EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS146-10278 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
NHDF 
Coordinate
chr3:42102370-42106170 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:42102437-42102449GTTTGTTTGTTT+6.32
Klf12MA0742.1chr3:42103424-42103439AACCACGCCCTTCTA+6.14
Klf1MA0493.1chr3:42104645-42104656AGCCACACCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr3:42102835-42102855CCCCCACGCACACCCACACA+6.07
RREB1MA0073.1chr3:42102802-42102822CCCCCACGCACACCCCCCCA+6.39
Number of super-enhancer constituents: 31             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42100849-42110891Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42103304-42103870Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42102629-42105918Aorta
SE_02512chr3:42102571-42105836Astrocytes
SE_10226chr3:42102802-42104135CD19_Primary
SE_10922chr3:42092287-42111479CD20
SE_23272chr3:42103325-42103869Colon_Crypt_1
SE_25861chr3:42102470-42106148Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42102629-42105906Esophagus
SE_29565chr3:42100077-42111501Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42100886-42106777HSMMtube
SE_38230chr3:42102410-42105900HUVEC
SE_40683chr3:42101584-42106077Left_Ventricle
SE_42248chr3:42101660-42105904Lung
SE_44342chr3:42100992-42106487NHDF-Ad
SE_44918chr3:42102813-42106315NHLF
SE_45733chr3:42101835-42106620Osteoblasts
SE_48185chr3:42101819-42105888Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42101702-42105961Right_Atrium
SE_49555chr3:42104156-42104560Right_Ventricle
SE_49555chr3:42105146-42105862Right_Ventricle
SE_50309chr3:42102641-42103829Sigmoid_Colon
SE_50309chr3:42103956-42105894Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42100863-42106373Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42102255-42106027Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42102688-42105862Small_Intestine
SE_53513chr3:42101516-42105919Spleen
SE_54717chr3:42102690-42105960Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42102277-42106171HSMM
SE_65044chr3:42102493-42106259NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr34210264842102781
chr34210280842103873
chr34210520042105820
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042057chr34209869342111283
Enhancer Sequence
CCTTGGCCGC CTAAAATGCT GGGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCGG CCTTTTTTGT 60
TGTTGTTGTT TGTTTGTTTT GCAGTTTTTT GGGGATCTCA TCAGGTTCAT TTAGGGCTAA 120
ATAAACTGAC CCTCCAAGGG ACTTAATGAC TTATGCTGAA GGACCCTGTG AAAACCTAAA 180
TGGTATGCTT CAGGCCTGGA AGCTGACTTA AAAGTGCATT TTAAAAAGTT CTTTGTTATG 240
GTATAATTTT AGATTTATAG AAAAGTTACA AAAAGTGTGC AGAGTTCCCA TACACCCTTG 300
ACCCAGCTTC CTCTAATGTT AACATCTTAC GTAACCATTG ACCTTAAGTT TTCAAGTGAT 360
GGGTGTGTGT CTACATCTGT GCATGCGTGC ATGCACACAC CCACCCACAC ACGCACCCCC 420
CCATGCACAC CTCCCCCACG CACACCCCCC CATGCACACC CCACCCCCCC ACGCACACCC 480
ACACACACAC ACACAGTGCC AGGGAGGCAG CCCTGTTGTC TGTCAGCCTT TTCATAGCTC 540
ATCATATTTA CACCTCCTGG ATACAGAGTG GACCCTGGCC ATGGCAAAAG CAGGCAAGGA 600
GCTACTTTGA AGCTGAAGTT CCAAAGCAGG AGATACGGGG AAAACAATCA GCTGCTACAG 660
AGCTCTGAAT ATCATGTGAA CCCAGTGCCA CTTGAACTTT ATTTAGTAGA AGATTGGCCT 720
GAGACACTTA ATATAGAAAT CCCAGCCATC ATGTGAGAAT TCCATTCCGT GCAAGTACAA 780
ATACAAGAGA ATTTGGGAAT GTTCACTTTG GCTTGTGTTA TGCTAAGTCA TCTCACTTCT 840
TTCCCATCTA ATTTATGAAT CAGAACACCA ACAATATATA CCAGTTTATT AACTAATGAA 900
TCAGGAGCAA CAAGCCCATC CATCTACCCA TCTGCATGGA TTTGAGCTTT ATTCAGTAGT 960
ACTTTGCCTT GGAAATGGTC CAGGTTATTT TGGAAACGGA TATTCAATTC AAATGATGAC 1020
AGCCATTGGC ACTCACTCTG GGGCTCAGGA GGGAAACCAC GCCCTTCTAG GCTATTGCTG 1080
ACGCCATCCC TCCAGAATGC AGCTGTCTCG GGTGGAGGCT CTGGGACAGC TGCTTCTGGC 1140
TAAGGCTGCC CATTTGGGAG AAGGGGACAT TGAAATTGCA AGAGGAGTCA TGGCTGAGAG 1200
AGATCCTGCT CATATGTGTG GCAGGAATCC TACAGCAGAC AAGATTTTGA CAATGGACAA 1260
GTCACTCACC TTCTAACATG TCCACTTTCC TGTGGATGAA GTGGAATTTT CCAAAAGCAG 1320
GAGTACAGTG CTGCCTGTTA CTCTTGTGAA ACTCTCAATC TCTTGGTGAA CTACTGGTAT 1380
TATAAAGGAG TGCCGTATTA GCGGAGGTGC AAACAAAATG CTTCAGTGCT TTTGATTCCT 1440
TTGGCTAAGG ATAGGTCTTA ATTTTGAATA TTTTTTTTCC TACTAGGGCC AATTTCAAAA 1500
AAAATCAAGT TTGCATTCAC ATGTTTAATA ATTCCAGTTA TACTTTTAGC ATTAAAAAAT 1560
ATGCTTGTCT TGGAGACTAT TTTTTAACAT TTCAGAATCT ACAAAACCAG CTTAAATACA 1620
GCATGACTAT ACTGCTACCC CTCTGAAAAA CTTTGTATTT GAGTCCTGGC ACCTCTGAGG 1680
CTTCTTCATG TTGGTGGTTT TTATTTTCCT TTTCACTGAC CATGCATGCT ACTCTGTGTG 1740
AAATAGGGTT TGTGAAATAG GTTGTGTCAG CGCTATCTGT ATGCCTTAAA ACAAAGTATT 1800
ATGCTGTTGA GAAAAAGCAA AACAAGGATA GGTCTTTAAC AAAGACTATT TAGGCTGCTG 1860
CTGCCTAATA TAATTCTCAT CAGTGAAGTC TTCACTTTGT TGGAAAACAG TGCCTGACAC 1920
TCCCTTGTGT CCTGCCTGGT GGGACTTCCC TACAGCCCCT TGAGCTGTTT TCCAGGCTCT 1980
GCACTGCAGT GAAGGCGTGT TTGTCTTATG AGGGGATGTG CACTGCACTT TCACCTGTAT 2040
TACCTCACTC CCCAGAGCCA CCTTAGGAGA TGGATGACAT TATCCCTGTT TTTGAGATAT 2100
GGAGGACGTG CTTCAGAAAT TTTAAGAAAC TCAAACAAGG TCACACTGGT AGTGAGTAGT 2160
AAAGTCAGAA TTCCAGGCCT GGTTTTCCAG TACCAAATCC AGTGCTTATT CTCACAGACC 2220
ATGGGTCAAA TCCATCCCAC CGCCTGCTGT TATAAATAAA GTTTTATTGG AATACAGCCA 2280
CACCCATTCA TTTCCATATT TTCTGACTGC CTTCCAGCTA CAACTGCGGA ATTGCAACGG 2340
AGACTGTATT GCCCTCAAGG CCTGAAATAG TTATTATTTT CCGCTTCGCG GGAAAAGTTT 2400
GCCAAGCCCT GCCCTAAGCC ATTGCTGAAG GAGCATCCGG GTTTTGTCTG TCAGTACATT 2460
CCCCACTGCC CCTGCCCAAC CAGGAATGCC TTTGTGATGC AGTTCTTGCT CTTTTGTAAA 2520
GGTGGGGCTG GGTGTGGTGG CTTGTGCCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAGGCGG 2580
GCAAATCAGT TGAGATCAGG AGTTTGAGAC CAGCCTAGAC AACATGGCAA AACCCTGTCT 2640
CTACAAAAAT TACAAAAACT AGCCAGGCCT GGTGGGACAC GCCTGTAGCC CCGTCTCCTT 2700
GGGAGGCTGA GGTGGGATGA TTGCTTGAGC CTGGGAGACA GAGGTTGCAG TGAGCTGAGA 2760
TTGTGCCACT GCATTCCAGC CTTGGTGACA GAGTGAGACT CTGTCTCCAA AAAAAAAAAA 2820
AAAAGTGGTG GGAGCCACAC AGTGAAAAAA GCATATGTGC CGGGGCAGCC CAGCTGTGCC 2880
TTATTGTCTG CTCTCTGGCC CTGTGGTGGG CTGAAAGTTC TTACCATACT CCCATCCAGA 2940
TGTAGAGTCT GTAACCTTTC CCCTTGAATC TGCGTTGGCC CGGTGATGTA TTTTGACCAA 3000
TAGTTTGCGG TAGAAGTGAC ACTGTGTAAC TTTTAAAATT GAGTCTAAAG AGATCTGTAA 3060
TTTCTGTCTC ATACTTTGAA CACCCCTTCT TGGGATCCAG CCAGCATGTG AGAAGCCCTG 3120
GTGGCCATGT GGAAATTATA TCCACGTGAG AGAGAGGCCC AGTCATCCCT TTCAGAGCAC 3180
TAGAGATGGG AGGGAACCCA TTTTACATGC CCAGCCCTTA TTACTATCTG ACCTGAGGGA 3240
GATCACAAAT GCCTTCTGTA TTGGGTGGTA ATGATACATC ACAAAAATGC GAATGCTCGC 3300
AGCCAGGCGG GCGCTGTGGC TCAAGCCTGT AATCCCAGCA CATTTCAAGC CTAGGTGGGT 3360
GGATCCCTTG AGCCCAGGGG TTTGAGACCA GCCTGGGCAA CGTAGCAAGA CCCTGTCTCT 3420
ACCAAAAATA CAAAAATTAG CCAGTCTTAT AACCCGGTCT CAAATGAATA AATAAATAGA 3480
GGGATACAAA TTAAAAAAAA AAACCTTTAA AAAGAATTCT CTTACAGTCT GATGTCAATG 3540
TTGGAAGATT AAGAAATAAA ATAAATTTTT GAACTTGCTG TCTGAGTTAC CCAAATGTAA 3600
TTTCTAAGAA CTCTAAAATA TTATCACCTA GAATCTAGGA AGCTACCATG TGATCCTAGA 3660
CTAATAGCAT AGAATGAATG TTGCTTCATT ATGAACTTAT TATGGAAATA CAAATACATA 3720
ATAAATACTT TAAGCAGACT ATAGACTGTT TCCTAAAATA CTGAAGTTAA AATATTTGTG 3780
CTAGACTTCC TGATATGAAA 3800