EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS174-00139 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SK-MEL-5 
Coordinate
chr1:66812970-66815060 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HLTFMA0109.1chr1:66814437-66814447AACCTTATAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 34             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04069chr1:66814378-66823300Brain_Anterior_Caudate
SE_05322chr1:66814464-66820965Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07288chr1:66813312-66821078Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08122chr1:66814425-66824208Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10326chr1:66813318-66816898CD19_Primary
SE_10951chr1:66793771-66843734CD20
SE_11953chr1:66813103-66814376CD3
SE_11953chr1:66814686-66818918CD3
SE_14770chr1:66814611-66818700CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15575chr1:66814780-66818363CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16375chr1:66814613-66818455CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17661chr1:66812448-66818571CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17976chr1:66810355-66819481CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18332chr1:66810170-66819609CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19345chr1:66811028-66814268CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19345chr1:66814409-66819543CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20316chr1:66814648-66819396CD56
SE_21049chr1:66814490-66818477CD8_Memory_7pool
SE_22031chr1:66814604-66818277CD8_Naive_8pool
SE_22734chr1:66814266-66819193CD8_primiary
SE_26190chr1:66814439-66819441Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30156chr1:66813451-66820989Fetal_Muscle
SE_32694chr1:66811036-66814450GM12878
SE_32694chr1:66814460-66818972GM12878
SE_34252chr1:66806587-66824529HCT-116
SE_38011chr1:66811092-66822034HUVEC
SE_44003chr1:66814654-66817256MM1S
SE_51219chr1:66814472-66819776Skeletal_Muscle
SE_55986chr1:66808562-66819556u87
SE_58443chr1:66794442-66847442Ly1
SE_58986chr1:66795973-66869510Ly3
SE_60961chr1:66794456-66871060HBL1
SE_61831chr1:66795907-66847252Toledo
SE_62241chr1:66781876-66869563Tonsil
Enhancer Sequence
CCAACTACCT TTTTTAATAG GATAAAATTG CATAAGAAAT AGCTGTCTAT GAAATTTATG 60
TCTATTTTAT GTTATGAAAC TATTTTCATC TTTTATAGTT TTAGTTAATA GTTTATGTGT 120
GCAAACCTCC AACCTGTTAC AAATTTTCCT CAATTTGCCG GTGCATACTC TAGCTTAGGG 180
ATTACTGAAA TATCAAAACA GATAATAATA TATATGCTTT CAGGGAAGGA AAGGATAGAT 240
CTATGTAGTC CAAAGCTTTC TTTTATTTTT TTGATAGGCC CTAGAGTTGA TCTTGAAAAT 300
TGCCAGATTA ATAGGCTGTC CCAGCCCTGA GAAATCGCTA ATCTAGAAGT GGCAATTCCC 360
AAGGCAGGTT TTGAAGCATT CCATTGTCTT TTACCTCAAG GGATGTATGA AAGTCACTAG 420
CTGAAATCAA TACAATTAAT AATAAATACA ATGTATTCTA CATGGTATTT TTAAGGGGTA 480
GAGTAATAAT CTCAAAAACA AGCTATGATA GATTTTTGTA GCTGCAAAAA ATATTAGAAA 540
CTTCAATAAG GCAGGATTTA AAACAACCTA AGAGGTACTA TAGACTGAAA ATGGAATTAA 600
CTTCTTAAAG AGAATCATGA CCAATACGTA AGGGTTATGA AAAGAAAGTA TAATATTTGA 660
GTGGTAGTTT CCCTGTTCTG TGTAACTACT TTCATGTCAG ATATGAAGGT CCTAAAACAT 720
AGGTGTTATT TTTCACTAGT CAGGAAAGGA CACTAGACTG GATGGTCTGT GGGTCTGATC 780
CACAGTAAGT GTTCTGATTG CTGAAAAATA CTATAAGTTG TAGAGCTTCT AGCTGCGAAA 840
TGTTTCAAAA TAAACCTTTG TCATCTACTT TGGAATCATA TTAATGCCCT GTGGCCTTAG 900
AATTGACTCT AGAAGCTTTC AGTTAAATAT TAGCCGTTAT ACCTGTACAG AAAAAGTTGT 960
AGAAAGGCTT AAAAGGAAAA ACAAAAGAGT GACTGAATAA TGTACCTTGA TTCCTTGATT 1020
TTTCTCAGTT ACTATGATGA TTTTTGTCAT CTGTTGAAAA AGGTTTCTGC TAAATTTAAT 1080
TATCAGATCA TCATCTCAAA TCTTCAAAGT TCCTTTTTTT GTCTTTCTCT ATTAACAGAC 1140
AAATTAAAAG GGAAGGATCA AGTATATGAA ATGAAATTGT GATGCTCCAG GAACAGTTTT 1200
AGGTCTTACG TTTCTCATTG GAAGAAAAGT CCTCTGTCAA AAAGAAAATT TTGAAAAGTT 1260
TAAATTATCT AAAAATATAC AGTGCCCCTA AACTTAACAT ATATAATGAG TGTATGGCCT 1320
GGAAATCCAA TCTCTTCATA GGCTATTTGC ACATGCAATA TCAGGACCAT ACTTACAGTT 1380
AAAAAAAAAA AAAGATAAAG AAAATTCTTC TTTATCTGAA ATTCAAATTT AACTAGGTGC 1440
CCCGAATTTT TATTTGCTAA ATCTGGCAAC CTTATATATG TGGAAACATA ATATAGTTTA 1500
TAAATATTAT ATATATAGTT TAAAATGCAT AGTGAATGTA TCAGTCTTTA GGTATAAATA 1560
GTTACAGTAT CTTTTGTCCA TTTGATTACA TCACTGCAGC AACTTTCAGA GTTGAGAGAA 1620
TGTTGGATCA TGAGAAATTG CTATAAACAT TCTTATGGGA ATCACTTTGG GTCTAGGAAA 1680
CGTCAATTTT TTAGTGTTCC AATAATGTGT GTTATATCAT CTCTTGAGAA GTTTTCAGAA 1740
ATTCTGAGAA AAATGGACAG CAGAAAAGGG TTAGATAGAT AGGAAGAAAT ATGTAATAAT 1800
TTGGGGAGCT GTTCAAGCCC TAATCTCATT TAGGAGATTA GTTATAGAGC AGCTATATTC 1860
AAATTTGTTT GATCTTTTGA TATTTTTCAA TTCTGTATGA AGGCATTAAT GGTTTTTCCC 1920
TGCTTTGCCT TTTAATATGT CACTTGAGCA GAGACTTGTC CTCTAACTAG CAAGTAGAAT 1980
TGATTCTATT GTTGCTTCAT CATAATTTTT GATGCAGAAT AATGGTAGAT ATATTCATGC 2040
TTGTTTTTCG TTGTATACTT ACCTATTGAT TACTACGTTG CTGAGCAGTT 2090