EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-01090 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr1:201235650-201239080 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr1:201238177-201238191ATTCCCCAGGGACC+6.84
FOSMA0476.1chr1:201236046-201236057GATGAGTCACA-6.14
GSCMA0648.1chr1:201237869-201237879GCTAATCCCC+6.02
JUNDMA0491.1chr1:201236046-201236057GATGAGTCACA-6.14
KLF4MA0039.3chr1:201236015-201236026CCACACCCTCT+6.02
MEF2CMA0497.1chr1:201235678-201235693TTCTATTTTTGGACT-7.27
Nr5a2MA0505.1chr1:201237750-201237765GCTGGCCTTGGACCC-6.24
ZIC1MA0696.1chr1:201237692-201237706CACAGCAGGGGGCT-6.01
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_26526chr1:201235717-201237437Esophagus
SE_26526chr1:201237453-201239549Esophagus
SE_35843chr1:201234594-201238839HMEC
SE_37062chr1:201234857-201239624HSMMtube
SE_64243chr1:201234398-201239013NHEK
SE_68514chr1:201210031-201254923TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr1201235691201237000
chr1201236006201236165
chr1201238600201238622
chr1201238484201238741
chr1201237679201238422
chr1201238000201238600
chr1201237729201238000
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I201265chr1201234755201239296
Enhancer Sequence
TGATGGTTTC AAGCCTTTCC TTTAGCCATT CTATTTTTGG ACTTGTATGT TGTTTCTAAC 60
TAGTTTATTA GCTGTGTAAT TGCATCTAGT TCCCAATTGT TTTCCTAACC CTGCAATCTC 120
TTCATCTCAT TCAGTTTTAT AATTATCTAG TCTTTGTATT TATATGGTAT TATCATACTC 180
TGAAACATGA AACACTGGTG AGGAATTTGT TTCTGTTTTC AGCTCAGGTT TTCTTCCAGC 240
TTGGACTCTT TCACCTGTTT TCAGGCTATA TTCCTTCCTT CTTGTTCCCC TGCCTGCATA 300
GTATATTTTC ATAGTTGCTG TGCTATTTCT TTTCATATTG CTTACTCTAA CATGAACAGC 360
TCTGTCCACA CCCTCTACTT GCTTTAATAT AAAGCAGATG AGTCACACGT GTCTCATATT 420
GTTCCCTAGA TTGCCTCATG CATGTAAGTC TTGCCTGAAT GCCTGTGGCC TCCTCAGAAA 480
CAAGGAACCT GCTTCATTCT CCTCTAGCCT CGGTGCTATT CCCTGGTACG TGGCTTGCCA 540
CAGGCACACA AAATTGGGTG TCTGGGTTTT GACTCTAATT GTCAGAAATT GGGGATATAT 600
CAGGTTCTTA AATCCTAAAA GGCATTTAGA AAAATAATGA CAGGATTCTG AGCAGCAGTT 660
CTGGGAGCTT ACTGAGGATA AAACAAGACA AAATGTATTT AAATTACGGC AAGAGAAATA 720
GAAATTACTC AGAAAACATC ACTTGCTGAA TTCCAAGAGT TTACCTGCTA CTAACTTATA 780
CTAATTTACA GTGGCAGAAA CCTTAGGGTT ATTTCCTTGA GGAGAGGGGA TTTTATTTGT 840
CTCATCTTCT GTGAGTGTGG AGTTTGCTTT GCAAAGTGCT ACATCTCATA TCTATACTGT 900
CAGGAAAAGC TTTCTGGAAA AATTCCAACA ACCACCACCA TTTATTAAAT ACCTGCTCTG 960
TGCCAGAAAC TTTATATGGA CCTTCCCACT GAATCCTCTC AAATGATCCT ACAAGCGTGT 1020
TTTCACGTCT CCTTTTGCAG TTAGGAAAAC TGAAGTTAGA GCAGTTAGGT AAGTAGTCCG 1080
AGGACACAGA CTGGTGAGCG TCTGAGACAG GTGCACAGAC CCACCGGTCC AGGCCCGGAG 1140
CCTGTGCCCC TCCACTGTGC TGCCTCCCAA GCTGGCGTTA AGGAGGTGAG ATTTAGACAG 1200
GTTTCAACAA GGCAAGGGAA ACAGAATGGG GCTTGAAAGA TAGAAATGAA GAAAGCATTC 1260
TAGGCTATGG GAGTAAAAGG GGTGAAATGG CAGAGGGAGA CGCGAGAGAA GGGTCTGGAT 1320
ATATACCCCA AAAATTGAAG ACAGGGACTT GAACAGAGAT TTGTCCGCCC ATGTTCATCG 1380
CAGCATTACT CACCATAGCC AAAAGGTGGA AACCACCCAC CGTCCATTGA CAGGTGAATG 1440
GGTGAACAAT ATGTGGTCTA TCCACACAGT AGAAAAGGAA GGAAACTCTG ACATGTGCTA 1500
CAATATGGAT GAATCTTGAT GACATTATGC TAAGAGAAAT ATGCCAGTCA CCGGAAGACA 1560
AACACTGTCT GATTCCACTT AAATGAGTTG CCTAGAGTGG TCAAATTCAT AGAGGATGAT 1620
GCGTCAGGCA CTAGTGGGAG AAGGAAATGG GAGTTCTTTT TTAATGGCTG CAGAGTTTCA 1680
GTCTGTGATA AGGAAACAAT TCTGGAGAAG GATGACAGTG ATGGCAACCC AACAATGCGA 1740
ATGTACTAAT GCCATTCAAT TGTGCACTTA AAAATAGGTA AAATGGTGAA TTTCATGTTT 1800
TGCATATTTT ACTACGATTA AAAACATGTA TAATTATTTA GCTACACCTG AATGCTCCTT 1860
AAAAGTTCAT ATTCCTGAGC CCCAGCCCAG ACCTGGGTGG GCTCCTGAAA TGTCCCTTTT 1920
AAAAGAAGTA ATGCCAGATG ATTCTCACGC TCTGTAGTTT GAGAATCATT GGCTGGAACG 1980
AAGAGGGCTG ACTAGTGACA AGAAACTGGT CTGGAGGAGT ATGCGGACAT GGCCAGTCTT 2040
CTCACAGCAG GGGGCTGTGT CCAGCAGCCT GCAGGGACCC TGCACCACTC CACTCTGTCT 2100
GCTGGCCTTG GACCCTCGAC GTGGCAGCCT GCCTTATCTG GGATAAGCTC GTCCTCATCG 2160
CAGAATCCTG ATCCAGCTGC CTCAGCAGCA GCTGCTGCAG GGAGGGAGGG CGGTGGAGAG 2220
CTAATCCCCT CTGCTTTGGC CCAACACCGA GGCAGAGCCA TCCCCCAGAA CCAGATCCTA 2280
CTACGGGAAG AGCCTGACAG GCCATCTGGC TCTTCTTCCC ATCACTGCCA GACTCCCTTG 2340
TACCATGGCA CTCCCACGTC TGGGTCCAGG ATGATTCATT CTTCACAGAG GCTTCGTCCA 2400
CAGGGAAGTG TCCACATGCA GCGTCTGGGA GAGGGTGGAC ACTGGCTGGT GGCCAGGAGG 2460
CCATGTCTGA TCTTGAGAGC CAGGCTGCAT GGAATTATCT GGTAAACGGG GTGCTGTCAT 2520
TGTTTTTATT CCCCAGGGAC CAGGCCCCTC CCTTGCTCAA AAGAGTCTAC TATTAGTTAC 2580
CTTGGGTCCC AAACACCAGG ATTCTGCGAG TCTACCTGAG TGAGAATCAG GGGCTGGATG 2640
TCTGCCAAGA CTCACTTGTC TCTTCTTTTC TCTCTGTGAC TCTGCTTCAT TCTCTCTTTC 2700
TCTCTCTCTG AAGCAGGGTT CTCTGTATGC CAGACAACAT GTTAGACAAA TAGGCTCCCC 2760
GCTACCCAGA GAGGCTCATT CCCACAGAGT CCCGATTCCA TATTCAGGGT TACTGTTTGG 2820
AGCAGTTCAG GTCAGCTGGA CCCCTAAAGG TCCATGTCAC CGTCATGGCT CCTGAATACC 2880
AGGGCACGCG CTTTCTGAAA AGGCAGAGCT AGGAAAGGAG CGGTGTTGGG AAATAAACCA 2940
GTCCTTCTGG CTCCAAGTCC CAGCTCGTTC CTCTACCCCA GGTTGCTGGG TTTTCTGTAT 3000
AATGTGGTTG ATGATTTTCA AATCTCTCCT GATGTAATCC AGATTTTTTT CTTCCTTTCC 3060
CTGAATTTCT CTGTGATTAG GCTAAGCCAG GAGGCTTATT GCTAAGGAAG GATATAGAAG 3120
AGGGGAAAGA AGCTTCCACC CAGCAGGAAG AAGAAGGAGA AAACCCTTTC GTAACCTGGG 3180
AGAGGGGACA GGAAAGGCTA TGGGGTGAGA ATAAAGGGAT CAGACATTGA CCTCCTCCCC 3240
TACTGTCAGG TTCACGGCAA GAGGAGGAAA GTATTGTTAG GGGTAGAAAC ACCCAAAGAG 3300
GTTTGGTGGG AGACTCCGGT GCAGGGGCCT TGCTCTTAGG TTCCAAGGAT ATAGACCTAG 3360
AAAATTGCTA GGCTCTCAGA AAAGTCTTGT GGTCTCCATG AAGCCACAAG ACTCCAAAAA 3420
GGGACAGGGC 3430