EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-01127 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr1:204254800-204259390 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:204255425-204255443GGAAGGCAGGGAGGCAGT+6.25
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:204255421-204255439AGAAGGAAGGCAGGGAGG+6.93
Foxq1MA0040.1chr1:204258016-204258027TATTGTTTATA+6.32
Gata4MA0482.1chr1:204258631-204258642TCTTATCTCCT+6.14
MecomMA0029.1chr1:204258626-204258640CCTTATCTTATCTC-6.42
SCRT1MA0743.1chr1:204255242-204255257AACAACCTGTTGCTA-6.13
ZNF263MA0528.1chr1:204255556-204255577AGAGGAGGAAAGGGAAAGGGA+7.28
ZNF263MA0528.1chr1:204255120-204255141GGAGGAGGACAGGGTAGAGGA+7.5
ZNF263MA0528.1chr1:204255057-204255078GGAGGAGGAGGAAAGGGAGGT+8.16
ZNF263MA0528.1chr1:204255054-204255075GGGGGAGGAGGAGGAAAGGGA+8.28
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_06666chr1:204255504-204259003Brain_Hippocampus_Middle
SE_08425chr1:204254857-204257802Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_28816chr1:204254505-204259219Fetal_Intestine_Large
SE_31690chr1:204254586-204258901Gastric
SE_37243chr1:204255433-204258878HSMMtube
SE_50227chr1:204255241-204257792Sigmoid_Colon
SE_52903chr1:204254784-204257672Small_Intestine
SE_65374chr1:204254475-204257762Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204258084-204259097Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1204257000204257857
chr1204254999204255106
Enhancer Sequence
CGCCGTGTTG GCCAGGCTCA TTATTTTTAA ATCACATGCA TTAAGACTCC TCTGCACAGT 60
TTGAAAGTAT CATTACTAAC AGCACTGGCC TGGTAGGAAA CACTGGAAAA GGTCATCCAG 120
CAGCTTAAGG AGGCTGGGAG AGAAGAGTTG GAGAAGGAAG AAGAGTTGGG GAGGAGGCTG 180
GAGACACAGA GGACCTGTTC CTCCCTCCTG CTTTCCTTTT CCTTCCTGGA TTGGCCAACC 240
TCTAGCTGAC GCTTGGGGGA GGAGGAGGAA AGGGAGGTCT TCTGTGGGGC CATTTGGTCC 300
AGAGCAGGAG AAGCTGGCAT GGAGGAGGAC AGGGTAGAGG AAGTACCACC AAGGACAGCA 360
GGCTTAGGAT TCTTCCTTCC CTGCACCTCC CCTTCCCCAC CCAGCACTCA TCCAGACCTG 420
GATCCTATGG AAATCACAGG TAAACAACCT GTTGCTAAGC AGACATCACA AGAAGCAGGT 480
GCCAGAGAGC ATCCACTGAT AACCGGGGCT TACAGAGGGG AGGGAAGACA ATCTCAGAGG 540
AACGGAAGAG GTGCTCCTAG GCCTAGACCT AGCCTAGAGA ACCTGCTGGC TATAGCCCAG 600
ATAAGGAAAA GAGAGGGCCT GAGAAGGAAG GCAGGGAGGC AGTCAGACAA GGGACACTGC 660
TGTTCCCACC CCTGTCCTGC CACGCAGCAG CCGTGAAGAA AGACTGGGCA TGGAGGCTGT 720
GACAAGGAGG AATAGAGTAC TCTGGGAGGG GAACAGAGAG GAGGAAAGGG AAAGGGATGC 780
AGCACAGGTG CCAGCCGGGA CAGAAGCCGG CCTCCATAAG TGACACCTGA GTAACAGGTG 840
AGCCTGCCTA CACCTGTTGG AGTATATGAG CAACTATTCT GCACCTGCAA CTTCTGGCTG 900
GGCCAGGAAA TAAGACCAGC TGCACAATTT GCGGGCCCCT TGTGCAAAAC TTAAGGATTT 960
CAAGACAGCA ATAGCAGAGC ATTAAACCAA GCATGTGGGG CAACTGCACA GTTTGCATCC 1020
CCCATGAAGC CCCCCTGCCC TGCCTGGAAA TAACAATCCC AGTATACTTC TCCTGGGAGT 1080
GTAGGGATGG AGGTTGGCTA GTCACATTTG TGGCTGACTC TCAATATGAG GCAGAACACA 1140
ACAAGTATCC CCGTTCCTCT CCTATACTCT ACTTCCCCTT CTTTCTTGGC CTCAAATGCC 1200
CAGAAACTTG GCTGCTTCTG CTCTCGCCCT GCTGGGTCTA GTGGCTGGCA CCTTCCCCCT 1260
ATTGTGCCTG GTTTCTGTTT GCCCATGGGC AGCCCAGCCA GAGGAAGCAC CACAGCTGAA 1320
AGCCACAAGG GGGTTGGGTT TACCTTATCG CTCGAATCTG CTTTCTAAAC TGGCACAGGG 1380
AGCACCCTGT TCCCACCTAA TAGGCTCTCC AGAGCCCCGA GTTCCTCCCT AGGTTCAACC 1440
TAGCATCACT ATGTCATCGA ATCTCTTTCC TCCCAAGAAA GAGGCAAGGG AACAAAAGGG 1500
CTCCTAGCTG GGGGCGGGAG GAGAGTAAAG TAAGCACTTC CTTTTTGGTG ACAGTCTCCC 1560
TCTTTTTTTT TTTTTTTAAA TCACGTGGGC ATTCATGAGT ACACACACAG AGAGATAGCA 1620
TCAGCTGAGA AAAGCCAGTG CGTCCACCTC CTCCTCCAAG CCAAGGAATT CTTGTCCACA 1680
CCCCCTCCAC AAAACTGTCA TTAGAAGGTG CCAGGGTCAA AGAGCACAAA TGTTTTGGAG 1740
GTTGAAGGGA TGAGGGACCT GAAGGGGAAG TTGAGGGAAT GGGGGCAACA GAAATCTAAA 1800
TGCAAAAGGT TGGTTCTCTT TCTCCCTGGA TTTCAGTTTT GTTCTCAACT GACAACCTTG 1860
TCTTCTTAAT GAGTGAAGAG TTCTCCCCGC AACTCTCTGC ACCCACCCCC GCCAGGTTCT 1920
GTCTTACCCT ACATCTCACC ACACCTGACT CTGCTAAGTA AAAGGATAAA ACCAGGAGCA 1980
CAGCCATGCC AGTCTCCTGT GGCTCTGTCC CCTCCACCTT CCTCCCGTGG CCCCATCCAG 2040
GAAATCGGCC CACAAGAGAG GCCGACGCTG CTTCTGACCA GAGCTACCGA GCGCCTCTCT 2100
GGAGACAATG GCTCAGAGAG AAGGAGGAAG ACTAGCAGCT CCAGCTTTGT GCTCAGGGTG 2160
GCCACACAAA ACCATTGTCT TGACATCAGG ACAGACAATG GTTTGTATCT CTGGCTTCTG 2220
CGCTGAGCAG TTCACTCCCT TGGACTAAGA TAATTTTAAA GATTTCCTTC TAATAAATAG 2280
TAATGATACT GGAATCTGGC CTCAAGCTGA GAATTTGTAT CTGGTTGTAA CAAAAGCCCA 2340
CTCTGGCTGA TAGAATGGGT ATATCTAGGC TTCCTTTTCT GTTCCAGAGC CACCCAGACA 2400
AACATAGACC AGACAGATAA CCACTTACTC ACCGGCTCTT CTTTGCTGTT CCCTCTGCTG 2460
CCTCTAGCCC TGACTCCTTT CACACTGAGG AGTAGGGAGA AGGTTTTCCT TTAATACTCA 2520
CCAGGTCCCT GGTGGGTAGC AATCATTAAC AGCCACACAT GCTGGCTGGC CTTAACCCCT 2580
TCAGTGCTGG GTTGCCTCAG CCAGCCGGAG CTGGCTGATG GACAGCCCTG TCCCTTCTAC 2640
TCTGCCCTGA GAAAGTAGCA ACTCCCACCT TGATGCCATC CACCTGAGTA ATGCTGCCGC 2700
CTCCCATGTG GAGAAGGAGA GCCCTCTAGT CCCACCCAGG CCGCCCCGCC TGATTGGAGC 2760
ACACTTGCAA CCTGAGGCGT TTGGCTCTGG CACGATGCCC AATTGGATGA GCCCACATTA 2820
TGAAATATTT GCCTGGCGGG CCAATAGAGG AACTGGGATC TGGGGGAGGG ATGATATTGT 2880
TATTTATTCC TGGAGGAAGG AGAGCAGACA AAGATAGTCA CAGCATCCCT AGCCCTGGGA 2940
TGGGAAGCAG TGGGAAGGTG GTCTTCAGAT CCATGGAACT GCCTCTAACT GCTCTGTCCA 3000
GGTAGAGTGA ACTAATTCTT GAAGCTTTCT AAGCAATTTG AGCCTGGCTG TTCAGCTAGA 3060
GGGTTTGTTT TTATTTTTAT TTTTTTACCT TAATGTCTCT CTGCGCCACT CAGAAGTTTG 3120
GAGAGCAGCA CTAGGAATTG TAATAGAGAT TAAGAGGAGA AACACATTGT CAGTCAAGGA 3180
ACTGCTTCAT ATCTGCATAA ACTATGCAAC CACAGTTATT GTTTATAGTT CAAAGTTGCA 3240
GAAATTATTT TAGTGTCTTT GGAGGATACA GACGGAAGGT GAGCAAGAAC AAGAAGAGAT 3300
AAATTCCCTC TTTATCCTTT AAAAATAGGC AACTGATTTG GGGGAAATCT AAAAGTATCT 3360
ACAAGCAGGA CACATGCAAA TCTATGCAGA TGTGTGCAAA TGAGCAGCGC CGGGCTTGTG 3420
AGAGTAAGTC CTTGCCAGGA TTTTCCTCAT TTGAGGAAGA AATTAGGTAG TCTCTAAACC 3480
CCATATCAGA GCATCTCACT AGAGCATAAG GAACTCAATA AGCCTATATT TATTGAGCAT 3540
TTACTCCATA TGAAACAGAG TGCCTTTAAG TACAGCCCAG TAGGATTTTT CTTTTTTACC 3600
ATGATCATAA ATGGGATATA CAGAGAATAC AAGTTCCCTC TCCCTACACA CCCACAATTA 3660
ATAGCCCCTT CTCCTTTCAG GCCCCAGAGG AGTGATTTGG CTACTCCTCC TCTTGCCAGC 3720
CCGGATTTAG TAGCTGGCAC CTCCTCCTTA TCACCCCTGG TTCCTGTTTG CCTATCAGTA 3780
GCCCAGCCAC TGTGGCTCAG GACCCTGCTT TAAACCTGCC AGGGGGCCTT ATCTTATCTC 3840
CTGGGCTGCC TTCCTAGCAG CCCGCGGGGT GGCTGGCTGG CCGGGTTCCT TAAAGGGGCT 3900
GCACTGCATT CCCACTTGCT CCATTCACCC TCAAGAGTAC CCCAGAGATC TGGAGGTGTT 3960
CTACTTGTGT AGGGTCAGAA TTTACTATAC CACCCTTCCT TCCCATCCTT TACAGTCACA 4020
GCTACTGTAG AGCTGCTACT GAAATGATCT ATGACTTAGA ACAGAAAGAT GCTCATGCTT 4080
TTAGAGCCAT TGTAAATGTT TATCATGTCA TGCAAATGCC CTGCCCCTTG ATATTTTCAG 4140
GTTCCTGCTC TTTTAAATTC AATTTTCAAA GCAAGGGAGG AGAGGCTCAG GATACAAAGT 4200
CTATATAGAA AAATCAGTTG TATTTCTATA TACTGGCAAC AAACAATGAA AAAAGGAAAT 4260
TTTAAAACAC CATTTATAAT AGCATAAAAT TAAGGGATAC TTTTGACAAG GGATGTGCAA 4320
GACCTATACA CTGAAAACTA TAAAACATTG CTGAAAGAAG TGAAATAAAA TCCAAATAAA 4380
AGGAGAAAAA TACTGTTTTC ATGGATCAGG AGACTCAATA TTGTTAAATT GTCAACTCTC 4440
CCCATATTTT TCTATGGATA CAACACAGTG CCAACCAAAA CCCTAGCAGA TCTTTGTAAA 4500
GTTGACAAGC TGATTCTAAC ATTCACATGG AAATTCAAAG GATCCAGAAT ACTCAAAAGC 4560
TTTGAAGAAG AATAGGTTTG GAGGATTTAT 4590