EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS146-08215 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
NHDF 
Coordinate
chr2:54799520-54802410 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10205410chr254799599hg19
Number of super-enhancer constituents: 61             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54799791-54802361Adrenal_Gland
SE_02562chr2:54796678-54802057Astrocytes
SE_04102chr2:54799690-54802108Brain_Anterior_Caudate
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_12885chr2:54798660-54800004CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54800577-54801934CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54797492-54801918CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54798186-54800123CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54797995-54802474Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54799575-54801320Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54801348-54802387Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54797970-54802593Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54797867-54801835Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54799542-54802418Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54795734-54802579HUVEC
SE_39396chr2:54795484-54802646Jurkat
SE_40773chr2:54796706-54802488Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54799847-54801132Pancreas
SE_47832chr2:54801568-54801965Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_56813chr2:54799680-54801306VACO_400
SE_56813chr2:54801496-54802415VACO_400
SE_57612chr2:54799687-54800303VACO_503
SE_57612chr2:54800456-54800805VACO_503
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54795484-54802646Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr25480004554800558
chr25480140654802103
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
ATGTTGTGTG ACCATAAAAC GAACACAGCT TTTCTAACCG CGAGTGTCTT TGTTTACAGA 60
GATAACAGTG TGAGTAATGC TTTGCTAGAA GCCAGGCAGT TAAATCACAC TCTGAGCAAA 120
TAGAGGCTGG GCTTCAGAAA CTTAGATAGC ACACGAATGT GCAAACTTGG TCTTTTAAAC 180
TGAAGACATA TCTGAAAGAA AACTGCTTTT GGCCCATGAA CTACTTTCCC AGCCCTTTGT 240
GCCTCCCAAT CTCTGCCCCC CTTTACAAAA AATCTTTGTT TTTCCTCTAC AAATATACAT 300
ATATGATTTC AATTTGGAGG TGGGATGTTA TTTTTTTCAC TTGAAACACA AGGAAGCAAT 360
TTTTAAAAGT CATACTCGTT CAGCAGTGGG CTTGACTGTA GCCAGTTTGA CTAGGAGTTC 420
TTGGCTACAG AACCATACAC TTGCAGTCTT TATCAGGGTA GTAAATTCAG ATGGGTTTTT 480
GGAAAGGGAG AGGGCTGGAG TTGAGGGAAG GGCACTAGAG CAGTGTGACC CACGGCCCAG 540
GAGCAGTGTG AGTGGGAAGG GGCTCTAGAA GCTGACTGCC TTTGTGTTTG CCACAGCGTG 600
CTGGGAATCA GATGAGAAGG CGGGCCCAGA CCCCACCAGA TACTCATCTC AGCCATTGTT 660
GTCATTAAAT GACTCTGAAA TGACCTTTCT TACCTCAGTT TCCTGTGAGC TCATAGTTGT 720
CTGCAGATGT GAATTATGTC ATTGATCTTT GCTCCCTCTT TGCTTATAAG GAGTAGCTGT 780
TCTGCTCCAT GTTTCTGGAA GAGGAAAGTG ATGCACAGGT CACTTAGTAA AGCGGTCCCC 840
AGCCTTTTTG GCACCAGGGA CTGGTTTTGT AGAAGACAAT TTTTCCACAG ATAGGGTGGA 900
GGAAATGGGG AGTTGGTTTC GTGATGAAAC TCTTCCACCT CAGATCATCA GGCATTAGAT 960
TCTTATTAAG GAGTGGTAAC CTAGATCCTT TGCATGCACA GTTCATGATA GGGTTTGGCT 1020
CCTGTGAGAA TGCTGCTGCT GATCTGACAG GAGGCAGAGC TCAGGCAGTA ATGCTTCCCA 1080
TCCACCACTC ACCTCCTGCT GTGTGGCCGG TTCCTAATAG GTCACGGGCC AGGACCAATA 1140
CCGGTCTGTG ACCTGGGGGT TGGGGACCCC TGACTCGGTG ATTCAGCAGT TGATTTGGGA 1200
TCCTCTGTCT TTGTTCCTCC TCCCTCAGCG GGAATTCACA GTGTAACTCA TTTGCTAAGG 1260
TTTTCTGCGT TAGAAACAGA ACTCCTTTTG GACTACTAGG AGACATGGTC ATTAGAATAA 1320
TTATGATTCT TAGTATGACT CAACCCCTTT TTAATATTCA GCCTTATGGA GGGCCTCTGC 1380
CTGCGGCTCT TTGCTCAGGC ACTAGGGCCA CAGGGGTGTA ATTTCTATCT CTGCCCTCAG 1440
GAAGCTCACA AACAAGTCAA GAGACAGGAA AACGGATCCT GTTTTTCTAA TGGGATTTGA 1500
ATGGATGTAT TTATGGGAGG GGGGTGCTTT GTACACCTGC AAAACAGAAC ACCAGCCCTC 1560
CCTTCTCCTC TGGGGTTGCT GTGAGAATCA GTTAGAATAA TGTGCATGAA CCCCGTATGG 1620
AAAATACAAA CTCATAATTA AATCTAAGAA ATTTTTGTGG GGGGACACAA ATGTTGGGGT 1680
TGTCTTTGTT CTCAGGTCCC CTCAACTGGT CTAATGAAGG AAACAGACAC CTTTCCAGTA 1740
ACAATAGCCA ACATTTATTG GACACTTATG TACCAGACTG TGCTATTTAT GACATACATT 1800
ATCTAATTTC ACAATCAGAA GAATGCTAGA GATAGGGTCA GGCGTTATCT CTGTTTACAG 1860
ATGAGGAAAG CAAGGCTTGG AGAGAATGCC ATACAGTTAT TAGTGTGGCG GAGCCGGCCT 1920
TTGCACCTGG CTGTTGACCA CGCCCTAGCA TTAAACCATT ACCTCACACT GCTTCTCCGA 1980
GATAGTTATC TTCTTGGGAT CATTTAGGTG TGGCAGGATC TGGAGGGAGC AGTTGGACCC 2040
AAGTCTCCTA GCAGCAGCCT ACACGTTTCT TGAGTCTGTT TTGAAACAAC TTCCTTAGCC 2100
CTAGCTGCGC AGAAAGCATC CTCCCCTCAG AGTGATGATT TTTATCATGT GGTTTCCTTC 2160
CTCCTGCCTT TGGAGGTCAG GTCTTCTCAC CCAGGGTCAG AAAGCCCATC AGTTGCTGAT 2220
AAGCTGCAGC ACTTGAGTCA CAGGGTGCAG GCCTGTGTTT AGAATGGGTC ATGCTCATGT 2280
CAGGCACGTG GGGAATCAGT GATCCCATGA GAGCTCGATC AGTGCAGTCT GGTTTGGAAT 2340
TGCAGGTCAC ACCCTTCCAC CACTTTGCTC ATGTGTCTAC TGATGCCTGT GATGTAGTTA 2400
GTTAAACCAC TGACTTCTTT CTCCTGCATC AAACATGACT TTTTGAAAAA GTGTGTGGGG 2460
GCTTTCCAGC ATGAACCAGG CATAAACCAG GTACCTTCAT GAACATATTA TTTATCCCTT 2520
CAGTCACCCT GTGTGCTAGG TGGTATCATA ACTGCTTTGT GGATTGAGGA ACCTGAGGAC 2580
CAGAAAGATG ACTTGAGGTG GCAGCCTCAT TTAGCCAGCA AGTAAGAAAA TGGGTGATGG 2640
TGAACTTCTG CAGCAAGAGG GGGCCGTTTT CAACATTTCT GTGAATTCAA GGCGTGTGCT 2700
TCGTCTAAAT AGGTGGAGAC ACGTAGGAAG GCATAGTGTA TACATCCATC AGCACATGGG 2760
TAGATTTTGA GGTTTTTTTT GTTTTGTTTT AAATCCAGAG CGTTGTGTAT TTGATCATTC 2820
TTGGAGATTC AGCCACATTC ACAGGTGTTA AGTGTCACAC CTAACCTAGC AATACAATAC 2880
ACAGCTGAAA 2890