EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS167-00577 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Retina 
Coordinate
chr1:12000410-12008030 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:12001284-12001296GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12007309-12007321AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12007313-12007325AAACAAACAAAC-6.32
HSF1MA0486.2chr1:12006368-12006381TTCCAGAAGATTC+6.06
IRF1MA0050.2chr1:12003347-12003368TTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.59
IRF9MA0653.1chr1:12001561-12001576AGTTTCACTTTTGTT-6.15
KLF13MA0657.1chr1:12004895-12004913AAGCCAGGCCCCTTTGTT+6.32
KLF4MA0039.3chr1:12006724-12006735CCACACCCTCT+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr1:12002675-12002692AGGTCATGCCAGGGTCT+6.09
ZfxMA0146.2chr1:12001784-12001798CCCGCCTAGGCCTC+6.24
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04401chr1:12000209-12001469Brain_Anterior_Caudate
SE_05426chr1:12000203-12001599Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06308chr1:11996980-12001547Brain_Hippocampus_Middle
SE_07453chr1:11999893-12001507Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08423chr1:12000168-12001475Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_34570chr1:12003473-12004339HCT-116
SE_34570chr1:12004366-12005693HCT-116
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr11200434612005135
chr11200080812000900
chr11200440012005200
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I011940chr11200066112000910
GH01I011942chr11200215012002882
GH01I011943chr11200356812005510
Enhancer Sequence
CTTTATTCCT GACCCCCAGG GCAGCATCTA CCAAGACACA GCTCCCCTTT AGGGGAGGCA 60
CCCTGTCGCC AGAACCCCCC CGCAGCTACC AAGGCAGGCA CTGTGCCAAG CGCTTTACGG 120
CATTGGCTCA TTGAATCCTC ATGAAAGTCT CTGGAGGGAG GTACTATCAT CTGTATTATT 180
CCCATTTTAC AGATGAGAAA ACTGAGGCAC GGAGAGGCTA AATTCCCTGC CCAGCAATCT 240
GTCTTTAGCA CCCTCTCTGT TGTATCTCAT TGATTTCTGC TGATCCTGGA TCACGGGTTC 300
ATCTGGGGAA GTCATTGCTG GACTTTGGGC AGTAGGTGGG GAGGGCTGAG AGCTCTGGGT 360
GCCAGGCCTT GGCCTTAGCC CAAGGCAGCT GGCTGGACCA GACAGAAAGC AGATGGGAGG 420
GGCCTTGGTA CTCGAAAATG AATCTTCCAC ATCCATGCCT TAAGGGTTTC TCTGGCCTGG 480
CCTAACAGTG AGCTGGGAAA AGACCTCACC ACGTGACTGC AGTTGGGTGC TTGTGCTGCA 540
GAGGCCAGAG AGAAGGCACT GGAAGCGCTG GCTTTTGTCT GCAGCCAGGA GTCTGGCATC 600
TTAGGATGTT GGGCTCTTGG ACAGGGAAAT GAAGACAAGA GCATGGGCAT TTAGAATTCC 660
AACTCATTCC CATTTCACCT AAAGGTTCTG TGACTTTGGG TCAGGTATTT AGCCTCTCTG 720
TGCCTCGGTT TCCTCACCCG AAGAAGCAGT GATAAAAATA TCACCTTCCT CGTAGAGTGT 780
TGACCGTGAA ATAAGATAAT GAATGTAACA TGCCTCATAC AGCACACGGT ATCTCACCGG 840
GTTCAGTGGT GGTAGCTGTT CCTAAAAGTA CTTTGTTTGT TTGTTTTGTT TTTTGTTTTT 900
TGTTTTTGAG AGGGAGACTT GCTCTGTCAC CCAGGCTAGA GTGCAGTGGC ACCACAAAAG 960
TACAAAAGTA CCTTCCATGT TGCTGCTTTT TTTTTTGAGA CAGAGTTTCA CTCTGTCACC 1020
CGGGCTGGGG TGCAGTGGCA CAATCTTGGC TCACTGCAAC CTCTGCCTCC TGGTTTCAAG 1080
TGATTCTCCT GCCTTAGTCT CCTAAGTAGC TGGGATTATT ATTATTATTA TTATTATTAT 1140
TTTTGAGATG GAGTTTCACT TTTGTTGCCC AGGCTAGAGT GCAATGGCAC AATCTGGGCT 1200
CATTGCAACC TCTGCCTCCT GGGTCAAGCA ATTCTCCTAT CTCAGCCTCC TGAATAGCAG 1260
GGATTATAGG CGCCTGCCAC CATGCCCAGC TAAATTTTTT TTGTATTTTT AGTAGAGACG 1320
GGGTTTCATC ACATTGGTTA GGCTGGTCTC AAACTCCTGA CCTCAGGTGA TCCGCCCGCC 1380
TAGGCCTCTC AAAGTGCTAG GATAACAGGC GTGAGCCACC GCGCCCGGAC TAGTAGCTGG 1440
GATTACATGC ACCACCGTAT AACTTGCAGT ATGTAATATG CACCACTGCC TGGCTAATTT 1500
TTGTATTTTT AGTAGAGACG GGGTTTTGCC ATGTTGGCCA GGTGGGACTT GAATTCCTGA 1560
CCTCAGGTGA TCTGTCCACC TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGGT GTGTGAGCCA 1620
CTGTGCCCGG CCTTTTTTTT TTTTTTTGAG ACAGAGTTTC ACCCTGTTGC CCAGGCTGGA 1680
GTACAGTGGC ACAACCCTGG CTCACTGCAA CCTCTGCCTC CTGGGTTCAA GCAATTCTCG 1740
TGCCTCAGCC TTCTGAGTAG CTGGGACTAC AGGCTCTTGC CACCACGTCT AGCTAATTTT 1800
TGTATTTTTA GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GCTGGTCTCA AATTTCTGAT 1860
CTCAACTGAT CTGCCTGCCT CAGCTTCCCC TCACTTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGTG 1920
TGAGCCACTG TGTCAGGCCT CACGTAGCTG CTTAAGGCCA GAATGTACAG TGTGTCTTGG 1980
TCATGCCCAG TCCCAGCCAT GGTGAGGGAG AGGGAGACCA AGGAAATAAA GATGTGGCCC 2040
TGGCCTGGCA GAGGGAGAAG GAGCAGGTTT GTACCAATAC GTCAACTACT GGGCAAACCA 2100
AGACTGCACG TGCAAAGGAG TGACCACATG GGATGAGATT AAGGAGGGCT TCCTGGAGGA 2160
GGTAGACTGG AGGCCTCTTT AGGGGAAGGA ATGTGTGTTG CAGACAGGTC AAGGGAATGG 2220
GGTGCAGGCT GGGTTTACTG AGGCTGTTTC CTTGGGGATG TTAGGAGGTC ATGCCAGGGT 2280
CTCTTGTTGG AGGGCTTGCC TTCAGTTCTC TTGTTGTGAA CCGCCTCCCA GACCCCTGCA 2340
TTGCAGCCCA GTGTCAGCGG ACCAAGGGGA TGGATTGGAC CAGTGATTCC CAAATGTGGC 2400
TGACATCAGA AATCACCTGG GAAAGGTAGG AAAAATCCAG ACTCCTGGGC CCACCTCAGA 2460
CCCCTAGCCC TGGGGCCTAG GAGCCTGGAT TCCACAACCT CTCTTGTGAT GCTGATGTGT 2520
GGGCAGGTTT GGGACCCTCT GAACTGGACA ATCACGTGGG ATCCTCAACC AGAGAGGCAG 2580
GCTCTGCGTG GCCCAAGGAA CCCGGGAGTT TTTTTTGTTT GTTTGGTTTT TTGTTTTTTG 2640
TTTTTGTTTT TGAGATGGAG ACTTGCTCTG TCACCCAGGC TAGAGTGCAG TGGCATTATC 2700
TCGGCTCACT GCAATCTCTG CCCCCTGGGT TCAAGCAGTT CTCTGCCTCC ACCTCCCGAG 2760
TAGCTGGGAT TACAGGCTCC CGCCCACCAC CATGCCTAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 2820
AAGATGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGCT GGTCTTGAAC TCCTGATCTC ATGATCCACC 2880
TGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTAGGATTAT AGGCATGAGC CACCGTGCCC GGCTTTTTTT 2940
TTCTTTCTTT TTTTTTTTTT GAGACAGAGT TTTGTTCTTG TCGCCCAGGC CGGACTGCAA 3000
TGGCACAGTC TCTGCTCACT GCAGCCGCCA CCTCCCGGGT TCAAGCGATT CTCTTGCCTG 3060
AGCCTCACGA GTAGTTGGGA TTACAGGCAT GTGCCACCAC GCCCGGCTAA TTTTTGTATT 3120
CTTAGTAGAG ACAGGGTTTC ACCATGTTGA CCAGGCTGCT CTCAAACTCC TGACCTCAGG 3180
TGATCCACCT GCCTCAGCCT CTCAAAGTGC TGCGATTACA GGCGTGAGTC ACCACGCCTG 3240
GCCACGGAAC CTGGGGGTTA AGGTCCCAGT GTGGGCTCTC AGCAGCACTG TTTCCCTGGA 3300
AAACAGGGAA TAGACAGGTT ATAGGGAGGA AAGTGGGCAT GTGGGGAGGG CACAGCTAGA 3360
CAGCTCCCTT ACATAGATAG AGAGACAGGG CCCTCTCAAC AGATGGCCTG GCCACCGTCC 3420
CTGGCTGGGC AGTGCATGCA TTTAGGTTAA GAGAGGAGAC TCTGGGTTCA GGCTTGTGTC 3480
CAAGTCCTGG TGCTGCTGCT TCCTAGCTCC CTTGGGCACA TTACTCGCCA GCTGTACCCT 3540
TGGTTTCCTA ACTGGAAAGT CGGGGGTTAG TATGTGTGAA GTGCTTGGAA CAGCATTGGC 3600
TGGGCACGGT GGCTCATGCC TGTAATCCAG CACTTTGGGA AGCTGAGGCA GGCAGATCAC 3660
CTGAGGTCAT GAGTTTGCGA CCAGCCTGGC CAACATGGTG AAACCCCATC TCTACTAAAA 3720
ATACAAAAAA TTAGCTGGGC GTGGTGGCCG GCACCTGTAA TCCCAACTAT TTAGGAGGCT 3780
GAGGCATGAG AATCGCTTGA ACCCAGGAGA TAGAGGTTGT AGTGAGACAA GATCTAGCCA 3840
CTGCACTCCA GCCTGGGTGA CAGAGCGAGA CTCTGTCTCA AAAAAAAAAA ATTGTGTCTG 3900
GCACACAGAA AATGCTCGAT GAAGGTAAGC CATTATTGTT GCTGTTATTG AGAAGCAGGA 3960
ACCTGAGAAA GGGGCTTTGA GCCACGCCAC CCCATCCCCT TCCCCCACCC CTGCTGCTGG 4020
AGTTCAAGAG CCTGTTCCAT CAAGAATCCT GAATTGCGCA TGCACGCGTA CACACACACA 4080
CACACACACA CACACACACA CTCACTCACA TGCTCTCACG CTGGCTTTTT CCATCCATGA 4140
AATGTGACAC TCTTCCTGTC CCCAGCAGCC CCCTGTTGCC AAGAGGGCCT CAGAGCTGGT 4200
GGCTCTGGTT CTCTTCACCT GGGGAGAGAC TTCACCGTCC TGGCAGGAGC TCGGGGGAGC 4260
CCTTCCCCAA GTGTGAGCAG CATCCCTCGT TTCTGGATCC CAGGTTCAGG TAGTGAGGCC 4320
TCTCCTTCCC ACACCTGCCT GGTGTATCCA CCCCCTCCTC CCCCAGCACC GCAGCTAATC 4380
CCTGCCAATC CCTGCTGGGC CGCCTGGCGC CAGCCCTCTG CCCTGGGGCC AGCTCCCTGC 4440
CCCGGCTACC CCTGCCCCAG CTACCCCTGC CCCGCCAGCT CTGGCAAGCC AGGCCCCTTT 4500
GTTCCTACAG TCTAGGTTCC TCCTGACTTC CTGAGGTGGT GGGAGGGGAG GGCCTTACCT 4560
GCCTGCTGTC AATCTGGCCA CCAGGTGAGA AGTGTAAGCT GCAGACCCTC AGGGAGCTAA 4620
GACTCACCCA GGGAAACAAT GATGAGCACT GCAGTGTGGG TCTTGCCTCT GTGGCTTGGA 4680
GGCCAGAGAG GGCAGGAGAA ATCCGAGAAG GCTTCATAGA GGTGGAAGGG ACGTCATTGT 4740
CACTGGCCCT GGGACCTGGA GGAAGGTTAG AGAAAGGAGA CACAGGCCGG GTGTGGTGGC 4800
TCACGCCTGT AATCCCAGCA CTTTGGGAGG CCAAGGTGCG CAGATTGGTT GAGGCTGGGA 4860
GTTCCAGACC AGCCTGAGTA ACATGGTGAA ACCTCATCTC CACTAAAAAA TTTAGCTGGG 4920
CTTGGTGGGG TGCACCTGCA GTCCCTCCCA GCTACCTGGG AGGCTAAGGT GGGAGGATCA 4980
CCTGAGTGCA GGAAGTCAAG GTTGCAGTGA GCCATGAGCC ATGATTGTGC CTCTGCACTC 5040
CAGCCTGGGC AACGGGAGTG AGATTGGGTC TCAAAAAAAA AAACCCAAAA AACAAAAACA 5100
AGAAAGGGGA CACAGAGGGA GCCATGGTCC CTTGCATGGG AGGTCCCTTG CATGGGAGGT 5160
CCCTTGCATG GTCCCTTGCA TGATCCCTTG CATGGGAGGA ACCCAGCAAG GAGAGACCCC 5220
CTCCAGTTGG AGGAGGGCCT GCATGATGGA GAGGGATGAG TATATCACCC GCCAGATCAG 5280
AGAGGGCCTT GAATGCCAGG CCAAGGCATT TGCTTCTCAT TAATCAGCAC CAGTAATACC 5340
TCTTTATTTT TATTTATTTT TATTTTTATT TTTGAGGTGG AGTCTTGCTC TGTCACCCAG 5400
GCTGGAGTGC AGTGGTGCGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC TACCTTCTGG GTTCAAGCAA 5460
TTCTCCTGTC TCAGCCTCCC AAGTAGCTAG GACTACAGGC ACATGCCACC ACGCCCAGCT 5520
AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACGGGGTT TCACCATGTT GGCCAGGCTG TTCTCGAACT 5580
CCTGATCTCA AGTGATCTGC CTGCCTCAGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CCGGTGTGAG 5640
CCACTGTGAC CAGCCTTCAG TAATACCTCT TCATGTGTGC CGAGCATCCC AATAAAGATT 5700
TTACATGCCT GATCTCATTT AATTACTCCA GCAGCCCTGA GAAGTAGGTA CTATTATTAT 5760
CCCTGCTTTC CAAGGGGGAA ACTGAGTCTC AGAAGGGCTA GGGACTTGCC CCAGGTCACA 5820
TGGCTATTAA GGAGCAGAGC TAGGATTCTA ACCAGGCAGG CTAGCTCCAG ACTCCTCGCT 5880
TCTCAGAGAA CACAGCTTCA AAGTGTGCTC TGAGAGGGGC TTCCCCAGGG CTCCCTGAGA 5940
TGCTCTCTGG GGAGTTATTT CCAGAAGATT CTGTTGCAGA GGCAGGCCAC ACTACAGAGC 6000
CTGGGAGAGG TTCCTTGTTA AAATTGTAGG AATGGCTGCC CTGGCCAAAG GTCAGCAGTG 6060
GACCAGTAGA TTTCAAGTCA GTTTCCACTC TGGGCCGACT CATTGGTTCT AAGAGCCTCA 6120
AGCATGGTGT TGGGAGAATC TAGAGCCATG TGATACTCAG CAAGAAAGAC TGTGAGATAG 6180
ATTAGCAATG TCTGTCCTGG GTTAGGTATG GAGAGCAGGG ACCTGTGAGC CATGTATTTG 6240
CTGTCCCTGG GCTAATTGTC TATCATTGGC CAGAGAGATC TTCCTGGTGG TCAGCATTCA 6300
GAGTAATCTT CCTTCCACAC CCTCTAAAGC CAGAAACTCA GTCCTATAAT GTAGGGTGTA 6360
GACACCTCTC CTGTCTACAG CACATGCTTC ATGACATGTT GGTCAGTGTA TTTGTCTGTT 6420
TTATGTTGCT GTAAAGAAGT ACCCGTGGCT GGGTGATTTC TCAAGAGGTT TATTTGGCTC 6480
ACAGTTCTGC AGGCTGTACA AGCATACCAC CAGCATCTGT TCTGCTTCCA GTGAGGCCTC 6540
AGGAAGCTTT GACTCATGGC AGGCATGTCA CATGGTGAGA GCTGGAGCAA GAGAGAGGAG 6600
GAAGTGCAAG GCTCTTTTAA ACAACCAGCT CTCTGCTGGG CACGGTGGCT CATGCCTGTA 6660
ATCCTGGCAC TTTGGGAGGC CAAGGCGTGT GGATCATTTG CGGTCAGGAG TTTGAGACCA 6720
GCCTGGCCAA CATGATGAAA CCCCGCCTCT ATTAAAAATA CAAAAATTAG CTGGGCATGG 6780
TGGCGAGTGC CTGTAGTCCC AGCTACTCAG GAGGCGGAGG TTGCAGTGAG TTGAGATTGT 6840
GCCACTGCAC TCCAGCTTCG GTGACAGAGT GAGATGCTGT CTCAAAAAAA AAAAAACAAA 6900
AACAAACAAA CAAACAAAAA AAACAACCCA GCTCTCTTGG TCGGGCATGA TGACTCATGC 6960
TTGTAATCCC AGCACTTTCG GAGGCTGAAG CAGATCACCA GAGGTCAGCT GTTCAAGACC 7020
AGCCTGGCCA ACGTGGCAAA GCCCCGTGTC TACTAAAAAC ATAAAAATTA GCCAGGTGTG 7080
GTGGCACCCG CCTGTAGTCC CAGCTACTTG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT AGCTTGAACC 7140
CAGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGCTGAGAT CATGCCACTG CACTCCAGCC TGGGTGACAG 7200
AGTGAGACTC TGTCTCAAAA AAATAAAAAC CAACCAGCTC TCACATGAAC TCAGAGCAAG 7260
AACTCACTCA TTACCAAGGA GATGGCACCA AGCCATTCAT GAGGGATCTA CCTCTGTGAC 7320
CCAAACACCT CCCACTGGGC CCCACCTCCA ACAGTGGGGA TCACATTTCA ATGTGCAATT 7380
TGGAGGGGAC AAATATCCAA CTATATCGGT CAGTTACTGG GTGGAGGGAG CCCTGGAGGA 7440
GACTCAGGAG ACCTGGGTTA TTTCCTGCTC TATCATCCTT TCTTCCCTGG GCCCTGTTCT 7500
GTAATGGGTT GACATGAAGA CACTTCCTGC CAGAATTTGA CAGGTCACTG GGAACAAAGA 7560
CCTCCTCCCT GTCACCTCCC TCATCCTCCA TTCCCATTCA CCATACCCTC CTCTGTCTGC 7620