EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS172-00557 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
SGBS_adipocyte 
Coordinate
chr1:100136770-100140410 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:100137231-100137242TTTTATGGCTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr1:100139672-100139683TTTGTTTACTT-6.62
RARAMA0729.1chr1:100138432-100138450AAGTGCCCTTCTGACCTT-6.28
SOX10MA0442.2chr1:100140328-100140339AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr1:100140328-100140338AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00046chr1:100108153-100159785Adipose_Nuclei
SE_30449chr1:100137586-100138869Fetal_Muscle
SE_30449chr1:100139937-100141061Fetal_Muscle
SE_35292chr1:100137190-100140236HeLa
SE_38038chr1:100137417-100138975HUVEC
SE_41100chr1:100134920-100140818Left_Ventricle
SE_51309chr1:100133488-100143713Skeletal_Muscle
SE_55869chr1:100139212-100141343u87
SE_67841chr1:100139212-100141343u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1100138206100138591
chr1100138968100139231
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I099674chr1100140301100140582
GH01I099672chr1100137587100140168
Enhancer Sequence
AATATTGCTA TTACCGTGGA GTCCATAGCA GGGCCAGACT TTGCCCATGA ACCTTTCTTT 60
CCTTCTACTT CTAAGGCGTT GTAAGATGAA CTGAAATAGC GTTGCCTCTG GCATTCAAAT 120
CCCTCTTCTG CTGACATAGT ACACAGGCTT GGCCATGTTC TTTCATTTCT TTGAGCCTCA 180
GTTTCCTTGC CTGTAATGTG AGACAGTTAT AGCCACTTCA CAGGACTGCT GTGAATACAG 240
AGTGCCTGAC ACATGGAGGT GTACAAAAAA TATTAAATAC TAGTCCTTAC TAAAAGGTGA 300
AATTAGAAGA ACAACACTGC ACGGATCTTT ATCCAGGTAT TTTTATTTTT TGGCCAAGTT 360
CTCTCCTTTC TTTATGCTAG TACAAAGAGT GTTTTTCTTG GAGTAAACTG AGAATACCAA 420
CCAATGAGGA TTCTTTCCAT TTGGAAATAA TCTATGATTT TTTTTATGGC TTAAAGTCTA 480
GAATGCTACC ATAGAGGTTA ATTTTTGTGG AACATTTGCT GTGGACCAGG CATTGTGCTA 540
AACATTTCAT GTACATTATT TCATTGAGTT CTCACAACTA CCCTATTAGG TAGGTAACAT 600
TTAACAGATG AGAAAAATTG ACACTTACAG AGGCTAACTC ACCCTAAGTC ATACAGCAAA 660
ACGTAAAGAG CCAGGATTTA AAACCTAATT AAAAGTCCTA ATCATAAAAA TAAAATTGCA 720
CCTCAGAGCC TGTAGAAATT TTTTACAAAT GTTAAATGCT GTAAACTCTA TACTTTTATA 780
GCATTTTTAA GTTTCCAATC TATGCTACAA TTTCACTTTT ATGTGTACCA CTTTATGTAG 840
ACATTTACCT GAATATTTAA CATATTAAAG ACATTCAGAG GGTACCCTGA CTCACACATA 900
ACCTTTAAGT AAAGCATATC TGCTTATTCA TCCTGTCGTT GTCTCCTCCA AAGAGAGGCA 960
ACATTTCAGA AAATAAGTGG GTTTCCATGG TTTCTGTCTC TGAGTTACAT TCTTAGCTTT 1020
CAAACAATAT TGTGGAGTAT TTTGCCTTGT GCCCTGATTA ATACCTTAGG AGGAAATGTT 1080
CCCAGGGGAA GCCTATATTG AACGTCTCCT TCTGAATCAC TTTGCTTAAA TAGAGTTTCA 1140
ATTTGCCTCC CAAAAGAGCC CTGCGCTTAC TGCGACCACT GAACCATTTA CTGCCTGATT 1200
GTAGGCACAG GTGCACTGAT TTTTCAGTCC AAATATCCAT GTGCACAAAT TTATACCTGG 1260
TTTAGAAATC TTGTCCTAAC ACTTTCCTTG CTCTCCTCTA TCCAATAGCC CACACCCAAA 1320
ATGACACCCC CAGTAAGTCT CCATAGGAGG TATGCCCCCA GCAACTTGTT CACATCCTGG 1380
GTTCTTCTTT CCTATCCAGC TGCCCTGCAG TTGTCCATGA CCTCCCTTAG CCAAACTGCC 1440
CTGTGCCAAG CTCCCGGCCA GACACTCTAC TTCTTGAACT GTGTCCAAAG ACCTCTGACT 1500
TTAATTGGAG CACACAGAGC GCCTGACAGA AATGTCATAA GCATGAAATG TAAAAGGTCA 1560
ACTGCCGAGG AGAATGATGC AAATACACTG CATTCCCTTT GGGAAGGATA AGCTACTTAT 1620
GATTAAATGT TCTCTAGCAC GGATTTTTTT TTTAATACTC CAAAGTGCCC TTCTGACCTT 1680
CTGCCTTCTT TTAATGAACT TTCATTTGTC CCCCAAATAG TTAGAAACCG CCTTCCACAG 1740
ATGATACAAA TGGGCAAAGG TGTATGTGAA GCCTTGGATG TCTGTGTGAC TACGTGTCAT 1800
GAGAAAAGCC AAGTGGGCTG GTACAGCAGC TATAGCCACA TCCCACATAA CTTAAGGAAA 1860
ATTCCTCCAC AAAAGGAGCT GAAACCCAGG AAAATGCATT CTGCTCAATA TCATGTAAAG 1920
CAATAATTTA CTCAATTAAC TAAAAAGAGA GCAGGCAAAA TTCAATTCAA AAGAGAACCC 1980
AAAACATTGA TGTAGAAATA TAAAAGTTAA ATTTTTTTGT TACTGGTTAT CATTTATCAA 2040
AGTTTATCTT ATTATTATTT CCATCCAAGT TTAACCCCTA CTTAATGCTT TTAACTACCT 2100
GTGCAGGTCA ATTGTACCTT AATGAAACTA ATGTTTCCTC AAACACGGGT GAGATATGCT 2160
ACGTGAAAAA TACTACATTC TAGATGTTTC TGCCTTCCTA CCCTAACCCG TATCTAATAC 2220
CACATAGCAG AGAGATAGAC AAGCTGCTCT TTTATGACAA CATAAGAAAA AAAAAGAGGC 2280
GAAAAAAAAC TCTACCATTT GTTTCTTATT AAATTTGCTG TTGCCTAGAG ACACTCAAGA 2340
AATTATTCTA AGGTAATTAC ATGAGTCAAA ATCGTTCCAA GCATGTTTTT CACTCTCCAT 2400
ATTTGACTAA TTGGTTTACC AGATTTGTAA TAGTTCATCT GTTGTTGTTT TCAATTTCCC 2460
AGATAGTCTG ATTATTTTTA ATTCAGGAGC TTCACTTTTA ACAAAAAAAA GCCAAGTAAA 2520
CCAAACTTAA AAGCAAAAAA GGGAAGAAGT CTACCCACTC CAACCCTCCG AAACACACAC 2580
ATACAAGCCC CTAGTACAAC GCCTAGCACA TAGTAGGAAT ACCTGTGAAT ACATAGCTTA 2640
ATAAGTGAAT GAATGAGTAA AATAGATGAC GTATAGATGA ATGTTAGTAC TTAAAAATAC 2700
TACCTTTCTA AGAGGACCAG CTAAAGAAGC CTAGATAATG ACTTGAACAT TAATGAACTG 2760
AAAAGGAAAG CCTTGAAACT CTTTTAAAAA TAAGAAAAGA ATAAACATCC AGCTATTTTG 2820
AGTCAAGGGC AAAGTTAAAT GGTAGTAGTG CCCTGGTTTT TTAAACAATT ATCAATGGCA 2880
TGTTTTAACA TCTCACCAGC ACTTTGTTTA CTTTCTCTCC ATGTTCCCTT CCTCCATATG 2940
CCCTTTTATT TCCTTATCCC GACCTTTCAG CATTCATTCT TGCTCATACC TGCCAATCTC 3000
ATCTATATGT TAGTAGAAAT AAAGATTAAA TGGTTACTGG CCCCCACCAT GATAAGCTGA 3060
AAAGTAGATT GCAATAAACT CTGAGGGTCC TCCCTCCACT CCACTTCAAT TTATTTAACA 3120
ACAGCTACTC TTTATGGAGC ACTATTCTGA GAATGACAAT TCTCTGAGGG AAGTCTAATT 3180
AGCCTCATTT TGTACATAAG GACACTAAAT CATAGAAAGC TATAAATCTG GCAACAGTCA 3240
TGCCAGGAGT CACACATAGG TCTTTCTGAC TCCAGACCCT TCCCACCAGA CCTCACACTG 3300
CTTATTCTTG ATTCATTCCA TGAACATTAT TGAGAACTTG CCATATGTAA GTCTTTGAGT 3360
CTTACAGAGA AGATTCCATA TAAACTCCCA CCCAAAAAAA AAAAAAATTT GTTTTTCTCT 3420
CTTTAAATCC CTTAACTTTT CAAAATGCAT TTACATTTAT TATCTCACTT CAAATGGTAT 3480
TCAGTGCCTT GAAATACAAA TATGACACCA TTAGCAGAGT TGTCATAAAT CTTTGGCTGT 3540
GCTGACATGA GTAAAGACAA AACAAAGGAG CAACTGAACA ATCCAGAAAG TGGGAGGTGA 3600
ATTAGTTTCA GTGACCCGTT CTCCAAGCCT TGGTCATAAA 3640