Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS155-13464 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | Ovary |
Coordinate | chr8:38626240-38629010 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Gfi1b | MA0483.1 | chr8:38628874-38628885 | AGCTGTGATTT | - | 6.14 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626697-38626717 | TGGGAGGGTGTGTGTGGTGT | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627191-38627211 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627408-38627428 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627018-38627038 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626631-38626651 | TGGGTGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626822-38626842 | TGGTGGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626362-38626382 | TGGGGGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.49 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626758-38626778 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627295-38627315 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626943-38626963 | GGTGGGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.86 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626358-38626378 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626880-38626900 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 10 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_00183 | chr8:38622119-38630072 | Adipose_Nuclei | SE_25871 | chr8:38622053-38630309 | Duodenum_Smooth_Muscle | SE_27135 | chr8:38624195-38629708 | Esophagus | SE_29948 | chr8:38625586-38629397 | Fetal_Muscle | SE_32046 | chr8:38627018-38629032 | Gastric | SE_42390 | chr8:38625843-38629159 | Lung | SE_46615 | chr8:38625356-38629751 | Osteoblasts | SE_50980 | chr8:38623958-38629300 | Sigmoid_Colon | SE_53926 | chr8:38626751-38628713 | Spleen | SE_54632 | chr8:38613262-38630260 | Stomach_Smooth_Muscle |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 3 | Chromosome | Start | End |
chr8 | 38627218 | 38627790 | chr8 | 38627692 | 38628125 | chr8 | 38628365 | 38628436 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH08I038764 | chr8 | 38622181 | 38629647 |
|
Enhancer Sequence | GTCACCATAT ATATATGTGA AACTGTGTGT GGGAGGTATG TGTGTGACTG TGGGCTTATG 60 TGAGAGTTGG GGGTAGGTGT GGTGTGTGTG GTTATATGTG TACCAGAGAC TCAATGTGTG 120 GGTGGGGGTG TGTGGTGTGT GTGAGACTGT GTATGTAAGA CTGTCGGGGG AGGTGTGTGT 180 GTGACTGTGT GTGGTGTGTG TGACTATGTG TGTGGGGTGT ATATGTGTAC ATGAGACTGT 240 GGGGATGGGA GTGTGTGATA TGTGTGGTGT GTGTGAGACT GCGTGGTGCG TGGATATGAG 300 GCTGTGGGGG TGGAGGTGTA TGGTGTGTGT GTGAGACTGT TGTGGGGAGG TTTGTGTGAC 360 TGTGTGGTGT GTGTGTGTGT GAGAGACTGT ATGGGTGGGG GTGTGTGTGG TATATGTGTG 420 ACTAGGTGTG TGGTGTGTGT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GAGGGTGTGT GTGGTGTGTG 480 TGATTGTGTG GTGTGTGTAT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GTTGGGGGTG TGGTGTGTGT 540 GACTACATGT GTAGTGTGTA TATGTGTATG TAAGACTGTG TATGGTGGGG GGTGTGTGTG 600 GTATGTGTGT AACTAGGTGT GTGGTGTATG TGATACTGCA TGGGTGGGGG TGTGTGGTGT 660 GTGATTATAT GTGTGGTGTG TGTATGTATA TGAGACTGTA TGAGGTGGGG GGGTGTGGTG 720 TGTATGTGAC TGTGTGTGGT GTGTGTGTGT GAGACTGGGT ATGGGTGAGG GTATGTGGTG 780 TGTGTGTGTG GTGTGTGTAT GTATATGTGA GACTGTGTAT GGGTTGGGGG TGGGAGTGTG 840 GTGTGTGTAT GACTGTGTGT GGTGTATGTA TATGTATGTG AGGCTGTATG GGTCAGGAAT 900 GTGGTGTGTG TGACTACGTG GGGTGTGTGT GTGTGAGAGA GAGACTGGGT ATGGGTGAGG 960 GTGTGTGGTG TGTGTGATTG TGTGTGTGGT GTGTGTGTGA GACTGGGTAT GGGTGAAGGT 1020 GTGTGGTGTG TGTATGTGTA TGCGAGACTG TGTATGGGTT GGGGGTGTGG TGTGTATATG 1080 ACTGTGTGTG GTGTGTGTAT GTATGTGAGG CTGTATGGGT TAGGGGTGTG GTGTGTGTGA 1140 CTATGTGGTG TGTGTGTGAG ACTGGGTATG GGTGAGGGTG TGTGGTGTGT GTGTGATTGT 1200 GTGGTGTGTG TGACTGTGTG TATGGTGTGT GTGTGTGAGA GAGAGTGGGT ATGGGTGGGG 1260 GTGTATGATG TGGGTGTGAG ACTGCTGGGG GAGGTGCATG TGTGACTGTG CATGCGTGTG 1320 GTGTGTGTGT ATACATGAGA CCCTGTGTGG TGTGGCGTGT GTATGTGAAC ATGCGTGCTC 1380 CCTGCGCTGC CGGCTCTGGC TCTCCCCCAT CCTTCCTCAC AGAGCAGCGC AGGTTTGGCC 1440 ACAGATGTCA GGAGCCCGCG GCTTCCCTGC TGAGCTAAGA GCCCTCTTCA GGCCTTGTGG 1500 TGTCACTATA GCTGACAGTG TCAAGTCTCA CGCCCTTTAC GAAGCAGAGA GGGGTTTTGA 1560 TGCCGCATTG TTTAGCAGTA TGCAGACCTC TCCCTAGGGG CTGTAGATTT CCTGCCTTCT 1620 GAACAATCTC GAGGGGAGCG TGGATTTCCG TCCCGGCGGC ACCCTCGGGT TTTCCCTCCC 1680 CTGCCCCCTC CGCCGCGCTC TCCCCCTTCG CACATTCGGA AACCCTCTTG GGAGCTGAAT 1740 CATGTTCTCG CCTTTTTTGG TCCTAGTTGA GCTCTCTTCC ACTTTCATCA CCAGAGGCTT 1800 GAGATCTGTG AAAGAATCAG TTCCTCGCAG GCTGCGGTCT GCGCCGCGCC TCCTTTGTAT 1860 GTCACGCTCA GAGAGGAGCA GTGCCCTTGG AGTGCCCTGC TCTTGCTGAG AGCCGCACGA 1920 TAGATGTCTT TGAATGACTG ACTTTAATTA AAGTGTGGCG GGCTGGAGAT AAAATGATTC 1980 TGAATATCTT ATTTGGGGGG AAAAAAAAGC CAGCTTCTTT CTTAAGGGAG AAAAAAAGGA 2040 CTCCAGCGCC AGGAGTCTCT TCGGTATCCC TGAGAGTCGG GGGAACTCTT TAAATGCGGC 2100 CCTTGATGGT GTTGTGGAGG GAGAGTGAAT TCTGGGAATC TCTCAGCAGC TTTTTGCCAA 2160 ACAGATGGGC CAGGAGCCGC GGAACCAGGC TGAGGAATGT TGCCTCACGA TCTCACATAT 2220 CCATTCCTGG CACCCACCAG CCCAGGGAAT GCCTCTACCA GTTGTCAGCG AGAGGCTTAC 2280 ACAGCATCTT AAATAAAAGG GATTATTGAA CCAAGAGGCC AGGGACTGAT GGAAATGCCC 2340 ACCTTGCTGG CTCATTGAAA AAGTTTGGCA AGGTTGTCAG GAGACATGAA TTAGATGGGC 2400 TTGGGTCTTG TGCCCTTTGC TAAACCAAGT GCTGTATTGG GAAAGAGACG GGGAGAGAAG 2460 TGTTGGAGAT GCTCTTTAGT CAGGCCTGAG TCACTTGCCC AACCCTGGAG TTGGAGTTGG 2520 GGATGGAGCC AGGATCTCCA AACCACATGC CCCTAGAGTT TCAGGGAAAA TATGGATTGT 2580 GAATTGAAGA TGGGGGGTGA TGTAAGGCAG ACAAGGACAG AAAATCCCTC TTCCAGCTGT 2640 GATTTGGCTG TGAGTTTGGC GCTCGAGACA CCATACGCTC CTGAGGTTTG TTAAGGGGTT 2700 TCAGGATATT GTGGACAAAA GGGAATAGCA AACGATGTTC AGTCCATAAG TACCATTTGG 2760 AGGAGGAAAT 2770
|