Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS146-09004 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | NHDF |
Coordinate | chr2:238120530-238123320 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
CDX2 | MA0465.1 | chr2:238123289-238123300 | AAGCAATAAAA | + | 6.32 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 7 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_02314 | chr2:238121202-238123139 | Astrocytes | SE_38852 | chr2:238120423-238123498 | IMR90 | SE_44256 | chr2:238115148-238123571 | NHDF-Ad | SE_44771 | chr2:238120660-238123165 | NHLF | SE_45533 | chr2:238120777-238123523 | Osteoblasts | SE_55650 | chr2:238121540-238124101 | u87 | SE_67448 | chr2:238121540-238124101 | u87 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr2 | 238122137 | 238122516 | chr2 | 238122528 | 238122624 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH02I237207 | chr2 | 238115705 | 238123265 |
|
Enhancer Sequence | GCATGTGTGT AAGGTATGTG TGGGGTGTGT GTAACACATA TGTGGCATGT AAGGTATGTG 60 TGTCTCGTGT GTGATGTGTG TGATATGTGT GTATGAGGTA TGTGTGGTGT GTGTGATGTG 120 TGTGAGGTAT GTGTGGTGTG TGTGATGTGT GTGATACGTG TGTGGCATGT GTGTAAGGTA 180 TGGGTGGTGT GTGATGTGTG CATAATACGT ATGTGGCATG TGTGTAAGGT ATGGGTGGTG 240 TGTGTGATGT GTGTGTAATA TGTATGTGGT ATGTGTGGTG TGTGTGATGT GTGTGGCATG 300 TGTGTAAGGT ATGTGTGGTG TGTGTGATGT GTGTGATACG TGTGTGGCAT CTGTGTAAGG 360 TGTGTGTGGT GTGTGTGATG TGTGTGGCAT GTGTGTAAGG TATGTCTTGT GTGTGATGTG 420 TGTGTAATAC GTGTGTATAA GGTATGTGTG GTGTGTGGTG TGTGTGATGT GTGTGATATA 480 TGTGTGTAAG ATGTGTGGTG TGTGTGATGT GTGATACATG TGTGTAAGGT ATGTGTGGTG 540 TGTGTGGTGT GATGTGTGTG ATGTGTGTGA TGCATGTGTG GCATGTGTGT AAGGTATGTC 600 TTGTGTGTGA TGTGTGTGTA ATACGTGTGT GTAAGGTATG TGTGGTGTGT GTGATGTGTG 660 TGATACATGT GTGTAAGGTA TGTGTGGTGT GTGTGGTGTG TGTGATGTAA TACATATGTG 720 GCATGTGTGT AAGGTATGGG TGGTGTGTGT GATGTGTGTG TAATATGTAT GTGGTATGTG 780 TGTAAGGTAT GTGGTGTGTG ACATATGTGT GATACGTGTG TGGCATCTGT GTAAGGTATG 840 TGTGGTGTGT GGTGTGTGTA TGTGTGTGGC ATGTGTGTAA GGTATGTGTG TCTTGTGTGT 900 GATGTGTGTG TAATACGTGT GTGTAAGGTG TGTGTGATGT GTGTGATACA TGTGTGTAAG 960 GTGTGTATGG TGTGTGATGT ATGTGTGATA TGTGTGTGGC ATGTGTGTAA GGTATGTGTG 1020 TCATGTGTGA TGTGTGTGAG ATACGTGTGT GTAAGGTATG TGTGGTGTGT GTGTGATGTG 1080 TGTGTAAGGT AAGTGTGGTG TGTGATGTGT GCATGATACA TGTGTGGCAT GTGTGTAAGG 1140 TATGTATGGT GTGTAAGATG CATGTGTGAT ACGTGTGTGG CATGCGTGTA AGGTATGTGT 1200 GTCATGTGTG ATGTGTGTGA GATACGTGTG TGTGAGGTAT GTGTGGTGTG TGATGTGTGT 1260 GTAAGGTAAG TGTGGTGTGT GTGATGTGTG CATGATACAT GTGTGGCATG TGTGTAAGGT 1320 ATGTATGGTG TGTAAGATGC ATGTGTGATA CGTGTGTGGC ATGTGTGTAA GGTATGTGTG 1380 TCGTGTGTGA TGTGTATGTG ATACGTGTGT GTAAGGTATG TATGGTGTGT GTGTGTTTGG 1440 AAGAGGAGTA AAGAAGAGTG CAATGTGGCA CTTGGGGAAA GGACAGAGAT GCTGCAGGGA 1500 GATATTTGCT GATATTTTTG CTTTGAGGGC TGCAGTGTAA CCCTCTCCTA TCTTCTACTT 1560 TCAAGAAAAT AAAGTTTTCA GAGAGGCTTC ACGGTTGACC AAGGGTCTGT GTGAGCTGGA 1620 AGTGCAGCCT GGGGCTGTGC CATGGCAGAG TGACACCGGA GGAGCAGGGG AGGTTTGAAC 1680 ATAAGGGTTT TACAGCACCA AGAAACCTTA GCTCCATTAT CTTACACTTG GAGGTCTCTC 1740 ACGGATAAAT CAGCTGCTTT TCAAAATAGA AGAGACTTAT GAAAATGTAT CACTTGGCAG 1800 ACATAGAAAG CAGCTGCTTA TCATCATTAA TTTTCAATAA ATATGTATTA AGCAACAGGA 1860 TATAGATCAC TCTGTGAGGT TCAGGACCTT GGGAAAATAC AGTATCCTAG AGACAGCATT 1920 AACACAAGGC ACGACTCAAG GCCGCTCCTG TCATCTACAC CCCTCCCGCT CTGCACGGCT 1980 GACTCAGAGC CTCCTGGCCT GCGGAGGAGC AAGAGGCACT GCACAGGCCA CAGCGGGTTG 2040 TGATCCAGGA GAGGCCATTG GTTGGGGCGG GGGGATGTTA ATTCCTCTGA GGTTGTGGGC 2100 AGGGGAGATT TTCTTGGAGG ACATTCATTT CCCAGTGGGG AGGGAAGATT GAGACTATAA 2160 TGTCTCTAGG GAAATTTAAT AATTAAGGAA GGTCCACATG ATGGAACTGT GGGCCATTTT 2220 CTATTTCAGG CCTTATGGTT ATTTTGCCTT TACCATAGGG CGGTGCTTAT CACCAGCAAG 2280 ACTGACCAAC AAACCAGCTG TGGAGGGAAA TTGAGAGTGG GCTCCCTGCT GAAGACAGTA 2340 GACATGGCCA TCAATTAATG TCCTGTTTTC TCCCGTGCAG AGCCTCTCAG GGCCAAAGCT 2400 GGATTGTACC GGGCTGGGAA AACAAAAAAT AAATACATGG GGAGAGAATG TTGAGGGGTG 2460 ACTTGCTAAC CAGTCAGTTG AATTCCAGGC ACAGATTGAG TTGCTTCTGG AGTGGGCAGG 2520 GTCACTGTGA ACGCCTACGT GAGCCTCTTC TGCACCACAC AGCAGAAACT GTAAGTTGCA 2580 TGTGACTCCC CTTAGGGTCT GGCATTCACC ATTCTCTCTC TCCATGCAAG CACACACACA 2640 TGTGCGGTTA TAACTTTGCC TCTTCTACCA TGTGGGCGGT AGAAAATGCT GAGATCCCAT 2700 GATTTAGATG AGGGCTTAGA GAAAGATATG AAAAACACAG ACCAAATTTT CTGACTATAA 2760 AGCAATAAAA TCAATGTCGT AATGTAAGTA 2790
|