EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS164-00409 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Raji 
Coordinate
chr1:40521350-40525000 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:40521399-40521414TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:40524181-40524196GAGGTCAAGAGTTCA+7.64
RARAMA0729.1chr1:40524181-40524199GAGGTCAAGAGTTCAAGA+6.45
Stat6MA0520.1chr1:40524887-40524902CTGTTCCTGAGAATT+6.35
TBXTMA0009.2chr1:40523594-40523610TTACACTTATGTGTGA-6.46
TBXTMA0009.2chr1:40523594-40523610TTACACTTATGTGTGA+6.47
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04621chr1:40522034-40524441Brain_Anterior_Caudate
SE_09462chr1:40520026-40528261CD14
SE_11290chr1:40512290-40537565CD20
SE_13580chr1:40520109-40526931CD34_Primary_RO01536
SE_14500chr1:40519247-40528352CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17728chr1:40519508-40528705CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18663chr1:40520031-40528361CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20876chr1:40520328-40528166CD8_Memory_7pool
SE_22570chr1:40519992-40531995CD8_primiary
SE_26225chr1:40524410-40526945Duodenum_Smooth_Muscle
SE_39994chr1:40521759-40526762K562
SE_52954chr1:40522823-40523734Small_Intestine
SE_52954chr1:40523852-40526719Small_Intestine
SE_53653chr1:40522699-40523525Spleen
SE_53653chr1:40523748-40526668Spleen
SE_60101chr1:40499989-40553062Ly4
SE_62827chr1:40499695-40532104Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr14052284740523094
chr14052318040523428
chr14052430040524769
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I040055chr14052136240527365
Enhancer Sequence
AAATTATTTT TGTAGAGACA AGGTCTCCCT ATGTTGCCCC GGCTAGTCTT GAACTCCTGA 60
CCTCAAGCAA CCCTCCTGTC TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTAGAGGA GTGAGCCACT 120
GTGCCCAGCC AGTATCCTAA CTCTTATCAG TCAGGATGGA GGCAAGAGGC ATCTATTCAT 180
GAGATACACT AAATAGAGCC TATGGATTTT GATGACTGAT AAGATGTTGT GGGGGAGTTT 240
ATGGAATCCT TACTATTTTC CAGGACTGTG CCAAGCACTT CTACATGGAT TCCTTCATTT 300
ATTCTCACTG AAGCCCTTTG GATTTTTGTG CTATTATTGT CTTCATTATA AAGATAAGGA 360
AATTGAGTCT CAGAAAGTTT GATAACTGCT TATAGTCACA AAGCCACTGC ATATTGTTAT 420
TCAAACCTCC AATCTCTCTG ATTTCTCTAA AGAACACTCT TATCCACTAT ATAATACTGC 480
CCAACAGTTT CCAGTTACTG ACTTGATCAA TCAGGTGATT GATAGCAGTG CTGGAGCAAT 540
GTTAGGGAAT ATGATTTCTG CTTTTGGACA TTTCAGGTTG CCTTTGGGAC ATCCAGGTAG 600
CGATGTCTAG GTGAAAGCTG GATTTTTTTT TTTTTGGAGA CAGGGTCTCA CTCTGTCACC 660
CAGGCTGGAG TGCATGGTAC AATCACTACT CATTGCATCC TCGACCTCCT GGGCTCAGGT 720
AATCCTCACA CCTCAGCCTC CTGGGTAGCT GGGACTACAG GTGTGTACCA TCATGCCCGG 780
CTAATTTTTT TATTTTCTGT AGAGATGGAA TTTTGCCATG TTGTCCAGGC TGGTCGTGGA 840
CTCCTGAGCT CAAACACTTC CTCCCATCTT GGCATTCCAG AGTGCTGGGA TTGTAGTTGT 900
GAGCCACAGT ACTTGGCCTG AATCTAAAAT TTAATCCCAG ATGAATGGCC TGAGCTAGAT 960
GGATATGCTG CTCTGGTAGT CTTTAGTCTA TAGGTGGTTA TGGTGGTACC ACCTCGCAAA 1020
TAGGCTGGGT GTTACTACAA CAAGGGTAGT CAGAGGCTTT AGGAGTGTAC ATGACCACCG 1080
GAAGAATGTA CGTGTGTATA GAGAATAAGA AAAGGTGTGT CTTTCACACA ACTGAATCTC 1140
ATTCTCTACA CACACATACA ATGTCATACT TAAATTCTGG ACATTATTTT CCATAACATC 1200
TCAAATCTCA TCTTACTCCC ACCAAGAGCA AAAAAAACAG TTTCTGTTCT TTTGTATTTG 1260
GTTAATGGTA GAATGAGATT AGCTATAAAT GGTAGCTGTA TTGTCCTTTT TCATTCTGCT 1320
TAAGTCAGAC AGCGGAACTT TAGCTTGTTT AGCAGTGAAA GCCTATAAAT ACAAATGAAA 1380
TATGGAAAAA GGGAGCCAAA GTCCCATGAA GCTCTATTAT TAAGCATTTA AGATTGGTAA 1440
ATGTTCACAA ACTCTGGCAG CCTCTAGCAA TACATGTACT GTGTCTCCAT GTTAACAGTG 1500
GTCTCAACCT GAAACATCCA TGTATGAAGG AACATGTTTT AATAACAGAA CTGAGTGGTA 1560
TCTGTTCATG GAAGGTAGCT TAGGAGTTTA TTGCGTTCCT TGCCTTTTCC CCTGGACTTA 1620
CAGTGTGGTG GATTGTATAT ATATGTGAGT CTGTCTCTTG ATCAGTATGC ATAATGGAAC 1680
AGGGCAGGAA TTCAGATATC AGTTGATAGT GTCATAACAT TAGGGAAAGT ATGTTGACTG 1740
CTTATGGTCT GCTCTATTTG AGAGTAGGAC ATAGACCTGG AGGCTTCTGC TGCTGCTGCA 1800
GGCCAAGGAA TGGAAAGGTT TGTTTGGTTC TCATTCTCAT TTTTTTTCTT TGCTTCTCTT 1860
TTAAACAACA CTCTCTGACA AGTGATTGGG CCCACAGAGA CCAGAGCCTG TACACAGAGA 1920
ATGGACAGAG ACTATATTGT CTTCCTTACT TTATCTTGTG AGCTGCTTAT CTCTTCCACA 1980
GGGAGGACAA TGTGTTAAAT TGAGATAATT CTGGCATGCT GTCATCTTTG GGGGAATCAT 2040
AATTGCTGTT GTCATTTTAG GCAGCTTCAA GGGAGTTGAG TTCATTCAGC TTCAGTTACC 2100
TGAACTGAAT TCAGTTGCCT GAATTGACGC TTTTGTGAAA TGGAATCTTT CCAAGTCAAA 2160
GCTTGGATTG AAATTTCACT GACTGGTTTT TATGAGATCA CTTAGGGTCT CAAATACTTT 2220
ATGTAGAGGT GCATTGATCA TATTTTACAC TTATGTGTGA CTTATGGGCA ACTTTTAGCA 2280
CCCTTATCCC TCTGGAGTTT TGGAATGCTA TTTGTGAGGT TTATAACTTC ATAAATATTT 2340
ATTGAACATC TACTACCTGC CAGGTAGTAG TCTAGATGGT AGAGTATACA GTAAGGAACA 2400
AGCTATATAA GGTCCTTTCT CTGTTGGAGC TTACTTTCTT TGGGATATTA GACATTGAAT 2460
TAGGCTATTT CAGATAAGAT AGTACTTGTG AAAGATCTAT AACAAATTCT TTTGGATGTG 2520
TCTAGTGTCC TTCCCTACTG CATGTCCAGA TCTTTCTCAT CTTCATTTGA AGGCTGGCTC 2580
AAATGGCAGC TTCTCCATCA TATCCTTATC TGATCCTTCC AGCTGATATA TTACTCCCCT 2640
CTTTGAAATC TCATGCCTCT CTATCAGCAA CTTTCTTATG TCACCTTAAC ATTTTTTTCT 2700
ATTTGTTTCA TAGTTGTTAG TGCATATGTT AAGTCTCCCC ATTAGACTAT AAATTACTGA 2760
GGGCAGGCCG GGCACAGTGG CTCACGCCTG TAATCCTAGC ACTTTGGGAG GCCAAGGCGG 2820
GTGGATTACT TGAGGTCAAG AGTTCAAGAC CATCCTAGCC AACACAGTGA AACCCTGTCG 2880
CTACTAAAAC TACAAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGGCGCA CACCTATAAC CCTAGCTACT 2940
TGGGAGGCAG GAGAATCCCT TGAACCCAAC AGGGTGGAGC TTGCAGTGAG CTGAGATCCT 3000
GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GTGACATTGT AAGACTTTGT CTGAAAAAAA AAAAATTATT 3060
GAGGGAAGAG TAAACATCCT ATTCATCTTG GTTTGGGATA TTTCACATGC AGGCAGCAGG 3120
ATGTTGTAGG AAAAAAACAC ACTGAACTTA GAACCAGAAG GATCAGATAA GGATATGATG 3180
GAGTACTGGC TTCTCTATTC ACTGGCCGTG TGACTAGACA AGTCATTTAG CTTCACTGAA 3240
ACTAAGTTTT CTATCTCTAA GCGTGTAGTA ATCATCCTTC TATTCCTGAA TAGTTGTCGG 3300
GAGGCTCAAA CTGAGATAAT GTATGTGACT ATCCTTTGCA AATTCTAACT TTCTACACAC 3360
AGTATCATAG TAAATATTGA GTATTTGAAT GAGTAAGCAT TTACTTTAGT GAACACCTTT 3420
TCCTGAGCAG TTCTCTTGCT TAATGAGGTC TTTTGATTTT GTAAATATGC TACTTTTTTA 3480
TCTGATATTT TTGTATTGTT CCATTTTGCA GATGATATCT AATTTTATTA AATTATTCTG 3540
TTCCTGAGAA TTGGCATCCT CTTCATCCAC CTGGGGATGA CCAGGAATTT TCTGTTTTTT 3600
TCTCTGTAGG TGCTATTTAA TATTTAAATA ACAAATGACA TTTGATCTGT 3650