EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS165-09929 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Ramos 
Coordinate
chr3:42065930-42068010 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:42067595-42067613CCCTCCATCCCTCCTTTC-6.17
MyogMA0500.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.02
Tcf12MA0521.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr3:42067591-42067612CTCTCCCTCCATCCCTCCTTT-6.38
Number of super-enhancer constituents: 37             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42060660-42068971Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42066131-42066552Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42066556-42067516Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42067617-42068091Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42066168-42066949Aorta
SE_02512chr3:42065459-42068129Astrocytes
SE_10226chr3:42065877-42068137CD19_Primary
SE_10922chr3:42060609-42068638CD20
SE_23272chr3:42066116-42066919Colon_Crypt_1
SE_23272chr3:42066976-42067316Colon_Crypt_1
SE_24262chr3:42066235-42066832Colon_Crypt_2
SE_24991chr3:42066143-42066941Colon_Crypt_3
SE_24991chr3:42067525-42067991Colon_Crypt_3
SE_25861chr3:42065366-42068715Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42066043-42067298Esophagus
SE_29565chr3:42065389-42069132Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42065344-42069055HSMMtube
SE_38230chr3:42065373-42068528HUVEC
SE_40683chr3:42066021-42068361Left_Ventricle
SE_42248chr3:42066070-42068146Lung
SE_44658chr3:42065460-42068844NHDF-Ad
SE_44918chr3:42065870-42068385NHLF
SE_45733chr3:42065416-42068758Osteoblasts
SE_48185chr3:42066028-42068146Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42066166-42067443Right_Atrium
SE_48670chr3:42067563-42068128Right_Atrium
SE_49555chr3:42066577-42066889Right_Ventricle
SE_50309chr3:42066089-42067441Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42060817-42068845Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42065989-42068136Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42066102-42067523Small_Intestine
SE_52625chr3:42067553-42068124Small_Intestine
SE_53513chr3:42066102-42068146Spleen
SE_54717chr3:42065389-42068637Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42065927-42068150HSMM
SE_65769chr3:42066166-42068375Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr34206596042068007
chr34206711042067525
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042019chr34206049442069114
Enhancer Sequence
TTATGATAGT CCTTAAAATG CTGTAATTAT CTTTGAAGTT TTATAATTTT GCAGTGTTTA 60
ACTTATGGCA GCAATAGCAT TGGTATTTTA AATCAAAACA GAACACTGTC AAGGGTTACA 120
TAACTTATTC ATGATATTAA CAAGATATAA AGCACCATGT TTTTGTGTGT AACTGTTTAA 180
CAGTAGATGA AGTTAATGAT TGCCCACTTT CAGCTAATCA TATGATTGCT ATTGAAATAA 240
GTACTTGCTA GACAGGGATA GAATCTAGTA ATTTGTTAGC TTCAGTACTT CATGCTTGCA 300
TACACACCCA TGCTATTGTG TTACCAAGCC TGAGTTTTGA AATGTGGCGT TCTTTGTCTT 360
TTTCTGGTGA ATAAACCCCA TACGTCTTAC CATAGCCATT TGACTCTTCC TGGCTGTCAG 420
GATGTGTTGC CCTGGACTGA GAGTGAGAGA TCCCAGATTT TTCAGCTTCT CTTCCAATTG 480
CTAGGGATAC CACATCAGTG CCAACGTGAG TCTCCTCTTG TCACTTTCTG CTAGGCTTCC 540
CCTTAGAAGC TGAAATTCTT TCCCTTCCTG ATGCTAAGTT GCAGTTTCTT AAAATGCTAG 600
AGAGCTTTTA AAAGCATACC GTGATGGGAA TTAGTTTCAA AAGATTATAC CAGAGGGGGT 660
TAAAACTTGC CAACCTTGTA AAAACCTAAC TTCTTTGTTT ACGTCCTCCC TGCCCCGCTT 720
TCTGCTGTGC TTGGTTTCCT CCTAGCAATA TGCCTTGGTC AGGGGGAGAG TCTTCCTGTC 780
AGACATAACT TCCCAGACCA GCACTCCTGG AGGGGCCTGT ACCTCAGACC CTGGCAACGA 840
GGCACGCTGG GGCACGCTGG CCTTTCGTTG TGGTGTAGAA AATTTTTCAT TTGGAATTCC 900
ATTTTAAAAA TAAGTATAGG GTTATTTATA TCTTCTTACA TTAATTTTGA TAAGTTGTGT 960
ATTTTAAGGG CTTTATCCAC TTTATCTAAG CTACTGAATT AATTGGCACA ATTATTACTC 1020
TTTCAATGTC CATAAGACCT GTAGTGATGT CCCCATATTT TATTTCTGGT ATTTGCCTTT 1080
CATGTTAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGGAG AGGGGAAGGA GAAAAGAAGA ATGTGTCTGT 1140
TCAAAGGACT GCTGGATCAG GGTAACTTAG CTCAAGAAAA TGAGAAGGGG TGGTTTCTGG 1200
AAGGGGAGAA TGAAAGCCGT GGAGGAAATA AAGCATGAAT GTGGGGGAGG GCGGGGGCGG 1260
GGACTGCTTC TCTTGCTGGC TGCCTTCTCT CTCTGGAGAA TCTGCTGGAG AAGGAGCAGT 1320
CACGTGGGTG GTGAGCTCAT TAGGCTGGGG ACACCAGCTG TGCTATTATT AGGGCTTTTA 1380
AAGTCCGTGG CAGATGTTCT TAGGCGGTGT TCCAGCCTTG TTCACTTCCC ACATATGGCA 1440
TGATACTGTA CACAGAAAAA AGAGGGACTC TTTAACAAAT AGCTTTTCCA TGAAATGCAT 1500
CACTATTTTT TTCCCATGAA CTTTTTTCTT TTCTTTCTTC CTCTGTCTCT GTTTCTTTGT 1560
TTCTCTCTCT GCTGTTTGTT CTTTCTTCTT TCTCCGTTTA TCTTTCTCCC TCTGTCTCTT 1620
TCTTGCTTTC CTCTATTTTT CTGTATTCTC ATTCTCCCTG TCTCTCCCTC CATCCCTCCT 1680
TTCTATACTT CCTTCTTTTG TCCTTTGAGG CCCTTTTTAT TTAATCCTTT GTGAAACTAG 1740
AAGAGGACTC AGAGGCACAT GAAGAAAGTT TGTCTATTTT AGATTAAAAG TGAGCCTTAG 1800
CATTTCATAG AAAGTATAAG AAATGTGGGT AAGTCTCAGG GTGATCATAT ACTAGAGAAT 1860
TTTTTTGACA AGAGCCTGTT TTGAATTGCG TGGTTAGCTT GCTGCCTCTT CACTCCTCTG 1920
GCACAGTGGT AGTTTTTGTA CAGGATCGCT TTTACCTCAA TGGACTGATA AGCTAGCCAG 1980
GGCACCGATT ATTTTTACAT ACCAATTTGT GTGTTGTTTG TTTGGCTAAT CACCTCTTCT 2040
GCAGCTGTTA TCCTGGATCT CAGTGATCAA AGAGATCAGT 2080