EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-00949 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr1:172901540-172904810 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr1:172901662-172901676CCAATATTGCTACA+6.27
FOSMA0476.1chr1:172903188-172903199GATGAGTCACA-6.14
JUNDMA0491.1chr1:172903188-172903199GATGAGTCACA-6.14
NFE2L1MA0089.2chr1:172903201-172903216CATGCTGAGTCATGC-6.81
Nfe2l2MA0150.2chr1:172903203-172903218TGCTGAGTCATGCTG-9.03
TCF7L2MA0523.1chr1:172902100-172902114GAACATCAAAGGCA+7.28
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02673chr1:172902365-172904239Astrocytes
SE_34373chr1:172900698-172904579HCT-116
SE_37116chr1:172901786-172904484HSMMtube
SE_37971chr1:172900401-172906219HUVEC
SE_39022chr1:172901218-172904657IMR90
SE_45341chr1:172902883-172904298NHLF
SE_46344chr1:172901586-172904473Osteoblasts
SE_52221chr1:172902706-172903851Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_63524chr1:172902653-172904093HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1172903010172903534
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I172931chr1172900674172905932
Enhancer Sequence
CCAAGTGCTG ATCAACTGAA AGAAAATCCA GGGACACAGA GGAGACAAAA GAGGTTAGTG 60
GGAAACCCAG CAAAAGGAGA CTCAATGGTC ATAGCCCCTT CTGCCCTCTG CTGCTTATGC 120
TGCCAATATT GCTACAGTTG TTTAGCCTAA AGGTGGCTTC TGTGTTTTGC CCCAACATCA 180
GCTTCAGATC CTCTGCCTTT CTCCTAGAGG TTCTGTACTA TCTGGTTGGC TTTGAGCTTC 240
ACAATAGAAG GCATAAACTG CTATCTCATG GATACCAGAG CAGGGGCTCT CAAGCTTTAG 300
CATGTATTAG AATGACCTGA AAAACTTATT AAAACACAGA TTGCTAGACT CCATCCCAGA 360
GTTTTGTGAG GTGGGGCCTA AGAATCTGCA TTTCTACATA TTCCAAGGTG CTGATGTTGT 420
CACAGGTCTG AGAACTATGC TTTGAAAATC ACTGATCTAC AGAAATGGAG TGACAGTGAG 480
AAATGGGCAG TCATGATCAA AGTACACTCC TGCTTGCTAT ACTTGTACAA TGCTTACTAA 540
ATATAAAACC AAGTTAACTT GAACATCAAA GGCATCTTAA ATGGGGCACA TGCCAAAAGG 600
AGGAATTACA GCTGAAAAGT TGGAATATAG GGAAAGTCAA TTCCACCTTC TGCTTGAAGA 660
TGGTATCAGG TCTAGGAACG TGGGGTTCTG GGATAATCCC ATGGAATCAA ATCTTATGTG 720
ATGTTCTGCT TCATTTTGAT TGCAATCACT AGCTTTCTTT ACCCTGAGGC TAGTTCTTCA 780
GTTCCCAGTA TGGCACACAG TGGGCTGAGT GGAAGGGACA AAGGTGAACT TCTCAGGGTT 840
ACTGTTGGTA TTCATCACCA GCCTAAGAAC AGAAAAACAC AGCCAGGAAG AGAAACTCAG 900
GTGAAACTGG ACAGCCAGAG CAGAAGTGGC TCCTAGATAG TGGCTCTAGA AAGTAAGGTA 960
TTTTTAAATG TTTGGGGGGA TTTATATATT AAAAAAATAG AATTTAAGAA GTCATTAATT 1020
AGGTTTTGGT CTTGATGTAG GTTGCTTAAG AAGAAAAAAT CAGTTTCATT TAGAGGCCTG 1080
TTTTGGAGAT TGGTTCTTAC CTTGTTGGAA TAGAGATAGC AGACTTGGGC CGGGCGTGGT 1140
GGCTCACCCC TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCTGAGGC AGGCAGGTAG CTAGGTCAGG 1200
AGCTCGAGAC CATCCAGGCC AACACGGTGA AACCCCGTCT CTACTAAAAA AAATACAAAA 1260
AAATTAGCTG GGTGTGGTGG CGGTCGCCTG TAGTCCCAGC TACTCTACTC AGGAGAATGG 1320
CGTGAACCCG GGAGGCGGAG CTTGCAGTCA GCCAATATCG CGCCACTGCA TTCCAGCCTG 1380
GGCAACAGAG CGAGACTCTA TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA AAGAGAGAGA GATAGCAGTC 1440
TTGGCCTATG GACTGGATTC TTGTTTCGCT TGTGATATCA CTTTTTCCAG TCACTGATTT 1500
GGAATATTTG CGTTTTTTAA CTTCTCTTTG TCAGATCTCA GGCTGCCTGG GAGGTTGAGG 1560
GTAGGGGTAG AAGAGGGATT ACAAAAACCT GGCAGCCTCC ATGGACTCAC ACTATGGGTA 1620
CACATTAGAA ATACACCAGG GAATGGAAGA TGAGTCACAG CCATGCTGAG TCATGCTGGC 1680
CAGATAACTA TCAGAAGGAT TTCCTGTTTG CCTGCGAGGG ACACAGATGA TAAATTATTT 1740
TTCCTCTTAT TTAACCCATT TGTGTTAATA ATAACGTCAT AGATGGTGTA TCCCTTGGTC 1800
CATTATCAGA ACTCTCTTAG TTTAGTCTTC CAAATATAGA AGGAACAATG GGACACAGGG 1860
TCCTGAAGTG AGTCTGTGCC TTATTCGGTA AATTTGATGC AAGCATCTTT GCCTTTAAGT 1920
GCAGAGAATG TCAGTCTTCT CACACGGAAT GGGGAAGGCT GCTTTGTGTA CTTCCCCTGA 1980
CACTACAGCA TCCAGATGGC CAGTCATCTG GGAAGAGGAG AGCAGAGTTA CAAAGGAGAC 2040
AGAGTCAATG ATAAGTTCAG AGGCCTAGGA AAGTTTATTT AACCATAATT GTCATCACTG 2100
AGTGAACAGG CAAAGAACCC GCATTAAGTC TTGCTCAATT TCTAGAAGCA GATTCCCAAA 2160
CGTGGATGTG CCTATGCATC CATCTCCTGC GATGCTCGTG ATCAAGGTAA ATTCCTTGCT 2220
TCTATGCATA GTCCTGGAAG CTGATTTTTT AAAAGACTCC CTTCCTCAGT AATTTTGATC 2280
CACTTTGGAA AACATTGCCT TGGATGACAT CCTCTTCTGG GCCTAGTCAT TGAACATGTT 2340
GAAAATTGTA ATGTCTGCAA CATGGAAATG TACAGCTAAA ATTTACACTA GAAATGACTT 2400
GTATGTATGG TAGAGGATAA AAGTGGGGAT GAGAAGAAAA GAGAAGAGGA GCACATTAGG 2460
ATCAACAATT TTAAGGTACT GAAGAATGTG AGCATTCTGT AAGCCACAAA TTACCATGCT 2520
ATGAAGCTTC AAATTGCACT TATGCCACTG GCCAACATAT ACATTCATCA TTTGTCCTGC 2580
TCTATCATGG AAAGAATGGA TAATTTACAC TGCTCTTGAT TTTTTAAATG AGATTCACAT 2640
ACCATAAAAA TCACTATTTT AAAATGTACA GTTCAACAGT TTTCAGTATA TTCACATAAC 2700
TGCAGATATC ACTATCTAAT TCCAGAATAT TTTCATCACT CTCAAAAGAA ATCTATGCTT 2760
GAATAATCCA TTTCCTATTC TCCCCTCCAA CCTCTAGCAA CCACTAATTT ACTTCCTGTC 2820
TCCATGATTT GCCTATTACG AAAATGCTGT ATAAATAGTA TCATGGAAAT GCTGTATAAA 2880
TATGTGTGCT TTTGTGACTG GTTGCTTTCA CTTAGCATAA TGTTCTCAAG GATCATTCAT 2940
GTTGCAACCT GTGTTAGTAC TTCATTCCTT TTCTGAGAGT AAGTTATATT CCATTGTATA 3000
GATATACCAC ATTTTTATTT ATCCATTAAC CAGCTGATGG ACACTTGAGT TGTTTCTACT 3060
TTTTGGCTAT TCTGGGTAAT GCTGCTATGA GTGTGTGCAC ATTTTTAGTG AATATATGAT 3120
TTCATTTCTC TTGAGTATAT ACTAAGAGTA GAATTGCTTG ACAATATGGC AATTCTATTG 3180
TTTTCTTCAT ATAACCAAAG GAATTCTTCA TAAAGTTGCT GCCCCTATAC TGCCAGAGTC 3240
TATTTCTCTT GGATGGCATT CAACAGGAAT 3270