EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-04533 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr4:15653470-15656820 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs71601486chr415655764hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:15655236-15655257CTTCACTTCCACTTTCGATTT+7.14
NFIL3MA0025.1chr4:15653985-15653996TTATGTAACCT+6.14
Nkx3-2MA0122.3chr4:15654303-15654316TATAAGTGGTTTA-6.09
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_07707chr4:15652527-15658809Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_09838chr4:15648871-15672329CD14
SE_36534chr4:15653235-15658387HMEC
SE_54144chr4:15653367-15653807Spleen
SE_54144chr4:15655007-15658419Spleen
SE_64691chr4:15653087-15658389NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr41565593515656313
Enhancer Sequence
AACTAACCAC ATCCTGACAA CCACAGCCTA CTCTTCTCTC AGAAATCAAT TCAAAGAGAC 60
CACTCCTGAC ACTTTAATGT GGAGCTGACC GTGTAACTCC CTTTGCTCCC ACTATACCCT 120
ATTTGGATTT CCATCCTAGC ATAGATGTTA TTACATACTG GACTGTAAAC TTTTTGAGAC 180
TAGAGACCAC ATGTCACATT GCCAACGTCT TTCTGTAGTA CAAGCTACTA CAGAGTAGAC 240
GGTAGAAACT CCAATGCTCA CTGACAGAAT TAATGGAGTT AACCTTGGAG AACTGGAGAA 300
AAGACTGAGA AATTGAAGTA AAATGGAAAA AGGATGTCAT TCAATATAAA TATTTACTAA 360
CATCATCCCA GTCTGAAAGG TCAGTGAATT AGCAGGAGAT TTCTTAGCAG ATTGTTCCCA 420
AAAAAGTAAG AAACTACTAT GATTTAATAT AAAGAAAATT AAACTAGGAA TCCTAACAAT 480
GACTTGGGTT TCCATCTGAA TCTACCACTA GCTGCTTATG TAACCTTGGC CTAGCTAATC 540
TAGGCCTCTA AGTCCCCAGC TATAAAACAG AAATACCTTG TCTTTACATA ACTCAAAGCA 600
CTGTTGTCTG GATAACAAAG GTGAAAAACC TTTCCATAAA ACTTTTTACA GATGTAAAAA 660
GAAATCCATG GGCAAAGTAT TAAATCGGGT ATTGTACAGC AATATTTAAA ATGGTCTAAG 720
ACATACATCT GTCAGCTTTT GAAAATTTAT TTTCTCATCC TATTCACCTT TATACCTAAA 780
AAATAAGTAG ACTAACATAA CTTTGGAATA CATTATACTA ACTGGCTTAA GCATATAAGT 840
GGTTTACTTG ATGCTAGTAA ATAAATGGAT GCTTCTAAAA TACATTCTAC TTGAGAAGTT 900
CAATATTGAA AATAGTAACT GACTTCTTGA TAATAACTGG GCATTCAGAG CCCAAATTTG 960
TACAGTGAAA TAACTATTTT GTACCTTTTT AGTCTGAGCA TAAAAACTAG TTCTCATTTT 1020
ATATAGTTTT ATTGTAAACT GTTTGGTTGG ATATCCTTGG TCTATACAAC CAAAGGATGG 1080
CAAAACGTGA GATGATAAAT GGATAAAAAC AAACAAGGTA CTCTTCCTTT AATTCCTTTA 1140
AGATTACTGA ACCATTACAA AATACTTATT TTCCACTCTA GCTCCCAAAG GACATCCTAA 1200
GAGAGATTTC CATTGGCTAT CAGTATCAAG AAGAAATCCA GATGTAAAAT TCCTATGCAT 1260
TTTTTTTTCC CTAAATCGCC TCAGTTTCAG TTCAGAAAAT TGGACTTTTA ATCTTCGTGA 1320
TAAACGTATA CAACAATCTC ATTAACTATA TCTAATTAAT TCAGAATTAG TAATAATTTT 1380
GACTTACACC ATGTCAAATT GAAAATGCTT TATTAAACTA GTTATGCAAG TGGGAACATT 1440
ACTGAAAAGA CTCTTGGCTC AGATATCTTG TAAAAAAGCA ACTGCATTTT CAAAATTTGT 1500
TCAAATACTC TCAACCACCA GGAAGAGACA GAAAAAGAGC GACTAACTTC TTGAAAATTT 1560
TAAAATAAGG CTGCTTAGCC TTAGTCTGCA AGTAAATTAA ATTGTGATTC TTTATTTTGG 1620
GAGGTCACAA TCATCTGGAA ATCGATGAAA GCTACAAACA CCCTAGGAAA ATGGACACAC 1680
GCACAAAATT TTCCATATAA TTTCAGGTGA TCCTAGGCTA CCTCTCCACA GTCTAAAGTG 1740
GAGAGAAAAC CTTGGATTCT GTTAGTCTTC ACTTCCACTT TCGATTTTTG AGACCATTTT 1800
TTTTTTCTTT CCTGCTATTA AAGAATGGTG TCTGAATGAA CGATATTCAA AAGCCAGAGA 1860
GGATAAAAAC ACTATAATAC TGCTAAGTAA AAAATTCAGG GATATACCCT CTTGCTTAAT 1920
GGCTTAACCA TTCCTCATGC TTCTCCTAGA TGAGTGGTTC TCACCCTCAG CTGCATACTG 1980
CACTCAAATG GAGAGCTTTA ATCATTTATA CCTGATGTCT GGGTGAAATC CTAATTTTAG 2040
TGACCTAGAC ATCAGGACTT CTAATAGTTT TTAGTTTAAG GCTAATAAGC AACCAAGGTT 2100
GCAAACCATT GTCCTAGACA GTCCTGGTGT TTCCAACTCA TGTGAACTGG GTGTTTCTAA 2160
ATTTTCAGAA TGGAGGGAGG GAGAAGATGG AGTGCTAAGA TTTGAAATTC AACGTCACTG 2220
CTTTAAATTG CTGGTCTTGA GTGTGGCCTA ACAGTGAATA CCCTGGGCAT CCTCCAATCG 2280
CCTGGCTGAG CTATGAAACA CCCCTCTTTT CTGTAGACAA TGGTTCTGCA TAATGCTATG 2340
CAATTTCTGA GAATTCCTAA AAGTTGATTT CTATGCTTAA ACAGTAGTCA TTTGAATGCT 2400
TTATTTAGTT GGATCATTTC CACAAGAAAC GGGACTGCCT GAGGTTTGCA GATATCCATG 2460
ACTTTCCCCA ACATAAACTG ACAAATACGT GGAATGTTAA TATTGTTTTA AAATCACTAG 2520
CAAAGGGCCC TGAACCATCT CCACAAAAGT GCCTCTTCAG CTTATGCTGC ACCAATTATG 2580
GGCCCAAAAT GGTTCTCACA GTTAAACCAA CTTTTCCTGA GGCCCCCTTT ATTCGAGCTC 2640
ATATAAAGAA ATCCAAGAGA GAATTGCTGT CTTATAACAA AATCTACATC CAGTAAGTGT 2700
TCAGGGCAAT AAAAGTTGCA AGGAAAACGA TAACGACACA TGAAGAGTGA AGGTTCTTCA 2760
GTTCTAAACT TGGCTTTTCT CCCAAATCAA ACCAGTGAAG AAAGCCGGGG GTAAAAGGAA 2820
CCGGGTAGCT GGGAGACGCT GCAGTTCCAG CCAGGAAGCC AGCGAGAGGT GCAGAGGATG 2880
GGTGGGTGTC TGCACGGAGA GCCCCGAACA GGCCCGGGGG AGTGACGGGG GACGGGAACA 2940
ACTACTCGGT GCAGATGGGA GTCCACCGCA GGTGGCCGGC CGGGGCACCC AGGGCTTCGA 3000
GGAGGTAGGG CCGCTCTCCT TAGAGGCAGC AGCGGGAGTC CCAGCGCGGC GGTGGGGCCG 3060
GCCCGAGGGC GGCCAGTGAC GCCGGTAGCG CCCCTCCTCA GCCGCCAGGC CCTCGGCAGG 3120
GGACGCCGCC CGCCCCGAGA GCACGTCCGA GGCGGCGGCC AGGCCGGCTC TGCGAAGGCC 3180
TCGCAGCGGG CGGGCAGGCT GCGGGAGCGG GCGGCGCTGA CAGCTGCGCA GGCGGCTACT 3240
CGCGCGGCGA CGGCACGGGG CTGCGGGCGC GGCGCAGGCC AGGCCGCCCC AAGAACCCAG 3300
CCCGCTCCCC ATCGCCGCCC GCACCGCCCA CAGCGGGAGG CTCAGCGCTC 3350