EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-05580 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr12:13323150-13327660 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12228756chr1213326456hg19
rs75432890chr1213327597hg19
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:13325009-13325027CATTCCTCCCTTTCTCCC-6.36
GATA2MA0036.3chr12:13323200-13323211ACAGATAAGAA-6.14
Gata1MA0035.3chr12:13323200-13323211ACAGATAAGAA-6.62
MEOX1MA0661.1chr12:13327383-13327393GTTAATTAGC-6.02
NEUROG1MA0623.2chr12:13327546-13327556GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr12:13327546-13327556GACATATGTC-6.02
NFAT5MA0606.1chr12:13326325-13326335AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr12:13326325-13326335AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr12:13326325-13326335AATGGAAAAT-6.02
PBX1MA0070.1chr12:13327606-13327618TCATCAATCAAT+6.44
PRDM1MA0508.2chr12:13327067-13327077GTGAAAGTGA-6.02
RREB1MA0073.1chr12:13324509-13324529GGTAGGGTGGTGGTGGGTGG-6.58
RREB1MA0073.1chr12:13324092-13324112TGGCAGTGGGTGGGTGGGGG-7.51
RUNX1MA0002.2chr12:13326808-13326819AAACCACAGAA-6.32
ZBTB18MA0698.1chr12:13326266-13326279CTTCCAGATGTGT+6.16
ZNF263MA0528.1chr12:13325012-13325033TCCTCCCTTTCTCCCACCCTC-6.02
ZNF263MA0528.1chr12:13323840-13323861GAGGGAAGAGGAAGGGAAGAG+6.1
ZNF263MA0528.1chr12:13323828-13323849GGGGGAAGCGGAGAGGGAAGA+6.33
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00070chr12:13322001-13329284Adipose_Nuclei
SE_02366chr12:13324113-13327858Astrocytes
SE_26715chr12:13323239-13323809Esophagus
SE_26715chr12:13324024-13328761Esophagus
SE_36302chr12:13324133-13329267HMEC
SE_45692chr12:13323910-13328954Osteoblasts
SE_55863chr12:13323889-13330257u87
SE_64909chr12:13324369-13329500NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr121332403413324099
chr121332461513327060
chr121332596213326157
chr121332658313326856
chr121332735413327623
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH12I013170chr121332324013323809
GH12I013171chr121332412813329500
Enhancer Sequence
TCCTCAAGAA TATCTATGAA ACTTGAAGGC AGAGGAAAAG ACATTTTGAG ACAGATAAGA 60
AGTCAGAAGG CTTAACTTTA CACACCTTTT TTTTGGAAGT CATTTGAAAA CACACTCCTG 120
CAAAATGAGA AAGTAGAACA AGCCAGAGGA AGACATAAAA TTCCAGAAGC AGTGTATTCA 180
ACCTGGAATC ATAGTGAAGA GTAACACACA ATGACAGTTT TGCTGCAGGT CTGGAGAGAC 240
CAGTGACACC AGTATAGATT TTACAGCCTT TCAGGAAACA CTAATTTGTG TCTTCAAATG 300
TTTTTTGATG ACATGTAAGC ACAGAGACGT TAAATCAGTT GGCCAAGATC ACTCAATGGT 360
AAGCAGTAAG TTAGCGATCC GACTCAGCCT GTCAGGCTTT GGAGGCTGAG CTCTTACCTC 420
TTACTATACA GTGCTTCTCC TGGTAACCTG CCTTAATGTT ATTAACGGTT TCCATTAGGA 480
AAATGAAAAT AGTGATATGT TCCATGTATG CTAAACCCTC ATTTATTATA GTCAGAATGC 540
AAAAAAACGC TATGTAAAAT TGCTAAATTA AGAAATAGCT TTATAGAAAT CAAGAAACAG 600
TTTTTAGAGA AATAAAAGTA ATCACCAGGA GAGAAAACTC AAAGAGAATG CAAGGTGATT 660
AGGTAGAGGG AGTGGGCAGG GGGAAGCGGA GAGGGAAGAG GAAGGGAAGA GACTGTTGCT 720
TTGCATTTTA AATCCCCTGC ACCTTAAAAA AATTAAATTA TGTGCATGAA TTACTTTGCA 780
AAACTGTACA TTTGTGTATC TTTTAAAAGG GTAAATAGGG CTTGTTTGGA AGATAAGCCA 840
AAAGGGGAAT GATAGTAATG TTCAAAGGGT GAGATGAGTT GGAAGTTCAT GGCCTGATAG 900
GGAGTGGTGT GATCTAGTGG CTGGACTCTA GGGAGGTTGT TTTGGCAGTG GGTGGGTGGG 960
GGGAAGAGGG GGAGCGGCTG GAGGTGACTC TGGAAAAGTG GGCTAAGGCA AGGCTGTGGA 1020
AAGCATTGAA TGCCATGCTA AGAAGTTTGG AATTTCCTCT GTTGACCATG GGGAACTATG 1080
AAAAAAAGTT TTGAGCAACA TGATTCCATC TGTGTTTCAG AGGAATCATC CTTATGGCAA 1140
AATGTGGTAG GATTTGGAGT GTGGGAATGG CAGGAAGCGG GAAGGCCAGA TCAGAGATGG 1200
TTACAAGCTT AAGGGACTCT TTAGGGTCCG AATTAAGGCT TTCAACCTCT GTAGAAAACT 1260
GAAGTTCCAT AATTGCAACT TGAATCAAAA CTCTTCTACC ACTTTCCTCG CCCTCCTGTG 1320
GACTGGGGTG TCCTCTGCCC AGGAAGACAC TGATGGGGCG GTAGGGTGGT GGTGGGTGGG 1380
CCACAGGGAA CTGCCCACCC CTCCTCATTC AGGGGCCACT AGAACCTCCT GTCTGGTCCA 1440
AATCTCACTT CAGATTTTTA GAATCTTACT ACAAACAATT TTTTGGCCAC ATTTCAAGAC 1500
ATGTCTTAGT TTTTAGCACA GGATTTTTAC CAATCTCTCC CTAGCCCCCT CCACACCCTT 1560
TAATGATTCC CTTGGTTTTT ATAAGTAGGT TTCCAGTTTT TTCCTCCTGC CTGCCAGCTC 1620
ATCTAAGAAG TAGGATTTTT TTTCTCCTTT TTTATTATTG GTATTTAAAA AATAATAAAA 1680
TGGAAAAAAT GAATGTTTTT GCACTTCTGG CCTCTTGCTT TCGAGGTTCA CACCCACTGG 1740
CGCCCTCCCT CTGAGGCTCA CTAACATTCC ACACTGCTGG GCGTGTGTCT GTGTGACTAG 1800
GATTCCTTGG CTGTTGTCTC CTGTCATCAT AATTTCTCCC TTACCTCCTC ACCTACTTGC 1860
ATTCCTCCCT TTCTCCCACC CTCTGGTTGC CAGGCAACAC AGCTGAGGGG CAGGAGGAGC 1920
TGGCAGGCAG TGCCCCCATG GAAATACTGG CTGCCTGTCT TCCTCTCCCA GCAGCTTGGC 1980
TGGGAGTTGG GCAATTGCTG AAGGTCAAAG GCAGCCATCC ATAGTTGTGT CATTCCCTCC 2040
ACTAGGTATA AACCTGACAC AATCAGGGAA ATACTTGAAG GTAGGGAATG GGGTAAAGTA 2100
AGGCAGTTAG TTTTCCCTTC ACACCCAAGA GGCTGGCGTG ACTCCTGCCT TCCGGCAGAA 2160
GAGGGTAAAG GTGGAGATGA ATTGGCCTTT CTGCGTTTCA GAAATGTGAA TTTCATTTCC 2220
TTCCACACCT CTCTGTCCAG TGGCTGGGCT TGAGAATTAG AGTCGACCCG GCAAAATGAC 2280
AAATTCACTT GTTAGCAGAG GTTGAATTTT TTGAGTTGGG GCCCATTTCT CTAGTACCAA 2340
ACATGATCTG GGGACTCGCA GCATGGACAG CCTCTGGGAG CTTGTTAGGA ATGCAGACCT 2400
CAGTCCCATC CCAGACCACC GAAACAGAAG CTGTAGTTTT TCAGAATGAC TGGGTAATTT 2460
GCATGCATGC TGATCAAATA CTGTCGATTC GGTCTTGTGT TCTTGAGACT TCTTCCTTTC 2520
TCCTGCTCAG TGGGGCGTCA TGGAGTCCTA TGTTGGGGTC TTTCATGGGT TTACGGAGAG 2580
ATGAGTGAGC AAATGCAGAG ACTGTCTCAG CCTGACACAA ACCCCTTCCC CTTTCTCCAT 2640
CTATCCTTAC CCTACACAGG TATGAGACAA GGCATGTCCA GATATGTTAC CTCCCTTATC 2700
CTCACACACT CCTGTGTCTA TTTTTAAACA ACGAATCCCA ATTTTATTGA TGAAGAAATG 2760
ACCTAGGTTG TTGAAACTTA CAGAGCTTCA ATGGACTCGC CCTGGTGATT ACTGAACAGC 2820
TTGCTTTCAC CTTCCTTTGG TATGTGTCCT AGGCTAGAAA TTCTGTCCTT TTAAACACGT 2880
AGCTCCAAAG AGTCATTATT GAAAAAAAGC AATCAGAAAC AGAATGTTGG GTTTGGTTTG 2940
AGTCATAAAT TCCACCATGT AGGGATGAAA TTAAGGACTT TTTCCTGAGC CTCTGCAAAT 3000
GATTCCAGTA GTTCAGAGGC CCTTTTGAAC AAGAGGTTAC ATGGATTGGG TTTCAAAGAA 3060
AAGAATGTCG AAAGACATCT TCCAGCTGAG AATGGGCTCC AGATGTGAGC ATTGCTCTTC 3120
CAGATGTGTG GACGAATGGA GCGGGACTGA GATGCCTCAC ATGTCTGCAA CATGAAATGG 3180
AAAATCCTCT CTCAGCCACA GGGGAAAGTA GGACAGGGGG AAGACAAATG GAATCCAAGT 3240
TAAACTCTTC AAGGTGGGGC CAGACTAACT CTAAGAAATC ATTCCCAGGT GGGCTGATAT 3300
TTTACGTATG CAGTATGTGT AGAGGCCACA CCTCAAACTG TGCTGCTGAG CAGAAACTCA 3360
GAAGGTATTG TGTCTGCAGG AACTCACTCT TCTCAGACCT GCATAAATCT GATTCAGCCC 3420
CTTAGAGGAG CCTCACTGAG AACTGTTGAG ACTACAGGCA GATCAAGCAG GACAGGCGGC 3480
GAGACTTACT CAGCGGAGCT GAGAACAGAG CCCAGAATGC GGAAGGGGAA GGAGCCAGGA 3540
GTCACACAGT CCTTTCTTTC TTCAGCTTCT GAATCAGCAA CTCATTCTCT CGGGGATCGC 3600
TGGGTTTGTT TCTTTACAAT GGCTAGAAGG TCCCATGTTT CTCAGATGAG TAAATTTGAA 3660
ACCACAGAAA ACTGAGGCCT TGTGGCCAAG TCCTCTTGGT TTGTCACATC TCTGAAAATC 3720
TGAGCCATTG TCAAACTCCT GGCTGCAGGG AATTAAACCC TTTATTTCCC TCTGCCAGCA 3780
TCTTCACCTT CTCCAGGAAG ATCTGCCAAA GGACTGCTCC AGGTGCAGGT CCACCCACCT 3840
CCCCACTTTC CCAAACCTTC CTCCTTTTCC ATTTAGAGAC TGTCCCTGAG TCCCAATTTC 3900
CATGTCACTC TGGAAGTGTG AAAGTGATCT TTATTCCCCA TACCTTCTCT ATTTTTAAGC 3960
AACACAGTTA ACTCACTCTG TACTGGTTCA GCTGGTGAGG ATCCATATTT TTATTTTCCC 4020
CTAAGAGTTC CCAGCCTCTA AACAATACAT TCTGACAAAA CAGGTTAATT TAAGTTGCTA 4080
ATTATTTACA TTATTAAAAC ATTATTACAT TTGCACATGT AATAATGTCT ACATACTGAT 4140
TACACACACA CACACACACA CACACAAACC TAAACTGGCA TAATCCCTGG TTAATATGCT 4200
AATAATAAAA TTGATGATTA CTAAGTTGAA AAAGTTAATT AGCTGTCTTC TGTTTTTGTA 4260
TGTGGGGCCT AATCCTCCCT GTGATCTTGG GCCCAACACA TTTCTCAAAG GCCACACCAG 4320
TCAGAAGGTA GATTTTCCAG TTGGAAGGTA TTGAGAGCAT TGCAGGGGTA AACCCAGTAC 4380
CAGTCCACCC TGGGAGGACA TATGTCATTA TACTGAGAAT CAAGTATCAG GAAGTATAGT 4440
ATCATCATCA TCATCATCAT CAATCAATGA CTAACTGTGA GTTTATTTCC TTTTGTTTTT 4500
ATTTTTTAAT 4510