EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-06073 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr12:53780260-53783190 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs9739640chr1253783174hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr12:53781072-53781086ATTGTTTACTTTTG-6.63
FOXP1MA0481.2chr12:53782967-53782979GTCTGTTTACAT-6.44
FOXP2MA0593.1chr12:53782968-53782979TCTGTTTACAT-6.02
Foxd3MA0041.1chr12:53780440-53780452AATTGTTTGTTT+6.22
IRF1MA0050.2chr12:53780731-53780752TTTTTTTTTCGTTTTCTTTTT+6
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00711chr12:53779432-53786230Adipose_Nuclei
SE_26373chr12:53779513-53782949Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26935chr12:53782027-53782789Esophagus
SE_27963chr12:53781910-53782514Fetal_Intestine
SE_31931chr12:53780646-53781099Gastric
SE_31931chr12:53782342-53782871Gastric
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr125378088153780941
chr125378295053783049
chr125378028253780367
chr125378257553782629
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I053386chr125377978553786123
Enhancer Sequence
ATCTTTTTTT TTTTTTTTTT TTCATTTTTG AGACTGAGTC TTGCTCTGTT GCCCAGGCTG 60
TAGTGAGTGG AGTGGTGCAA TCTCCGCTCA CTGCAACCTC CCCTTCCTGA GTTCCAGTGA 120
TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC AGGTAGCTGG GATTACAGGC GTGTGCCACC ATGCCCGCCT 180
AATTGTTTGT TTAATGGAGA CGGGGTTTCA CTGTGTTGAC CAGGCTGGTC TCGAACTCCT 240
GACCTCAAGT GATCTGCCTG CCTTGGCCTC CCAAACTGCT GGGATTACAG GTGTGAGCCA 300
CTATGCCCGG CCTGACTTTA TCATTTTAAA TTCCATTGTA TGGAGCTAAT CTTTAATAAA 360
GCACAATAAA AGGATACACA TACATCTTTA TATGCTGGCA CAATTATACA AATACGGAAA 420
ATAGTTTAAT ATCACCAAAT AATATCACCC AACTTCTAGG TTTGTTTTTT TTTTTTTTTT 480
CGTTTTCTTT TTTGGGACTG ACTCTAGCTT GTCTCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGTGCGAT 540
CTTGGCTCAC TGCAACCTCT GCCTTCCGGG TTCAAGCAAT TCTTCTGCCT CAGCCTCCCG 600
AGTAGCTGGG ATTACAGGCA CGTCCCACCA TGCCCATTAA TTTTTTGTAT TTTTTTAGTA 660
GCGATTGGAT TTCACTGTGC TGGTCAGGCT GGTCTCGAAC TCCTGACCTC GTGATCCGCC 720
CGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACTGCGCCT GGCCACTTCT 780
AGTTCTTTTG GCATATATAT GTGGGTTTAT AAATTGTTTA CTTTTGTTAC CAAGTTCTCA 840
TTCCATTTAA CTGATTCTTA CATAAGTGAG GGTAGCAAAT AGGCAACCAT ATTTCCTGCC 900
TCCTGCAGTT TTGGTAAATC TAGGGGGAAA GTCTGCTTAA GTTCCCTGAT TTCTTACATT 960
CCTGTGGTGT GTTTAGAAAT ACTACATGTT GAGCTTTAAC AAGACAGTAA TTTTCTTAGT 1020
TAATTGAAAT CTTAGAATTG AAAGTTAGAG CTGGAAGGGA CTGAAGTTAT TTAGTACAAC 1080
TGCCTTATTT TCTAGATGAG GAAATTGAGG TACAGAGAAT CACTTAATGA GACAACAGCC 1140
AGAGCTGAGG CTAGTTTTAC TAGTCTAGGG TGCAACCTGT TTTAACTAGG GACTTGAACA 1200
ATTCTTTAGA TTGTTAAAAA TGTATTCGAG CCAGCCTGGT GGCTCACGCC TGTAATCCCA 1260
GCACTTTGGG AGACTGAGAC AGGCGGATCA TGAGGTCAGG AGATCAAGAC CATCCTGGCT 1320
AACATGGTGA AACCGCATCT CTACTAAAAA TACAAAAAAA TTAGCTGGGC GTGGTGGTGG 1380
GTGCCTGTAA TCTCAGCTAC TAGGGAGGCT GAGGCAGGAG AATGATGTGA ACCTGGGAGG 1440
CAGAGCGTGC AGTGAGCTGA GATTGTGCCA CTGCACTCCA GCCTGGGTGA CAGAGCGAGA 1500
CTCCGTCTCA AAAAAAAAAA ATGTATTCGA AAAGGTGTTT TTGATTTAAG ATTTAATGCT 1560
CTAAAACTGA CAGATGTTTA TAAAACATTT ATAAAAATGT TTTATAAACT AAACATTTAT 1620
GGGAATAGAA ATGGGAAAAG TTTTATAAAA ACTGACCTCT ACAACGTAGA AAATTAGACA 1680
CTTCTGGGCA ACCTACACCA TCATGTTTAT TTTCTATTTG CTCTTAGATT GAAGTGCCCG 1740
GTTTTGCTCT TCTTCAGAGC AAACTGTGGG ATTATTCCTG TTAATAATTT GGATCCTTGC 1800
AATTTCTAAA AGGCTTATAA CTTAGGGTTT AGAGAACAGT TATGAGGCAT TCTCATTGCT 1860
AAATCATGCT CTGGGGAAGT CTGCCATTTA ATATGTCATA GACTAGGGCT ACCTAGTTGT 1920
TACTGATGGT GTTTGAGCTG AAGAAAATGC GTGTGTGTTT CTGTAAGGTA AGAGGAGCTT 1980
GACATTCACT AAGGAGATAA TGAGGCATTG ACAGGCTGTT TTGTAAGAGT TGAGATTGTT 2040
TGCTTCATTA ATAGGGGTTT TTGAAGATCC AAGTTTTCTC CTTTCTGGCT AGTAATAATT 2100
GTGTAGTATT TCCCCTTTAA TTGATATGAC TTCATCCTTA AAGAAAGATA ATAAAATCAC 2160
TTCCTAGAGG CTTACTCCTT TTTCAGCTTT TGCCTTCCTG CTGGCAAAAG TATCTTGTTT 2220
TGGCCAGGCG TAGTGGCTCA TGCCTGTAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCA AGGCAGGCAG 2280
ATCTCTTGAG CTCAGGAGTT CAAGACCAGC CTGGGCAACA TAGGGATCCC CCATCTCTAC 2340
AAAAAATATG AAAATTACCT GAGCATGGTA GCACACGCCT ATAGTCCCAG CTACTTGGGA 2400
GGCTGAGGTG GGAGGATTGC CTGAGCCCGG GAGGTTGAGG ACGCAGTGAG CCATGATCAC 2460
GCCACAGCAC TCCAGCCTGG GCAGTAGGGT GAGTCCCTGT CAAAAAAAAA AAGTATCTAA 2520
TTTTACCCCC TTCTCTGATA GTTATTTTAC TGTAAAATTT AACCTTTTTG CAGTATGTTC 2580
AACTTCTTGG TACGATGTAG AAAGAACATT GGATGTGAAA TGTTGTATGA TACATGTATA 2640
TATCACTGTA CAAAATGAGA TATATTACAT GATTGTGGAA GATTGCAGCT TCCATGGTGT 2700
TCACTTAGTC TGTTTACATT CATTATTTTT TAAAATGATC TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 2760
GGGAGACGGA GTTTCATTCT TGTTGCCCAG GGTGGAGTCC AATGGTGTGG TCTCGGCTCA 2820
CTGCAACCTT TGCCTCCTGG GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC GAGTAATGCC 2880
CACCACCACG CCTGGCTAAT TTTTGTATTT TTAATCGAGA TTGAGTTTCA 2930