EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS155-02637 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Ovary 
Coordinate
chr11:65245880-65247640 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246290-65246308GCATCCTTTCCTCCTTCC-6.19
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246294-65246312CCTTTCCTCCTTCCCTCC-6.56
HNF4GMA0484.1chr11:65246233-65246248TGACCTTTGCTCTCC-6.09
Number of super-enhancer constituents: 78             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00879chr11:65243737-65247689Adrenal_Gland
SE_01577chr11:65245864-65247837Aorta
SE_02242chr11:65245846-65247850Astrocytes
SE_02898chr11:65245861-65247649Bladder
SE_03165chr11:65245855-65247985Brain_Angular_Gyrus
SE_03882chr11:65243488-65248309Brain_Anterior_Caudate
SE_04846chr11:65243590-65248492Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06693chr11:65243625-65248376Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07762chr11:65243485-65248309Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08788chr11:65246013-65247878Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09268chr11:65243462-65246742CD14
SE_11317chr11:65243218-65247007CD20
SE_12859chr11:65243747-65246162CD34_Primary_RO01480
SE_13317chr11:65243305-65247514CD34_Primary_RO01536
SE_14049chr11:65243474-65246108CD34_Primary_RO01549
SE_14376chr11:65243250-65248236CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19912chr11:65243461-65246522CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20736chr11:65243345-65248112CD8_Memory_7pool
SE_23775chr11:65245744-65247567Colon_Crypt_2
SE_24819chr11:65245945-65247705Colon_Crypt_3
SE_25770chr11:65243454-65248568Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26547chr11:65243712-65247764Esophagus
SE_27634chr11:65243475-65248010Fetal_Intestine
SE_28555chr11:65243470-65247915Fetal_Intestine_Large
SE_29556chr11:65243690-65248034Fetal_Muscle
SE_30929chr11:65243697-65247190Fetal_Thymus
SE_31424chr11:65243704-65247822Gastric
SE_33445chr11:65243783-65246412H2171
SE_33445chr11:65246425-65248022H2171
SE_34266chr11:65243277-65248485HCT-116
SE_34617chr11:65237426-65277580HeLa
SE_35831chr11:65243480-65248037HMEC
SE_36925chr11:65243656-65250247HSMMtube
SE_37995chr11:65243474-65247266HUVEC
SE_38870chr11:65245883-65248011IMR90
SE_39847chr11:65242346-65247990K562
SE_40612chr11:65243484-65248051Left_Ventricle
SE_41603chr11:65246191-65247746LNCaP
SE_42107chr11:65243459-65247905Lung
SE_43442chr11:65245821-65247985MCF-7
SE_44137chr11:65243645-65248494NHDF-Ad
SE_44750chr11:65243565-65248057NHLF
SE_45562chr11:65243454-65248511Osteoblasts
SE_46695chr11:65245876-65247656Ovary
SE_47127chr11:65243490-65277571Panc1
SE_47538chr11:65245995-65247517Pancreas
SE_48070chr11:65241375-65248038Psoas_Muscle
SE_48581chr11:65245850-65247830Right_Atrium
SE_49457chr11:65245877-65247582Right_Ventricle
SE_50062chr11:65243572-65247904Sigmoid_Colon
SE_51077chr11:65237462-65248280Skeletal_Muscle
SE_51697chr11:65245863-65247937Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52357chr11:65243567-65248006Small_Intestine
SE_54467chr11:65243714-65247868Spleen
SE_54503chr11:65243495-65276614Stomach_Smooth_Muscle
SE_55162chr11:65246193-65246851Thymus
SE_55732chr11:65243661-65248051u87
SE_56764chr11:65246058-65246660VACO_400
SE_57390chr11:65246011-65247348VACO_503
SE_57928chr11:65245862-65246096VACO_9m
SE_57928chr11:65246166-65247148VACO_9m
SE_58932chr11:65238587-65276390Ly3
SE_59720chr11:65237780-65272476Ly4
SE_60674chr11:65238641-65271340DHL6
SE_61239chr11:65237836-65278618HBL1
SE_62240chr11:65238321-65275907Tonsil
SE_63249chr11:65244238-65267283GLC16
SE_63391chr11:65243820-65268347NCI-H69
SE_63485chr11:65243646-65248049HSMM
SE_64233chr11:65243668-65247416NHEK
SE_65811chr11:65242911-65247755Pancreatic_islets
SE_66874chr11:65243783-65246412H2171
SE_66874chr11:65246425-65248022H2171
SE_67468chr11:65243661-65248051u87
SE_68042chr11:65238458-65277023TC32
SE_68043chr11:65238458-65277023TC32
SE_68495chr11:65243635-65267694TC71
SE_68496chr11:65243635-65267694TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr116524595465247012
chr116524627965246484
Enhancer Sequence
CACTACAGAA GAGTGCAGAG GGGCGCCTCA GCTAGAGGAC TTAGGGATTT TCCTTAGGGG 60
CATTTATGGA CCTTAAAGAG GGAGCTTAAG GGTAACTTGG ACCACACTAG CCACATAGGT 120
CATGATAAAT GATTACATTT GTAGACATTT TGGTGCCTAA TGCCAGTCAG CAAGGGTTGT 180
TGCACAATGA GTTTGGACAG GCATGCATTT GCAGAGATGT ATAGAAATTC TAATTACTTG 240
GAAATTTTGT TGGACCGGAG CTAGGAACCA AATGGTATAG GGAAGTCTCA TTACTTCTGA 300
ATTCCTCAGA TAAAGAGTTT TGCCTCTGCC TGGGCTGCTC GATGGCCACC AGGTGACCTT 360
TGCTCTCCTC AGGGGCTGCT GTGGGTCCAG AGCTGGAAGG AGAATGGGCC GCATCCTTTC 420
CTCCTTCCCT CCCCGCAGCA GCAGGGGCTC TGGCTGCGGG GGCGGGCTGA GCTCCGTCCG 480
GGGTGATGCG AAGGGGGTCA TGCCGAGGGG GTGACTCCCA GCTTGCACTG CGTCCCACAG 540
TCGCGCCTCG CCTCGCCTCC CGGAGCCCGA GTCTTCCAAG GGCGCTGGCA GCTGCGTCAG 600
CTCCCGCTGC CCGCCCCAAG CGTCCAGAGC TAGGAGGGAG TTACGGGGCG AGGCCCAGGG 660
CTTTTCAGGG CCGGGGGTCG TGCGGCCAGG CGCGGGTGGA CTAGGCCAGC GGCCACTGAG 720
GGGCAGAGAG GTCTGGGGTT CTAAGTTTAG CCCACTCCGC GAATGTGGAT TGCTTTGTTT 780
GGATGTGATT CCCTTTCCAG GTGACTGTAG GTTACCCCCA CACTGCCCTG GCATGGAAGA 840
GATTTAGGCT GTCCTAGGCC TTCACCCTTC CCTAAGACGA GAATCCAGAG GAGGAGCCAT 900
TTAACAGCTC CCTGGCTTCT CTCACTTACA GGGAGCTCAC TACTACTACT AAAAACATTT 960
TGAAGTTAAC ACCCCCTTAT GCCTGGCTCA TTCGTGCATT CAACAGATGT TTACTGAGCA 1020
CAGACTGTGT GTTGGAGACT GGCCACTGGT TTACATAACG AGCTGTGATA AAACAAAGTC 1080
CCAAGCCTCT TGGTTGATGT TCTCAGGCTT TTTTGAGGTG TGAATCACTT CTCCCTGGAA 1140
GCCCTCCTAG CTATGCCACC CTGGCTTAAG ACTGACTTTT GTGCTCTAGT GGCCCCTCAG 1200
GGATTCCCCA CATCAGCACT GACTAAATGT CCACTTCCAT GAGCTAGAGG AAGGTGGCGC 1260
CTCTTATTTG GCCTGGAGCA GGGAGCTAGG GCTCCTGCAG CCTCCAGATC CCTTACTGGG 1320
CGTCAGCTCA AGGGTGGGAA GGCCGGGGGC CTGCACCCCC TGGGAAAGAT GTGGGCATTT 1380
GTTTCAAGGC AGGTGGTGGT GGCTGAAGTC TGGAGGCAGG GAGAACGGCT GCGTATTTCA 1440
AACTTGTAAG CAAAGGACAG GGGACCTATT ACTGGGAAAT TTCCCACATG TGCCAGGGGG 1500
AAGGAACAAC CCTCTCCCTG TGGAAGGTGG GGGGAGCGAG CTCACCTCCC AGAGAGACAA 1560
CTCTGTCACT CTGGCGCCTC TGCCCGCCCT TGTTCTTCCC TCCATCTGAA ATCTTCCCCT 1620
CTTCTCAAAG CTGGTGTATT CTCATCCTTT AACTCTCCAC TCAAATGTCA CTTTCCTTGT 1680
CAACCCTTGT CAAAATTGGT CCCCTCCTCT GTTCCCTTTA TTCCATCACC TATATTTTCT 1740
CAGAACATGT ACAGTGCTCA 1760