EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-05272 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr5:139054460-139059940 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3822742chr5139059017hg19
TF binding sites/motifs
Number: 34             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PLAG1MA0163.1chr5:139058399-139058413CCCCCTTGAGCCTC-6.35
RARA(var.2)MA0730.1chr5:139057466-139057483TGACTTCTAATTGACCT-6.09
ZNF263MA0528.1chr5:139056449-139056470TCCCCTTTTCTCTGATCCTCC-6.01
ZNF263MA0528.1chr5:139056078-139056099CTCCTCCCCATCTCCTCCTCA-6.04
ZNF263MA0528.1chr5:139055970-139055991CCTCCTCCCCAGGCCTCCTCC-6.06
ZNF263MA0528.1chr5:139056025-139056046CCCACCTCCTCCCCAGCCTCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr5:139055783-139055804GCCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.24
ZNF263MA0528.1chr5:139055895-139055916GCCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.24
ZNF263MA0528.1chr5:139055819-139055840ACCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.25
ZNF263MA0528.1chr5:139056005-139056026ATCTCCTCTCCAGCCTCCTCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr5:139055736-139055757CCTCCTCCCAAGTCCTCCTCC-6.3
ZNF263MA0528.1chr5:139055748-139055769TCCTCCTCCCCTGTCTTCTCC-6.53
ZNF263MA0528.1chr5:139055772-139055793CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139055884-139055905CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139056052-139056073CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139055808-139055829TCCTTCTTGCCACCCTCCTCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr5:139055844-139055865TCCTTCTTGCCACCCTCCTCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr5:139055923-139055944TTCTCCCCACCCTCCTCCCCA-6.75
ZNF263MA0528.1chr5:139055945-139055966CCCTCCTCCCCAGACTCCTCC-6.78
ZNF263MA0528.1chr5:139056137-139056158CCCTCCTCCCCAGACTCCTCC-6.78
ZNF263MA0528.1chr5:139055957-139055978GACTCCTCCCCACCCTCCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr5:139055933-139055954CCTCCTCCCCAGCCCTCCTCC-6.93
ZNF263MA0528.1chr5:139055715-139055736TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCA-6
ZNF263MA0528.1chr5:139056031-139056052TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCA-6
ZNF263MA0528.1chr5:139056064-139056085CCCTCCTCCCCAGGCTCCTCC-7.08
ZNF263MA0528.1chr5:139055859-139055880TCCTCCCCACCCTCCTCCCCA-7.23
ZNF263MA0528.1chr5:139055960-139055981TCCTCCCCACCCTCCTCCCCA-7.23
ZNF263MA0528.1chr5:139057518-139057539GGAGGAGGGAGGGGGTGAGCA+7.24
ZNF263MA0528.1chr5:139056028-139056049ACCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-7.2
ZNF263MA0528.1chr5:139055871-139055892TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCC-7
ZNF263MA0528.1chr5:139055868-139055889CCCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-8.38
ZNF263MA0528.1chr5:139055712-139055733TCCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-8.5
ZNF263MA0528.1chr5:139055920-139055941TCCTTCTCCCCACCCTCCTCC-8.81
ZNF263MA0528.1chr5:139055856-139055877CCCTCCTCCCCACCCTCCTCC-9.74
Number of super-enhancer constituents: 52             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00187chr5:139052580-139059377Adipose_Nuclei
SE_03140chr5:139054437-139055772Brain_Angular_Gyrus
SE_03140chr5:139056046-139056660Brain_Angular_Gyrus
SE_03140chr5:139056739-139059366Brain_Angular_Gyrus
SE_03865chr5:139028287-139055846Brain_Anterior_Caudate
SE_03865chr5:139055996-139061963Brain_Anterior_Caudate
SE_04768chr5:139026027-139072090Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05771chr5:139026065-139074431Brain_Hippocampus_Middle
SE_06683chr5:139027027-139071104Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07722chr5:139028082-139075240Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08785chr5:139056815-139058122Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_11063chr5:139026860-139059578CD20
SE_13414chr5:139053784-139055505CD34_Primary_RO01536
SE_13414chr5:139056780-139058400CD34_Primary_RO01536
SE_13414chr5:139058435-139059304CD34_Primary_RO01536
SE_15340chr5:139054793-139055739CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20188chr5:139054283-139055773CD56
SE_20188chr5:139056880-139059135CD56
SE_25255chr5:139058189-139058964Colon_Crypt_3
SE_26221chr5:139056720-139057563Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26778chr5:139056356-139058039Esophagus
SE_27739chr5:139056202-139058212Fetal_Intestine
SE_28684chr5:139056665-139058254Fetal_Intestine_Large
SE_29581chr5:139056057-139058505Fetal_Muscle
SE_30930chr5:139053361-139055811Fetal_Thymus
SE_30930chr5:139056057-139058331Fetal_Thymus
SE_31417chr5:139056046-139059186Gastric
SE_33677chr5:139055902-139059162H2171
SE_34346chr5:139057922-139059244HCT-116
SE_36941chr5:139027373-139059446HSMMtube
SE_40649chr5:139053309-139055789Left_Ventricle
SE_40649chr5:139056032-139059400Left_Ventricle
SE_42197chr5:139056073-139059249Lung
SE_45813chr5:139052444-139055736Osteoblasts
SE_45813chr5:139056829-139059282Osteoblasts
SE_47229chr5:139028435-139055812Panc1
SE_47229chr5:139058326-139059295Panc1
SE_47460chr5:139056780-139058230Pancreas
SE_48055chr5:139051864-139055859Psoas_Muscle
SE_48055chr5:139055919-139062629Psoas_Muscle
SE_48579chr5:139055935-139059336Right_Atrium
SE_49460chr5:139056809-139057877Right_Ventricle
SE_51090chr5:139054441-139055802Skeletal_Muscle
SE_51090chr5:139055934-139059157Skeletal_Muscle
SE_53351chr5:139057715-139058567Spleen
SE_54845chr5:139055998-139057753Stomach_Smooth_Muscle
SE_55730chr5:139057497-139059261u87
SE_58504chr5:139012442-139092243Ly1
SE_63555chr5:139056584-139057808HSMM
SE_65250chr5:139036623-139059169Pancreatic_islets
SE_67548chr5:139057497-139059261u87
SE_68692chr5:139057230-139059117H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr5139058350139058600
chr5139056887139057262
chr5139057354139058068
chr5139055823139056431
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH05I139674chr5139054284139055802
GH05I139676chr5139056126139059178
GH05I139679chr5139059516139060267
Enhancer Sequence
GCCCTGCACA ACTGGGACCC TGACAGCCTC ATAGACACAC CTCACATCTT CTTCCCCACC 60
TGCTTAGGCT CTCTTTCATG CCTTTGTCCC CTCTCATTGC TTCTCCTTAT CCTTAACTCT 120
CAAACTAGCA GTCCCTTCCT CCAGGAAGGC CTCAGATAGC TCATTGTGTC CCCTTCCGGC 180
TCTTGTTTCA CGCTGGTTCA TGTGACTGTG GGCCCAGCTC CTGTGCACTC CTGGAAGGCA 240
GTGCTGGGGT CTGGGTCTGT GTGCTCTGCT GTCTCTCCGG TATCATAAGG TACAGGGCTG 300
CTGTCGAGGT AGGTGCAGGG AAGATGTGTG CAAAGGAATA TCTAGAACAT CCAGCTGTGG 360
GCCACCTGTG TACATGTCTG TGTGCAGATG GCACTATGTC ATCCCAGGAT GTCCCCTCCT 420
TCCCAGTGCT TTCTGGCCCG AGAGTTCAAG ATTGAACCCT GCGGGGGGTG AAGTGAGGCT 480
CTTCTAGGGC TGAGGGTTGA ATAAGGGCAC TGCCACCACC TCCAGTGACC TCACTGCCAG 540
CTGGCATTAT GATGTCACTG GCTTAGCATT CCAGGCCCTG GGCATCTCCA AGTGCCCCAG 600
GTGGGGGCAC TCTCCTGGGG TCTGTGACAG CTTGCCCCCA ACCACGGAGA GGTGACAGGC 660
ACGGTAACAA TCCTGGGGAG TGAGAGCAGC CTTAGGGGTA CCTAGGTCAC CTGCCTTGGG 720
CCACTCTGTC AATTGCAAAA GTGGCCACAG AACAGGGTGA CTAACACTTG GGCTCTGGGT 780
TCAAGCTCTA CCCCTGCTAG GCACCAGCTG TTTGACCTGA GGCTGACAGC TTGAACCTCT 840
CTGAGCCTAA ATTTCCTCAT GTCTGAAATT GGCAAATAGT TTCTGTCTCC CGGGGTTCTG 900
GGGAGGCATT CAGAAGCTAA GACATGTAAA GCATAAAAGC ACAGGGCCTG GGACACAGTA 960
GATACTCAGT AAATGCTGGT TGATAGGATC CGTTGGTTAA GGAAACCAGA GTGGCAACAC 1020
AGGTGGTGGG GGCTGGCTAG AAGGGGGCAG GCTCCGTGCC TTCTGGGGCT GGCCAGAGCC 1080
TTAGGGTAGA GGCACGGGGT GGCCTCCACT GCCAGGAAGG TGGCCCCAGG TATGAGTCTC 1140
CCTCCTTCCA GCTCAGCCAG TTAGCTGGAG CCTACAGGAG GCATTGGGCC CTGCAGCCAT 1200
GCTCTGGGGC CAAGAACCCA TTACCCCCCA CCTCCTCCTC GGTACTCCCC AGTCCTCCTC 1260
CCCAGCCTCC TCCCCACCTC CTCCCAAGTC CTCCTCCCCT GTCTTCTCCC CACCTCCCCC 1320
CAAGCCCTCC TCCCCACCTC CTCCACAGTC CTTCTTGCCA CCCTCCTCCC CACCTCCTCC 1380
ACAGTCCTTC TTGCCACCCT CCTCCCCACC CTCCTCCCCA GCCTCCTCCC CCCAAGCCCT 1440
CCTCCCCACC TCCTCCCCAG TCCTTCTCCC CACCCTCCTC CCCAGCCCTC CTCCCCAGAC 1500
TCCTCCCCAC CCTCCTCCCC AGGCCTCCTC CGCAGATTCC TCCCCATCTC CTCTCCAGCC 1560
TCCTCCCCAC CTCCTCCCCA GCCTCCTCCC CACCTCCCCC CAAGCCCTCC TCCCCAGGCT 1620
CCTCCCCATC TCCTCCTCAG TCCTTCTCCC CAGTGTCCTC CCCACCCTCG TCCCCAGCCC 1680
TCCTCCCCAG ACTCCTCCCC ATCTCCTCCC CACCTCCTCT TCTCAGGCCT TGGGCTACAC 1740
AGTGGGTCTG ATCTGGTCTC CTCGCCACTT CTCCTCTACC CTTCCCTCTG CCTCCCTCTC 1800
CTGTGGGCAT GCCCAGCTGC CTTCTGGGAT TCCCTCCTTA GGGCTGTTTC CTTGTCTTTT 1860
AGACCCTCAA GTCCCTGAGC CTGGACAAGG TGTCCTGGGT CCCTGGGTCT CTGAACCCTG 1920
TTACCCCAGA CACTGCTTCC CATGACACTG TCTCCACTAA CCTTGACCCT CTGCCCCTTC 1980
CTCTCCAGCT CCCCTTTTCT CTGATCCTCC CCTCTAGTTC TCTGTCTCAT GATTCTGTCC 2040
CCACCACCTG TCTCTATTCT GCCCCCGCAT GCCCCTCTGC CCCCCAGCTT TCCATGACTC 2100
GTCCCCCCTC AGCCCCCCGT GCTCTGTCCC CGCCCGTCAG CCCCTGGTCC CAGCTCCCGG 2160
CTGGCCGGCT CCTGCATGGA CAAAGGGGTC CTTTGTGGGC TGACCGCGGC TGGCGGGGCG 2220
GCGGGGCGCT GGCTCCGCAT TGCTGATGAA ACGGAGCCCT TTGTTGTCCC TCCTCAGGCG 2280
CAGTATTTCT TTTTGGGGGC TGGATGTGTT CCTGGCAGGG CCGATGATGG ATGCGCCCGC 2340
CGCCGCCCGC CTGCCCGCCA GCTTTCCCTC CCGCTCATTC CCGCTCCGCT TCAACGCAGC 2400
CCTGACTCCT CCCCTGCTGC CTGGGCACTG CCAGGCCCTT CCTGGCCTGG AAGGGGATGG 2460
CTGTGTGCCC TAGAGTAGAA GACTGGGACC TGGGAGAACG TCCCCTCTAT GTCCTCCTCT 2520
TCCATGAGTA GGGCAAATGG GGCTTTTGGT CAGGGGTCCA CTGGGACCAG GACATCAGTT 2580
TTTCCTAAGG TCTGAAGGAG AAGATGAGCC AGGTATCAGG GCCGATTTGG AACAAGCTTG 2640
AGGACCAGAT GTTCATGTCT GTCTACTCTG GATTTGAAAA CAGAGTTGTC CCTGTGAGCC 2700
AGTCCCTCCG TGTACCCACC TCCCTTCAAC TTCTGTGGCT GAAAAACCAT AGTGTTCTGC 2760
CTGCAGCACC TGTTTGGTGA CATATCACAT CCTCTGGTCC CAAGCTCAGT ATGTCCCAGG 2820
ACCTCAGAGG CTGGGGGTGG GTGGGCCCTG AAGAAGGATA GAATAGTGGA AGATCAGAGA 2880
AATTCCAAGA GAGGAACAGA ACATGAGGTT TGGTCCCCAC CAGGAGAGAC TCAGGACGGA 2940
GACAAAAGCC GAGACACTCA GCCAGAGCGC CAGCCCTGAG CGCAGGCCGG CTGTGTTGGA 3000
AGGAGCTGAC TTCTAATTGA CCTGCCCGCC CCGCACGCAG AGCCAGATCC TGGAGCTGGG 3060
AGGAGGGAGG GGGTGAGCAG AGCAGGAACA GCGTTAATGC AGCTATCGAT TTCTGCCACC 3120
AGCCAGCAGG CCGCAGAGGC GGGGGACGCA CACAGGGGCT GGGGCGCAGC CTGCTCCCCT 3180
CCCCATCTCT GCAGCCCACA AGACACCTGC CTTCTGCCTT CTCCCCTCAC CCAGTATCTG 3240
GGCTGCCGGG GTTGTCGTCC AGGGCAGGGC AGATGAGCTT AGTTGGGCAG GAGCTGGATG 3300
AGCTGACTTG ACGGTTTTTG TCCCTGATCT CACTGACCCT GGTCCCCAAC AACTAGCCAG 3360
GGTCACTGAT TCCTGAAAGG GTCACCAGTC TCTGAGGAGA GGGGCTGAAA AGACCATCCT 3420
GGTCTTGGCC GTTATGAGGT GGGAGGGAAC ACAGCTATCC TTGGACACAC ATGGTCTTCT 3480
TGCTTCAGCT CTGACCTCTG ATGCCCCCCA ACCCAGCCTG GATTCCCTGC CAGGGCCCCC 3540
CGGCTCTGTC CTGGTGGAAT CTGCCATCTT GCCCAGCTCT TCCTCCTCAC CCATTTCCCT 3600
CTGCTAGGAA GGAGCCCTAG GTGGTCTGGT GCCCACTGGG GAGGGACAGG GAGTATCTGA 3660
CTGTTGATGG CGGCTACTCG CCTCACCCTA GAGACAGAGC TTTTCCTTTC CCCACACCCG 3720
GTCCTCTTTG GCCACTCCTT AGTCCTGGGG AAGCCCCCCC TCCCCCCCGC TTGGGGCCTC 3780
AGTTTCCCCC TCTGTAAATG CAGAGGGTTG GACTAGATGC TCTCTTGGGA CAGGCTTGAG 3840
TCCTGTGACT AGGGGGGTTT TGGGGTTGCC TGGGGACAAA GATCCAGTGT GTGCTGCCCT 3900
CAAGCCCAGG GCGTGATGGG GCCCGCCAGA TGTGCGCCTC CCCCTTGAGC CTCCAGCTGC 3960
TCTGGGGCTG GGCCCTGTCC TCCCACCCCT CTCTTGGGGC ATGCTAGGCC ACAGCAGGCA 4020
GACAGGGAAG CAAGGCTGGA GAGCCGGGAC TGATGAGGAA ACCGCCGCCT TGCTCCATCT 4080
GGCCCAGTCC CTTCAGCTGA GGAGGCAGCT CAGACGCCTT AGCCTTGAAA CCTGAGTAGA 4140
GCAGGCCCTG CCCCGGGATG GGCTGCCTTG GAAATATGGA GGTGGCCAGA GGACAGGCTC 4200
CTGCTGGGCT CCATTCCCTT GAGGGTCACG CCTACTCCTC AGTGCCAGCC TGCCCCAGCC 4260
AGAGGTCCCT CCTGGCAACA GCCCACCCCG GCTCTCTGGG TTCTCACTGA GACCTCCACC 4320
CAGGCCCTAC TCTGCAGGCC TTGTGAGGCC TCTGCCCACC ACCGCCCCCA ATCTGGGAGC 4380
CAGGCCAGAG CACCACAGTG AGGCCTGAGT AGAGACAAGA ATGAGGTCTG AGACGATAAT 4440
GATTGTGGTT CGGGGGTTGA GAAGGAAGCG TGTGCCAGGG TGTGCACAAG CATGTCCTCT 4500
CACTGTGGCA GGGGACGGCT GGTCCTCTGG CCCTGTGCTG CTCGCCCTGT AGCAGGCGGG 4560
GAGAAGATCC CTGAAATAAG GGTTCTGCAC TCATTGGCAA ACTGGGTTAC ACAAAGGCAA 4620
CCAGGTTCCT TTGCCTGCAG GACATGTCAG AGCCTTGAAA TAACTGATGT GTATTAGTAA 4680
TCCCCAGATG AGGATCCAGG GGCAGCCTTC CAGACTTAAT GATCTGTACC ATCAAGCACT 4740
CTTCTCCTCA GATGGAGAAG GAAGATTAGG ATGTGGAGGT GGTTTTTTTC TTATTTTTAT 4800
TTTTTTGACA GGATCTCACT CTGTCATCCA GGCTGGAATG CAGTGGCATG ATTATAACTC 4860
ACTGCATCCT CAACCTCCTG GGCTCAAGCA GTCCTCCCAC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTA 4920
GGACTACAGG CATGTACCAC CACACCTGGT TAACTTTTGT ATTTTTTGCA GAGATAGAGT 4980
TTCACCATGT TGTCCAGGGT GGTCTCAAAA CTCCTGAGCT CAAGCGATCT GCCTGCCTCT 5040
GCTTCCCAAA GTGCTGAGAT TACAGGTGTG AGCCACTGCA CCCAGCTAAT AAGCATCTCC 5100
AACACTCTCC CACCCCAGCA CAAGAAGGAC TGCCTGCTTC TGGCAGGTCT TCCTAGACCC 5160
TAGCAGAGCA GATTTGGGCT GTGGAGGCCT GGACTAGGGC CTCCACCATG CCGCTTGGTG 5220
GCTGTGTGTT CATAGACTGG TAGTTCTCCT AAATCTTGTT TCCCTCATCT ATAAAGTAGA 5280
TTACCAGCCA CTGCTTCTAG AGTTCTTGTG GGTCTTAACT GAGATAGTAC AAATAAGAAA 5340
TTTCTCACCA GGATGGATCT GGTGCTTAAT AAATGCCTGG TCAAGCACAT GGTGGTCAGG 5400
ATGACAGGAC CGTTGATAGT GGCGGTGGTG GCGATGTTGA AGGGGGAGGT GTTCACTGCT 5460
GCCCTGACCC TGTATCCTCT 5480