EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-10231 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr3:171846540-171849060 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT-6.28
RFX1MA0509.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT+6.3
RFX2MA0600.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT+6.53
RFX2MA0600.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT-6.54
RFX5MA0510.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT-6.03
RFX5MA0510.2chr3:171848167-171848183GGTTGCTATGGCTACT+6.1
ZNF263MA0528.1chr3:171847777-171847798GGGAGAGGGAGGGAGGGAGGG+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:171847789-171847810GAGGGAGGGGGAGAGAGAGAA+7.16
ZNF263MA0528.1chr3:171847781-171847802GAGGGAGGGAGGGAGGGGGAG+7.23
ZNF263MA0528.1chr3:171847785-171847806GAGGGAGGGAGGGGGAGAGAG+7.35
Znf423MA0116.1chr3:171847195-171847210GCCACCCAAGGTTTA+6.06
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00049chr3:171841997-171861661Adipose_Nuclei
SE_02658chr3:171846967-171849032Astrocytes
SE_09145chr3:171841856-171861555CD14
SE_25963chr3:171842096-171849143Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29885chr3:171847686-171848916Fetal_Muscle
SE_31596chr3:171846636-171847260Gastric
SE_31596chr3:171847628-171848645Gastric
SE_34801chr3:171843568-171850830HeLa
SE_36004chr3:171846833-171850239HMEC
SE_37863chr3:171846424-171849358HSMMtube
SE_37981chr3:171843201-171850586HUVEC
SE_43273chr3:171846528-171847338Lung
SE_43273chr3:171847796-171848807Lung
SE_45552chr3:171842011-171861553Osteoblasts
SE_47161chr3:171842038-171849555Panc1
SE_55881chr3:171845511-171861265u87
SE_64748chr3:171846812-171848925NHEK
SE_67571chr3:171845511-171861265u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr3171847438171848726
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I172124chr3171842127171875990
Enhancer Sequence
CCTGTTGGAT AATCATAAAT GTGGGCTCCA AGGGAGAAGT ATTCATTTAT ACATGAAAAC 60
AAGCTACACA AAGTGTGGCC AGTGGAAAAA ACTCTAGAAG TGAAATGGGA TCTCCTCTCT 120
GGTATGGTTT ATATCTTGAT TGTCTGAGGG TTGGATTTAA CGCTTAAAAA TGCTGCAAGT 180
GTACTATTTT GTCTTTGGTC AGTTGGTACT CTTCTCCCAG GAGGAGCTTT TTTTTGGGAG 240
ACAGTCTTGC TCTGTTGTCC GGGCTGGAGT GCAGTTGGCA CCGTCACGGT TTGCTACAGC 300
CTCGACCTCC TGGGCTCACG CGATCCTCCT GCCTCACCCT CCTGAGTTGC TAGAACTACA 360
GGAATGCACC ACCATGTCCG GCTAATTTTT ACAATTATTT TTGTAGATAT GGAGTCTCAC 420
TATGTTGCTG GGGTTGGTCT GGAACTCCTG GTCTCAAGTG ATTCTCCCCG TCTCAGCCTC 480
CCAAAGCACT GGAATTACAG GCATGAGCCT CTGTACCTGG CCAGAAGCTT TTTTGATGGA 540
CTGATCCATT ACCCTGATTG CTTATTTGAG TGACTGGTAA TTTTTTTATT TGAGGCATAA 600
ATTAGACATT TGCCTCCAGG AGTAGTCTTA GATACTATTG GCACCTGGTT AATCAGCCAC 660
CCAAGGTTTA AATTGCAAAA GTAGCCTCCC TTTTCCTCTT TTAATGAGTA TAAAACAGAG 720
TTAGGTTTAG ATTTATACCT GTAAAGGAAA GATATTACAC CTTCTTTCAG TTCTCCTGTT 780
AGACAAAGAA TTCCCATGAT GCTGTGTTTA CTCAATTGTA TTAATTGCAA CTCTTGTTTT 840
ATTGTTTCTC TGGACTTTGG AAGAGTGGTC ACTTATTTTT CATTAAACTT TGATAAACTG 900
CCTTCTGTTT ATTTCCAGCT TCTTGGTTCA TGTAACACTA ACGGTTTTGA AACAGATCTG 960
ATGAAGCAAT AGTAGCTTAG AGGATGCTCC CATGATTTGA TTAGCATGGT TCTTCTTAAG 1020
ATCTCTGGAG AAAAAAAATA TCTAGTTAAA ATCTTTGTCT TTTTTTTCTT CCTCTGAAGA 1080
CATGGTGCAG TATGAATCAG TTTAATGCTG ACTTTGGAAA AGTAGGAAAT GCTTAGTGAG 1140
TAGACAAAAA ATGATGTGGT TTGGACAGCG ATGTTCTGTA TCGCATTTTA TATTAAGGAG 1200
GACTTGTAGC AGTTATTATA TTTCTGCTTT GTGGTTGGGG AGAGGGAGGG AGGGAGGGGG 1260
AGAGAGAGAA ATTGCCCAAC TTGTATGATA GGAAAGGTTA AGTGCCGGGA GTTGGCCAGG 1320
TTGTGACTCA TGCTCCTCGG GGCTGCGTGA TGCAAGACCT TTTGCCGCCA GCTCATTCAT 1380
GTCTGCTGTC AGGACCGGTC ATTGGGCTGG TGTGTGTCAA ACTTATTTTT ATCTCTGCTT 1440
TATTGACAAT GAAAACAGCT AGGTGGTCAG CCTCCCTCAG TATAATAAAA TGCTTTCTTT 1500
TAAAATACCT CAGTGCCAAG ATGAATATGG TTTGTTTAAA TAATGACTTC TGCTCTACTG 1560
AGAAAAATTG ATATTGGGAC ACAGGAGACT TGCCTGGTTT CTGAGGTAAC TTGGTAGATT 1620
ATAATCTGGT TGCTATGGCT ACTCAGCAGC AGTGAAAATT ACATGAACTA AACATTTGAA 1680
GGGAGGTATT TTCGTCGGAT GCTTAAAAGC CCGTTACCTA TCATCTTTCT CCCTGAAGAA 1740
GTGGGATGGG GGTCAGGAAT TGAACTCAGT AAGCAGGGGG GGAAGGTATA AGTGGACCTT 1800
AGAGGCTGGA TGCCTCTGCG TCGTTCTTTG AAGTTTGGCC TGGTGTCAGT GACCACTGAG 1860
GAACTGTTAC AGACACTTTT TGTGCAATAT GATAAGCAGA TAATGTGACG ACAGTCCGGA 1920
CATGTCCCAA TTCAGAAATC CGTTTTCTTG CCTGGGACTT TCCGTAATAC TGGTGAATTG 1980
TATTTTCTGA ACCGGTATTC AGGGCACATT GTCTGACAAT TATGAGCGTG GTAGAAGAGA 2040
GTATATGAAT TTGGGATTGT CAGAGAAAAT CTAGGACATA GAGTCTTGGC ATCCATTGGT 2100
TCCCCCCTCC CCCAGCTAAT TAATTCCATG GGCATATATT ACAGTTCTAT CCCTAGAGCT 2160
TTAAACACAA AGCAAATGGT TTTTGCTTTA TTACAGTGAT GCTAGAATTG GTCTAAGGAC 2220
CTTTAAAAAG ACATGGATAA TTGTCTGTAT TGAAGTGTGA TTTTCTTCCA TTGTAGTTTT 2280
TATATTGTAT ATTTATGTAA AAATAAATGA TTTTCATGTT AAAGAAATGA CTTTAAAAGC 2340
TCCTTTTCAA GAAAACAAAT ATTTGGCCCG GCGCAGTGGC TCACGCCTGT AATCCCAGCA 2400
CTTTGGGAGG CCGAGACGGA CGGATCACCT GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGCTTCAACA 2460
TGGAGAAACC CCATCTCTAC TAAAAATACA AAATTAGCCA GGCGTGGTGG TGCAGGCCTG 2520