EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS142-00658 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
NCCIT 
Coordinate
chr1:120558670-120561760 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs372562666chr1120561314hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:120561555-120561568TCAACCACTTAAA+6.24
Number of super-enhancer constituents: 26             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00001chr1:120545720-120570355Adipose_Nuclei
SE_03065chr1:120557761-120559627Bladder
SE_03065chr1:120560868-120562770Bladder
SE_03434chr1:120554599-120564678Brain_Angular_Gyrus
SE_03980chr1:120549079-120570221Brain_Anterior_Caudate
SE_07385chr1:120548934-120569847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08816chr1:120556940-120559534Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08816chr1:120560737-120563322Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09137chr1:120545789-120570232CD14
SE_12867chr1:120554695-120560603CD34_Primary_RO01480
SE_12867chr1:120560851-120563850CD34_Primary_RO01480
SE_13322chr1:120545914-120570095CD34_Primary_RO01536
SE_14057chr1:120546042-120569730CD34_Primary_RO01549
SE_18945chr1:120550673-120570213CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26595chr1:120555685-120560732Esophagus
SE_29608chr1:120554644-120561087Fetal_Muscle
SE_36951chr1:120555708-120560186HSMMtube
SE_36951chr1:120560204-120563380HSMMtube
SE_41312chr1:120555136-120563468Left_Ventricle
SE_42341chr1:120556611-120563456Lung
SE_43397chr1:120554561-120565886MCF-7
SE_45586chr1:120545832-120570231Osteoblasts
SE_46953chr1:120558653-120559658Ovary
SE_46953chr1:120561329-120563259Ovary
SE_49875chr1:120554642-120565868RPMI-8402
SE_53396chr1:120556680-120563463Spleen
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120014chr1120556661120559639
GH01I120018chr1120560624120563022
Enhancer Sequence
TTGGTGTCCA GAACTGGGAC GCTTGTGGTA AAACACACTT TCTAGTGTAG TTTTTCTAGG 60
GCCTTACTAG TTGTATGTGA AGGAAACAAA GACAAGTATA CAATCTCTCA CTCTCACACA 120
CGTACACACA CACATACACA CTTTTATCAC AACTAATACA CAAAGACTAC CAAATACTGC 180
AGGGCAGCTC ATTTTTCTAC TATGTAAATT CAGCTTCCTG GACAGACCAT TTCTGCTTTT 240
CTTGTAGAAG TATTTCAGAA AATGTTAATC TTGGTTCCCA CATTAGGTTG CATGCTTCCA 300
AATTAAAAGT TTCCCACAGG AAAAGAACTT CACGAGGAAT TGTGAGGCTG GGAATTATCT 360
CTGAAACCCC ACCTCACTTA GTTTACATGT GTTAGGTTTT TCACCCCCTC ATCTGAATAA 420
AGCATTAAAT ACACACTGAT TTTAAGAAAC CTAAACCAAA AAGAAGCTGA AGTGATACGG 480
ACTTTAAAGC TGTTGATTCA CAGCATCATT CATCTTCACT CAGACTATGA AATCAGTAAC 540
CACTGCAATG AGAAACCATG CTTTATTTAT ACAAGAACTT TACAAACATC CTTATCTTCC 600
AGTTTACAGT CTGGGCTCAT TTATCAGAAC TCAAAGGCTG AGCTGAGCAC CTAGTCTCTT 660
CAATCATCAC TTGAAAGATT GGGAAGGGGC ACACAGTGTT AAAAGACTTG TGTTGTTGCT 720
ATAACAGAAG GTGGTCTTTC CTCTGTGTTC CAGAACACAA TCAGGATCTT ACCATACTTC 780
ACTGCACTGG ACCCTGAGAA AATATCTACT TGTGATTAAA ACATGGCAAA CACATTCTAG 840
ACATATGAGT TTACAAAAAA CACCCTTCGA TGTAATGGAC AAAACTGAAT GAGTTAGCTC 900
AGTTGTTCCC AAGGTATGGG CTGTGGAGTT ATTGCAAGGG ATTGCAATCC TTATAAATCA 960
CTTTCTAAAC TACTAAACAG TATCTTGTCC ATATTTAAAT ATATGTATAT GCTTTTATGA 1020
CTAGTAAAAC ATAAAGATAT ATTAAATGAT TCTTGAATTC TTAGATTTTG ACAGTATACA 1080
TTGTATTCAA ACAACACACT GAGAAATTGT TTCATCTCAA GCTCTCTCCT TTATGCACTA 1140
TACTCTTGCT AAACGCCTTT CAGCTCCTAG AAAATGCTAT AGTACACTAC TTCTCACTTC 1200
CAGACCTCTG TACACGCTGT TCAGTCAGCC CAAAATGCTT TTCCCCACTT TCTCATGGCT 1260
AAGCCCTAAA ATTTCATTAA GTCTCAACTT AAATGTTATT TCCTGTGAAA AACAGCCTTG 1320
ATACCCCCTC TGTTCTTATA ACCCTGAGCC TGTGTTACTC ATTAGCCCTT ATTATGATTA 1380
TCTGTCAACA GACTAAAATT ATTAATTCTC ATACTCCCAG TGCCTAACAC AATGACTGGC 1440
ATATAGAAGG CATTCAACTA TTCAGTGCAG AAGCACAAGG TCAAAATGAA GGGCTCTGTG 1500
GAATCTTTAC CCCTTAAAAA GACCCTATAA ATACACTTGA AGTTTGGGAA CAACTGGGTT 1560
GAGCTATTTA CCTAAAGGAT TTTCAAAACT AATTAAGATT CCTGATATAT AGACTACTTC 1620
TTAACCCCCA CTCACCCCTA TATCAGTCAA ATTGGGCCAA CTCCATGCAA AGTAGATTAT 1680
TTTTTAATCA CCTTCCCTCC CACCTACCAA ATATGAAGTT AACCAACACA CACAGAGAGG 1740
CATGTGTGCA TGTGCAGACA TACACACACA CAGTCCTCAT TCCCTCTTGC ACTTTTATTA 1800
GTCTTTCATC GGTTGTTGAT AAAAGACTGA CTACATAAAC CACCAGGGAC CTGGAGCCCT 1860
GACTAAGAAA AAAAAAAATC CTACAAAGTG GCCTCAATAG CATGAACTGC TAGATTCTGT 1920
AGTGACTGCC ATTGAAAATT AAAGAAGATC TCTAGAAAGA AAAGTGTTGG AGCCTTCTTT 1980
CCATTCCCCA ATGTTGGTGG ATGACCACCT TCAAAGTTCT GAAGTCCAAA AAATATCTAA 2040
AAGCAGAGTA ATTTAAAAAG CTTACTGTTT AGTCTAAAAG GATTTTCCTA GATCAAAAAC 2100
AACTGTACCT ATTTGGATAC CAAAAATGAA AAAGAAATAG TGCAGAATCT TTAGATTGCC 2160
TAATGGGATC TGGAGAAACA GCTCTTAGTC CCAGTCTACA TTCTAATGAG TTATGTAATA 2220
AAGGCTAATT CGCTTAGCTG TATTACACCT CAGCCGCCTC ACTTATAAAA CAAAATGAGT 2280
GACAAAGGTG CTTTCCAAAG TCCCTTTGAC CTCCTAAGTG TGATGACTCT ATAATCTTGG 2340
CCTTTGAAGT CCCTTGGCAA TACCACCCAA GGATGTAATG ATGCTTGCTG ATGTTAATGT 2400
TTGGGTGTTT GTGGTTGTAT ATGTCTTGAC CACTGTCCCA CTCCAAGCAG GGGATCCTAG 2460
GGTAAGAACT GTACTGTGTC TCTTTTTTAA TATCCCTCAC AGTGCCCATC ACCCTCTAGG 2520
TGCACAGATA ATTCAATATA CACTTATGTA AATGAATTGT TCCACAACTC ACACTTTCAG 2580
CTAGCCCCTC ACAGATGCAT AAGAAAGCAA AGAACAACCA AACAGAAGGA ACAATATATT 2640
TAAATAAGAT AAGGGGAATG AAAAAGAATC TTGTGTTTAA AAGGGATAGA AAGGTCTAAC 2700
CATCTTCTAT CCCAAACAAC TGGCCAACAT GAGAGCCTGT TTTCTTGAGC ATAGAATGGT 2760
GGTAGGTATT TCAGCCTCTA TGGAATCTGA CCTGCTGATT AGTTATACAA GGCTAAAACT 2820
GACTGAAGTG TGTATGTAAG ACAACGGTCT GGGAAGAGAA GCACTAAATT TAAGCTCACA 2880
GGGAATCAAC CACTTAAAAT GGTAAATTCA GATAGAACTT TATCCAGATT TCATTTTTAT 2940
GCATCCTCTC TACAAGCATA AACGCTTATC TTACTCACTT CCCATCTCAT GATGCTATCA 3000
TCAATTCTTA TAAAATTTAG AAAAGAATAG GTGATGTCTC CTAATTAGAG AGTTTGCTTC 3060
TGTCACAAAC TGTGACAGTC AGTGTCAGCC 3090