EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-02870 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr1:223891620-223895120 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr1:223894355-223894366AGGAGATAAGA-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:223894565-223894580GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SP2MA0516.2chr1:223893170-223893187ATGTGGGAGGGACTTAG-6.73
ZNF263MA0528.1chr1:223894171-223894192GAAAGAGGGAGGGGAAGAAAA+6.35
Number of super-enhancer constituents: 37             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223891964-223894610Aorta
SE_02306chr1:223892116-223896302Astrocytes
SE_04026chr1:223892317-223894515Brain_Anterior_Caudate
SE_05972chr1:223891995-223895701Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223892580-223894588Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23408chr1:223892519-223892911Colon_Crypt_1
SE_23408chr1:223893759-223896170Colon_Crypt_1
SE_26209chr1:223892263-223896172Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223892455-223896502Esophagus
SE_31491chr1:223892450-223896280Gastric
SE_33950chr1:223892039-223897144HCC1954
SE_34545chr1:223893587-223897272HCT-116
SE_34979chr1:223893945-223896369HeLa
SE_36294chr1:223892209-223896197HMEC
SE_37129chr1:223886879-223896561HSMMtube
SE_38254chr1:223892197-223897487HUVEC
SE_38957chr1:223892076-223894679IMR90
SE_38957chr1:223894705-223896262IMR90
SE_41495chr1:223892178-223896347Left_Ventricle
SE_42269chr1:223892060-223896221Lung
SE_44530chr1:223892152-223896327NHDF-Ad
SE_44904chr1:223892205-223896189NHLF
SE_45872chr1:223889824-223896323Osteoblasts
SE_49408chr1:223892167-223893562Right_Atrium
SE_49408chr1:223893604-223894625Right_Atrium
SE_50365chr1:223893595-223896281Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223892369-223896155Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223893884-223894596Small_Intestine
SE_53249chr1:223894745-223896091Small_Intestine
SE_55958chr1:223886755-223897239u87
SE_63671chr1:223892313-223896169HSMM
SE_64794chr1:223894664-223896174NHEK
SE_65644chr1:223892460-223893201Pancreatic_islets
SE_65644chr1:223893499-223896161Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223886755-223897239u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1223892629223893260
chr1223893295223893662
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223704chr1223892008223897501
Enhancer Sequence
ACACACTCAC ATCCACACAT GCCACAGACC CTCTCATGAA CATCTCATGA AACATGTTTT 60
GCTGAGTAAA GTTTGTTTAA CATTGAACTA GGCCAGCCGT GGTGGCTCAC ACCTGTAATC 120
CGAGCACTTT GTGAGGCCAG GGCAGGCAGA TCACTTGAGG TCAGGAGTTG GAGACCAGCC 180
CGGCCAACAT GGTGAAACCC CGTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCAG GGCATGGTGG 240
CGCATGCCTG TAATCCCAGC TACTCAGGAG GCTAAGACAC AAGAATCACT TGAATCCAGT 300
GGGTAGAGGT CGCGGTGAGT CGAGATCACG CCACTGCACT CCAGCCTGGG CAACAGAGCA 360
AGACTCTATC TCAAAACAAC ACCAAAAAAC ATTGAACTGA AGACCCCTAA AGTTCCATCC 420
AACCCTGAGA TTCTTTCATA TGAATCTCAA AGTGTGAAAC GCCTCAGTCG CCTAGGGCCT 480
TATTCTACAG AAGGGAAGTC CAAAGGCTCA TTTGAATTGC ATTAGCAACT CGAGCTATAT 540
TTGTAAGTCT CCTCCCATCT GAGAATTTCT TTGTCAGCAA CGTTTTCCCT ATTCTACAGA 600
TGGAGAAATT GAGGTCTAGG AAGACCAAGA CACTTGTCTC AGACCCACAG TTGAGGTCTT 660
AGTTTGCCAC TGAGTCACGG TCCGTGTGAC ACAAGGATGG AAAACCAAAG GGAGCCATAG 720
CTGAGGGAAG GGAAATGAGA AGGGTATCTG AAATGTCGGC CCTGCAATAA GGTGGGCCAC 780
AGCAATAATG AGATGTCACT GGGCTCAGCC CTGTGCCTGG AAGGAGGGAG GTGGTCAAGG 840
ATATCAACAA AAAAATAGTT GCTGATCCCA GGAGAAATAC AACACTGAAT TGAGGGGAAA 900
ACACAGAAAC ACATCTAGAC TGTCATTAAA CAAATGTAAC CGAGGCAGGG GAAATGTGGA 960
GCCCCAACGT GAGTAGGTGA TGGAGTTGGG TGACTGTCAT ATGTCACAGC AGGATGGGTA 1020
GTTGGCTGCC CCCAGCCCCC TCCTGCCGCT CCCTGTTCCA GCACCCTGGC CCACCAGCCC 1080
CTTCCTGGCA ACTCCCATAC TCCCCCAGTT CATCCACTAA AGGATTAATA GCTCACTCAG 1140
GGGAGGCTTC CTGCCCCTCG GCCAACACCA ACTTCCCTTT CAGCAAGCCA GTGTCGGCAC 1200
TACAGTGGTT TGGAATACTT TCAATATCAC TCCCTGTTAA CAAGCCTATC CTTGGACTGG 1260
CTGAGAAAAG AAATGGAACG GGGCAAAGTA ACAAAACAAA GAGGCAAGAC AGAGCCAAAT 1320
GTCTCCTATG GTTACCTAAA TCACAATTTA GACAAGCACT GGTGATTCTT GCACATAGAG 1380
AACCACCACT GAACTGTACA GGGGAAACTG GTTTCTGCCC CAGAGATGTG TTGGGGAAAT 1440
GACATACTGA CCACCATGAC TACATCCTCG GAAGACTGAG TGGCAGAGTG CTACTTTGGC 1500
TTTCTTACCA GGTGAACTTG AGCATATATC TGGGCAGTTC TAGAATTTCG ATGTGGGAGG 1560
GACTTAGGGA TGAAAAAAAT AAAATGTGGA TGGTAGATGG CATTTGGGGC AGGGGATTGG 1620
AGGCTTGTCT TGTAGCTGTT TCTGCTTAGT AAGCTCCCTG TTCTGGCTTA GAGACATATT 1680
TATTGGGGAG CTTGCTGATG GGAATTATGG ACGGGGCCAA CTCCTCTCCC AGCACCCTGT 1740
GGTGCTGACA TCTGAGGTGA TCACTTCCCA TGGAGTGGAG AAAAGCATGC TGCTCTATAT 1800
TTGTTCCCTA CAACAGGAAG CGTGAAAACA GGATTTGCTG CCACATGTCA AGTACTCATG 1860
TGCCTGTAGA AGAAAGGGGC CATTGCTGCT GATGATAACA ATGATAGCAT CTAAGGTTTT 1920
ATAGTTCCCC AAATAATTTC ACATACACTG TGATTTGATG CTTATAACAA CCGTGTGAAC 1980
TATGCAAAGT AGGTATTATT TCCCCATTTT AAGAGATGGG AGAATGGATA GTTAGTATTT 2040
TGAAAATTGC CAGACCCCAC ACTTATAAGA CTACATGTAT TATTAGTAAA ATTACTACTA 2100
GGGGACCCCA GCTATGAAAA CCTCTCTGGG AGATAGCACT GGTGGGTGAG GGGCAGCAGC 2160
TTCGGCTCTT GCCTCCTGGC AAGGGTGGGA TGTAATACCC TAAGCTCCAA CAGACTGGGG 2220
AAAGAGAAGG GGCTTAGAAA ACTGTCTGGG CTGCTGGATT TCTTTCCGGA GTTTCCCTCT 2280
CTCCTTCTAC TGTCAGCACG TCCCATCTTT TGCAACACCA GGGAGAAGCC TTTCCATGCC 2340
TCTTCAGCTC TTGGAATCCC TCCAGAAGCC CCCTCCCTCC TGAGTGGCAT CTAACAGGCC 2400
TGTCCAATAC TCATGCTACA GCTATGAGGA AAGAATAAAC CCTGCAGCTG CTTCAGAAGA 2460
GAAAGAAATC TCTTTTCAAA TGAAACCGTT TTTTGCAGCC CTGTGGAATT CATATTCTCT 2520
GTGATCTCCT TTGGATTCAA ATCACGGACC TGAAAGAGGG AGGGGAAGAA AACAGGTTCT 2580
TTTCCTCTGC CTGGGCCTGC CGTTCCCTCT GCCCTCCTAC ACTGGGTATG GACAGACCCC 2640
AAGGGACCAT GGTCTAGGTG TTGGCAGCCA GGCTGGCTCT ACAACACAAC ATGTCAGCTG 2700
CTCTGCTGGG CCTCTGTTTA CTCATCCATT AAATGAGGAG ATAAGATCTC CCTTGACTGG 2760
CTGTGAAGAT TAAGTGCACA AATATGTGTA AAGTGCACAA ATATGTCAAA TAAAAACTGA 2820
GACTGACACG TGGAGGTGCA AAATTAAAAA GGAAGCTTTG GTTAGTATCT CCAGAACCTG 2880
GCTAGGCACG GTGGCTCACA TCTGTAATCT CAGCGCTTTG GGAGGCCGAG ATGGGTGGAT 2940
CACCTGAGGT CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GGACAACATG GCGAAACCCC GTCTCTATTA 3000
AAAATACAAA AATTAGCTGG GCATGGCAGT GAGCCCCTGT AATCCCAGCT ACTCAAGAGG 3060
CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC GAGATCACGC 3120
CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGTGA GACTCCACCT CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA 3180
TCCAGAACCT GCAGATTGTG CCTCTGATGC ATCTCAAACA TCCAGGGCCA GGGAGAAAAT 3240
AATCTAAAGA AAAATACTAC TGAAAAAGAT TCCATTGCCA TGGCCCTCTG AGACACACAC 3300
ATTCTTATTC TCTTATTTTC TCTCTCTCTC TCTCTTCTTC TCTCTCTCTC TCTTTCTATC 3360
TCTCTCTCTC ACTCCCTCTC TCATTTACTC ACAAGGTCAG TGGCCCAGAC CCAGGCAGTT 3420
CTGGATAATC CCAGCTGTTT CTGACTCACC ACCATCCTCA GGGCTGGCTG ACTCACTCCA 3480
GGAAGGTTTT CCACCATGAA 3500