EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS168-02240 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
RPE 
Coordinate
chr20:30307280-30309450 
Number of super-enhancer constituents: 70             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30306461-30312254Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30306371-30311908Aorta
SE_02627chr20:30307051-30311961Astrocytes
SE_03109chr20:30308258-30309433Bladder
SE_03156chr20:30306497-30311444Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30307109-30310334Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30306439-30312272CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30306472-30311911Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30306378-30312004Esophagus
SE_27731chr20:30306378-30312126Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30306317-30312080Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30306355-30312106Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30306417-30312032Gastric
SE_33407chr20:30306334-30312298H2171
SE_34309chr20:30306323-30312556HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30306311-30312155HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30306459-30312236HUVEC
SE_39144chr20:30307380-30311380IMR90
SE_39443chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_39853chr20:30306390-30312315K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30306474-30310131LNCaP
SE_42121chr20:30306366-30312046Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30306380-30312027NHDF-Ad
SE_44995chr20:30307052-30312090NHLF
SE_45708chr20:30306812-30312173Osteoblasts
SE_47264chr20:30306465-30312746Panc1
SE_47861chr20:30307071-30308101Pancreas
SE_47861chr20:30308207-30309183Pancreas
SE_48182chr20:30306387-30312048Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30306370-30312050Right_Atrium
SE_49684chr20:30307804-30310082Right_Ventricle
SE_49886chr20:30307003-30312251RPMI-8402
SE_50155chr20:30306356-30312043Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30307061-30311605Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30306397-30311994Small_Intestine
SE_53471chr20:30306475-30312120Spleen
SE_55108chr20:30307049-30311900Thymus
SE_55770chr20:30306834-30312280u87
SE_56767chr20:30306433-30312207VACO_400
SE_57375chr20:30306412-30311876VACO_503
SE_57919chr20:30306425-30311882VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30306862-30311641HSMM
SE_64478chr20:30306344-30311737NHEK
SE_65412chr20:30308226-30312394Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30306834-30312280u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr203030772030308274
Enhancer Sequence
CTGAGTCAAA TGTTCTTTAC TCCCTGGCCT TAGGGAGAGA ATGTGTGCTC AGAAATGGTT 60
CTGATATAAC TGGCTCTTCC ACACACATCC CCTCTGTTCA CCAAGAGGAA GTGACATGTG 120
GTATGTTGTC CAACAGGCTC TGATGATTCT TAAGCAAAGA GATGGAAGAT GGAATTTCAA 180
CCCCATGGAG ATCTAATAAA CTTACCCAGA GTTGCTGTGT CTAAGACCTC TTTCATATGC 240
ACCACTGGGC AGCTGGCAAT TCTCTGGTAG GGGTAGCCTT CTGCAGAGGC TGGCTAGCAG 300
ACCAGGCACC TCTCCCAGAC TGCCTTTTGT TTATAGCTGG CAACAACCCA CCTGGTATTA 360
GGACCACTGG CCAAAGACAA TAGTCAGGCA AAGTGGGCAA GCAGCCTCAA TCCCTACTTG 420
GAGATGCCTC AGAGGGTGTG TCTGCAGTAC TGGAATCCTG TCCCTCCTGT AATCAGCTGA 480
ACAAATATTT GCCCCAAAAG AGAATCAAAG CAGGAGGGAA CAGGAGAGGT CACTGCACAA 540
ACCAACAGGA ACTATTTAAT CATTTATCCC CCTAGAGAGT TCATTTACAG AATGGCTTTC 600
AAGTCTAGTC AGCTAGCTCA AGAGAACCCA CCACCTTTAC CTCCCCTGAC CCCACCCCAG 660
TTATCTGACC TCTATTGACT TGACCCCCTT GCCTTTTACA AGAGCTGGCA CAGACGAGTT 720
GAAATTGCAA AGAAATGCAA AATGAGAGAG GGGGTGGGGT TCCAGGGCAA ACTCAGGAGG 780
TCTCTTGCTC AGTGGTAAAG TGAAGTGCCT GCCACACCCT AGGCCCAGCC TATAGACAGT 840
TGCATTCTTG ACATTCCTGA GTCCATGGTG CATGTCCCCT TCCACCTCAG CTCCTTCAAT 900
GGATGACTTA TTTTCCACAG CTTGATGCTT TTCTGCATAC TCTGAGGGGA TAGAACATCT 960
CTCATAAAAC CTGCACCTCC GCTAGGTAGG GAGATAAGCA AGAAAACAGG ACTGAATTCA 1020
CTGAAGAGCA AAACTTGCCT ACAGTGACCA CTGGTAAAGA AGCTTTCACC ACCATCTCAT 1080
CCTGGCTCAG TGATGGGCAG GAGAACTCTC CCTCCCTGGA AAGGGAATTT GCTGGTGTCA 1140
GTCACTGTGC TCACATTATC GCCAAGATTT ACAATACACT GTAAGGCAAG GAGAGCTTGC 1200
CACATTTTTT AGTGAAAGAA ACTAAGCCTC AAGAAAGTAA CCCAGCCTGT CCAAGGTCAC 1260
ACAGCTAGTT ACATGACAGA ACTGGAACTT ATACCTGCAT GTGAAGTCTG TTACTAAATC 1320
TCAATGTCCC ACAGAGCCCC AAAGACTAGG TTCTTGCTTT GCCAGCAAAC AGTGCTTGAA 1380
GAGGCCCCTG GGCTCTGGCC GGAAAGTAAC AGGCAGAGCA GCTGGAGCTC CCCAACCGAC 1440
CCCAGGCAAT GAGGTGCAAA GTCCCCTGGC TTAATGTGTG ACACAGCAAG TGCTCCACAA 1500
ACAAGGCAAC CATGCAGAAA GTCGCACACT TTGGGGGAAA TGAACTTAGG GGGCGCAGTG 1560
CAAACACAAT CTGCACAGCC TACACTGCCC CAAAATCTGA CAATTCTCAG CCATTCAACC 1620
CAGTGGGAAC TCCTGCCTAT GGCCATGCCC TAGTCTGAGA GGAGAGTGCC ATACACGCAA 1680
ACTTTGAAAT AAAGGGAACT TGATTTGGGG GAGAGAAGCC CAGGATAGGA CTGAGACCCC 1740
TTGGGGGGAA CAGATGGAGA GGTCTGTGGG TCATTGATGC TCATCATCTT CTCCAGGCAT 1800
TATACTCATC ACCCCTTTGT GTGTGAACCA TTGTATAAGG TAAGGGAAAC ACCGAACTAA 1860
CTTCCTACCC TCACAGGTTT GGGACTTAAT GAACACATAG GCTACAGTTT TCTTTGCTGA 1920
GAAACTGGAA CACAAGTATG GAATAGTGGA GTCATGGGGG TGACCAGGGT GAAAGATGCC 1980
TGATCTCTGA AGCACAGGGT CATTTGTATT TCCAAGGAGT TAACCTCTTG TGGTGAAATG 2040
AGGCCAGTCA GGTTTCCTCA ACTATCAACG TCTCCAACAA TCACCCAACA CAACAGAAAG 2100
AGATACAGAA GAAGGGCTGT TGGGGATCTC TGACCAGAGG CCAAAGAAAA GGGACACACA 2160
AGGGGCTTGG 2170