EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS173-00139 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SH-SY5Y 
Coordinate
chr1:20802070-20805280 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20803030-20803671Brain_Angular_Gyrus
SE_03446chr1:20803754-20804585Brain_Angular_Gyrus
SE_05163chr1:20802127-20814849Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20802438-20803173Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20803865-20804568Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_41848chr1:20804758-20805193LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
AGGCAGGAGA ATCACTTGAA CTCGTGAGGC GGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGTGCCAT 60
TGCGCTCCAG CCTGGGGCAC AAGAGCGAGA CTTCGTCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAG 120
TTCAGAGTGG AAGCCAGACT CAGACTCAGT TTCCACTCCT GGCTCCTTCC TGACTGAGGA 180
CAGGTTACTC AGAACCTCTG GGCCTCGGTT TCTTTGTATG TGAAATGGGC ATGATATATA 240
GTTGTAACTG GCACACACCA TAAACATGAT TCCTAGGGCT GCTGTGAGAA TTAAATAAGA 300
AAATGTACAC GGAACACTTA GCACTGTGGC ACATGACAAG AAGGCTATTA AGAAAATTTA 360
AATAATGGAA AAAAAATAGA ATACCGATAG TGATAACTGC GCACTCATAC AATGCCTTGG 420
TTGCAGAGGT CATTCCCCCA CATTACCTTG TGGGGTTTGA TCAGCAGTTC TGGAAGCACC 480
TAGGGCAGGA ATCACCACCC CAGGGTCACA GATGAGACTG CTGAGGTTCC CAGAGGACCC 540
AAGCAGGGCT GCAGGTGCCC TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT GCTCTCTGGT TCCGGAAAAG 600
AATTCTGGGT GAAAGCGGGA GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC CCCCAGGTAC CCCTGAGGTC 660
TAACTCTGGA ACTCCTTGGA TAATGAGAAA AGGGGGGCTT CGGAACCCAG GACGTGGGTT 720
CCACATCCTG CGGGGGCAGG GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC CAGACGCAGT AAATAATTCA 780
CACAGATGAA CTGGAGATAA GGGCGGCTTC GTGGAGGATC GAGTTCAGGT CGGAGGAGGC 840
TCAGACGGCT GGGGGGACTT GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA GGGGAAAATT CCTGGGACTC 900
TGGCTGCCAG GAAAACACAG TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT GCCACTCCCT GCCATTGGCG 960
GGAGGGAGCT CCCCGGAACT GCCCCGCGGG GCAACAGGCC TGGCCAGCCG CCTCCGCCCA 1020
GCCGTCCCCA TGGCAACCGG CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA CGGACAACCG GATCCTCTGT 1080
CTCCCCTCCC CCACGGGAGG CTGGGCGTCT TAGACTCCCA ACTGTGTTCT CTGGGAGCTT 1140
CCAGCTGCAG GAACCTACAG AATCATCCTG TCTGACCCCC TCGTTTTATG GGAGTAGTTG 1200
AGACCACGGA CTCTGGGGAC CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG CCCCGCTCCA CCATTTCCTG 1260
CTGTAGGATC CTAGGCAGGG GACTTGGCCA CCCTGTGCCT CGGTGTTCAT TATCTGTAAA 1320
ATGGGGATGA TAATAAGTGA CTGTCTTATA GGGTTGTGAA AATTGAATGG ACTAAATGCA 1380
AAGAGGGCAG AGTGGTTACT GGTCTGTAGC CAGCACTGAG GAAGCATTAT TTTCCATGTT 1440
GGGAAGGTGA CGGTCACACA GCATGCTATT AGCAGATTTG GGATTGGAAT GCAGTTGCCA 1500
ATTCTTCCTA AAACACCCAG GGTGGCCACA TTGGGATTCT CCAAGGGTTA CCTGTGCTTC 1560
CTGCGGGCCC ACCCAACCCC CCTCTCTAAC CTCTTGACAG TCACAGTCAT TGAATTGTCT 1620
TTGACCAGGC AGTAAAATCC CTGAACCAGA AAAGGTCTTG CTCTAGCCAG CCCGGTCTCC 1680
CCAGTGCCAA GCACAAACCC GTTTCCTGCA CCTCCACTTT CCACCCCATG CCTGGTAGAG 1740
GAGTTGTTGA ATGAATATAG ATTTAATTAA TTAATTAGTT CATCTCCTCT ACCCAAACAC 1800
CCTCCCAGAG CAAGCTCCTG AAGCCCCTGG CCACCCAGCT CTCTCTCTTA CAGGACACCC 1860
CTTACGCTGA CCACTTCCTG CCATCAGCCC CCACCCCACC CCACTGCCAT CACCATGCTG 1920
TTCACAGTTC CCATGGCACA TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC CCTTCAGCCT GCCCTCCCTC 1980
ACTTCCCTCC CCGGTTAGTG ACCCTTTGTC CTCAAAATGG CTGTTTTGGG GTCAAGGACC 2040
CTCCTCCAGG TCCAGAGGTG TACATTTCCC CTGGGTTAAG GAAAAACCCT CCAATGTGAG 2100
AGGCAACAAA GTAAACCGTC CTCATCCCCC ATCCTGGGGG AGACAAATGG GGGCCTGGTA 2160
CTGCCACGAT GGGTGTAGGG GTAATCCAGC GGCTTTCTGG GACTCTCCAT CCCACTAGGG 2220
AGGTGGCAGG GGCTTTTGGA CGCAGAATCT CTGCCCTTAG GGGCCACCCC ACAAGCTCCA 2280
GCCCAGCTGC CAGGTTTCCT CGGATACGGC CCAGTCGCCT CTGATTTATT TTTGCATGTG 2340
GTTTGGGAGA ATCTCTGTTG CTGGAATAAC GACAACCTTT TTTTTTCTCT CTCTCTTTTC 2400
CTTCCCTCCA ATAGGCAGAC TTTATAAACC AGAGCAGCTG CCTGAAGGTT TCCAAGAAAA 2460
AAATTCTGCA CAGTTTCTAA CCAGGGTGAC AGTTCCCCTC CACAGGAAGT TACTTTTATT 2520
AATTTTTTTA TCTCTTCTTT TGTAAGACTA TATACTGGTC ATCAGGCAGC ACCTGTGGGC 2580
ATTTTCTTAT TTCCCCCCAC TGCTCCCATT TGCCTGGAAT TCATTATTAA ATCTAACTCA 2640
TAGTGGCCTT GCCCAACACA GGGGCGAAGT TCAAACTACT GAAAAATGGG TCACTCAAAT 2700
CGCCTGTGCA GAAGAATCCC AAATAATTTA TGGAGATACT CCTCCCTCAA GGCGGTGAAA 2760
CATAAATCCC TGTCCCTGAA GTGTGGGCTG TGCATAATGA TTTCCTTCTA TGGAGTATAG 2820
TATGGAAAGC AGGGGGAAAG AGTAATCTTG CAGGAGAGAA ACCTGACAAG CACTAGCTCA 2880
GCCAGATGGC CAAGGTCAAC ATCAGCAGCG ATCAGTCGTG TCTATAGCAT GGACACTTGA 2940
TATGATGTGA TGGAAACAGC ACATCACCCC CAAACCCATA ACCACAGTTG AACCATGAGA 3000
AAAACAGCAG ACAGACCCCA CCTGAGGGAC AGTCTACAAA TTACCTGACC AACAGTCCAT 3060
CAAAAGCAAG GAAAGTCTGA GAAACTACCA CAGCCAAGAG CAGCCTAGGG AAATAAGATG 3120
GCTGCATACA ATGTGAGAGA CCCTGTGGAA CAGAGAAAGG ATGGTGGGTA AAAACTAATA 3180
AAATCCAAAT AAACTACAGA GTTTAGTTAA 3210