EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-01964 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr1:155937070-155938940 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:155937983-155938004CTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.41
Myod1MA0499.1chr1:155937739-155937752TGCAGCTGCCCCC+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155938583-155938603CCCCCACCCCACCCCCTCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr1:155938584-155938604CCCCACCCCACCCCCTCCAC+7.01
ZNF263MA0528.1chr1:155937603-155937624CTCTCCAGCTTCCCCTCCCCC-6.35
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155935629-155941788Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155934724-155941198Aorta
SE_03231chr1:155935411-155941178Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155936927-155937325Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155937326-155938520Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155938679-155939364Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155936457-155939358CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155937235-155938653CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155936695-155940384CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155935980-155938209CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19282chr1:155938352-155941313CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26270chr1:155936615-155938673Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26270chr1:155938718-155940935Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155935912-155941094Esophagus
SE_29653chr1:155935863-155942574Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155936039-155937982Gastric
SE_32195chr1:155937995-155941084Gastric
SE_37367chr1:155935140-155941528HSMMtube
SE_39002chr1:155938017-155941141IMR90
SE_40938chr1:155934691-155941319Left_Ventricle
SE_42293chr1:155934607-155941204Lung
SE_45406chr1:155937214-155937779NHLF
SE_45406chr1:155938586-155939581NHLF
SE_47089chr1:155937159-155937866Ovary
SE_47089chr1:155938546-155939070Ovary
SE_48803chr1:155935124-155941166Right_Atrium
SE_50236chr1:155936031-155941345Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155935853-155941418Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155936908-155938578Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155938679-155941227Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155936636-155941195Small_Intestine
SE_53512chr1:155935694-155941433Spleen
SE_55468chr1:155937112-155937974Thymus
SE_56150chr1:155938459-155941237u87
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155936894-155941241HSMM
SE_69165chr1:155935996-155938187H9
Enhancer Sequence
AGAATGGGGG CTAGGGGCAG AGGGGAAATT TACATTCCCT GAGCTTTTAT AATAGTAAAT 60
GTTCCACATT TACTTAATCC TAACCACCCG TAGAGGGAGG TTCAGTTATC CTCATTTCAT 120
GTATGAGGAA CCTGTCCTGG AGTGGCTAAA TCGTCCATCA GAGGTCACAC GGCTAGTGGG 180
AGAGGTGGTG TTTACACTCC GGTGGGCCTG AATCCAAAGG CCGTGCTCCT TCCCTCGCAC 240
CACATGCCCT GGACTCTGGC TGGGCCTCAG CAGCTCCAAG GCTGATTGAT GGCTCCAGTG 300
GTAAAGAAGG GACAGGCAAC TCCCCACCAA GCCTGGCCTT CTCCCTTCCA GGCCCAGGGA 360
GTCCTGTTCC CCCAACTCAG GCAAATCCAC AGCTCCCACA CTCCATCTGC TTCTCCGCCA 420
TCCTCCACCC CACCTTGCCA TGGGGTAGGA GAGAAGAAGA AAGGAGGATT CGCTGAGCCT 480
AGGCACTGGG ACCCTGGCCG TGCCCTTCCC AGACATGCCC TCAGCTCCCG GCCCTCTCCA 540
GCTTCCCCTC CCCCATCCAA CAACACCGGA AACTCTGCTA ACTCTTTCAG ACAATACCCA 600
GCACCACGCT CACTTCCACA AATACAAGGC AAACAGGGTG GAGCAGAGGG GGCAGACAGA 660
AGTGGGGGTT GCAGCTGCCC CCACCCCCCT GGAGCTCCCT TCTCCTACCC CCAACACTCA 720
GTGTCTCTGG ATTGAACCTC CGCTTTCCAC CTGCTCTCAA AATAGTGCTG CCCGCCTCCC 780
CTGTTCCCCT GGCAACAAGC TTCCGGATTG GGAATTTTGT CAGGTCTCTA TAGGGATCTA 840
GATTGGGGTT CCCTCCTCAT CCTCACAACT CTAAATTGAA CAGTGAGGAA AGTAGGGAGG 900
CTTCACTGGT TTTCTTTTCT TTCTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGCGGTAGC AAGCTTTATT 960
GTGAAGAGCA AAATGACAAA GCTCCCACAG CGTAGAAGGG GACCCGAGCG GGTTGCCCAT 1020
CACTGGTCCT TTCTGGGGGT TCCTTCCCCA AGTTTCATAG GGATTTACAG GCTAGAGCTT 1080
TTGTCCGCTA TTCAGTAGCA GGTCACAATA CCTTCAATCC TGCTCTAATC AGAGGCATCT 1140
CTGCCATAAC TTCAGGAGGA ATTGAGGGAG AGGGGGCAGC AGGAGCCCTC TGTGTACTGG 1200
GGAAGGAAAG AATTCCTGGC TTATACTCCC TAAAGACAGG ACTACACTCA GATGTGGATG 1260
AAGGGCAGGA ATTCTAACCC CTGCCCCTCA ACACACACAT CCCTGCTACA TTCCCTCTTT 1320
CTCACTAGAA ATTTGAGATG AAGGGTCCTA ATCACATCTT CTGCTTGAAA CAGCAGAGAT 1380
TTCAGGCTCC ACCCATAGTC AATAGAAAGA AAGGGGCAAG GGGACTGTGA AGTCCTGAAT 1440
GCCCAGCTCT GCGCAGGAAG ACAGGCAGAG CCAGCTGCAA GGCTGGCAGC TTTCCACCCA 1500
GTTCCTCTGT CACCCCCCAC CCCACCCCCT CCACACATAC AACATTCCTG CTCCTTCTCC 1560
AATCAGTTCC CCTAACCCTT AGCAGCTGTT CGGGGAGCAA GGGGGGTGCC TGGTGGATGA 1620
CAGCTGCAAG AGGAGCCAGC ACAGCCTCCC CTCCCCCACA TTCCCAGATA GTCCGGCTTA 1680
TGCCATATTC CAACAGCCAC CACCCCTCAG AGTGAGGACA GGGAGCAAGG GATCAAGCAA 1740
CTGGCCCTGG CATTTGGGCC CAGCTGGGGA TCAGAGAGAA GAGTGACCCT CATGGATCCA 1800
GGCAGAAAAA ACAGATGAAA AGATCAGGGT CAGTGGGCAC CGAGTCTGGG TGACTCTCAG 1860
GGTCCAAACA 1870