EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-04220 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr3:156873860-156876650 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:156874799-156874815TGTTGCCATGACGACA+6.39
RFX1MA0509.2chr3:156874799-156874815TGTTGCCATGACGACA-6.39
RFX2MA0600.2chr3:156874799-156874815TGTTGCCATGACGACA-6.01
RFX2MA0600.2chr3:156874799-156874815TGTTGCCATGACGACA+6.25
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00231chr3:156870871-156880613Adipose_Nuclei
SE_07626chr3:156876194-156879627Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_09826chr3:156875259-156880430CD14
SE_10375chr3:156876272-156880063CD19_Primary
SE_11161chr3:156873313-156880614CD20
SE_12001chr3:156874450-156875170CD3
SE_12001chr3:156875741-156879740CD3
SE_13159chr3:156875974-156879398CD34_Primary_RO01480
SE_13559chr3:156873682-156875144CD34_Primary_RO01536
SE_13559chr3:156875191-156879799CD34_Primary_RO01536
SE_14215chr3:156876306-156879467CD34_Primary_RO01549
SE_14507chr3:156871985-156879819CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15510chr3:156876079-156879439CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15861chr3:156874939-156879557CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16416chr3:156875797-156879750CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16970chr3:156873480-156875433CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16970chr3:156875477-156879502CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17441chr3:156870975-156880553CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17939chr3:156871407-156880346CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18467chr3:156870733-156880628CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19331chr3:156874371-156875674CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19331chr3:156875724-156879498CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20063chr3:156875711-156880250CD56
SE_20832chr3:156871838-156879734CD8_Memory_7pool
SE_21509chr3:156874465-156879560CD8_Naive_7pool
SE_22033chr3:156874002-156879572CD8_Naive_8pool
SE_22382chr3:156871501-156880567CD8_primiary
SE_23302chr3:156874618-156875026Colon_Crypt_1
SE_23302chr3:156876202-156879222Colon_Crypt_1
SE_25988chr3:156873230-156880028Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27755chr3:156873581-156879740Fetal_Intestine
SE_28736chr3:156873513-156879853Fetal_Intestine_Large
SE_29671chr3:156875861-156879996Fetal_Muscle
SE_31217chr3:156876042-156879414Fetal_Thymus
SE_34832chr3:156875502-156879948HeLa
SE_36540chr3:156875571-156879736HMEC
SE_38728chr3:156875830-156879789HUVEC
SE_44125chr3:156875865-156879490MM1S
SE_44695chr3:156875242-156879511NHDF-Ad
SE_44947chr3:156875570-156879517NHLF
SE_45937chr3:156873878-156880141Osteoblasts
SE_51331chr3:156875278-156879975Skeletal_Muscle
SE_62674chr3:156874328-156894975Tonsil
SE_64709chr3:156875619-156879509NHEK
SE_65819chr3:156875696-156879991Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr3156875169156875335
Enhancer Sequence
ACAACAACAA AAATTACAAA GTCCAAACAT GGTTAGTTTC ATTTATGTGT TACAAAGACT 60
GAGAAATATT GGAACCAAGT CTTCAAGAGA CTATAACAGA TTGGTAGTTT ACAAAGAGGC 120
ATACTGCCAA GCAATATACA AAAATTTGTA ATGCCTACTT AAAAGTAGAA ACATCCTTTA 180
TAGGTATTTA AACAAACTGA AGGCCACCTT GTAGAGCCAC AGAATTATAC TGTAGAAAGG 240
TGGTAGACTA AATGACATCA CTTAACACCC TTCCAATTCT TACCTATCCA ACTTTTATTA 300
TCTATGGATA CACTGAAAAT ACATTGTATT TACTAATGAG AATGGTTAAA CCAGTCTTTG 360
AAAATTTTAA TACGCTGCAT CTCAAAAGTA AATATTTGGA AACTAGAACA ATGAAAAAGC 420
AATCCCCCCT CTAAATTTAG CTGTTTATTG TCAACTTAAA AGATAATTAT CGAACCACAA 480
AAAACTGAAG GAGGAATAGG CCAAACAATC CAGGTTGGGG ACTAAGCACT GGTACTTTTT 540
AAAAAGCTCC TCTGCTAATT CTCAATGTGT AGCCAGGCTG AAGAGACCAA TGACCTACAA 600
GCAACATGAA TAATGTATCT CCACTGTAAT TGTCAAAGTC ACACTACAAT TTAAAGTTAT 660
GAATAAACTA GATTAAAACA AATAGCATCA TTAAGACAAG TGATATGCTT TACCTAACCA 720
ATGTATAATA CTGATAGTAC TTTCTAATGA CATTAACCTA TGCAAAAATA AATACAAAGC 780
TATAGTTCTA ATAACTTGGA CAGCAAAGAC AAAAGCTTAT AACAAGAAAC AGGAGTTTTT 840
CTAAATGGTT CACCAGTGGC CAACCTGTTA GTCCCCGATT CCAGTGACCT ATTCTCAGAG 900
CACTGGCTTC TCCTTGGGGA TTTTCGATAC TTCACTCACT GTTGCCATGA CGACAGCTTC 960
ATCTCTATGT ACCACTCCAC ATCACCCAGG CTTTGGTAAA TGTAGCTGGT CGCTGTATAG 1020
TCGGTTGCAA GGGAAAAAAG AGTTGAAGTT AATAACATAT ACAAGTTACG TGCTTGAGTA 1080
AACTTGTAAT ATGCATAGAA ACACTTTTAC ATCCTGCTTT AAAAAAAGGC TTCCATGCAA 1140
TTAACAACTC CTTTTAAATT TTGCTATAAT CAGACTTCTA AGATTGAAAC AAAATCAGTT 1200
TCTCTGTAAT AATGACCCAA AAAACAAAGT TACATCAGAC ACAACAATCA GGTGAGATTA 1260
TATTATTTTA AATTCCATGG TTTTTACAGT TAAGACCTAT TCTAACATCA ACGAAGTAAA 1320
CTAGTCTCAC AGGAAAATTC CACAGAAGAT AATCATGTGA TTACATAATA GTTGGCTCAA 1380
TGGTTCAAAG AATACTAGAA AACCATTTCC TTTAAGCAAA GAGAAACCTT TGACTAAAGA 1440
TAGAGCCTTG TATTAGTGTC ATTACTTTAA ACATCCTGAA GAATCAGCCA GGTATCTAAA 1500
TACAGATTTA ACCTCAGACC ATACCAAAGA CCAATTTGAA ATCTTCCCAA TTCCCAGGGA 1560
CTCATCAACA AACTAAAAGA TATTTTAGAA TTTAAAAAGT ACTCTATCCC TGGACACAGT 1620
TAAGGTGAAT GAGAAAAGAT GGGGGAGAAA AAGTATGTAG GAAAACTGTT GCAGACTTTT 1680
TGACTAGGAT ACTCTTTTTT TAAAAAAGAA CTGTCTGTAG ACTCACAGAA TAGACTAGTC 1740
ATCTTAAAGT TGCTTTAATA TTTGCTTGTC TGAATAGTTC CATTACTGCC AACTTACAGA 1800
TTCAGCCAAT AAGGACTACT CATATAGAAT ACTAACAGCA CTAACCAACA TACCCAACCC 1860
CCAGAACAAC TTATAATCCT TTTAATAACT TCCTTTCAAA CTCAGTACAA TTTGTCTAAC 1920
ATCACTACAA TTCCTTAAAG AGTGAATGCA AAAACTATTC TACACCAAAT ATATCATTCT 1980
GCAGCATGTA CTGGAAGTCA CCTGTAGATG CAGGAAGTCC TGCAACAAAC TTTTTGGTAC 2040
TGCCTCACAG GAACACATAG GTCCACATAA AATTATGTTA CCACAACACC TAGGAGATAC 2100
TATTTCAGTC TCTGTATTTT CTTACAACAT CAAATAAATG GCCCTATCTA AATGCAACCC 2160
AATCAATCTT ACTTGTTAAT TTTCTAACCC ACTCACTGAG ACTGTATCTA ACCAAAACAA 2220
AATACCTGTT TAATCCCTTT GACTTCAAAC TTCAAACTTT ATCATCCTGC AGTCCTTTCA 2280
GATCCGGTAT TATTCGATTT ATCGTAGTTC AATGTTGAGA AGTACTCTAA CAAAAGCCAA 2340
CCTCAATTGA TAAAGAATTA ACTGGGACTT CGAGTAGAAA AACATAATCT ACACAGAACT 2400
TTGCCACAAT ATTAACTTAA ACTACAGTGT TTAAACTTCC AGCCTTCAGT CTTCCAGAGA 2460
GGGGAGAGGA AAAATAACTT ACAGAATACA CTCACACTTG AGCCAAATGT ACTCCCTTTC 2520
TTGTTTAATC TTAAGCCACA GGCCTGGCTT CACAGCACTG TTAGGATTGT CCATAAATGC 2580
AACTGCCTCT ACAAACTTTA GATAACCGGT TAATTATGTT TCTTTTTTCA AATTATTTTA 2640
AGTATCAGTG TTCCTATATG AACTTTAACA CCTAAATTAA AGTCCGTTTT CTTTTGCATC 2700
CGTATTCACT TGAAAGGAAA GATGTTTTGA TTTGATGACT GGTGCACGGT ACAGCAGTAG 2760
CAAGAGATAC TATGTTCAAT AATGCCAATC 2790