EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-00860 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr1:159885600-159886860 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12122337chr1159886422hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT-6.12
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT+6.46
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:159886551-159886569GGAAAGGGGCAAGGAAGG+6.32
MEF2BMA0660.1chr1:159886082-159886094GCTATAAATAGT+6.18
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159885104-159886879Aorta
SE_02391chr1:159885366-159886916Astrocytes
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_13325chr1:159885066-159886957CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159885331-159886978CD34_Primary_RO01549
SE_17500chr1:159885071-159886264CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_30108chr1:159886059-159886832Fetal_Muscle
SE_34858chr1:159885031-159888333HeLa
SE_36438chr1:159885508-159886945HMEC
SE_38165chr1:159885029-159888329HUVEC
SE_41182chr1:159885360-159886918Left_Ventricle
SE_42315chr1:159885077-159886984Lung
SE_44957chr1:159885611-159886831NHLF
SE_47692chr1:159885387-159886849Pancreas
SE_48986chr1:159885191-159886903Right_Atrium
SE_52604chr1:159885209-159886864Small_Intestine
SE_53483chr1:159885044-159886920Spleen
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159885478-159886944NHEK
SE_65431chr1:159886137-159888901Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
TGTTCCACCT TTTATTCCCC ACACTTCCAT TTCCTGAGCA CTATGTGCTA GCATTCCCCA 60
TGCAAAGTGC TTTCCAGGGT TCATCTAATC CTCACGGCAA CTTCACGAGG AAGGAATTAT 120
CATCTTCAGC TTACAGATGA GGAGCATTGC CCTGCCACCC ACCACCACCT CTGTCCCCTA 180
GTCCCTTGAC AGCTTCACTT CTTGCTGAGC CTAGAGCTGC ACAGGCTCAG CCAGGTTCAG 240
AGCCAGCTTG ATTGGATGCA AATCCCTGCT TCTCCCTTAA TTGCTTTGTG GCCCTGGGCA 300
CATTCCTTGG CCCTTCTGAG ACCAGTATCC TCATCTAAAG ACAAAATGGG GAACACATTA 360
CAGTAATATC CACCTCCTGG GCGTTTGTGA GAATCTTCTG GGAGAAGGCA GTGGTTCTCA 420
GCGCTGGCAC TGTAACAAAT GGCATTTCTC AGAGTTGTGA GGCGTGTGGC CAATAATTTA 480
TAGCTATAAA TAGTTAAACC AGGGAAGGTG GCAAACGGCT TGTTGTTTTA GTATACATAG 540
CGAATTCAAT GTTTTCTCTG CAATGACATC ACTCTCCCTG ACTAGCATTC CACAAAGCCT 600
TCCTGAATGA GAGATAAAGG ATCTAATCCC CTGGGAATTT GCCCATAGGC TGCAGCCTAT 660
CTTATCTGTG CCACAGCCTG TGGGAGTGCA GCAAGCAAGC AAATACAGTC TCTCCCGAGG 720
TGTGGTGTGG CAAGGCTAAG CGTGGTGTGG GGATGAGGCT GACAGCCATG GCTATGAAGA 780
ATTGGCATTG GGCCTCGCCC CTAGTGGGTG CTTTTTGGAA GAGGGAGCCT CAGAGAAGCA 840
GGGGAACAAA AGGGGAGAGA ACAAAAGCTC TGGATACAAA CCTGTTTCCC TCAGGCACAG 900
TGTTGTGGCT TTCTCCTCCT AGGAGACAGA GATACCCTCA GGTAGAAAAG GGGAAAGGGG 960
CAAGGAAGGC CAGGCCTCTG GGTGAGGCTG ATGGGGCTGG AACTTAATGT CAGACTGGCC 1020
CAGCGTCCCT CAAATTCCCC CTGGGGAGAC ACAGAGTCTG ACTGGGAAGC CTTGGGGTAA 1080
AGGTAACACC TAGTGGTTAG AAACTATGGG TGGGGCTCCC AGCACTTTGG GAGGCTGAGG 1140
CTGGGGAGTT GGGAGATGGC AAGAAAAGGC AGAGCCATGA GGTCAGGCAG ATCGCTTGAG 1200
CTCAGGGGTT CGAGACCAGG CTGGCCAACA TGGTGAAACC CCATCTCTAT AAAAAATACA 1260