EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-01446 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr1:44477400-44482710 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:44478725-44478741GGTTGTTTACTTAGGG-7.34
Foxa2MA0047.2chr1:44478728-44478740TGTTTACTTAGG+7.22
ZIC1MA0696.1chr1:44480003-44480017CTCAGCAGGTGGTC-6.13
ZIC3MA0697.1chr1:44480002-44480017GCTCAGCAGGTGGTC-6.09
ZIC4MA0751.1chr1:44480002-44480017GCTCAGCAGGTGGTC-6.12
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04236chr1:44476144-44484011Brain_Anterior_Caudate
SE_05099chr1:44474958-44484186Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06661chr1:44475060-44484159Brain_Hippocampus_Middle
SE_07053chr1:44475106-44484097Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_23374chr1:44476677-44482159Colon_Crypt_1
SE_24099chr1:44479608-44480705Colon_Crypt_2
SE_24099chr1:44480727-44481564Colon_Crypt_2
SE_24883chr1:44476162-44478294Colon_Crypt_3
SE_24883chr1:44478765-44483361Colon_Crypt_3
SE_27482chr1:44479315-44480785Esophagus
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr14448166144481800
chr14448037344480714
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I044010chr14447616344482159
Enhancer Sequence
GGGAGGGGGC CGAAGGTCAG GAGAGGCAGA TGCGGGGATT TGCCCCAGGG AAGAATGTGG 60
GGCCTGCAGG ACTGAGCTGG TGGCCTGGGC CCCACTGAGG ACAGCCCCTT GTGGAACCCC 120
AGGCCCAAAA GCTGGAACTG GCTCTGCAAG TCCCTTGGTT AAAGAAGTCC CTTAATAAGT 180
GCCATGCTCC TTCCACCTCC CTCCCACAGT GAGCAGGAAA TTAATCAGAG CCCAAGGGCC 240
CCAAGGGGTC TCACTAAGGA GACAGGGGCT CAGTGTCACC AACAGAAACA CAGACAGACC 300
TTAGTGCCAG AGACAGCCTC CCAGAGGTGA GCTATTCCCC TGAGAGAAAC AGACAGACCT 360
GGCATCAGAG ATGGAGCCCC GTAGCCTCAG AGAGATGCCA GTGATGTGAC ATTCACCCTC 420
CGCTTGAAAG AGACATATTC GACAGCAGTC ACTCTGGTCA ATAAGCAAGG CAGCCTGGTG 480
CAGGTGAAAT GCTATCAGAC CCTGATGCTG ATGAACAAAC ACAGACGGAA TGAATGGCCT 540
CCCTGGGCCC CAAGCGCCTT GGATAGGCCA GGTGGGAATG TGGGCAAAGG AGGCACCAAG 600
GCCTGATGGG TGGGCACTGC AGCACAGACA CCTTTGTGGG GCAGCCACCC TGTGCTCTCA 660
ATCCAGCATC GACCCTGCCG AGATGTGATC CTCACACCCT CCACAGAGGG CAGGGGTGCA 720
GTGCCAGGGA CCATGGGTTT CCTTCAAGGA GCACCCAGAG CAAATCAGTG GCTGAACAAG 780
CCTTCTTTCA TTCATTCATT GATTCATTCA TGCAATGGCA GATTTATTGA CACTGGCTAT 840
GTGCCAGGCA CTGTGCCAGG AAGTGGGACT TCAGCAGAGA GCTCCTACCC ATTCGGAGCT 900
GGAAATCTAG TGGGGGTGCA ATGAAATGTA TACACCCATC ATCTTTAGAT GTGGCTTCAG 960
GGTGACCACA GAGGGGATCA TCTCAAAATC ACAAGAGTAT GGAAGGAGGA CAAGGCAGGA 1020
AAGCAGGGCT GAGGTCAAGG AAGGTCTCCC TGATGAAGAG GCTTGAAGAC ATGCTTGGCC 1080
CTGGTAGAGG GTGCCCCCCG GCCTGAGTGT GCCCTCTGTG ACATGCCCCT ACAGAATCCT 1140
GTCTGAGCAT GTCACCACCT CCTGGGGCCT TCACTGGGGC AGGTGTGGCA AGATCACAGA 1200
GTCAAGGGCC CATTTTTTGG AGGGTGTGAG GCCTGCTGGG GGTGGTCTAT CTGGTCCCAA 1260
ACAAATGCCA GCCAAATAGG GCTCCTATAT GTTGACCCTA CAATACCAGT TTTATTCTGT 1320
CCCAGGGTTG TTTACTTAGG GGCACAATGC CTGATTGTGC CAGCAGCACA GTACACGGAT 1380
GGGGTCACAG AGCAGCAGTT ACAGCTGTAA AAGGGACAAC TGATGGTCCA GGATGGACCC 1440
ATGGGCAGGG TAAGGGCAAG GCCCTTTGCA GAGATCCAGG TTCCCAAGGC TTGAAGATCA 1500
AGGCCTGTCT CCTGTTCCCA GCAGGATGAG GGACAGATGC CCCATACCCC CTGACCAAGT 1560
GGGACCACAT TTGGATCCCT GAAGTCTGCT CCTTCCCTGG CAGGGGGAGG TACGGGGAAG 1620
GTGGTGATGC TTCCAGCCAC GTGCCACAGA CAGCCGCCTG CCTGAGCCCT CAAGAGCCAG 1680
CCACTGCTCC GTTAATGAGC CGTGTGCTAA CCAGCTTAGC CGTGCGGGCT GTAACCCAGG 1740
GAGGCCACAG CCCCCGCGAC AGGGCTGAAC CGGGGTTGGC GACGGGGCTC TGGCAGGAAG 1800
TTTCTGACAA CACTAAAGGT CTGCTGTATG CAGAGGATCC TTGCAGAAGC AGCACCCACT 1860
TCTGCTTGGG CCTGGGTCCC AGCACTGTGG CGCTCGACCA CGGGAATCTG GCCCAGGCTT 1920
GGCCTCTGTC TTCAACTCCA GGGCTGTCTA CGCTCAGGTG GCTTGGCTGG GGAGGGCTGA 1980
GCTCTCAGCG GACGACAGAG CAGGCCTACC TTTCTCCAAG CAAACTGGAG GAAAGACTCT 2040
CCAAAAAAAA ATCCAGGCAC TTTCTGGGTG TTCTAGTTCC CTTCCTTGTC CAGATCTCCT 2100
CTGGGGACCA CCCTCTGACT TCCCTCCTGA GCAGCTAAAT CTTTTTCAAT ACTGTATGGC 2160
TTTTTTTCTC CCTCCTTGCA TAATCTTTCC TATTCTAAGC CTCTAGTTTT TCTTGATCTG 2220
CTGGGTGGAC GGCTGTGTCA CTGATATGAA CTGTCCCTGC AGTGGTCATC AGCTGAGGTA 2280
CCCACGGAAA AATCCCTTTG TGCTCACGAT TTGACTCAGA CTGGCTGCCC GTCTGCCTGA 2340
GCCAGCTCAG CCCCATGGAT GGGCTCTGCT CCAGGCTTCT CCTAACCCCC ACCACCATCA 2400
CCACCATCTG CCCCCCTCTG CTCACCCTCA CTCACTTGCT GACATCTCAG TGGGGAATTA 2460
AACCATAGCG GCATGGTTCC CTCTGGCTTG GCCCCCTCTT CTGCAGGCTC CCTAGGCAGC 2520
CCCTATGTGC CCTGTCACCC TTCCTGGCAG CTCTGAGAGG CCACTGCCAG GACAAAGCAG 2580
CCTCCACTTG CCACTGCCAT GGGCTCAGCA GGTGGTCTCC AGGACAGGAC TACCCTGCCC 2640
TGTCCCCAAG CTCTCCCAGC CATGGAAGGA ATGGAGGCTT TCCTTCCATG GCGGGGTGGG 2700
GTGAGCTGGC TGACACATAT ACACCCATAC ACACACACAC ACACCCCTCA GATGTTCCCT 2760
TACCCTTAGA ACCAGTCATT GAGACAGGAG TGTCCACCCT GGCACAAGGA CTTATGATCT 2820
TTCCTGGTTT AACAGCCTCC CACCCCTTCC CTGCCTAGCT GGGAGAGCCA CACTGAGCAA 2880
AGTCACTTAC ATAAGTCCTT TACACAGCCC TCTGCTTGGC TTATTTACTG CTCTGGCTGA 2940
GCCCCTGGAA TTAAGGCTGC TCAGCTCCGA GGGCAGAATC CAGATCTCCC ACTCAGCCCT 3000
GGGCTTGGCA GAGGCGGGAC ACCGGTGCAG GTGAGAGCCC TGGTGCTCTA GGGCCCGCTC 3060
CTCCAGTAGA GCCCTGGGCA AGCCACTTCC ACTCTTGGTA TCTCAGCACT GCTGTCTACA 3120
AAAGCAGGGG ACAGACTAGA TAACCTCACT ATCAGACAAG ATCGGGTGCG TTCAGGATGG 3180
TATGGCCATA GACTAGATAA CCTCACTTTC AATCGATCTG CCAGATTCCC AGGCTAGATA 3240
GCCTCTGTAG CTACTCATAT TCCATAGCTC TCCCTCACCT GGAATTTTGC TATTTCTGAC 3300
TTTCCCCTGT ACATTCCATT AGTTCCCACT AGCTTTCTAG ATTACTAAAA ACAATTTTGC 3360
CCTTTTTTTT CCTGATTATA AAAGCATAAT AAGCTATCAC ACACAAAAAA ATTAGAAAAT 3420
ACAGAAAAAG GTAAAGAGGA AATGCAGCAA CAAAGCCTAC TCCCAGAGCG AACCGGGCCA 3480
GCCCCAGGAT GCACTCCTGC CTTTTGCTGT TGCACAGACT CAGGGAGCCC AGCTCTCCAC 3540
CCTGGACGGT GACTGTGCTC TGGTGTGACA CTCCCGCCTC CTAGATCAGT GGCCAGTGGA 3600
TATTTTTGTG AATTGTGAGC TTCCCCCTCC TGCTCTGGGT GGACACTGAG GAATCCTGGA 3660
GCTGCCCTGG ATGGGCGGGC CCCTCTGGGA CCCAGCAGGC TTTGTGTTTA GGACTCTCCA 3720
GCCCCAGGGT TTGCTCATGG GATGAAGTCC CATCCAAGAC AAACTTTATG GAGGAGAATG 3780
GGCAAGACCT CACATCCCAG ACTGACTTTG AGCCAAATCA GATCACTGGC AACTTTCTCT 3840
AAGCCCCAAT GGGGAATCTA GACAGAACAG CCATTACAGT AAATTGTGGC TGCCTCAGAA 3900
GACCCCACGA CCTCCTTCCG GCCAGGCACC CCTCAGTTTT TGTTCTCTCC TATCAGTGCA 3960
GGGCCCAGCC TGGCCCACAG GCAGCACCTA CCCTGCAATG ACAGAATCTT CTGTCCTTCA 4020
CCTACATGGC ACTGAGTAGG GGCAGAGAGA CCCAGCTGCA GCTCTGATCT CTGGCCTCAG 4080
TTACCTGGAT ATGGGAGAGT CTGGGGCCGG GGTGGAGGGG CAGAACATGG GAAAATCTCC 4140
CCCGGGCCGA GCAGCCCCCA GTGGCCATTC ATGCCTCCTG CCTCAAGGCA AACCTCAGAG 4200
CCATCTCTGG GCACCTCTCA GGACTCCAGG TGCCTTCAGA GTCCAGGCCT TCATATAGCA 4260
GATGAGAGAG GCAAGAATAC GCCTTGTGCT TATCCATTGC AGAGCCCTGA CTGGCAGCAA 4320
GGGACCTGCC AATATTGTGG GCTGCAGACA GATGACTGGC ACCCCCAGGC ATGCCGGGCT 4380
CCACTCCAGG CCCTGGGGTG AGTGATGGAG GACCCTGGGT GGACCCTGGC CAGCTCCTCG 4440
CTTCCCACCC CAGACAAGCC CAGGAGGGAA GACTGGAGGC AATGGTCATG TCCTGTGCTG 4500
CAGCGGCTGG GGGCGGCGTC TACCCTCACT GGCTAGCAGC AGGCAGGCAC TCTGGAAAGT 4560
GGCTTTGGTT CTTGACCCTA GCAGTACTGA GGCTTGAGGG CAGCCCTGCG TACTGTTCCT 4620
CCCAGACCCA TCCCACATCG CCTCAGAGGA CATTCCCTCT CTTGCCTTTT GAAGGTCAAG 4680
TCAGGATGTC CTACAGGGGA GAAGTGTAGC TTTCGAGTCT CCTCACCCTC GCTGCCATCC 4740
GCTGACATCT CCACCCGTCC CCGGCGTCCA GGGATGAGGA CACACCGGCT CCCAGCCCAT 4800
GCGGGCACTT GCCCTGGACC CTGGAAAATG TTCTGTGGGG TCTCTCTCTT CCCAGCTGAG 4860
ACTCTTGCCC CATCCCCTTC CCCCACCCCT TGCCACTGAA ACCATGTACC ACGTTCCCCT 4920
GCCCCCTCAC CCACTCTTCC CATAGGAGTA ACTGCCGTGG CACAGACAAT GAGGCTGTAT 4980
TGATTAGTAC AATTCCTGGG CACCTCCGGC CCGTCTCCCC GGGAGCTAGG ACAATGCAGC 5040
TTTGATACAC AGAGCAGATT CTCAGCAGGT CCTTGGGCTG GGGGAGCCCT CACACCCCCA 5100
CTCTCCTCCC CCTCACCCCC ACCACACAGC TAACTCTTCC TACACTCCTT TGCACAGTTG 5160
CAACTTTCTG GGTCACTTTG GCTGGTGTCT GTCTTGCTTG CTGGCTGTGC CTGCCCCTCC 5220
CTGGCACAGA CCACTCAGCC CCTCTCCCCA TCCGCAGCCC AGCCTCTCAG CCTGCCTGGC 5280
ACCAAGGAGG GGGCTCAACT TCCTGGAAGG 5310