EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS161-01546 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
PC3 
Coordinate
chr1:223906480-223909720 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs7539624chr1223906827hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr1:223906727-223906738GGGCGGGAAAG+6.32
STAT3MA0144.2chr1:223908784-223908795CTTCCCAGAAG-6.14
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223908439-223909567Aorta
SE_02306chr1:223905802-223906971Astrocytes
SE_02306chr1:223907113-223908060Astrocytes
SE_02306chr1:223908173-223909671Astrocytes
SE_09681chr1:223899395-223907924CD14
SE_09681chr1:223908083-223912580CD14
SE_19702chr1:223899422-223907008CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19702chr1:223908760-223910194CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_23408chr1:223907471-223908158Colon_Crypt_1
SE_23408chr1:223908424-223909691Colon_Crypt_1
SE_24051chr1:223907500-223908004Colon_Crypt_2
SE_24051chr1:223908439-223908768Colon_Crypt_2
SE_24051chr1:223908866-223909579Colon_Crypt_2
SE_25230chr1:223907533-223908158Colon_Crypt_3
SE_25230chr1:223908229-223909855Colon_Crypt_3
SE_26209chr1:223907335-223910192Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223908287-223909800Esophagus
SE_31491chr1:223907108-223909701Gastric
SE_33950chr1:223905607-223907075HCC1954
SE_33950chr1:223907117-223909775HCC1954
SE_34979chr1:223908435-223909798HeLa
SE_36294chr1:223908325-223909765HMEC
SE_37129chr1:223899390-223911201HSMMtube
SE_42269chr1:223902366-223906841Lung
SE_42269chr1:223907334-223909767Lung
SE_44904chr1:223907251-223909858NHLF
SE_45872chr1:223899383-223910101Osteoblasts
SE_49408chr1:223908481-223909631Right_Atrium
SE_50365chr1:223899342-223907084Sigmoid_Colon
SE_50365chr1:223907302-223909908Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223908189-223908855Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51879chr1:223908921-223909593Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223907378-223908036Small_Intestine
SE_53249chr1:223908284-223909766Small_Intestine
SE_55958chr1:223908900-223910047u87
SE_58098chr1:223907523-223907886VACO_9m
SE_63671chr1:223906811-223908078HSMM
SE_63671chr1:223908189-223909737HSMM
SE_64794chr1:223908347-223911615NHEK
SE_65644chr1:223908923-223909708Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223908900-223910047u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1223906560223906975
chr1223907278223907575
chr1223907615223907781
chr1223908646223909233
Enhancer Sequence
CTCCTAATAC CAGCTGATAA CAGCTAATAT GTATCTCTAA GGCACCGTGA TTATTCCCAT 60
TTTATAGATG AGGATGCAGA GGTCTTCCTA CAGCTAAAGT GGTGGCTGGT ACCCCTGACC 120
CCAGGGTATG TTTAATTCCT GAGCTAGACT CCCTAAGACG GGACCTGGAA AATTTTCTAG 180
CCCTGAGGAA TGTCAGAGCA TCATGTGAAT CATTAGGACA GACAGACTGT GAGGAAGAAC 240
ATGAGCTGGG CGGGAAAGTT TGTCTGAGCT CAGGCTCTGC AGATTCCTGA GATGCCAGAG 300
CACATTCTTA CCTGCAGAAA ACACTCCTTT CATTTCTTTT CTTCTCGCCC CACAAAAGAC 360
AGAAGATAGA GGTCCTTGAG CACCCAAGGC GGATCCTCCA GGAAAATCTA TTCATTAGAG 420
AAAATGGAAT TGATGGAAAC TTTGACCAAC CCCGGGGGCT TTAGAGAATC CAGAAACAGC 480
CGGCGCAGTG GCTCACATCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCGAGGCA GGCAGATCAC 540
CTGAGGTCAG GAGTTAGAGA CCAGCCTGGC CAACATGGTC AAACCCTGTC TCTACTAAAA 600
ATACAAAAAA ATTAGCTGGA CGTGGTGGTG GGTGCCTGTA ATCCCAGCTA CTCAGAAGGC 660
TGAGGCAGGA GAATTGCTTG AACCCAGGAG GCAGAGGTTG CAGTGAGTAG AGATGGCACC 720
ACTGCACTTC AGCCGGGGTG ACAGAGAGAG ACCCCATCTC AAAAAAAAAG AGAGAGAATC 780
CAGAAACAAA CACAGCAACT GCCTAACATC TGCTTCAGAG TTTAACAACA CCTTAAGTGC 840
CAAAGTGTAA GCAACAAATA CATGATTTAA GTCCTGTGTA AATACCACTG GGCCAATTGG 900
AGAGGAGATA GCAAAGGTTA ACATTCCTGG GAGAAATTTC CCTCCCAGGG GAATTATAAA 960
CCAGGTGAAA TGTAAACCTT TTAAAAATTT CTTAGTAGCT AGTCTGTAAT TTCTCAGGGG 1020
TGTGTGCGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGCGCGCG CGCGCGTATA ATGCAGTATT 1080
GGTCATTTTG TTCTTTCAGC CTTTTATTTT GGAGGACTCT AGTTAGATCA CAATCTGTGA 1140
AATGTGGTAT ACTGTACTCT CACCCTGATT CTGGCACCTG GCCAGCGGGT GCTGATGGGG 1200
CCTTGACCTT CACCAAATCC CAACAGCCTC ACAAGCACCA GGAACAGAGG CCATGGCAGT 1260
GACACTCTGT GACATGGCCA GAGATATGAG CCTAGACTCA GCTCTGTTGG TAGTCCGAAG 1320
ACTGGGCAAG TAATTACCTG GAACTTCCAT CTGGAACCTC CGTCTCTTCC AAAAACGGAG 1380
AAGGAAGGAG GGTAAATGGA GTGACCTCAG ACACCCCCTA TGAGTTTGTA TTCAGCTATT 1440
CTAAAGCCAT TCCCGGGTTT CTAACCAGCT ACTCCTCATT CCTTGTGCTA GAGGGTTAGA 1500
GCACTACAAG ATCATCCTTA TTTTCTCTCT TTCTCTCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGACA 1560
GGGTCTCACT CTGTTCCCCA GGGCTGGAGT GCACTGGCAG GATCTTGGCT CACTGCAGCC 1620
TTGGCCTCCT GGGCTCGAGT GATCCTCCCA CCTCAGCCTT CTGAGTACCT GGGACTACAG 1680
GCACACGCCA CCACACCTGG CTAATTTTTG TATTTTTTTG TATAGACCGG GTCTTGCCAT 1740
GTTGCGCAGG CTGGTCTTGA ACTTCTGAGC TCAAGTGATC CACCCACCTC GGCCTCCCAA 1800
AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACTGC GCCCAGCCAA GATCATTCTT TTATTACACA 1860
CAGAAGGAGT AATAACAGTA CCCATCACCT GCATAACAGT ATGCAATTCA TAGAGCATTT 1920
TTTCACTACA GTATTTCATG TACTCATCCC AAATCTAAAG TAAATATTCT CACCTCACTG 1980
TACAGATAAA AAAAAACTGA GCCACAGAGA CGGGAGAGTA AGTGTAAAGC CACACAGCTA 2040
GTAATTGCCA AAGGATTGAA CCCTGGTCTG ATTTTGAATC CTACACTCTT CCTAACCCAT 2100
GCTCCCTCCA ATTTGCCATA GTGCTGTGCT GAGGAACCAT TCTCAGCAAA ATTCATCTTC 2160
TCTACCTGCG CTTTCTACCC TGAGCCTTAC TCAGTTCCCC CAGGGAACTT GGGCAGGTGA 2220
CATTCTTAGA CTTGTGCACT TTGCAACGCC CTGCCCTGTT TACTGTGCTG CCCAGCAATG 2280
TTTAATCCAC AAACACCCAC GCTCCTTCCC AGAAGGCTCA GCTTCCAAGC TTCACCAAAG 2340
TCATTTAAAC CATGTTTACA GAGCTGCTCT CACCAAGAGC CATCTCCATT GCAGAATATA 2400
GTTGTGTAAG AATTGATTCA GCAGAGAAAA ATCTGCCCTT CTGGAGGAAG GGCTGGAGAC 2460
CCAGCTGGAG CCTCCACTGG CTGACCCTGC AGCTAAATAT GGCTCTGAAA TCGTGGGGTA 2520
ATAACCACAT TCTTACAGGT GCTTGCCACT TGAAATGGCT CCCAAGGACC CAGGAAACTC 2580
CAAGGCTGAG CTGCTCCTAC CTCTGATGCT TTACTTTGCA CTGGGTCACC ACTGAGCTTT 2640
CCCCACAGCC TCACAGCTCA CGGATGAAGG CAGCTACCCC AGCCAGGAAG GCATAGGTCA 2700
CCTTGCAGGC CTCTGATTTC CTGGGGTAGA GCCCAAGGCT GCCAAGGCTG TTGAAACAGC 2760
ACACCCCCAT TTCATTGTAA CCCAGCAAAT GTTCCCTGGG CCCCTCAGAG GTGGGTCAAC 2820
CTGCCTCCTT CTCAAGATGT CACATGGACC CCCAGAGCAC CCACTGGGAG GTGTTTAGCT 2880
ACAGGGTGCC CCACCCCACA GCCTAGCTCA GCAGAGAGTG GGGAAGGGAC AAGACCAATG 2940
GGAAAGGCAA GCCAGATGGG GAATTTTCCA GTCCTGTTCC TTCTACCACT CATTAGCCAC 3000
TTATTTGGAC CCAACCCCTC TGAGCCTCAG TTTCTTCTTC TGTGAAATGG GAATAATGAT 3060
AAGGATCCCT TCCCAGGGCT GTGGAGAAAA GTGAGATTTA TACAGGCAAA CACACTTGGC 3120
ACACTATAGA ATCCCAGACA AATTCAAGGG ACCAGGATTA TCATTACTGA TTCCAGTTAT 3180
GTGAAAAGTC CTTTTGCCAA ATTGCCGAAG AAAAAGAGGA TGGTGGAGGA AGAGAAAAGG 3240