EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-00184 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr1:12512800-12516050 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:12515004-12515015CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12513684-12513694AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12511532-12515011Aorta
SE_03005chr1:12513269-12513663Bladder
SE_03005chr1:12513943-12515024Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12513098-12515726Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12506659-12513255Esophagus
SE_26716chr1:12513330-12515524Esophagus
SE_28215chr1:12513081-12514952Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12512885-12515007Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12514499-12515348Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12513768-12518184HSMMtube
SE_39882chr1:12512832-12515652K562
SE_41209chr1:12512181-12515171Left_Ventricle
SE_42647chr1:12511538-12515195Lung
SE_45864chr1:12513386-12516437Osteoblasts
SE_49026chr1:12513381-12515085Right_Atrium
SE_50544chr1:12513372-12515427Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12512592-12515650Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12513220-12515041Small_Intestine
SE_54847chr1:12512158-12515661Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr11251340412513748
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012452chr11251265812518656
Enhancer Sequence
CCCAGTAAAA TCTGATTAAC TACTCATCAA TACAGGTTTG GTTGGATCAT AGATTTCAAC 60
ATCTACTCAA GTTTTCTGGG TTCTCAAAGC TGTATTTCTA GGGGTGAAGA CTTTTGTAAT 120
GGTTGACTGT TAACAAGTGG CAAAGGACAA GTCCAGTTGG CTTGCATAAG CAATTTTTTA 180
TGGACAGAGA AACAGGAATT CAGACAGAAG TCCTACAGTA AGTTGAGATA GGTGTAGGTA 240
CCTTTCCATG GCAAAGGTCT TCATCTTACG GAAGAATCCA GCATTAGAGG GAAGAGTGAT 300
CTCTTAGGTC ATCTCATCCC ATCCTCCTTG GGTCAATACA TTGTCTTTGT ATAGAGAACA 360
CCCAGGACCC AGTTGGTGCT GGGGAGCTGA GGCTGCCACA GCAGACTTAG TTGGAAATTA 420
AGCTTTTGGC ATAGGCTCAC TCATCAACTT TGGATATTAA TTGATGGGAG TAGAAGAAGA 480
GGGAGTGATA TTGGGTATTC TGCCTAGATT ATTCTCCCAT ATTCTCTTGG TGGGGGAGTA 540
TTATAGGATT TTTAACTTCC TCCTAGTTAG CTGCCAGAGA TAGGTAAAGA GCACTTTACC 600
CTATCTGTCT TCCAAGAAAG AGAATGTAAG CTCTTAGAAA GAATATAAGA GCTTGAGAGA 660
AACAGGAAAG ACCTGAATAA GACCCTGAAT TGGCTGCGGT GCTCCTGGGT CTCTTCAGGT 720
GGAGATGTGT CCCCTGGAGA CACACAGGAC ATGGGCACGC GTCACTTAAC TGTGGTTCTC 780
ACAGCGTCTG GGGCACCAGA GAGACACGTT TTTGTCTGGA ACCTGAAGAA CGCTGGCAGC 840
CTACATAATT CTAAACATAG CAGGCACTCT TATTGATTCT TTCCAAAACA AAGGTCACAT 900
TTCCTTTCTG TGTAGTTTGT GTCCTGGGTT CCTGCTGACT GTTTTGTGTA TACGATTGTT 960
ACCTTCTCAA AGAGACTGTC AGTTCTTGAG GGCAGGGTTC AAGGCTGCTG TTTGTTTGTG 1020
TTCTTCAGCA GTACCTAAAT CTGTCCTGGG CTCAGAGGAA GTATTTAGTA AAGACATTCT 1080
ACCTTGGGTT GTAGGTCACA CAGTGCCAGA GCTGGAAAGG ATTTTGGAAA TCGTAGAGTC 1140
CAACACTCTA ATTTTGTAAG TGGTACCACT CCAAAAACTT ACTTGGGAGG CTGGTGTTTA 1200
TCTGCTGGAA AGAGAGGATT TTATTATGTT AAACTATAGT GCAAATGACC ATAATTCTAA 1260
ACCTTTGACA GGCTTCCCTC AAACGCTGCA GGCATGTTCC TCCTTGGACT AGTAGCAGAG 1320
TAATAAGAAC AGTAAGAATG CTAACTAGAT ACCAGGCCCC CGAGCCATTG TCATGAATGC 1380
TTCCAGCCAC ATGACAAAGT AGGTACTCTG GCTATTCTCC AGATGCAGAG GAGGCTCAGA 1440
GGTAGGTGAC CTCGCTCAGG GTCATGTAGT TACCAGAATG GTCGAGGGAG GACTGAAGTT 1500
TGGTCAGATG CCCCAGCTTG TGGCCCTTCT CCTATACTGT GGTAACTCTC AGATGGGGTC 1560
TCTGACTGAA GCCACTCCTT AGTGATTCAC GGTGCTAGCT TTGCAGCGTC GTGTGGTGTT 1620
TCCAGTTGTC CTAAAGGAAG TTATTAATTT TCATTAACTT TAATTCTCTC ATTAGACAGG 1680
CAGTGATATG GAAGGCAAGG CAGAAAGCAA ACAAATAATG ATAGGGGTTA CATCTCCAGA 1740
AAGGTCAGGA ATCACTGCCC TAGGTTGTAA AATATTTGGA CTGAGTAAAA GGCATGAGTC 1800
TTCCCATAGC TTCTTCCAGG AACTGTTGCT TTACATGGAA TTGCTGCTGT GTTCACTAGT 1860
CCCTCTTCTG TGCCCAGAAC TCACTGTCAC ATGTGTCAAG AATCCTCATG ACTGAGGTTT 1920
CCAGGGCAGA TCTGATCTGT GTAACACGCA CCCTAACCCC CTTGCCAAAG GAGAATGAAA 1980
TAGGCCCCTA GATGGCCACC CAGTTCCTGG GCCTTCCAGG CAGGCAGCTT GCCTTGAGGC 2040
TTTCCCCTGA GCCTTGTATC TAAGGAACAT TCCTGTGAGT TTTCTAAGAG GTTAGTCCTG 2100
GGTCATTGGC ACTTAAACCA CTTGTTTTGG TAGATCCTTC CTGAGAAGGT TAATTATATA 2160
TTTGATATCC TTCTCTTTTT ATGCCTGAAT GATGAGGATA AGTACTCTGT GGTTTATTAA 2220
CTGTCACTTT AAACCTTTTC AGATTGTCTT GTGACAAAAC AGAGTTTTAT GTCCTTTTTA 2280
TCCCAGCTTT GATGGATGAG ACAGCTTTTC TGGTTAAAGT ATGCCAGGAT AAATAAAATC 2340
TCTGAATTGT GGAAAGGGTG GGTTTGCATT TGAAATCATG AGTTCAAGTC TGCCACCTCC 2400
TATGAACGGT GACCTAACCT GTTAATCTTT CCATCGATTT CGTTTTTGGC TTTTGACAAA 2460
TGGAGCTTGG CACCTCATAG GTACTCAGTA ATTATTGAAT AAATGAAAGA CAGCATTACT 2520
GGAGGGAGTT TGATGTCTCC AAATATTTGA TACCAAACCC TAAAGCAACA ATCTGACACA 2580
TTTCCTGTTT TGAATTCCAC TAATTCTTAG AGCAAAGAGC CTATGTTCTT ACCATGATAC 2640
AGTCCTGAAG CTCACTTCTC CCTCAAGACT ATTTTGTTAT ACCTCTGATT TTTTCAGTAA 2700
ATTTGGAGTA GTATTCTGGA AAGTGAATGT CATTAAAGAT TTTTAGTAGT TGCTTTGCAA 2760
AGCCTAGTGT CCTCCATTGT ATGCATCCCC CAATTGGTAT GTGTCCAGTC CTTTTGAGAA 2820
CCACTCAACC TGGGGCAGAC AGTATAGGTA ACTGCATTTA AAATATTTAA ATTTATTTAT 2880
ATTTAAATTA TTGGCCAGGC ACAGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC 2940
TAGGTGGGCA GATCACTTGA GGTCAGGAGT TCGAGACTAG CCTGACCAAC ATGGTGAAAC 3000
CCCATCTCTG CTAAAAATAC AAAAATTAGC CAGGTGTGGT GGTACACACC TGTAGTCTCA 3060
GCTACTCGGG AGCCTGAGGC AGGAGAATCA CTTGAGCCTG GGAGGCGGAG GTTGTGATGA 3120
GATGAGATCA CACCACTACA GACCAGCATG GGCTTATCTA ATTGTATTTA ATTTAAATTT 3180
ATTTAAAGTA ATTCAAATAG TAAAAATAGT GCCAAGACTT TAAAACTCTT CTCCTGCTTT 3240
TAACTCCTTC 3250