EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS170-02088 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
RS4-11 
Coordinate
chr2:54805180-54809500 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr2:54808583-54808600TGCTTTCCAGGGAATCA+6.22
Foxq1MA0040.1chr2:54807773-54807784CATTGTTTATT+6.02
HNF1AMA0046.2chr2:54807149-54807164TGTAAATAATTAACA-6.03
HNF1AMA0046.2chr2:54807149-54807164TGTAAATAATTAACA+6.62
HNF1BMA0153.2chr2:54807150-54807163GTAAATAATTAAC-6.13
HNF1BMA0153.2chr2:54807150-54807163GTAAATAATTAAC+6.59
LHX6MA0658.1chr2:54808871-54808881ACTAATTAGC+6.02
NR2F1MA0017.2chr2:54806824-54806837CTGTTGACCTTTG-6.78
POU6F1MA0628.1chr2:54809012-54809022ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:54809012-54809022ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr2:54805504-54805524TGTTTGTTGGTGTTTTTGGG-6.57
RUNX1MA0002.2chr2:54805746-54805757AAACCACAAAC-6.02
RUNX1MA0002.2chr2:54809103-54809114CTCTGTGGTTT+6.14
SPI1MA0080.4chr2:54808948-54808962AAAAAGAGGAAGCT+6.24
Number of super-enhancer constituents: 68             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54806325-54806984Adrenal_Gland
SE_10400chr2:54805714-54810968CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54805104-54808137CD3
SE_12885chr2:54806626-54807961CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54808458-54809294CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54804541-54808139CD34_Primary_RO01536
SE_13387chr2:54808493-54809312CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54806403-54807663CD34_Primary_RO01549
SE_14098chr2:54808471-54809646CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54805070-54807930CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14488chr2:54808210-54809640CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54806491-54807991CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54805479-54807711CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54805988-54807944CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54805321-54807943CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54804469-54808160CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54806095-54808244CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54805963-54808154CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54805854-54819252CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54803525-54806250Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54806279-54807871Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54808352-54808882Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54806299-54806908Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54807139-54807736Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54803569-54807926Colon_Crypt_3
SE_25070chr2:54808294-54809145Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54804084-54808059Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54806258-54807572Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54804536-54807845Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54805683-54808040Fetal_Thymus
SE_31160chr2:54808248-54809658Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54805344-54806156Gastric
SE_31545chr2:54806192-54807558Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_38000chr2:54803941-54807936HUVEC
SE_39396chr2:54803412-54807973Jurkat
SE_39396chr2:54808243-54809665Jurkat
SE_40773chr2:54803413-54806814Left_Ventricle
SE_40773chr2:54806843-54807511Left_Ventricle
SE_42137chr2:54805064-54805813Lung
SE_42137chr2:54806257-54807405Lung
SE_43945chr2:54806647-54807844MM1S
SE_46220chr2:54804531-54807869Osteoblasts
SE_49907chr2:54803392-54808037RPMI-8402
SE_49907chr2:54808121-54809650RPMI-8402
SE_50115chr2:54803395-54807898Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54808260-54810694Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54803599-54807890Small_Intestine
SE_52386chr2:54808375-54809439Small_Intestine
SE_53342chr2:54804076-54805887Spleen
SE_53342chr2:54806289-54807792Spleen
SE_53342chr2:54808283-54809502Spleen
SE_55277chr2:54806481-54807552Thymus
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_66257chr2:54803412-54807973Jurkat
SE_66257chr2:54808243-54809665Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr25480630754807716
chr25480649054806642
chr25480666254807722
chr25480697854807402
chr25480808654808165
chr25480846654808535
chr25480875254809210
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
TGGAGATTCC AGACTATAAA GGACTCAGCT GACAGTACAG ACTCTCTTGA TCTGTATTTT 60
CCCAGTATAT GAAATTATTT GTAATGTACC CGTGAGAACC TGGAATAAAC TGTACTGGCA 120
CTGAAGTAGA ATCTTGGATT TAAAAGTACA GTGTTCACTG CTGCATCGTT GAGCATTTGC 180
TACACAGAGA ATAACCTTGG AGCAATGTTC AAAGGTGATG GCATTACCCA GAAACATGGA 240
GTTAGGCCAG GAAACCACAT CTGAAGTTCA GATTATTGGA GATTGCTGAT TTTTCTTGAC 300
TTTAAATATT TTCGACTGGT TGAGTGTTTG TTGGTGTTTT TGGGCTAAGT GTTAGCCTTT 360
TGTTCTGTGA TGTCCCTGTG TGAATAAAAT GGATAATCCC TGTTTCCGGT TAGCTGCTGC 420
TGCTGCTGCT GCTGCCAAGT ATAAGTGAAG ACTTCCAGCT GCGATTTGCA TTGTGTTTTC 480
AGGCCACCTT TTGAGTTTCC CCATAGCAGA TATAAAAACT GTTTCTAAGA GTTCATCCTT 540
ACGTGTTCAG CCTTACTTGT ATCCTAAAAC CACAAACTTG ATTTTGTTCC CATTCATTAT 600
GATCTATATT TGGCATCAGT GAGGCAAGTT ATTTATATTT ATTATTTATA CCCTGCCCAC 660
TTCCAGAAAT GATTTAATTT GGCCTAGGCA AGTGTCTTCT GATGGGGTGT GTGTGTGTGT 720
GTGTGTGTGT GTGTGATGAT AATTCTGATG TGTGTGTGTA TGATGCTACT TCTGCCACTT 780
CAAGAGTCCA GAATCATAAG ATTCCTAATA GGATTGTTGG GTTGGTGAAT GCTGGGTTTG 840
TTCTCTTCTA TGCCCTCTCT GTCCAGGAGA AATCTGAGTA TCTTTCTTAG GAATGCCTAA 900
CACTGCTAGA CTGAAAGGTG CCATGTCACC ATTTTTCCCA AGAAATTTTC TTTTGAGGGT 960
GCTATAGAGA AGCCCTCTGG TATGAATGTA TTAGGCTGGT GCAAAAGTAA TTGTGGCTTT 1020
TGCAATTAAA AGTAATGACA AAACTACAAT TACTTCTGCA CCAACCTAAT ATATATTATA 1080
TATTCCCATT TTGTTCTTTT CAGAATAAAG CTTCCTAGGA GTTTCTCTAG CTCATGACCT 1140
CTTTTACCTT TACTTTCAGT TGCAGTGTTC TTAGCTCATA GAAGGAGCTT TGACGGCACA 1200
TAGAATGAAG TATAACAGCT TCCGTTTGAC CTGAGGCATC CCTCAGGTAT GAGAATGTCA 1260
CCCAGAGATC GAATACAGTG CCAGGTTATC AACTACCATT TTTTGGGACT GATTCTCTGC 1320
TCATGTGTGA CCATTATTTG GGGAAATCAT ACAGTACCAC AAACCAGAAG TTTCTGAAAA 1380
CACCTAAACT CCCCATCTTT CACACTCACC CATAGGGACC GTGGCCCCCA ATGAGGGGTA 1440
GTTCGTCTCT GTATTGGTAG CATTAGCGCA CGTGCTATAT AGCTCTCTTA ATACCTGAAC 1500
TGTGGACAGA CCAGATCCTC ACTGAGCTGA AGCACATTGG CATATTAAGG GAGCCCAGCA 1560
TTGCTGTTTG GCCCTGCTTT TGAACTGGGA AGATATATTG CTGCATGGAG TTCTGAAAAG 1620
TACCTTTGTA AGTCCCGAGA ACTCCTGTTG ACCTTTGGAT TTAGGTAAAA TGTAAGTCTT 1680
AGGAGAATTG ATGAGAATGT AGGAACCAGT TTTAGCCAAT GCATTAAGAC TAAAATGACT 1740
CTATTGTTTG TCAGGCTTTG CCAGAAAGTA TAGTGAGAGA GAGAGATCCT AAAACTCTGA 1800
AAGCAAATAG CCCACAGCAG TTAACTGTAT TGACTTTGGA AACAGGTTAT AAACCCAAAC 1860
CTCTGTGCTG AACTTGAATG GGTGTTTCTT CTCTCCTTTC TGAGGGTAAA AGCTGCTGGT 1920
GAGAACGGCT CTCTGGTGTT GCTAGGACAG ACCTGTATGA CCTTCTTTAT GTAAATAATT 1980
AACAGGGGAA TATTTTCATT TACGTTAAAG CCATATATGA GAGAGATTTC CGGGCTGGCT 2040
CTGACAGCCT CTGGCCCCAC TGGAGAAGGA AGCCAGCACT GAAAAAATTC AAGCTTCCGG 2100
CCACACGGAA CCTGAGAATA TTCTCTATGA CAGCAGTGGC TGTGAAGCTG TTTCTTTAAA 2160
GTAAAACCCC TTTTGAAGGT TAGTCTGGGG TGACTTTACT GTTACATAGG GAGTAGATTT 2220
TGTTTCTTGA TGGTTCGTTG AGTGGTAGAG AGGTTAAAGG TAGAACTAAC ATATGTAGAA 2280
CTAAAAAGCA TCTGAAACTT TTAGCAAACC AGTAATATTT AGAGGCTTCT GCCCACTCTG 2340
GGTAGGCATT TTTATCTTGT ATACCCATAC CAGCTTTTCA CATCCTGTTT CTTGAGAATA 2400
CATAAAGAGC ACATTTCTCC ACATTATCAG GAAAACAATT TGAAGCACAG GTCTTGTGAA 2460
TTGGGAAGAC CACTAGTATT GCCATTAGCT GCTTATTTGT GTGTGTGTTG GAGGATGGAT 2520
TATAATCCAA GTGTATTCAT ATTCTCACAC TTTAACCAAA AAAAAAAAAA AATCTCCAAA 2580
ATCTTCTCTC TTGCATTGTT TATTGATAGA ATGGGAAACT TACTGCTGGT AACTAGTTAA 2640
TTCTGAAAGG GTTAGGGTTT CTACTGTATA CTTCCAAAAG TACAGGCCTG GGGGAGCCAA 2700
TATGAGAGAC ACACATAACC AAAAATTTGT AAAAACTTTA TTTTTTAATA AAAATTATAA 2760
ATAAAAATTA TAGGCCGGGT GCACTAGCTC ATCCCTGTAA TTCCAGCATT TTGGGAGGCT 2820
GAGGCGGACT GATCACTTGA GGTCAGGAGT TTGAAACCAG CCTGGGCAAC ATGTTGAAAC 2880
CCTGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAATTAGC CATGCATAGT GGCACACACG TGTAATCCCA 2940
GCTACTTGGG TGGCTGAGGC ACGAGAGTCG CTTGAGTCCG GGTGGTGGAG GTTGCAGTGA 3000
GCCACGATCA CGCCACTGCA CTCCAGCCTG GGCAAAAGAG CAAGACTTAG TCTTAAAAAA 3060
AAAGAAAAAA TATATAAATA TATACACACA CACTTTATAT ATTTTTATAT ATAATCTCAT 3120
ACAACATGTT TTGAAATACA CGTGCATTGT GGAATGGCTA TATTGAAAGC TAATACATAA 3180
CAAATTTAAT GATAATACAA GTGTAGAATG GACAACAAAG GGGTTGTGCA TAATCATCAA 3240
GTACTTCTCA TTAGTAAAAA CCCTTTTCAT TTGCTTAGAA TTGAGGAGGA GGGGATGCTC 3300
TAAATTGAGG ATTCTCCATA GGGTCGTCCG TGAGACACAA GATGTTGACT GTCCCACTTA 3360
CCCAGGACAT GGGTATCCTT TTGATGCTGA CAGCATTTGC TGCTGCTTTC CAGGGAATCA 3420
TGGCTGACAT TGAACTTCCA CTGCCTCTGG GCTGCTTTGC TCACTCCTCC TAGGCAGGCA 3480
AGCCGACCCT TGGGAAGCTC AGCATTTAGC CTTCATGCTT TGGTTTCTTT GCCCTTTTTT 3540
TTTTTTTTTT TTTTTTTGAA ACTTTTATTT GCTCTGGGAC CACTTTGAGG TTGAAGGTAC 3600
AGCCCACAGT TTAAGAAAAC TGTCCCAAAC CTGAGCTAAT AAACAAGAGT AAAAGCCTTT 3660
TTCTCTTGTC ATTACTACTT CCTCCTCACT GACTAATTAG CCAGCTGCTG CAGGTCTCAT 3720
TAAACTTCAT TAATCCTAAG CATCTGTCTG TAGGAACTGC CTCAAGATAA AAAGAGGAAG 3780
CTCCGCTAAA CATTTTTGTT GCTGCTGCTA ATTACCACAA GCTATGCTTT TTATTAATTA 3840
ATGGCTCTAC TTGCCTCCAA ATCCTACTGA AGAACTTTGC GAGACAACAG GCACTTCATT 3900
CTTCTGTAGC TGCAGACATG CTGCTCTGTG GTTTGGTGCA TGGGGTACCT GTAAATTATC 3960
AGCACCGAGA ATACGCTAGC TCTGGAAACC AAGGTAGAGA AAAAAATACA TCTGGAAGTC 4020
TGGTTATGTG TAACTTGAAC TTGCTCAAAG CCTTCAGCTG ACACTGATGC TTTTTAAAAA 4080
CATGGCAGTG ATAAATTATT TCATCACTTT GCTCAAATAC ATTAATGCAA AACATTACAA 4140
AACTAGTTTT CTTGACTCAG CTTCCAGGGT CTAAGAAAGC ATTTTATTGG GGGGTTGTGA 4200
TGCCAGAGCA TAAGGGATGT TAAAGGTGAC ACTTAAAAAG GAAGGTGTCG ATCTTGGTTC 4260
TGGTCTGGTG GTGCCTGAGA GCAGGGACTC CTTGAAGGTG CAAGATGAAT TACACTCCTC 4320