EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-02820 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr1:218646120-218650790 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs623356chr1218647386hg19
rs1764705chr1218648556hg19
rs12743469chr1218650783hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:218650648-218650659TAATCCAATCA+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:218648583-218648596GTTAAGTGGTTAA-6.62
ZNF263MA0528.1chr1:218650537-218650558AGAGCAGGAGAGAGAGAGAGA+6.23
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218646382-218647251Astrocytes
SE_02323chr1:218648227-218650769Astrocytes
SE_34115chr1:218648222-218649452HCC1954
SE_34115chr1:218649745-218650759HCC1954
SE_36549chr1:218648751-218650832HMEC
SE_37059chr1:218646289-218657164HSMMtube
SE_38564chr1:218645950-218648182HUVEC
SE_38564chr1:218649404-218650756HUVEC
SE_45788chr1:218648084-218650762Osteoblasts
SE_51738chr1:218648090-218650886Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218648409-218650897u87
SE_63527chr1:218648003-218655213HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218646870218647214
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218472chr1218646309218656788
Enhancer Sequence
TATACCTTTA ATTACTATAA TACAATATTC TTTCTTACAA ACAGCAAAAA AAAAATGAGA 60
GAGAGAGATA TCTGTTACTT GCCTAATTAT AATCTGAATT TTGTAATCTT TGTTTTCATA 120
AACTGAATTG CAAAATTCTA GATTTGTGTA AATCTGAAGA AAAAAATTAA ATTAAATTAA 180
AACATAAACA GAATCCGAAG AACTAAACAC AGAGTAGAGA TGTTGGCCTG CCCCATGCTC 240
TGAAAGACCA TCTGAGGGCT TCTGAGCCTG GTACACCCTG GGGAGTTCTC AGAGAGAGAG 300
AGGGATGTTT AGATCATGCA CCAGAGGGCC TCATGCAAGC AGGTACAACT ACAGGAGGTC 360
CCTCACCCAT CTCTGATGGT AGTTATGGCA GTAATAACAC CCTGATGGGT AGTACAATCT 420
TAAGCATGAG ACAAAATTAG TTTTGTATGA AAATGGTTTC AAATGTGGGT GTCTTTATTA 480
GAAATCCAAA ATATCAAAGT AATCTTCAGA GGCCACGGTT TCTCTTGTGT CATTTCATGA 540
TACATGCTGA TGTCTTCACA TAGGAAAAGA AAAAAGAAGA ATAGGGATCA AAAAAGAGGG 600
AAGGTACAAG GAAAGGAATA AGAGATTTTC AAATGTATGC CACCTGCTTT GAATGTTGTT 660
CAGATATGTG TCTTACAGTA TGCCTGGTGT GCCTTTGTTA GAGATTAATT GGACAAATTT 720
GATTTTATAG ATGATATGAG CCAGAATTGC AAAGGTGGTG TTTCTCCTCT TATGTGAAGA 780
GGAAGTCAGG GGGAGATGAA AGGGAGAATA ACCTTTACCT CATAATTTCC TTTCCCCTCC 840
TCTCTGTGTA AGCCACATTA GTCTCTCAGC AAAGGTACTT GGAGAAACTT GCTAAAATTT 900
TCCCTCATGC TTGAAATTTA CTTACCCTGG GTAACAGGAA ATGTGGAGTC TTGTGATGTA 960
GATTGTTATA CCAGATGGTA ATCTTAGCAC ATGCTATTTA TGTAGATCAG CCATGTGTGT 1020
GAGTCATCCA TGTGAGGCTG ACCTCAGCCA CTGTGAAATC GGGTTCCATA CCGCCATTAT 1080
TAATAAATAA TAATAATGGT ACTGATTAGG CATCATTTTG ATGCACATCT AATGAGGCCA 1140
TTACCTTTAT ATGATATTAA ATCTGGAATT GTTTTCTTTT TCTAAATAAT ACTTTATTAA 1200
CAACTGGCCA TGTTGTTAGA TTGCTATTTT TTACTGGCAA GGGCAGGCAC ACAATTTAAC 1260
TCAGCTAAGA TTAGGTAATT AAGGTATCTG CCACTTGCAT TGCGCTATTC ATTGAATGCC 1320
CTAACTACTT TGTTCTTTCT TTGAAGCAAA TGCCTGTCCT TATTTAAGTC ATCCTCTTCT 1380
AGGTCCTGTG GTTTGAGTTA TTATTTTACT GATGATAAAT TTGAGTGGGT AATCCACACT 1440
CTTTCATCTT GTCTCCCTTT TAACCACTAG CTAATTTAGC GATGGAGAAT AGTTTCGCTT 1500
TTATTACAGC TTTGATTATC TGGTGGTTGC AAATAAGTCA GATAGGGAAG CCTGCGCAAA 1560
GATAAATGCT TTAAAAGCAG GAAGTGTGTT TTATTTCCTT TCAACTAGCC ATCTGTTCAG 1620
GATTCTTGCC TTTAATCCTT CCCTATTTTC TTTCCGCCTT CTTTTCTTGC ACTTTCCCTT 1680
CATAGTGGCT AGAACTGTGC TCTGCACAAA ACAGGCAATA TCTTTTTGGC TTTGTAACAA 1740
CCGCAGAGAT TTTCTAATAT GACCCACTTT TCCAGAATGT TTCCTGCTTG TCTCTTTGAG 1800
AGACATGCCG TCACTTTTTT TTTTCTGTTT CTCTTACCCA AAGATAACAT TTCTTACCCA 1860
ACATCATTAG TGTAAAGATT CTAAGGTTTT AATGGTAATG CATTACATAC ATTTGTTTTC 1920
TCTTGGCTCG TGATTGTGGC TGGAGTCCTT CATTTTGTGA CTGAATTCAG ATCAGAATAC 1980
AAAGATAGCA AGTTCATTAG GGTTTTAATT TGCACACAGT TCCATTGGAG CAGCAAAATG 2040
ATTAAGGGTA CAAAAGAGAC GGGTTTCAAT GAGAAATAAG AGGCATTGAT TTACCTCTTG 2100
CTAGTGGGAG TTAGGGAGTG AATTGTTACA GAAATTGTGC TGCCAATAAT ACTTAACCCG 2160
AATTTTAGGT AATTTTTTTT CTTAGTTGCT GTCCTGAGTG AGGCGTACAG CTATGAGATG 2220
TACGGAATTC TTTAGAGCAA GGTCCTGTAT CATCAAAAAC TTGCTAGGCA TAGATTTCCC 2280
TGAGGGCCTA CAGTGGAACC CAGGAGCACA TCCAGCTCTG TCTTGGCAGT TCACCCTCTC 2340
TCTCTCCTGC TTTATAGAAG GAAAAAGTGA AAAGCACCCA TTTTTCCTTC AGAGGAAACA 2400
ACTCTTACAA GTTTATCCAG ATCTAAGCAG GGACTCATCT GAGACAGTCT CATCTCAGCA 2460
CTGGTTAAGT GGTTAAGAGA TGAGGCTTTG AAATCAGATC AATGTGGGAC TGAGTTCCAG 2520
CCCCAGTGAC TGTAACCTTT GACAAGTGGC AAAACCTCTC CTTGCCTTGG ATTCCTCATG 2580
TCTTACATAG GAATAATATA GCACCCATCT CATAAATTGG CTGTGAGTAT TCAATGAGAG 2640
AATCATGAAA AGTACCTGGC ACCAGCAGAT GGCAGCTATT TTTATCTATG ATCCACTAGG 2700
TAGAACATTT CTGTGCTTTC CCCAGTCTGA AATGGAGATG CCTTTACATC ATCCTTCATG 2760
GCTATTCTTA ATTACTCATG TCATTTGACT TTTAAGTGCC CATCATTAGC TTTCTATCAA 2820
GCCAAATGCC TATGAAACAA TAGGGATAAT AATTATATAG GCAGTCTTTG CGGAGCTTTG 2880
GAATACTGAC ATTTTGTCAG AATTTCTGGA TCCCTGATCA AGATAAGCAA AAAGCAGAAC 2940
ATTTCTGGTT GAGGATTATT ATCAATATTA ACCACTTCTT CTGCTCCTGA CCCTCTCCCC 3000
TGTCCCATAA AATACTAAAC TCCTATAATT ACACAAGATG CCTAGGTAGT AACAAACGCA 3060
AGTGGAACTT AAGAGATCAA GACTGGAGTC AGGAGAGTTT CAGAGCTGGC TCATTCAGCC 3120
CTAACATCCC ATGATATGTG ACTGTGAACT TTTTAGCTAG ATTATAAACT CCTTGAAGGG 3180
CTTGTTGATT TCTGGAGGGA GGAAGGTGGG GTTAGAATTT GCAGTGATCT GAACTAGGAT 3240
AACTTCCTAT ATGTCTTCCA GGGCTTATCT GAAAATTCCA CTTGTCTCTG AAAATGAACT 3300
TCTTATTCCC AAATACTTAA CTTTATTATA ATCTCTATAC ATAGCAAGCA TCTATCTGGT 3360
GCCTAACAGA TCTCTTATTG TACAAAGCTC ACACTTCATA TATGAGGAAC TTACACACTA 3420
AGTTGAAGGT GATTATAATA ACCTGGTTAA GGAGATAAAC AATTCAGTCT TGAAATGTGA 3480
AGAACACCCA TTAAAAAGAT TTTAGGAACA TAGACTGTAC TTGCCTTCTC AATTTTCCTT 3540
AACACATAGA ATAAATATTT GATATTGAGT TATTTTGGTA TTTTCAGCAA CTTTTAAAAT 3600
TATTTATTAA ACTCCTAAAT ATCATCTTTA TAAGATACTG TAGGAAACAA AAATTAGAAA 3660
ATTCTTGAAT ACGATTATTA TTGGTGTCTA TTTTAAAGGC TAGTCATTTG TTAGTTTGAG 3720
ATTCTGTGTC AACAGATATC AACGTGACGG CTGATCAACA TGATGATCCT GTTAGAAAAT 3780
ACCATGAGTC CAGAGACACT TTTGTAATGA GTCATTGCTA TTTAGCTTCT TCCACAAATG 3840
GTCTTAACTT GAGCAGGACT CTTAAACCAA CAAATGTTAG TTGCTAGAAA GGCATTTGGA 3900
TTTAACAAAG AAGATATTAA TTGTTTTGCA GCTTCTATTA GCAGTTCTTT AACCTACAGC 3960
ATAAAATTTG AAATCTGAAG GGGACTTAGA GACTGAGACA AGTCCTTATC CAGCATGTAA 4020
CTCCCATCCC AAACTATCTA GAATTGTCTA GCCTCTTTTA CTAACTGTTC ACTAGAGATA 4080
GAATGTGAGC CAAAAAAGCA AACCACATAT GTAATTTTAA ATTTTCTAGT AGTCATGTTA 4140
AATAAGTAAT CAGACATAGG TGAAATTGAT TTTAATACTA TATTTACCTC AATATGTTCA 4200
AACGATTACT ACTTCAGCAT GTGATCATTA TAAGAATTAA TGAGTGTATT ATTTTGTTCT 4260
CACGTTGCTA TAAAGAACTA CCTGAGACTG GGTAATTTTA TGAAGAAAAG AGGTTTAATT 4320
GACTGGCATT TCTGCAGGCC TAATAGGAAG CATGGTTGGA AGGCCTCGGG AAACATAATC 4380
ATAGCAGAAG GGGAAGCAAA CAGTTCTTTA CTATGGCAGA GCAGGAGAGA GAGAGAGATA 4440
AGGGGGAGCC ACTGCATACT TTTAAACCAT CAGATCTCCT GAGAACGAAC TCACTGTCAC 4500
AAGAACAGCA TGGGGGAAAC TGCCCCCATA ATCCAATCAC CTCCCACCAG GTCTCGCCCC 4560
TGACACATGG GGATTACAAT TCCAGATGAG ATTTGGTTGG GGACATAGAG CCAAACCATA 4620
TCAGCAAAGA CACTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TGAGATGGAG 4670