAT GAGATACAAA GTATAGTATC TGGTACTCAT GATAAATGTT AGTTATTTGT 780
TTCACCTGCT CCGCACCTCA TTTTATCATG TAATAAGTGT CACCAATCCA TGAACAGAAG 840
CTGGAATTAT GAGAGAATCC TAGAATGGGA GGTAAAAACT CCCTCATTTT TACAGACAAG 900
AAAAAAGAAA TGCGGTAAGA TTGGGTGCCC TGCCCAGGGC TACCTGATTC ATTAGCAAGA 960
AAGCAGCAGC TACAGTTCAG GTCTCCTAAT TGTCAAGGTT GGTGCAAGTC TCAGTTTTCA 1020
TTCCTTTGAA GACTGTGTTG GTATTTTTAT CCCCAGATAA CCCTTTTTCA TTCCTATTTT 1080
AACGCTAAGA CCAGTTCATA CTATTAACCA CTGCAATCTC TGTCTCCTGC AGCTCCCAGG 1140
AAACCTGCTG ATAACCTCCC CTTCCCAAAA GCCATACCCC ACCCTACCCC CCTGCCCCTG 1200
CAAAAGGCCA GGAAAGGTAG CGCTTTCTCA GAGACCTGAG GAAGCTACTA ATGGGGACAG 1260
CAGGTGAGGA AGGAGGCGGT GGAACTGCAG CTGCTGGCAA AGGTTGCCCT AGTAACCGTG 1320
CGGGCTCCAT TCAGGAAGCC AGCCCAACTC CAAGATGCAA AATGATCGCC TTCACGCGGC 1380
TACTGCAAGC ACAAAGGAAC CAGAGGAGCC CTGATATAGC TGGAAGAAAG GGAGGCACAG 1440
AGAGAGGTGG GGGCCCATGC TGTCAGTTAC AACCTTCCAC CTTCCACAGA AGAAAAAGAA 1500
GGAAAGAGAA TAGCTCTTTG AATCTTCTGG CCTATGTGAA CCGTAAAAAC CACCCATTTA 1560
ACATGAGTCC TTTGGTGAGA ATAGAGGGAA ACAGGCACCC CTCTGTTCAC CAGCCTTCTG 1620
AAACAATATG TCAGGAGAAG GGGGAGAAAC CTCAAACATT GCAACTTTAT GGAGGCTCTA 1680
AGCTCTTCAT ACTCTCTCTC TCCTTTATTC AGACTGGTGA CAAAGACCAT TTGCTCCCAA 1740
TTTATTGGAA ACTTTTTTTT TTTTCACAGC TTGAGCTGCT TAGATGCAGC GAGCTCCCTC 1800
TCCCCAAATT GCAGTCAGAC ACTTGCTGAA TGGGCCAGGC TCAATTATGC TCCCTCCACA 1860
GGTTCAGCTC ACACTGTGAC CCTGCATGGC TTCCTGCTAT TCATATGTGT TACTTCCCCT 1920
TTGTGGTAAT GGCTTGTGGC ACTTAGCCAG AAAACATTAT TAATTTCAGA AGTGGACTGA 1980
CAAACAACAA ACCCACAGTA AAACGAGAGG AAGTGCTGGG GAGGCCAGCT GTCGGCTTGA 2040
GCCAAGCAGT AGGAACTCAA TGTATGCAGG TTCTAGGAGG AAAGAGATAA TAATCCACAA 2100
AGAGGAAATG CACTAAAATT ATCCACAGCC CATATTTTTT TAAAAAACGA AAGAAAGAAA 2160
AAGAAAGAGA AAAGAAATCA GAGAAAAGAA AGGGGGGAAA AGCACCCAGC TACTTGAGCT 2220
GCAGCTGGAC AGGAAATTGC TAACGCTGCT TGCAAATCCT TACTTTGAAC AGGCAGTTTA 2280
GGGAATGCCA GGAGCGGAAA CCGTTCAGAA CTGGATTAAC ACGAGCCAAG TTGAACTGCA 2340
ATCCACTTCT CCTTTCTGTG CTCTTGCTGA CTTGGGACAC CCAAATAGGA CAGACTGACT 2400
TGGTATATAT ATATATTTGC ACTATTTCTG TTTGCTTTTT ATACTTAGTT GCTTAAAAAT 2460
CACCATGGAC AGTTTTATAT GATTGCCATC GAATGAAGGC CACTTGCCTC CTAAGTTAGT 2520
GTAGACGACC AAGCAGTCAA CTCATGTGCC ATGTAGGTGA AAAGCTCATT CTTCTCCCCA 2580
CTTCACATGA AGGGACTGAG CTCATGCAAA AAGAGCCCCA AATATAAGTA CGTTCTAGTT 2640
CTTTTGATTC CATACACCTG CCTTTTATTT TGGTTTGTGT ATTTTTACAT TTGAGGTAAG 2700
GAGAGGGTAG GTCCCAAGAA AAATGGCAAG ATATAAAGTC TTTAGCTTGA AAAGAAACTA 2760
AAATAATCCC CACAAGTTTC AATAAGGGTT TCTGACCCAC ATCCCAAGCC AGTTAAACAA 2820
AAAAGCACAT TACAACAGGG ATGACAAAGT TGCCTCCTAA GTGCCAATGT AAAATTCTAA 2880
AGCCATATCC TGACACGGTG AGGAAGCTTA GATATGCCTT GCCATGCGCA TGCTAGGGGA 2940
AAAAGTGGAG ACATCATTCT GGATTCAGCA TTCTCACACT AGGATATCTG CAGGTAGAAT 3000
TGCCCATGAC AACAGACTGG AAAAAGAATT ATCCCTACTT CCTCTTTGGC ATTATCTCAG 3060
CATTATAAAG CAGAAGATCC TGACAGTGAA GGATAGGGAG GAGGTTAACA TGTGGCTGTC 3120
ATCTTGGTAT TCTGCTACAC CTCTCTGTGG TTAATATCCA AATTGTATTC CTCAGCAAGC 3180
TATGCTCTAT AGGTTCATTT TTCTTCAGGG GCTTTAAAAT CTTAAGCCGG 3230