EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS165-00261 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Ramos 
Coordinate
chr1:28200980-28203090 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr1:28201011-28201022GCAGGGTGTGG-6.62
Lhx3MA0135.1chr1:28202191-28202204TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:28202192-28202205AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr1:28202193-28202203ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:28202193-28202203ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09233chr1:28198278-28207102CD14
SE_20343chr1:28199013-28203940CD56
SE_50884chr1:28199013-28201650Sigmoid_Colon
SE_50884chr1:28201667-28202339Sigmoid_Colon
SE_50884chr1:28202398-28203826Sigmoid_Colon
SE_53500chr1:28198475-28202256Spleen
SE_53500chr1:28202379-28203898Spleen
SE_62491chr1:28184415-28220281Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr12820180028202156
chr12820137828202229
chr12820127228202191
Enhancer Sequence
ATGTCTACAA AAAATTTTAA AATAAAAAAT TGCAGGGTGT GGTGGCTCAT GCTTGTAATC 60
CCAGCACTTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGGA TCACTTGAAC TCAGGGGTTC AAGACCAACC 120
TGGGTAACAT ACTGAGACCG TGTCTCTACA CAAAATAAAA AAATTAGTCA GGTGTGATGG 180
TGCATGCCTG TAGTCTCAGC AACTCAGGAG GCTGAGGTGG GAGGATTGCT TGAGCCTGGG 240
AGGTTGAGGT TGCAGTGAGC TATGATTGCA CCACTGCACT CCAGTCTGGG CGACAGTGAG 300
ACTCTGTCTC GAAAAAAAGG ACGAGGTCTG TGTTGCCCAG GCTGGTCTTG AATTCCTGTC 360
CTCAAGCAGT CCTCCCACTT TAGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTACAAGCG TGAGCCACCG 420
CACCCAGCCA TAACTTCCAG TTCTGCCTCC TATTACCTGA TCATCATGTA CAACCTACTC 480
AGCCCCTGAG AGGCTGTTTC TTTTTCTTCT TCTTCTTTTT TTTTTTTGAG ATGGAGTCTC 540
CCTCTGTCAC CCAGGCTGGA GTGCAGTAGC CTGATTTCAG CTCACTGCAA CCTCCACCTC 600
CTGGGTTCAA GCAATTCTCC TGCCTCAGCC TCCTGAGTAG CTGGGATTAC AGGTGCCAAC 660
CTCCACACTG GGCTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTTGGCCAG 720
GCTGATCTCG AACTCCTGAT CTCAGGTGAT CCCCCTGTCT TGGCCTCCCA AAGTGCTGGG 780
ATTACAGGCA TGAGCCACCA TTCCTGGCCA GCTGTTTCAT TATTTAGGAA ATTGAAACTG 840
CCTGTCTCCG CAAGAGCAGT CATGGGTCTT AAACACAATG ACGCATCAGT AGCCCTTGGC 900
ACAGTGCCGG GTATCTGTAG TACCACAGCT GCTGTTCTCA CCAGTCTGGA AGGCCCATGC 960
TCTGACATTG TAAACAGACT GTGGTTTATG ACTGGTGGGC ATTTTCCTGG CAGTACGTGG 1020
GGAGGTTTTC ATCAGTTTCT CAGGGCTGAT GTTGGAGCTG CCCTGTGGGT GGGGCTGGGT 1080
TCAGGTGGCC TCAAGGTCCT GCCACGTAGT CTGTTGTCCT CCATTAGCTG GATGGAGAGA 1140
CTGTGCACTC GTGTGTGCGT GAGAGATCTT TATTGAGCAA CTTCTGTGTT CTCGACACCA 1200
CTTACACACT TTAATTAATT AATTTATTTT TATTTATTAT TTTTTTTTTG AGACGGAGTC 1260
TCACTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGAAGTG GCGTGATCTC GGCTCACTGC AAGCTCCGCC 1320
TCCCGGGTTC ACGCCATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGAACT ACAGGTGCCC 1380
GCCACCATGC CTGGCTAATT TTTTTTGTAT TTTTAGTAGA GTCGGGGTTT CCCTGTGTTA 1440
GCCAGGATGG TCTCGATCTC CTGATCTCGT GATCCACCCA CCTTGGCCCC CCAAAGTGCT 1500
GGGATTACAG GCGTGAGCCA CCGCGCCCAA CCCTCACTTA CACACTTTAA ACCAGGAAAG 1560
CAGAACTTTG CCCATTGGGC CTCACTCTGT CAGTGCCCCT CTATTTTCCA GGGTGCTAGG 1620
AGGGCTGGGT ACCGGCCCTG GCTCCGGGTG ATCTCCAGGG AGCCACTGAC CCCTCTCTGA 1680
GCCTGATTTT GTAGCTGTAC ACTAAGGGAA TCCCAACTCC CTTAGTGTAC AGCTACAAAA 1740
TCAGGCTCAG AGAGGGGGAT TCACTGGGTT ATTTACTGAT TTGTGGACTT ACCACATACT 1800
CAGAGGCCAA GCCCTGTGCT GGCTGCAGTG ATGTTGAGAT GGATCAGCCC TGCCTGTGAA 1860
CTCAGTGGAG GAGGCACGGG GATGTGAAAA AGGCCAGAGA AGTGTGCCAC AGCGGGGTGC 1920
ACCGATGCCA GGAGGGGCAA GGACAGCTGA GGACGACTGA ACCTGTGGGC ATGAGGCAGG 1980
AACGACAGAG CAGGGCATGC CAGGCAGCAG GCACCATGTG CAAAGGCATG GCAGAGCAGA 2040
GCTTGTTGGG CACCAGGGCA CAGGCTGCCC AGCACTTGGC CCTTGTCCAA TGGGGAAATG 2100
GAGTCCTTGT 2110