EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS149-00439 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
NKC 
Coordinate
chr15:89182830-89186530 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr15:89186495-89186506GAGCCATAAAA+6.14
Foxd3MA0041.1chr15:89184200-89184212GATTGTTTTTTT+6.44
NKX2-3MA0672.1chr15:89184319-89184329TTCAAGTGGT-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr15:89184108-89184123GAGCTCAGAAGGTCA+6.1
Nr2f6MA0677.1chr15:89182907-89182921TGACCTGTGACCCC-6.32
RARAMA0729.1chr15:89184108-89184126GAGCTCAGAAGGTCAAGG+7.13
RxraMA0512.2chr15:89182907-89182921TGACCTGTGACCCC-6.39
SPI1MA0080.4chr15:89185148-89185162AGCTTCCTCTTTTT-6.24
SPI1MA0080.4chr15:89184847-89184861AACTTCCTCTTTTT-7.64
SPI1MA0080.4chr15:89185459-89185473AACTTCCTCTTTTT-7.64
SPICMA0687.1chr15:89184847-89184861AACTTCCTCTTTTT-6.84
SPICMA0687.1chr15:89185459-89185473AACTTCCTCTTTTT-6.84
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_06498chr15:89180604-89184229Brain_Hippocampus_Middle
SE_10195chr15:89177380-89186181CD19_Primary
SE_11023chr15:89163859-89196717CD20
SE_11840chr15:89177350-89184882CD3
SE_14442chr15:89177408-89185224CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15422chr15:89177405-89184405CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15832chr15:89177486-89184381CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15832chr15:89184467-89184964CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16339chr15:89177487-89184233CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16903chr15:89178127-89184254CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17356chr15:89164042-89186380CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17817chr15:89177171-89185170CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18443chr15:89177408-89186150CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19207chr15:89177700-89184829CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20004chr15:89177471-89185234CD56
SE_20004chr15:89185241-89186196CD56
SE_20848chr15:89177712-89184520CD8_Memory_7pool
SE_21489chr15:89177721-89184263CD8_Naive_7pool
SE_21938chr15:89177288-89184463CD8_Naive_8pool
SE_22318chr15:89177293-89185168CD8_primiary
SE_22318chr15:89185187-89186213CD8_primiary
SE_23572chr15:89180610-89184247Colon_Crypt_1
SE_24244chr15:89181197-89183794Colon_Crypt_2
SE_26448chr15:89180441-89184344Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27298chr15:89179030-89184186Esophagus
SE_31162chr15:89177485-89184011Fetal_Thymus
SE_31525chr15:89179051-89184959Gastric
SE_34984chr15:89178879-89183779HeLa
SE_36550chr15:89180662-89183396HMEC
SE_38322chr15:89179752-89184026HUVEC
SE_42832chr15:89179051-89184204Lung
SE_44652chr15:89179809-89183408NHDF-Ad
SE_50182chr15:89177396-89185021Sigmoid_Colon
SE_52431chr15:89177478-89184323Small_Intestine
SE_53433chr15:89177508-89185022Spleen
SE_55139chr15:89179088-89184324Thymus
SE_58134chr15:89181253-89183384VACO_9m
SE_62246chr15:89163927-89201948Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr158918543089185841
Enhancer Sequence
TGAAGGCCCG GCCAGCAGGG GCTTTGGAAA TAACCCCTCT CCCACTTCCC TGGCCCCTCT 60
TCCCTGGTGC CCATCTGTGA CCTGTGACCC CACTTGTAAG ATTTCCCACA CTGCTGTTGG 120
GAGAAAGCCG GTGGTGTCTC CATCACATCC TGGAGAAGGC TTCCTGTCTT CAGAGAACCA 180
TAGACTCACA TCTGGAAGCC GCCTTTGGGG CATCTATCTG GATCTGGTCC AACTTGCCGG 240
TCTTAAAATG GGGAAACTGA GTTCCCCCAC ACAGTGACTT GGGGTCTACA TTCCCCATTC 300
TTCCCTCTAC CCCAGGCTGC CACTGGTGAG ACCTGTGGGG AAATGAGAGG ATTCTTGGCT 360
GAGGCTCTGG CAAGAGGCTT TGGCCCTCCC AGTCCTGGAG AACAGGCTGA GCCTCGGGCT 420
GAGGACCTTG CTCTCAGGCT AGCATTCTGA CCCAGAGTAG GCTGTCTGCT CAGTTTGAAT 480
CCTGAGTTCG TGGTCCAGGG ATTTCCTGCA CTCTTGCTCT TAGCTGATTG TGAGGTCATC 540
TCCCCGTCTC ACTTTCTGTT TCTCTGAATT ACTAAGTGGA AAGCAAAACT TAAAGGTGTC 600
AACACGGTTA GCCACCCCTG GGAAATCTCA GAAGGGCAGG CGAGCTCGTC AGTTTCTAGA 660
CACCATGGTA GGGTTTGAGG AAGTCCAAGA AGAACACAGG TTCCTCAGCA GCACACACCC 720
AATCCGTGCC AGGCTCCAGG TGCTGGGGAT GAAATGACAA CAATAGCTAC TATTGACTGA 780
GCACTCACTA TGCACTGGCC GCTCCCCTAA GCACTGGCCA TTCCTGAGCT CATTCACTCC 840
TCACAAACAG CCCTGCCAGG CAGGTCCTCA GGAACTGTTA ACGCAGAGTT AAGAGGGTCA 900
GTTTCAATCT CAGTTCCCAT TACTTAACAG CTAAGGTACC TTGGACAAGT TACTCAACCT 960
CTTTGTACCC AGTAAAAGAA AAGAAGGATA ATAGTAGTAG CAACTTTGTT GGGTTATTGC 1020
GAGGATTGAG AAAGGGTCTA GATAGAGTGC CTAAATAGGT ACTCAAAAAA ATGTTAGCTA 1080
TTGGCTGGGT GCAGTGGCTC ACATCTATAA TCCCAGCACG GTGGGAGGCG GAGGCAGATG 1140
GGTGGCTTGA GCTCAGGAGT TCAAGACCAT CCTGGGCAAC ATGGAGAAAC CCCATCTCTA 1200
CAAAAAAAAG TACAAAAATT AGCCGGGCAT GGTGGCACAT GCCCATGGTC ACAGCTACTC 1260
CAGCAGCTGG GATCACTTGA GCTCAGAAGG TCAAGGCTGC AGTGAGCCAA GATGGCACCC 1320
ACTCCAGCCT GGGCAACAGA GCCAGGAAAA AAAAAAAAGT TAACTGTTTT GATTGTTTTT 1380
TTGTATGTCT GTTTTATTAT TATTTTTTTT TTAACCGGAG TCTCTCTCTG TCACCCAGGC 1440
TGGAGTGCAG TGACATGATC TTGGCTCTCT GCAACCTCTG CCTCCAGGAT TCAAGTGGTT 1500
CTCTGGCCTC AGCCTCCCAA GTAACTGGGA CTACAGGCAC CCGCCACCAT GCCCGGCTAA 1560
TTTTTTTTGC ATTTTTGGTA GAGATGGGGC TTCACCATGT TGGCCAGGCT GGTCTCGCTC 1620
GAACTCCTGA CCTCAGGTGA TCCGCCCACC TCGGCCTCCC AAAGTCCCAG GCATGAGCCA 1680
CCGCATCTGG CCATGGTTGT TTACCTTATT ATCCCCATAT TACAGATGAG GAAACTGGGG 1740
CTCGCTTGAT TATTTGTTAG GGCTGCCATA ACAAAGCACC ACACACTGGT GGCTTAAACA 1800
ACAGGAATGT CCTGTCTCGG GGTTCTGGAG GCTGCAGTCT GAGATCCAGG TGTCGCCCAG 1860
GTTGGTTCCT TTTGAGGGTT GTGAGTGGGA ATCTGTTCCC TGCCCCTCTC CCAGATTCTA 1920
GGGGTTGTTG TCAAAGCTTT GGGGTACCTT GGCTTATAGA TGCCTCACTC AGATCTCTGC 1980
CTTCATGTTC ACATGGCATT CTCTCTGTGT GTGTCCAAAC TTCCTCTTTT TATTTTTATT 2040
TTTTATTTTT GAGATGGAGT CTTGCTCTGT CGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCAGGATCT 2100
GGGCTCACTG CAACCTCTGC CTCCCAGGCT CAAGTGATTC TCCTGCCTCA GCCTTCTGAG 2160
TAGTTGGGAC TACAGGCACG AGCCACCACA CCCAGCTAAT TTTTGTATTT TTAGTAGAGA 2220
TGGGGTTTTA CCATGTTGGC CAGGCTAGAC TCAAGCGATC CGCCTGCCTT GGCCTCCCAA 2280
AGTGCTGGGA TGACAGGCAT GAGCCACTGC ACCTGGTTAG CTTCCTCTTT TTTTTTTTTT 2340
TTTTTTTTTT TTTTGAGACA GAGTCACTCT GTTGTCTAGG CTGGACTGCA GTGGCACGAT 2400
CTCGGCTCAC TGCAATCTCC ACCTCTTGGG TTCAAGCGAT TTTCCCGCCT CAGCCTCCCA 2460
AGTTGTAGTA TAGGTGTCCG CCACCACGCC TGGCTAATTT TTTATTTTTA GTAGAGACGG 2520
GGTTTCGCCC TGTTGCCCAG GCTGGTCTTG AATGCCTGAC CTCAGGTGAT CTGCCCTCCT 2580
TGGCCTCCCA AATTGCTGGG ATTACAGGTG TGAATCACTG TGCCCAGCCA ACTTCCTCTT 2640
TTTCAAAGGA CACCAATCAT ATTGGATTAT GAGCCCACCC TACTACTCCA GTGTGACTTC 2700
ATCCTACCTT AACTAATTCT ATCTGCAACG ACCTTATTTC CAAATAAATC ACGTTCTGAG 2760
GTATTGGGGG TTAGGATTTT AACATATGAA TTTGAGAGAG CGGGACACAG TTCAACCCAT 2820
AAACTGAGTA ACTTACGCTG TTAAGATAGA TGGAATATGG GACAACTGCT CAGGAATCCA 2880
AACTCAGGCT TACAGTCTCT AGAACTATGC TGTCCAGTGG GGTCCCCAGC AGCCATATGC 2940
TGCTAGTAGA CTGAATTCAG ACCTGGAGTG TAGCTGGTTT GAACTGAGAT GTGCTGAAAG 3000
TGTAAAGTCC ACACTGGATT TTTTGTTGTT GTTTTGAGAC GAAGTCTCGC TCTATCGCCC 3060
AGGCTGGAGT GTGGCGGCGC GATCTCGGCT CACTACAACC TCCATCTCCC AGGTTCAAGG 3120
GAGTCTCCCG CCTTGACCTC CCAAGTAGCC TCCCAAGTAG CTGTGCACCA CCACGCCTGG 3180
CTAATTTTTG TATTTTCAGT AGAGACGGGG TTTCACCATG TTGCCAGGCT GGTCTCGAAT 3240
GCCTCACCTC AAGTGATCCA CCCACCTCAG CCTCCCAGAG TGCTGGGATT ACAGCCATGA 3300
GCCACTGCAT CTGGCTGAAG CCTTGTATTT AAAAAAGAGA CAGGCCAGAT GCAGTTGTTC 3360
ATGGCTGTAA TCCCAACACT TTGGGAGGCC AGTGCAGAAG GATGGCTTGA GCCCAGGAGT 3420
TTGAGACCAG CCTGGGCAAG ATGGTGAGAT CTCCTCTACA AAAAAAATAA ATAAATAAAA 3480
TAAAAATTAG CCAGACATGG TGGTGCATAC CTGTAGTCCC AGCTACTCGA GGAGGCTGAG 3540
GTGAAGTATT GCTTGAGCCC AGGAGTTTGA GGCTGTACTG AGCTATGATC ATGCCACTGC 3600
ACTGCAGCCT GGGTAAGAGA GACCCTGTCT CTATTAAAAA ATAATAATAA TTAAAATATT 3660
AAAAAGAGCC ATAAAATGTC TCAATAACTT TTATATTGAT 3700