Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS145-10616 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | NHBE |
Coordinate | chr17:79398340-79400690 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
RREB1 | MA0073.1 | chr17:79398574-79398594 | TGGTGGTGGGTGATGTGGTT | - | 6.09 | RREB1 | MA0073.1 | chr17:79399659-79399679 | TGGTGGTGGGTGATGTGGTT | - | 6.09 | RREB1 | MA0073.1 | chr17:79399076-79399096 | GGTGGGTGTGTAGTTGGGGG | - | 6.15 | RREB1 | MA0073.1 | chr17:79399649-79399669 | TGGTTGGTGGTGGTGGTGGG | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr17:79398513-79398533 | TGGTTGGTGTTGTGTGGTGG | - | 7.03 | ZNF740 | MA0753.2 | chr17:79399908-79399921 | CCTCCCCCCCCAT | + | 6 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 9 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_01625 | chr17:79389351-79398706 | Aorta | SE_05872 | chr17:79388722-79398913 | Brain_Hippocampus_Middle | SE_05872 | chr17:79399962-79401456 | Brain_Hippocampus_Middle | SE_31439 | chr17:79399940-79400905 | Gastric | SE_34246 | chr17:79395925-79400024 | HCT-116 | SE_47177 | chr17:79395691-79399064 | Panc1 | SE_61461 | chr17:79399734-79459539 | Toledo | SE_65328 | chr17:79390158-79401315 | Pancreatic_islets | SE_68398 | chr17:79359303-79407988 | TC71 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr17 | 79399639 | 79399699 | chr17 | 79399752 | 79400128 |
|
| Number: 3 | ID | Chromosome | Start | End |
GH17I081424 | chr17 | 79398501 | 79398650 | GH17I081425 | chr17 | 79399639 | 79399699 | GH17I081432 | chr17 | 79399941 | 79401926 |
|
Enhancer Sequence | TGATGATTGG TGATTGATGA TGATATGGTT GTTGTGGTTG GTGATGGTGG TGGTGGTGTG 60 GTTGTTGTTG AATGTGGTTG GTAATGGTGG TGGATGATGT GGTTGGTGGT AATGGTAGTG 120 GTGATGTGGT TGGGGGCATG GTGGTGGAGG TGATGTGGTT GGTGATGATA ATGTGGTTGG 180 TGTTGTGTGG TGGTGGTGAT GGTGATGTAG TTGGGGTGGT GTTGATGTGG TTGGTGGTGG 240 TGGGTGATGT GGTTTGTGGT GATAGTGCTG GGTGATATGG TTGGTGATGA TGATGTGGTT 300 GGTGACAGGT GATGTGGTTG GTGGTGATGA TGATGGTAGG TGATGTGGTA GTAATGTGGT 360 TGGTGGTGAT GTGGTTGGTG TGATGTGGTT GGTGCTGATA GTGGTGGGTG ATGTGGTTGG 420 CATGATGTGG TTGGTGTGAT GTGGTTGGTG GTGATAGTGA TGGGTGATGT GGTTGGTGAT 480 GATGTGGTTG GGGGTGATAG TGGTGGGTGA TGTGGTTGGT GGTGATGTGG TTGGTGGGTG 540 ATGTGGTTGG TGGTGATAGT GGTGGGTGAT GTGGTTGGGG GTGATAGTGG TGGGTGATGT 600 GGTTGGGGGT GATGGTGGGT GTTGTGGTTG GTGGTGATAG TGGTGGGTGA TGTGGTTGGT 660 GATGATGGTG GGTGATGTGG TTGGTGGTGA TGTGGTTGGG GGTGATAGTG GTGATGATGT 720 GGTTGGGGGT GATAGTGGTG GGTGTGTAGT TGGGGGTGAT AGTGGTGGGT GATGTGGTTG 780 GGGGTGATAG TGGTGGGTGA TGTGGTTGGT GGTGATAGTG GTGGGTGATG TGGTTGGTGG 840 TGTGGTTGGT GGTGATAGTG GTGGGTGATG TGGTTGGTGG GTGATGTGGT TGGTGGTGAT 900 GTGGTTGGGG GTGATAGTGG TGGGTGATGT GGTTGGTGTG ATGTGGTTGG TGGGTGATGT 960 GGTTGGGGGT GATAGTGGTG GGTGATGTGG TTGGTGTGAT GTGGTTGGTG GGTGATGTGG 1020 TTGGTGGTGA TGTGGTTGGG GGTGATAGTG GTGGGTGATG TGGTTGGGGG TGATAGTGGT 1080 GGGTGATGTG GTTGGTGGTT ATGTGGTTGG TGGTGATGTG GTTGGTGGTG ATGGTGGGTG 1140 ATGTGGTTGG TGGCGATGTG GTTGGTGGTG ATAGTGGTGG GTGATGTGGT TGGTGGTGAT 1200 GTGGTTGGTG TGATGTGGTT GGTGGTGATG TGGTTGGTGA TGATGTGGTT GAGGGTGATG 1260 GTGGGTCGTG GTGGTGGTGG GTAATGTGGT TGGTGATTTG GTGATGATGT GGTTGGTGGT 1320 GGTGGTGGGT GATGTGGTTG GTGGTGATGT GGTTGGTGGG TGATGTCATT GGTGATGTGG 1380 TTGGTGCATG ATGTGATTGG TGATGTGGTT GGTGGTGATG TGGTTGGTGG TGATAGTGGT 1440 GGGTGTGGTT GGTGATGATG TGGTTGGGGG TGATGGTGGG TGATGTGGTT GGTGGTGATG 1500 TGGCTCGTGG TGGTGGTGGT GGGTGATGTG GTCCCCAGGC CCACCCTTCC CCCCATCCCC 1560 AGGCCCAACC TCCCCCCCCA TCCCCAGGCC CACCCTTCCC CCCATCCCCA GGAAGGCTGC 1620 GCTCCTCCCT GTGGGGTTGG TGCCTGGATC CTGGGCAGGC TGCCCACTGC GTTCATTCTG 1680 GAGGCTCCCA TGGGAACCTG GCACCTGCTC CCGCTCTTAG CTACCTTGCT CAGCCTGGGA 1740 ACAGATGGAG CTGGCCCGGC CCGCCCCTGA GGCAGCTGTG GGTCACCACT TGGGCCAGTT 1800 CCCTGCAGGC CTGTGGATGG GGAAGAGGCT GAGCTTCTGA AGCCTCAGGG GGCCCCAAGG 1860 ATTGGGCACT CCAGCTCCAA GAACGAATCT CTTGCTGTGC CGCCCCGCAA CCACTCATGT 1920 CCCGGGAGCT GCACTTTGAA ACACAGCCTG GACACCCGGG GGCCTGCCCA CCTGGGGTGA 1980 GGGGCCGTGT GTGGGAGCAG GGGTGTATGG CAGAGAGCAG ACAGGACTAG GGAAGGGGCC 2040 GCTGCAAGGC TGTAGGCCCT TCCGGCCCTA GAGTGGGAGT GGGAACTGCC CATAGCTGCA 2100 GTCACTGCTG AGGCCCCTCC TGTGCCCAGG GCTGGAGTCA TCAGTCCACC GAGGCCCCTC 2160 CTGTGCCCAG GGCAGGAGTC ATCAGTCCAC CGAGGTCCCT GTGTGCCCAG GGCAGGTGTC 2220 ATCAGTCCAC CGAGGCCCCT CCTGTGCTTA GGGCAGGTGT CATCAGTCCA CCGAGGTCCC 2280 CGTGTGCTCA GGGCAGGTGT CATCAGTCCA CCAAGGCCCC TCCTGTGCCC AGGGCAGGAG 2340 TCATCAGTCC 2350
|