EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS146-10274 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
NHDF 
Coordinate
chr3:42065540-42068120 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:42067595-42067613CCCTCCATCCCTCCTTTC-6.17
MyogMA0500.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.02
SOX10MA0442.2chr3:42065867-42065878TTCTTTGTTTT-6.62
Tcf12MA0521.1chr3:42067968-42067979CTGCAGCTGTT-6.62
ZNF263MA0528.1chr3:42067591-42067612CTCTCCCTCCATCCCTCCTTT-6.38
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42060660-42068971Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42066131-42066552Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42066556-42067516Adrenal_Gland
SE_01171chr3:42067617-42068091Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42066168-42066949Aorta
SE_02512chr3:42065459-42068129Astrocytes
SE_10226chr3:42065877-42068137CD19_Primary
SE_10922chr3:42060609-42068638CD20
SE_23272chr3:42066116-42066919Colon_Crypt_1
SE_23272chr3:42066976-42067316Colon_Crypt_1
SE_24262chr3:42066235-42066832Colon_Crypt_2
SE_24991chr3:42066143-42066941Colon_Crypt_3
SE_24991chr3:42067525-42067991Colon_Crypt_3
SE_25861chr3:42065366-42068715Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42066043-42067298Esophagus
SE_29565chr3:42065389-42069132Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42065344-42069055HSMMtube
SE_38230chr3:42065373-42068528HUVEC
SE_40683chr3:42065370-42065953Left_Ventricle
SE_40683chr3:42066021-42068361Left_Ventricle
SE_42248chr3:42064544-42066038Lung
SE_42248chr3:42066070-42068146Lung
SE_44658chr3:42065460-42068844NHDF-Ad
SE_44918chr3:42065870-42068385NHLF
SE_45733chr3:42065416-42068758Osteoblasts
SE_48185chr3:42065430-42065908Psoas_Muscle
SE_48185chr3:42066028-42068146Psoas_Muscle
SE_48670chr3:42065428-42065902Right_Atrium
SE_48670chr3:42066166-42067443Right_Atrium
SE_48670chr3:42067563-42068128Right_Atrium
SE_49555chr3:42066577-42066889Right_Ventricle
SE_50309chr3:42066089-42067441Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42060817-42068845Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42065989-42068136Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42066102-42067523Small_Intestine
SE_52625chr3:42067553-42068124Small_Intestine
SE_53513chr3:42065347-42065894Spleen
SE_53513chr3:42066102-42068146Spleen
SE_54717chr3:42065389-42068637Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42065927-42068150HSMM
SE_65769chr3:42064935-42066082Pancreatic_islets
SE_65769chr3:42066166-42068375Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr34206596042068007
chr34206711042067525
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042019chr34206049442069114
Enhancer Sequence
CCGGCTACTC CTGAGATTTC TAAGTGGAGA TGTTTAGGGC AGTGGGACGT CTGGGCCTGA 60
CACTTCGAAG AGGGATAGGA GTTTGAGGCA AGGGTTTGGG GACCATTCCT GTGTAGTGAT 120
ATCCATGTGT AGGAGAACTC ACAGAGGAGT AGTGACTAGA GATTGGGAGA AGACCAGAAT 180
TGCTGGGGGA GGGAGTGTTC TTTTGGTGAA GGGTAGGGTT CACAGGGTTA CTCTGCTGTG 240
AGAGGCCAAG TGAGATAGAA GCTAAAATAT CTTTTGGGTT TGTTTATACA TAGTAGGTAT 300
GCAGATATTT CTAGTTGTAT CATTTGGTTC TTTGTTTTTC AGAAGAGATG CTGGCTTAGC 360
CTTGTAAACA TCGCAGTTGC ATAAAAGTAT TTATGATAGT CCTTAAAATG CTGTAATTAT 420
CTTTGAAGTT TTATAATTTT GCAGTGTTTA ACTTATGGCA GCAATAGCAT TGGTATTTTA 480
AATCAAAACA GAACACTGTC AAGGGTTACA TAACTTATTC ATGATATTAA CAAGATATAA 540
AGCACCATGT TTTTGTGTGT AACTGTTTAA CAGTAGATGA AGTTAATGAT TGCCCACTTT 600
CAGCTAATCA TATGATTGCT ATTGAAATAA GTACTTGCTA GACAGGGATA GAATCTAGTA 660
ATTTGTTAGC TTCAGTACTT CATGCTTGCA TACACACCCA TGCTATTGTG TTACCAAGCC 720
TGAGTTTTGA AATGTGGCGT TCTTTGTCTT TTTCTGGTGA ATAAACCCCA TACGTCTTAC 780
CATAGCCATT TGACTCTTCC TGGCTGTCAG GATGTGTTGC CCTGGACTGA GAGTGAGAGA 840
TCCCAGATTT TTCAGCTTCT CTTCCAATTG CTAGGGATAC CACATCAGTG CCAACGTGAG 900
TCTCCTCTTG TCACTTTCTG CTAGGCTTCC CCTTAGAAGC TGAAATTCTT TCCCTTCCTG 960
ATGCTAAGTT GCAGTTTCTT AAAATGCTAG AGAGCTTTTA AAAGCATACC GTGATGGGAA 1020
TTAGTTTCAA AAGATTATAC CAGAGGGGGT TAAAACTTGC CAACCTTGTA AAAACCTAAC 1080
TTCTTTGTTT ACGTCCTCCC TGCCCCGCTT TCTGCTGTGC TTGGTTTCCT CCTAGCAATA 1140
TGCCTTGGTC AGGGGGAGAG TCTTCCTGTC AGACATAACT TCCCAGACCA GCACTCCTGG 1200
AGGGGCCTGT ACCTCAGACC CTGGCAACGA GGCACGCTGG GGCACGCTGG CCTTTCGTTG 1260
TGGTGTAGAA AATTTTTCAT TTGGAATTCC ATTTTAAAAA TAAGTATAGG GTTATTTATA 1320
TCTTCTTACA TTAATTTTGA TAAGTTGTGT ATTTTAAGGG CTTTATCCAC TTTATCTAAG 1380
CTACTGAATT AATTGGCACA ATTATTACTC TTTCAATGTC CATAAGACCT GTAGTGATGT 1440
CCCCATATTT TATTTCTGGT ATTTGCCTTT CATGTTAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGGAG 1500
AGGGGAAGGA GAAAAGAAGA ATGTGTCTGT TCAAAGGACT GCTGGATCAG GGTAACTTAG 1560
CTCAAGAAAA TGAGAAGGGG TGGTTTCTGG AAGGGGAGAA TGAAAGCCGT GGAGGAAATA 1620
AAGCATGAAT GTGGGGGAGG GCGGGGGCGG GGACTGCTTC TCTTGCTGGC TGCCTTCTCT 1680
CTCTGGAGAA TCTGCTGGAG AAGGAGCAGT CACGTGGGTG GTGAGCTCAT TAGGCTGGGG 1740
ACACCAGCTG TGCTATTATT AGGGCTTTTA AAGTCCGTGG CAGATGTTCT TAGGCGGTGT 1800
TCCAGCCTTG TTCACTTCCC ACATATGGCA TGATACTGTA CACAGAAAAA AGAGGGACTC 1860
TTTAACAAAT AGCTTTTCCA TGAAATGCAT CACTATTTTT TTCCCATGAA CTTTTTTCTT 1920
TTCTTTCTTC CTCTGTCTCT GTTTCTTTGT TTCTCTCTCT GCTGTTTGTT CTTTCTTCTT 1980
TCTCCGTTTA TCTTTCTCCC TCTGTCTCTT TCTTGCTTTC CTCTATTTTT CTGTATTCTC 2040
ATTCTCCCTG TCTCTCCCTC CATCCCTCCT TTCTATACTT CCTTCTTTTG TCCTTTGAGG 2100
CCCTTTTTAT TTAATCCTTT GTGAAACTAG AAGAGGACTC AGAGGCACAT GAAGAAAGTT 2160
TGTCTATTTT AGATTAAAAG TGAGCCTTAG CATTTCATAG AAAGTATAAG AAATGTGGGT 2220
AAGTCTCAGG GTGATCATAT ACTAGAGAAT TTTTTTGACA AGAGCCTGTT TTGAATTGCG 2280
TGGTTAGCTT GCTGCCTCTT CACTCCTCTG GCACAGTGGT AGTTTTTGTA CAGGATCGCT 2340
TTTACCTCAA TGGACTGATA AGCTAGCCAG GGCACCGATT ATTTTTACAT ACCAATTTGT 2400
GTGTTGTTTG TTTGGCTAAT CACCTCTTCT GCAGCTGTTA TCCTGGATCT CAGTGATCAA 2460
AGAGATCAGT GATCTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGACA GAGTCTCACT CTGTTGCCCA 2520
GGCTAGAGTG CAGTGGCATG ATCTCAGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCCA GGTTCAAGTG 2580