EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-05565 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr6:3337230-3342170 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs9503551chr63340717hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr6:3340239-3340255CCTTATGTAAACATAT+6.88
FOXC1MA0032.2chr6:3340242-3340253TATGTAAACAT+6.32
HOXA13MA0650.2chr6:3338861-3338872GTTTTATTGGC-6.14
JUNMA0488.1chr6:3339054-3339067AAGATGATGTCAC+6.2
JUND(var.2)MA0492.1chr6:3339053-3339068TAAGATGATGTCACC+6.18
POU2F2MA0507.1chr6:3338074-3338087ATATGCAAATATG-6.02
RFX5MA0510.2chr6:3339933-3339949AGATGCCATGGCAACG-6.23
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00561chr6:3337350-3343190Adipose_Nuclei
SE_03899chr6:3337297-3339548Brain_Anterior_Caudate
SE_03899chr6:3340895-3343041Brain_Anterior_Caudate
SE_04816chr6:3336995-3338750Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04816chr6:3340502-3344204Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05855chr6:3337324-3339947Brain_Hippocampus_Middle
SE_07816chr6:3337526-3338819Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_26116chr6:3340696-3343028Duodenum_Smooth_Muscle
SE_31490chr6:3337008-3338291Gastric
SE_40507chr6:3337222-3340677K562
SE_63339chr6:3333619-3356971NCI-H82
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr633378003339997
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I003337chr633374363342951
Enhancer Sequence
AAGGTCTTGC TACATTGCCC AGGCTGGTCT TGAACTCCTG AGCTCAAACA ATCTTCCTAC 60
CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GAATTACAGG TGTGAGCCAC CACTCCTGGC AGACTAGCTT 120
TATTAAGCAT ATTTACACAA GGGCATGAGC ATCCGTCATG AATGTAGCCT CTGAGGGCTC 180
TGCGCTAAAC ACAAATGCAG AGTTCCTCAG GGCTGCTTCA ACCACAGGAG AGCCAGGAGG 240
CCTGTTTGTT GGAGCAAATC GCCAGCCCAC CCCACACAGT TGCACTCAGT GACTATGTGT 300
GCCTAAGGCG GAGGTGCCAT TTACAGAGCT GCCAGTGGTG CTGCTGGGGA GAGTGGTGAG 360
TATTCAGGGA GGCCTTGTAG GTGCCAGGTA CTGGGCACAG TGCCTTTTAT CATCTGCACA 420
ACAAGCTCTG TGTTAAGTGT TACAATTCCC TTTTTTTTTT TTTTTTTAAA TCCTGCCTTG 480
TCCTGCCCCC AGTGTTAACA TTCTTATTTG AAGCTTGGGA AAAACTAATT CATTGACTCC 540
CATAAACGCA GTTAGCAAAA GGAAGAGCTA GATTTCAAGC CCAGGCTCCT GCAGAGCCCT 600
GGTGGGAAGG TAACAAGAGG CAACAGGGCA AGGACCCGGG CAAGTCTTTC CTGTGTACCA 660
TGTGCTCGGG CCCCACCGAG GGCAAGGACA GCCTGGTGTG GCGACAGGCT CGCAGAGGCC 720
ACAGGCTGGG CTCGGCCTTG GTGATCCACG AGGACTCCCT CAGATCCTGG GTTTTCCAAT 780
TCGTGAAAGG AATGTGGAAC AAGATCAGGA AGTTGTGAAG GGGCTCAGAG TATGTCATCT 840
TGAAATATGC AAATATGCTA CTTTCGCATA AGGATTATTT TGAGTTGAAG GCAATTGGAG 900
AAAGAGCAGA TGCAGGAAAA GCTCTCTACC CACCTTTCTG CTTAGAGGCA GGGCACAAAT 960
TTCCCTTTGT GAAGTTGTCA CCCCCAGACT CCCTCCCTTC TCCCACAGGA GCAAGAGGAA 1020
GTGAGATGAC TCACCACTGG GGACACTACC GACTTGAATC TGCATAAACA AACCTCACGA 1080
AATAGCCCCG TCTTCCATCA GTTTCCCCCA TATATTTACC GTCCCACAAT TTACTGCTCC 1140
TAGAAGCCCG AAGCCTTTTC CTTTGTCTTG TCATTTCTCA AATCATGTAT TGCTTTCTGT 1200
TAAAATGGTA TAGAAGCTCT TAGGCTTAAC CATTTCCTTG GGCTTTCATT TCTTCTGTGA 1260
GATTCCCCTG TACATGTAAA AATTAAAATA TTGACATCAA GTGCAAGTAT GGCCTTTTCT 1320
CCTGTTAATC TGCCTTTATT TCTTATTTTT TGAGACGGAG TCTCACTCTG TTGCCCAGGC 1380
TGGAGTGCAG TGGTATGATC TTCGCTCACT GCAACCTCCG CCTCCCGGGT TCAAGTGATT 1440
CTCCTGCCTC ATCCTCCTTA GCTGGGACTA CAGGCGCATG CCGCCATGCC CAGCTAATTT 1500
TTGTGTTTTT AGGAGACAGG GTTTCACCAT GTTGGCCGGG CTGGTCTTGA ACTCCTGCCC 1560
GCCTTGGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACA GGCGTGAGCC ACTGTGCCTG GCCTTAATCT 1620
GTCTTTAGTC AGTTTTATTG GCAGGGTCCC AGGTTCTAAA CCTAAAAGGG TAGAGGAAAA 1680
CATTTTTTCT TCCCTTTTAG TTGCATCCTT AAAGTTTTAC CACTTCATAA TTATGTGATA 1740
ATGTTTGTAA TAAAGAGAAC AATGCTATTA GAGATTTAAA AGCCTATACA GAATTAAACG 1800
TGGCAGCACT GAGTTTAATT ATGTAAGATG ATGTCACCTT TGGGGTTTCT TGCTCTTGTC 1860
TGAGAACATT AGCTCCTTCT AGTCTAGAAC CACTATTCCA TCAACACTGA CCAGATGGGG 1920
AACATGGAGC AAGAGAGGTC CAAAGGAGGT ACCCAGGAAG CCCCAACGGA GAAAGTAACC 1980
CCAAGACTGA AGCCTGAGCA ATTTGGTGGA GGTGCCAGAT GAAGAGAGGA TGTGTGTGTG 2040
GAGAGCACAG AGCTGCAGAG GGAAGAGCAG GGTCGAGGGG AGGGAGGAGC CAGTCATTTC 2100
TTAAGTGATG CAATAGCTCT GTGGCTATTA TTGCCATTGC AGCTGAAATC CATGTCAGCC 2160
TCCTACCAAT CAGGATTTCG TATCCTTTAA AACTCCTCTT CCAACTTTAA TAAAAATTAA 2220
AACAGTGTGC TTTCCCCCAC CCCCAATCTG ATAATCCACC ACCAGGCACA CAGGCCTTAG 2280
ATGAAGACAG ATGGTGATCT GTCTTCAAAG ACTTTGTCAA GCTTTGTTAC AAAGCTTTTT 2340
GTTTTCTGTT CATTCCCCAG GTGCAGCTGA GTTCCCAAGC CCTGGTCCTG TCCCTCCTGG 2400
GGTGACAGCC TCCACTTTCC AATTCATAAT GTCAGAGGCA TGTGAGCCAG AACAACTCCA 2460
TCTTAAACAG GAGCTGGGTA AAATGAGGCT GAAACCTACT GGGCTGCATT CCCAGATGGT 2520
TAAGGCATTC TAAGTCACAG GATGAGACAG GAGGTCGGCA CAAAAGGCAG GTCATAAAGA 2580
CCTTACTGAT AAAACAGGTT GCAGTAAAGG AGCCGGCCAA AACACACCTA ACCCAAGATG 2640
GCCACAAGAG TGACCTCTGG TCGTCCTCAC TGCTACACTC CCAGCAGCGC CATGACGGTT 2700
TACAGATGCC ATGGCAACGT CAGGAAGTTA CCCTATGTGG TCTATAAAGG GGAGGCATGA 2760
ATAATCCACC CCTTGTTTAG CATATCATCA AAAAATAACC ATAAAAAAGG GCAACCAGCA 2820
GCTTTTGCGG CTGCTCTGTC TATGGAGTAG CCATTCTTTT ATTCCTTTAC TTTCTTAATA 2880
AATTTGCTTT TACTTTGCAC TGCGGACTGG CCCCGAACTC TTTCTTGGGT GAGATCCAGG 2940
AATCCTCTCT TGGGGTCTGG ATCAGGGCCC CTTTCCTGTA ACAATAATGG CTGAGGAACA 3000
TCTGAGCCTC CTTATGTAAA CATATGAAAT TAAAAATGTG TCCATGAGAA TACAGCTTCC 3060
CTCCTCTCCT CTCCCCACAG GGGAGGTGCT TCCTAGCCCA GAGAGCGCTC CCACAAAAGC 3120
GGTATTATCC AGGAGGGATG GCCTGGAGAA GGGAATGGTA AGGGCAGGGG CTTTGAAATT 3180
GGTTGGCATT TCCATTTTCC AAGTACCAGC TATACGAATG ACATTGAGCA AGAGGCTTAA 3240
CATGCTTATG ACTCTCTTAT GAATGGCAAG AGGTACTATC TGGAAGAAAT GTTTGTCAGA 3300
GTCAAAGAAA GTGATGATAT AAGGTAAAAC GCCCGCCGGT CACATTCTCT CTAGGGCCTT 3360
CAAACAGCAC GTTAGTATAA TAATTCAGGG ACACATTTAA ACAGCCCTGT GGGCTGGCCT 3420
GGGGACCCAT ACGTAACCGC AGCAGAGTCT ATGACAAATT GCCCCTTTAG TTCCAGGTAA 3480
CCATGAGATA AATGAACTTT TGTAAAAGTT GATAATTCTT GCAAAAGTTG GGAACATCTT 3540
GCATAAGAAC GGCAACTTGG AAAGTGACTC GATTTCTAAC CACAGTATGA GGAGCTTTGT 3600
AACCGATCCT TTGTGTAAAG GCCAAAAACG ATTTTCAAGG TCCCATGTGA AAAAGCAGGA 3660
GACAATTGCC GTAGCAAATT TATAAAGTGA CAGAGTGCGG CCCTTATGGA AAACAGATGG 3720
GGCTACTGGG AAAAGGGCAG CCGCATGACG TGCTAGAGAC ATGAGAACCG AGAGACTGTC 3780
CTTAGGTACT TGTGGGTTTT GATGGGATCT GTCTGGAAAG GATACATTTA CCATTTGGGA 3840
AAACAGAAAC CAGGGCAATA TGAGTTTACA GGAATGATAT TTAAAGGACT CATGTCTTCA 3900
AGCTTATGCT CCTTCTTTCA GGATCAGGTT GAATGAGGAG GGGCCGGTCT CTCATGTTAC 3960
ACATAACCTT TGGCATTCCC ATCACCAATG CCTGCTATGG CACCTTCCCC TCCCTTCACA 4020
GGGTTGAAGG TGGCCTGCTG TGAAGTCAGG GGTCACATGG CTCCTGTGAG CTCCTGGCTC 4080
TGAAGGACAC ACATTCGGAA CATACAGCAT TTAATATAGA GAAACAATCC TCACACAGAG 4140
GTTGCTGAGA GGCTGGCCCG AGTCACAGAT GACCTCAGAA GCTGTTTTGA GATTCATTGG 4200
AAAGAGGGTT TCTCAGAAAG CCCTCCCTCC GATCAAGCTG AGAGGAAAAA TGTTAAATAT 4260
GAAGGATTGA AATGCTAAAA AAAAGTTATG CCATTGAAGC ATACTTTTTG TTGTAGTTGT 4320
TTCAAAAGAT TTTGTTCCAA AAGCCTAACT TTTATACAGT GCAAGAGGCT GTTTCAAGGT 4380
GAGGTTTAGA GGACACACCT GAAACTTTTT AGAATGGCAG ATGTCAGACC TCACTAGAAA 4440
ACTCTGAGGT GGATGGGTTT TGTTCTCTCT CTCTCTCTTC TTCCAACTCC TTGGGTCCAG 4500
AACATGAAAA CCCAGAAAAA AATCACAGTA TTACTCTACT TAGGATGTGA CTCTGTAGTC 4560
ACTGGTTAAT CACTGCTCTG GTGTTAGATG ACATTCAAAT GTAAATGCTG TGATTACCAA 4620
ACCATCTCAG ACTTCTGGGG TAAGTGTTCA GCCAGCACTT CTGATTCACG CTGGGCTGCC 4680
TTTGACAGAG TTGGCAGAAA AGAAAAGAAG CAAAAGAGAA GAAACCACAC GCACAATTCA 4740
TTGGTCATCT GTTGTGACCG AAGCTTCCCT GTCAAGCGAG GGGGGTGGGG GCGGGGGAGC 4800
GCAGGAAACT GAACACAAGC TGGGAATAAA ATTTCAGACT GGGGCCATCC TTTCCACACC 4860
TGTAAATCCT TTAAAAGAAA AGTTAATGGA TTTTAAAAAA AATCATACAA CTTAAGTCTT 4920
CTTGTACTTC TTTCATTTCC 4940