Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS146-14172 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | NHDF |
Coordinate | chr8:38625650-38629240 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
CTCF | MA0139.1 | chr8:38625983-38626002 | TAGTGCCCTCTGGTGGCTA | - | 8.69 | Gfi1b | MA0483.1 | chr8:38628874-38628885 | AGCTGTGATTT | - | 6.14 | RARA | MA0729.1 | chr8:38626045-38626063 | AGTGTCAAAAGTTCAATT | + | 6.43 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626697-38626717 | TGGGAGGGTGTGTGTGGTGT | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627191-38627211 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627408-38627428 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627018-38627038 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626631-38626651 | TGGGTGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626822-38626842 | TGGTGGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626362-38626382 | TGGGGGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.49 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626758-38626778 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627295-38627315 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626943-38626963 | GGTGGGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.86 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626358-38626378 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626880-38626900 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 | ZNF263 | MA0528.1 | chr8:38625653-38625674 | GAGGGAGGAAGGGAAAGAAAA | + | 7.19 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 10 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_00183 | chr8:38622119-38630072 | Adipose_Nuclei | SE_25871 | chr8:38622053-38630309 | Duodenum_Smooth_Muscle | SE_27135 | chr8:38624195-38629708 | Esophagus | SE_29948 | chr8:38625586-38629397 | Fetal_Muscle | SE_32046 | chr8:38627018-38629032 | Gastric | SE_42390 | chr8:38625843-38629159 | Lung | SE_46615 | chr8:38625356-38629751 | Osteoblasts | SE_50980 | chr8:38623958-38629300 | Sigmoid_Colon | SE_53926 | chr8:38626751-38628713 | Spleen | SE_54632 | chr8:38613262-38630260 | Stomach_Smooth_Muscle |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 6 | Chromosome | Start | End |
chr8 | 38625684 | 38626655 | chr8 | 38626109 | 38626284 | chr8 | 38626664 | 38629141 | chr8 | 38627218 | 38627790 | chr8 | 38627692 | 38628125 | chr8 | 38628365 | 38628436 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH08I038764 | chr8 | 38622181 | 38629647 |
|
Enhancer Sequence | AGGGAGGGAG GAAGGGAAAG AAAATAAAGG AGGACAAAAT TGACTTTTTG ACACCCCATT 60 CCTTCTGCTG GTCGGGATCC TGCCTCTCAG GGGTGTGTCT TCAAATCCTG TGATTCACAG 120 AGAACTTTCT GTAGCTTCTG AGAAGTTGGG AGTCTCCCTT CTGCAGTCGT TCAGTGCTTG 180 TTCATTTGTA TCTGCTGGTT AAACTGCAGT ATAAACACCC TGCATTGGAT GCAGAGGGGA 240 CTCATTGTGA CTTTTTGTAT TTATAGAAGT ACAAATGTTG AAGAAATTCT CTTCACACAC 300 AAATGTGTTG ATGGACGGTG TGATGGAACG TTCTAGTGCC CTCTGGTGGC TACTGCGGCT 360 TCCGGCTGGT GAAGCTGCAC AGCAGAAGGA ACGGGAGTGT CAAAAGTTCA ATTTTTTCCT 420 CCTCCATCCT TGATAATTGT GTGTCTTGTT TGATCGATTC CATACCCCTG TATGAATGGT 480 CCAGGGGCTG AGCAAGAAGC TGTGTCTTAG GACTGAAGTG CTTGAGGAGT GTGTGTGTGT 540 GTGTGTCAGA CAGAGAGAGA CTTTGAGGGG TATATGTGCA ATGTGTGTGT GTCACCATAT 600 ATATATGTGA AACTGTGTGT GGGAGGTATG TGTGTGACTG TGGGCTTATG TGAGAGTTGG 660 GGGTAGGTGT GGTGTGTGTG GTTATATGTG TACCAGAGAC TCAATGTGTG GGTGGGGGTG 720 TGTGGTGTGT GTGAGACTGT GTATGTAAGA CTGTCGGGGG AGGTGTGTGT GTGACTGTGT 780 GTGGTGTGTG TGACTATGTG TGTGGGGTGT ATATGTGTAC ATGAGACTGT GGGGATGGGA 840 GTGTGTGATA TGTGTGGTGT GTGTGAGACT GCGTGGTGCG TGGATATGAG GCTGTGGGGG 900 TGGAGGTGTA TGGTGTGTGT GTGAGACTGT TGTGGGGAGG TTTGTGTGAC TGTGTGGTGT 960 GTGTGTGTGT GAGAGACTGT ATGGGTGGGG GTGTGTGTGG TATATGTGTG ACTAGGTGTG 1020 TGGTGTGTGT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GAGGGTGTGT GTGGTGTGTG TGATTGTGTG 1080 GTGTGTGTAT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GTTGGGGGTG TGGTGTGTGT GACTACATGT 1140 GTAGTGTGTA TATGTGTATG TAAGACTGTG TATGGTGGGG GGTGTGTGTG GTATGTGTGT 1200 AACTAGGTGT GTGGTGTATG TGATACTGCA TGGGTGGGGG TGTGTGGTGT GTGATTATAT 1260 GTGTGGTGTG TGTATGTATA TGAGACTGTA TGAGGTGGGG GGGTGTGGTG TGTATGTGAC 1320 TGTGTGTGGT GTGTGTGTGT GAGACTGGGT ATGGGTGAGG GTATGTGGTG TGTGTGTGTG 1380 GTGTGTGTAT GTATATGTGA GACTGTGTAT GGGTTGGGGG TGGGAGTGTG GTGTGTGTAT 1440 GACTGTGTGT GGTGTATGTA TATGTATGTG AGGCTGTATG GGTCAGGAAT GTGGTGTGTG 1500 TGACTACGTG GGGTGTGTGT GTGTGAGAGA GAGACTGGGT ATGGGTGAGG GTGTGTGGTG 1560 TGTGTGATTG TGTGTGTGGT GTGTGTGTGA GACTGGGTAT GGGTGAAGGT GTGTGGTGTG 1620 TGTATGTGTA TGCGAGACTG TGTATGGGTT GGGGGTGTGG TGTGTATATG ACTGTGTGTG 1680 GTGTGTGTAT GTATGTGAGG CTGTATGGGT TAGGGGTGTG GTGTGTGTGA CTATGTGGTG 1740 TGTGTGTGAG ACTGGGTATG GGTGAGGGTG TGTGGTGTGT GTGTGATTGT GTGGTGTGTG 1800 TGACTGTGTG TATGGTGTGT GTGTGTGAGA GAGAGTGGGT ATGGGTGGGG GTGTATGATG 1860 TGGGTGTGAG ACTGCTGGGG GAGGTGCATG TGTGACTGTG CATGCGTGTG GTGTGTGTGT 1920 ATACATGAGA CCCTGTGTGG TGTGGCGTGT GTATGTGAAC ATGCGTGCTC CCTGCGCTGC 1980 CGGCTCTGGC TCTCCCCCAT CCTTCCTCAC AGAGCAGCGC AGGTTTGGCC ACAGATGTCA 2040 GGAGCCCGCG GCTTCCCTGC TGAGCTAAGA GCCCTCTTCA GGCCTTGTGG TGTCACTATA 2100 GCTGACAGTG TCAAGTCTCA CGCCCTTTAC GAAGCAGAGA GGGGTTTTGA TGCCGCATTG 2160 TTTAGCAGTA TGCAGACCTC TCCCTAGGGG CTGTAGATTT CCTGCCTTCT GAACAATCTC 2220 GAGGGGAGCG TGGATTTCCG TCCCGGCGGC ACCCTCGGGT TTTCCCTCCC CTGCCCCCTC 2280 CGCCGCGCTC TCCCCCTTCG CACATTCGGA AACCCTCTTG GGAGCTGAAT CATGTTCTCG 2340 CCTTTTTTGG TCCTAGTTGA GCTCTCTTCC ACTTTCATCA CCAGAGGCTT GAGATCTGTG 2400 AAAGAATCAG TTCCTCGCAG GCTGCGGTCT GCGCCGCGCC TCCTTTGTAT GTCACGCTCA 2460 GAGAGGAGCA GTGCCCTTGG AGTGCCCTGC TCTTGCTGAG AGCCGCACGA TAGATGTCTT 2520 TGAATGACTG ACTTTAATTA AAGTGTGGCG GGCTGGAGAT AAAATGATTC TGAATATCTT 2580 ATTTGGGGGG AAAAAAAAGC CAGCTTCTTT CTTAAGGGAG AAAAAAAGGA CTCCAGCGCC 2640 AGGAGTCTCT TCGGTATCCC TGAGAGTCGG GGGAACTCTT TAAATGCGGC CCTTGATGGT 2700 GTTGTGGAGG GAGAGTGAAT TCTGGGAATC TCTCAGCAGC TTTTTGCCAA ACAGATGGGC 2760 CAGGAGCCGC GGAACCAGGC TGAGGAATGT TGCCTCACGA TCTCACATAT CCATTCCTGG 2820 CACCCACCAG CCCAGGGAAT GCCTCTACCA GTTGTCAGCG AGAGGCTTAC ACAGCATCTT 2880 AAATAAAAGG GATTATTGAA CCAAGAGGCC AGGGACTGAT GGAAATGCCC ACCTTGCTGG 2940 CTCATTGAAA AAGTTTGGCA AGGTTGTCAG GAGACATGAA TTAGATGGGC TTGGGTCTTG 3000 TGCCCTTTGC TAAACCAAGT GCTGTATTGG GAAAGAGACG GGGAGAGAAG TGTTGGAGAT 3060 GCTCTTTAGT CAGGCCTGAG TCACTTGCCC AACCCTGGAG TTGGAGTTGG GGATGGAGCC 3120 AGGATCTCCA AACCACATGC CCCTAGAGTT TCAGGGAAAA TATGGATTGT GAATTGAAGA 3180 TGGGGGGTGA TGTAAGGCAG ACAAGGACAG AAAATCCCTC TTCCAGCTGT GATTTGGCTG 3240 TGAGTTTGGC GCTCGAGACA CCATACGCTC CTGAGGTTTG TTAAGGGGTT TCAGGATATT 3300 GTGGACAAAA GGGAATAGCA AACGATGTTC AGTCCATAAG TACCATTTGG AGGAGGAAAT 3360 AATTGAAATT GCTGCTGATC AAAAAGCTTT TTGTCTCCAG TTTGGATGTT GGAGACAGGT 3420 TTCTGTGTAA GAGAGTGAGG GTGTACAACA TGACTGAGAA AGAAAACAAT GAGTTAAGGC 3480 ACATAAGTGC GCATGGGTGT CACCTGGAGG CCTTCTTATA ACACAGATGG TCAGGCCCAC 3540 CCCAAGTTTC TCATGCAGTA GAGGTGGAGC TCAAGAATTT GCATTTCTAT 3590
|