EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS172-00757 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SGBS_adipocyte 
Coordinate
chr1:152001540-152003890 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:152001637-152001655GCTTCCTTCCATTCCTCC-6.09
FOSMA0476.1chr1:152002983-152002994TGTGACTCATT+6.62
LMX1BMA0703.2chr1:152003874-152003885AATTTAATTAA+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:152003776-152003791CGATCTCTTGACCTC-6
PHOX2AMA0713.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
ZNF263MA0528.1chr1:152002735-152002756TGAGGAAGAAGGGGAGATGGA+6.18
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09446chr1:152001463-152003803CD14
SE_19080chr1:152003527-152010096CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26843chr1:152001042-152002228Esophagus
SE_26843chr1:152002262-152002886Esophagus
SE_33944chr1:152001602-152002872HCC1954
SE_34680chr1:152001289-152002829HeLa
SE_35894chr1:152000890-152002901HMEC
SE_64304chr1:152001376-152002942NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1152001678152001977
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I152028chr1152000990152002822
Enhancer Sequence
GGCATCATCC AATCGGCTGC CAGCGTGGCT AGAACAAAGC AGGCCGAAGA AGCTGGCTTG 60
CTGAGTCTTC TGGCTTTCAT CTTTCTCCAT GCTGGATGCT TCCTTCCATT CCTCCTGCCT 120
TTGGGCATCA GACTTTTTTC TCTCATGACT CATATCCAAC CAAATCCCCA AGCCCATTTG 180
ATGCTCCACC CAAATATCCC TTGAATCCAT CCCCAACCAC CCACTGTCCA GGCCACCACC 240
TCCTCTGATC TGGATACTGC GGCAGTTTCC TGATGTTCGT ATTCTTTTCG CTTTGCCCCC 300
CCGGCACAGT GTCTGGAACA TTATAGAGAC TCAAATATGC ATTGCATGAT GCAATCGTCA 360
GGAAGGATGA ACAAAGCCTG CTGGGCCAGT GACTAGTAGG GGAGAAGTTT CAGTAGAATG 420
CTGAGGGCAA GTGTTAGAAC TCAAGGGGTT CAGGATTGAG TGGTAATAAA GGAAATAGAA 480
GCCTTTGGTG TAGACACATA CAAAAAAGCA ATAATTCTGA CCAAAGGGAA ATATCTAAGG 540
CAGCAACTCG AGGGTGTGGA AGTGTTGAGG AGTCTTTTGT TTCACTTTTT TGGTAGCAGA 600
GAGCAGATAA TCCTTTAAGG AAGAGTATAA ATTTAAGACG ATTAAAAATG TAAAGGAATA 660
TAACATTCAT ACACGAATTG TTAGGGAATC AGTGGGAATG TATTTTAAGA ATTACAACTG 720
TGTGTTAGCT ATCTATTATT GTGTAACAAA TTACCACAAA CTTAATTACT CAACACAATT 780
TCACTGTCTC ACAGTTTCTG TGGGTCAAGG GTCTTAGCAT AGCACTAGGA GCTGGTATCT 840
TTTTAAAATT TCTTGGCTCT GTTTCTCCAA CATTGGCTCC ACTCTCAGAT CCCTTCCCTG 900
TTGTCTTGAG ATGGCTATTG GCCTGTCTAA GGCTACAAAC TCTCAGGTTA GAATCCACCG 960
AGAAGGAGGA ATAAGCAATT GCCTTTATCC CAGAATTTTC AGCAAAGGTA CTGAGATTCC 1020
CTTTATTTTG AACAGCTTAG ATCACGTTGA CCACCCTAGG CCAATCACTG TGTCCAAAGG 1080
AATGCGGGGC ACTCATTAGC TTCGGCACAG GTGTGTCCTT GAATCTTGGA ACTGGGGAAG 1140
AACCCTACCT AAACTAAGAA CACCAAGAGA TGGGGAGTGC AGAGCAGGGC TTGATTGAGG 1200
AAGAAGGGGA GATGGATGCT GCAAAAACAA GGAATAGGCA CACACAAGGA ACACATCTCA 1260
AATACAACAT GGTTGGTTTA TTTATTTATT TATTTATTTA TTTGAGACAG AGTCTCATTG 1320
CGATGCCCAG GCTGGAGTGC AATGGCATGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC TGATTCCTGG 1380
GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAGTAGCTGG GATTACAGAC ATGCGCCACC 1440
ACGTGTGACT CATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TCACCATATT GGCTAGGCTG 1500
GTTTCAAACT CCTGACTTCA AGTGATCCTC CCACCTCGGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA 1560
CAGATGTGAG CCACCGCGCC TGGCCAAATA TAATGTGTTT TAAACCAGAC TCTATATTTT 1620
GCTCCTAAAG CTTAACCCCC TTGCTTCATT CCTGATTTCA GTGAATTGTA TCATCATCCA 1680
ACCAATTGTC CATGCTGGGA AGCTGGGAAT AATCCTAGGC TTCTCTTTCT CACCACTACA 1740
TTCAGATAAT CATCATCTCT TGGGTTTTAC CTCTTACATA CTCTTCCCCT CCCTTCCCGC 1800
TTCATTGCCT TATTTCAGAT TCTTAACTGA CCCATTTTAC CATCTCTCCA TTCTCTCTCT 1860
CTTAAAAAAA AATGTTGACT TGTGGCCGTA GAACGATGAA TGTCCAAGGC CTATGGATAA 1920
TTCTAATAGC CCACACACTT GGGCACCAAC CCAACAGTGG GATCATGTGT TCACTAAGAG 1980
TGTATTTGTG ATCGGTCCCA AACCTGTTTA TATTCTTTTT TTTCTTTCTT TTTTTTTGAG 2040
ACGGAGCTTG CTCTGTTGCT AGGCTGGAGT GCAGTGGTGT GATCTGAGCT CACCGCAACC 2100
TCCACCTCCC GCGTTCAAGT GATTCTCCTG CTTCAGCCTC CCAAGTAGCC GGGATTACAG 2160
GCGCCCGCCA CCACACCCGG CTAATTTTTG TATTTTTAGT AGAGACAGGG TTTCACCAAG 2220
TTGGCCAGGA TGGTCTCGAT CTCTTGACCT CGTGATCTGC CTGCCTCAGC CTCCCAAAGT 2280
GCTTGGATTA CAGGCGTGAG CTACCGCGCC TGGCCCGTTT TTCTTGTAAG GTATAATTTA 2340
ATTAAATATC 2350