EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS175-00055 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-N-MC 
Coordinate
chr1:2163150-2167280 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs263533chr12163568hg19
rs377599chr12164699hg19
rs61776614chr12166406hg19
rs76875252chr12166809hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU4F2MA0683.1chr1:2167174-2167190GTGAATTTTAAATGAG+6.06
SOX10MA0442.2chr1:2166223-2166234TTCTTTGTTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01294chr1:2159376-2166664Adrenal_Gland
SE_03761chr1:2161291-2164560Brain_Angular_Gyrus
SE_03761chr1:2164821-2165440Brain_Angular_Gyrus
SE_03761chr1:2165450-2166008Brain_Angular_Gyrus
SE_05718chr1:2160150-2166256Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05718chr1:2166592-2168047Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07454chr1:2160083-2167777Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08491chr1:2160251-2166506Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08491chr1:2166594-2167887Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08969chr1:2163743-2164177Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_11007chr1:2160050-2168251CD20
SE_17322chr1:2160103-2173005CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17845chr1:2160096-2171778CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18345chr1:2160148-2167869CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2160122-2166646CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19191chr1:2166670-2167677CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20071chr1:2160188-2164258CD56
SE_20071chr1:2165001-2167367CD56
SE_25123chr1:2157934-2165210Colon_Crypt_3
SE_27275chr1:2158012-2166662Esophagus
SE_32363chr1:2157770-2167811Gastric
SE_41586chr1:2160128-2166181LNCaP
SE_43103chr1:2160113-2167961Lung
SE_46124chr1:2160354-2166625Osteoblasts
SE_46124chr1:2166646-2167532Osteoblasts
SE_54234chr1:2157957-2167755Spleen
SE_62490chr1:2120386-2191742Tonsil
SE_68979chr1:2164680-2166097H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr121660002166071
chr121662002166926
Enhancer Sequence
GCAGCCACAC AGCCTGGCCC TGGCAGTGGT GTCCTCCGCC TGGCTCCCTG AATGTTCACC 60
AGCTCCTGCG GGTTTTCCTC TCCTCATGCT CCTGGGGGTG GGGCACCCAT CCTGCCCGTG 120
TTGCCTCCTG CTCTATGTTC TTGACGTGGG ATGGCGGCCA GGGACTCTGC CCTCGCTCAG 180
TGCCTGCCCT TTAGGCTCTG TGACTGTGCA CTTGGGAGTT CTGGGCTTCA GGGTCCCCTT 240
AAGTCTCCTC AGGACAGCCG TGTGCGTGTC TCTGTGTGCA CAGGAGCGAC ACATGAGAAG 300
GGAGTGTGGT CTCAGGGTGG GCGTGGACCC ACAGTGCCCA GACCCTACTT GTCCTAGAAG 360
GAGTGGCCTG GGAGGCCCCG CCTCCGCCCT CACTGGCCGC CGTTGGCTCC TCCCACTCGT 420
GTCTTGACAG CTTATTCTCG GGATATGTTT TGATTTCTTC ACTTCCTTTG TAGCTTATTT 480
TAATATTTTT GATCTGCCGA AGATGAGGGC AGAACAAAGA ATGTACTGGA ACTCTCTTTG 540
CAGGGCTGCT GCTCCCAGCA GGCCTTCGGG CTCTGCGGAG CCGGAGGGGG CTGAATTGCC 600
TTCCGGGTGT TTGTGGCCAG GCCAGGGTCG GGTCTCCTGC CTGAGTGGGC TGGGTCAGCG 660
CCACTCTCCT ACCCATGGTG GGAGGTGGGA GAGGGCGGAG ATGTTCCCGG GTCCCAAACC 720
AAGTGGGAGG CAGGGCTGCA GCTTTCTCCT TGGAAGCCTC CTGTGACAGC GGCTGTGCCT 780
GAGCCTCTGG CCTGTCGGCA GTGCAGTGGC AGCATGAGGG GCAGACAGTC TTCCTCCAGA 840
TGCCCCCTCA TGTCACGGGG TTACAGAGGA AGCCTCCGCT TCTGTCCAGT GGCTGTCGGG 900
CCCGGCCAGC TTCCTGCTGC TGTATCTTGG AAGACCATGT GGGCTGCATG GGTGCTTGGC 960
GAGTCTCCTC TTAGGGACCC TGGGGCTGCT ATCCTTGACA GGGGACCTTG TCTCACCTCC 1020
CCACTCGGTC CCACACTGGC TTTGTGACCT TGGACGAGTT GCTTAACCTC TCTGCCTCAG 1080
TGTAAACTGG GGACTACTGT TTATTGATCT TGGACTTTAT GTTTTGAGTG GTACAGGTGG 1140
GGCACAGATG GGTCATTGTG CTGCTGGGAG CACTTAGCCA AGACTGGAGC CTCTGAGCCT 1200
TCCCCACTCC CACCCCTCTT TCTTCTTTCC GGTCGGCTCG CCTCCTTCCT CGGGTTCTCT 1260
GATAGCTGTA GGACTCCATT GGACTACATT TTTTTGTCAG TATAGACAGC TGTCAGAGAC 1320
GGAGACAAAA TGTGGCAGTT GGAGCTGCCG CTTGGCCTGC TGCCTGGGAC GCGGCCCCTT 1380
GTCCCGCAGA ACGTCAGCCA AGCGCTTTCC GTGCAGGCTG ATAACAGGGT GGTGCCGTGC 1440
TTCCCTTGGG CCGTGGCAGG ATCCTGCTCC AAGGGGGGGT CCTGCTCCGA GGGGGCCGGG 1500
GTTTCTGTTC CAACAGGGCT GGTGGGGGGG GTCCTGTTCC CAGAGGTCCG GGATCCTGTT 1560
CTGAGGGGGC CAGGGTCCTG TTCTGGGCCG GGGGTCCTGC TCCGAGGGGG CCGGGCGTCC 1620
TGTTCCTAGG GGCGGTGGGC TGCCTGTGTG AGAGCTGTTC TTCACCTGCC ACGTGCAGTC 1680
TGGGCATTCT GGTGACTGGA GAATTTGGGT TGTGTTACAG TGTTGTTGCT CTGTCCTGCA 1740
GATGCCTGAA TTCCCAGGGG TCTTGCAGGT CCCCTTGCCC TTGCGCTGTG TGGGCTGGCG 1800
TGGGTCTCAG TGGGCTGTGG GTTGAGGGTC GCTTGGTTGG GAAGCTCTGC GCGCTTCCCA 1860
GTGGAGGGTC CGCGACGGGG GTTTTCTGAT CCCTCATGCT GGCTTTTGAC CCGTGTCACT 1920
GCAAGGCTGC CCCTGGCCCC AGGCAGCGTT TCTTCAGGCA GGTGCCCAGC CAGGTGGTCG 1980
GGCTTGAGAC CTTTGAGTCT CGAGGTCTGT TCTGGGGAAT GACTGAGCTT GTGGAGGCCA 2040
GGAAGGGGTT GCTGGGCTTG GAGAGCCTCT GGGGAGGAGT TGTGTTTTGC TCTTTGCTGT 2100
TTTAAGCTGA AATGATCACA GGAAGGGACA GCATCAAGAG TTTCTTTCTG GGACACCCCT 2160
CACTCAGCTC AGCGGCCGTG TGTGGGTTTG GGGCTGTGCT CTCCCAGACA CCCTCAGGTC 2220
CGGGGAGCAC TTCGGGGGCT ATCTGTCCCT TTGTCCACCA GCTTCCTTTG GAAAAAGTGT 2280
TTGCTGCAAG TGTTTTTCTC CAGCTTTTCG TGGGGTTCCC TGTAGTCTTG GGCCATGCTC 2340
TGGGGTCAGG CTCCCGGCAG GCCCTGGTCC CCGTGCAGAA GGCCAGGGTC TGCGGGTTTG 2400
GGCTGGTCTG CCCCCCAGGT GAGGGTTCCG GAAAGACGGC CGGCTGCTGA GTCTTCTCAA 2460
GCAGGGGAAA CAGCAGCTCG AGAGTGGTTC TTGACCTCTG CCCACCCCAG CTGGCTGTGC 2520
ACGGACTGGG GAGGGCATGG GCAGCTGCCC CCAGGTGGCT TCTGCAGGGA GCAGAGCTTA 2580
GTGGTCATTT TCCCGGCATG GTCTGTCATC CGTCTGTCTG GGACCCCTCT GGGAGCTGGG 2640
CTGGGTCCCT CGCCTTCTGG GGCAGCAGGG TCACGGTGGG GGGGCTAGTC CTCTCTTTCA 2700
GCATCTTGTT TCTCAGCCGT CCCTGCGGCT ATTTGTGCAA TGTCTGTCTG TCTGAGTCTC 2760
CGGGTGAGGG CAGACAGGAT ATGGTGCGAG GAAGTCTGGG GTAAGTGTGA GCCGAACCCC 2820
GCCCTGGAGT CTCTCGGGGT TGTGGGGCCA CAGCCCCAGC TTAGGTTAGG CCTTCACTGC 2880
TGCTGGCAGG GCCTCCAGAG AGAAGGCGGT GGTTCCGGGG CCTGGGCCCT GACTGTCTGG 2940
CAGGAGGTGT CCACGCCGGC GGCCCGGCTC TCTGTGGCAA TAATGTGTCT CTTTCTAAGG 3000
ATTGCGAAAG TTGAGGGAGG ATTTCTCCAC TGGAAGAATT ATGCAAGCTT CAACTGAAAT 3060
GTTTTTAAAA AGTTTCTTTG TTTTGAGTCA AAATACAGAA GGTGAATTAT TTCCCTAATA 3120
TCTGGGAGAG CTGGAAAAGA AGGCCCCTGT CCTTATTCTT CAGGGCTCTT CCCCTCCTGA 3180
GCAGTGGTCA CCAGGCCAGG GTGTCATGGA GGGGGGGCTG CCTGGGGACC AGCTCTTTAC 3240
ACCTGGCCTC CAGAGCGGGT GGTAGGGCGG CTCCTTCCTG CCCTGCCCTG GCTGTCACCC 3300
TCGTGGTCTG GAGCAGGGTT TTTTTTTGTT GTTATTTTTT TTTTTTTTTG AGACAGGGTC 3360
TGTTTCTGTT GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG GTGCGATCTT GGCTCACTGC AGCCTCCGTC 3420
TCCTGGGTTC AAGCGATTCT CCTGCCCCAG CCTCCTGGTA GCTGGGATTA CAGATGTGTG 3480
CCACCACACC CAAGTAATTT TTTTGTATTT TTAGTAGAGA TGGGGTTTCA CCATGTTGGC 3540
CAGCCTGGTC TCGAACTCCT GACCTCAAGT TATCTGCCCA CCTTGGCCTC CCAGAGTGCT 3600
GGGATTACAG GCATAAGCCA CTGTGCCTGG CCCCTGGAGT GGGTTCTGCC ACGGAAGGCA 3660
TCCCCGGGGT CTGCGGGCTG GAGGGGTCGC CCCCACTGTG CCACCTGTTC TCTCGAGGCC 3720
TGGTTGCCCT CTGCAGACCA GGTGCCATGC CAGGTGACCC TCAGGAAGCT CTGGCTCACC 3780
CCGGGGGCTG GGGGGCATGA TAAGCGATAG CTCTTAGGTG CTGCTGCTTT GTGAATATGA 3840
GAGAGTTCCA GAAGGGCCCC GCTTCCCAGA GCCTGCATGT TGGTTTCACT GTGTGGTACT 3900
TGATATTTTT CCAGGCTGCC TTGCTGGGGT GGCCTCGATG GGGGGCCCAG GGAGCCTCCA 3960
GCTCTGGGGA CATGCTGCCA CATGAGCCTG CTTATTTACG AAAATGAAGA ACCAGGACTT 4020
GAGTGTGAAT TTTAAATGAG ATTGTGGGGA CAATAGTAAA ATCCAGACTA GGACCAGATG 4080
GACTGAGCAC CTGCGTTGGC CATGGCCCGG AGGTGGCGTG GTGGTGCCTG 4130