EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS140-01621 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Namalwa 
Coordinate
chr2:54860190-54864840 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr2:54861798-54861809TAAGTAAACAT+6.02
Foxa2MA0047.2chr2:54861796-54861808ACTAAGTAAACA-6.44
MecomMA0029.1chr2:54864700-54864714CTTTATCTTGTCTC-6.11
RELAMA0107.1chr2:54862995-54863005GGGAATTTCC+6.02
SPICMA0687.1chr2:54864807-54864821TACTTCCTTTTTTA-6.31
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54838665-54870676Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54860461-54861048Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54861190-54861757Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54861758-54862971Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54863505-54864334Adrenal_Gland
SE_04102chr2:54860996-54863149Brain_Anterior_Caudate
SE_04102chr2:54863404-54864515Brain_Anterior_Caudate
SE_07789chr2:54859267-54863115Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07789chr2:54863210-54864870Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11005chr2:54858427-54866655CD20
SE_17333chr2:54859718-54862944CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_29772chr2:54859993-54863637Fetal_Muscle
SE_31545chr2:54859925-54861051Gastric
SE_31545chr2:54861123-54862872Gastric
SE_31545chr2:54863472-54864349Gastric
SE_40773chr2:54855609-54863256Left_Ventricle
SE_40773chr2:54863472-54864334Left_Ventricle
SE_42137chr2:54859148-54863257Lung
SE_42137chr2:54863462-54864496Lung
SE_49296chr2:54859664-54861071Right_Atrium
SE_49296chr2:54861093-54863035Right_Atrium
SE_49296chr2:54863481-54864340Right_Atrium
SE_52386chr2:54859296-54861081Small_Intestine
SE_52386chr2:54861090-54863085Small_Intestine
SE_53342chr2:54857850-54863077Spleen
SE_53342chr2:54863300-54864422Spleen
SE_61789chr2:54844402-54866912Toledo
SE_66257chr2:54859908-54864393Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr25486040054863216
chr25486115554861205
chr25486169954863024
chr25486397654864200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054629chr25485619154865204
Enhancer Sequence
GCGATCAGGT GTAAGCCATG CCCTTTGAGG ATTAACACAC GCTTGTGTCA CCTGATAGGA 60
CCCCTGGCGC CAGGTATTCC CAGCCAAGCC CGTGTTCCCC TTCATCCATG AGAAAGAAGC 120
CTGTCAGGAG AGTGGGAAGG GAGGGTGAAG CTTGCTTGTT CTGAGTACCT GGCAAAGCTA 180
CAAAGGAACA TTACCTGGAC TTTTTTAGAA AATTGGCTTG GATAGTGCTG TAATAGGATC 240
TTTTTCATGA TGGAGAGGTA AATAAGAGCA AAGGTTATTT TCCTCTTCTG CCAGGGCATC 300
TCCAGGATTG GATACACTTT CTTCATTTCT TGTTTAAAAT TATTTTTTTA TTTACGTGTG 360
TGTGTGTGTG TGCGTGTGTG TGTCTGTCTG TCTGTCTGAA AGATTTCCTC CCCGGCTGGA 420
GGCCAGTGGA CTCTGTTTGA CCCTAACTCT TTGACTCACT CCTTACTCTT GCCTTGCCCC 480
GGTTACTTAA GTTGGAGGTT GGGGCAGATC AGGGGTTGGA TGCACTAGCA CAGGCCAGTC 540
TGGGCCAGCC ACTGGATCAA TCACTAGCCC CTGTTCCAGT TTGGGTTGAA TTTAAGGGCT 600
TGCTGTGAGA CTGATGTAAT CAAAAAACAA GCCCTTCCTT TCTGCCTCTC TTCTGGCCTT 660
CAAGTGTGTT GGAAAGGAAA AATATTCCTT TGCTTACCAC ATCTGAGAGG GTTTCCTGGG 720
ACCCCTGGTC AGGTTGACTT AAAATAAGAT GGGTGGAGAG GGGATTACTC TGTTTCCAAT 780
AAAGATTGAG CTCCTGTCTT TACCACTTCC AATCTTTTTT TCTGAGCTGA TTCCCAGGCT 840
GAACTATATG TTCTAGGGTG GTATTGTGGA ATAGAGAATA ACTTATGTTA ATTATAATTT 900
TGTATCTGTT GCTTTTAAAA CAGCTGCAAA AAAGAAAAAT AAATCCACCA AACCCTCCTT 960
AAATGAGCAT GAGAAACAGC AATTGGGCAA AGCATTCATA ACCTAGGGAA AAAGAATTTC 1020
CTTTTTTTGT AATATTAACT CTGAGTATTT TGTAAATAAG ATATCCTATG TACTTCCATG 1080
TTAGATGCAC ACAGCTGGTT TCCTGCAGGC GGGCTTGGCT GTTAGGGATG TGTGCATTCA 1140
GGCAGGCATG CAGCTGCCTT GCTGCTTCCT CGGTTTCTTT TTATGTCCCC AGTGCTGCAA 1200
CTGCACAAAG CTGTTGGAAG CAGATGATGC TGTCTAGACT CCTGGATATG ATAAAACGTT 1260
TCAGCAGCAG CAGCCCTCAG TTGTGGCTTA ACCTTCATTT TGCCCTTGAC CAAGAGCCTG 1320
GGCTACTGGT GTTCCAGAGC TTCCTTAGGA TTCCTCAGTT TTAAAAATGA AACGTAAAGA 1380
TAACCCTGTA CTATCAATAA GCATAATAAA GATGGAAGGA GGGAGCTTTC CGATGACCTG 1440
CCATCAGGAG AACTACATTT TCTTATTTTT CTCCATTGAT GTTAACTGAA TTCTGATTTC 1500
ACTTTAATAT CCCCAGAGGC CCACAGAATT GAAACTGACC CTAGAGGGTA CTTGTCAGTT 1560
ATGAAAACAC ACACATCTGT GAGTTCCAGG TGCTGTAGGA GCACAAACTA AGTAAACATC 1620
TAAACCTTCA GATATAATCC CCGCTCCTCG AAACATCCTG ACACTGTGGT GAAGCGATTC 1680
TCCTAGAATG TAAAGTCATT ATAATGTGCT TACGTTCAGG AAGTTTCCTG AGTTGTTGAA 1740
AGAGTACCAG AACAAAGACA CTGACTCTAA CAGATGTGGG TGGGGCATGA GTGGCCTTCA 1800
AAGTGCCTGT GAGTGGGAAG AGACTGTCCT CAGCCTGCCC CAGGGGATGT GAACAGGGAG 1860
GGAGGGAGCT CCTGACCAAG AGGGAAATTC CAGCCACAGC ACAGTTCATG GGGAGCAAGG 1920
AACAGTATCC AGCTTCATAA AGCAAGACCC TGTCTCACAC CGGAAAACAG GCTCAGAAGT 1980
TACCCAGCTG TTTCACTCAG GCACCTGGGG TTCTTGACTA TTCACAGAAA CCAGAACACC 2040
CGCATCTGCT TCATGTGATG AGGGAGCTTT TTTGAGTCTT ATTACAGGGA GAGAAAGTGA 2100
GAGATGGAAA AGCACTCTTT AAGACTGTGG AAACTACTCC CTAGTTTTAA AAGGTCCTTC 2160
TCAGGCCCTT CCCTGTAATT GAATCCGTGA TCCAACATGG AGAGAATTTC CTGAGTTTCA 2220
CTTCCCACGA ATGATGTCCG TTGCACTAGT AAACCATTAA GCCACACTCA CTTCTTTTAA 2280
GCGTCTTCTG AGTCAGCGGC AGTCCCAGAT GCCTGTGTGG CTGTGTTTCA CACCACACGA 2340
AGGCCGTTGT CACACCTGCG CATAGATCGG TGTCATTTGG ACATGTGACT CTAAATCCTT 2400
GCCTCTTTCT TCCCATCTTG ATGGTCCCAC TATAGGAGAA AGGCTGCCTG GGCCGGTAAC 2460
TGCCGGGCAT GCATGAGAGT TGATTATATA AGAAATACAT TCAGGATTCT GTATGGTCAT 2520
ATTTCTCCCT TAATGAATCT TTCCAGTGTT TGAAGTTACT TTCATTTCTG TTATTTCCGT 2580
GAGAGGCGAG GATGTGTGTC CTGTTGTTAA TTTCCAGTAT CTGGGATTCT TCCCTGCCAC 2640
TGTAGGACTT CAATGAGATG CCATGCCAAA GGGAATGGAA TCCTTTATCC CTTTGACTAC 2700
TGGCAGGACT CCTGCATTTG TCACTAAACT CCAACTCATA TTATCTCCTT TCTAAAGATT 2760
TGCGTTCTTG AACTCCCCTA GAAATAGAAC TGGAATTTGA GGGAAGGGAA TTTCCTTTTG 2820
ACATTCCTAA CCCATCCACA TTCTTAGATG ACTAATTCTT TTTAGCCCAA ATTCACTAAC 2880
AATCTTTTAT TTTTTTAAAT TTAATTTTGG TTTCTGATGA TAGATGGCAA TGGCATAAAA 2940
TGTCTCTGGC CTTTATTATT TTTTGTTGTT GTAAAAGCAG TAAATGTCTG ACATTTTCAA 3000
GGGGAAAACT ACTGCCCTTA ATCCCATCTG TAGCATATGC CATTTAAGTG TTTGCTTTCT 3060
AACCCATGCC TTGGAGTTTT ATATCATTTA ATATGTATAA ACTATTTTCA TTTAGCATTA 3120
TAGTATAATT ATTTTTCTAC GTTTGCATTT TGCCTATGTG GTATAAGCAT ATTAAGATCC 3180
CTTTTCCTGA TGCTATGGAA CTCCTTTCAA CTTAAAAAAA TTAAAAAGGC ATTATTTGTG 3240
TCTAACATAT GCCTAATGAT ATTTTTATTT ACAATAATTG TATGTAATAC TGTAATTTAC 3300
ATAATATAAA TTATATATGA TGTTATAACA TGTAAATATG TATAATTTCT ACTGTTCTGT 3360
AGCCACTGGT ACCTGCAGGA GCTATAGGGG CAGAGGGCTT TTCCCTTTGA TTCTCCAGGC 3420
AGACAATGGC TATGACACTG CATTGTCAGC AGCCACTGAG GGCCCGTGTG GTGCATGCAT 3480
CTCTACTCTA AGATCTTTCT TTCTCCTGGG GAAGTTTCTT CAGACACCGG TCAGCAGCAC 3540
GTGTTCACCA AGCTGCTCTT ACTCAGCGTG TTGGAGAATC CAAGGCTATG TGTTCTTCCT 3600
CATCCCTGCC TCAGGGTTTG GTGGATAGAG GAGAGACCTT GTGCAGGCAC AGGCAGAGAG 3660
AAATTGCTCT AAGAATCGAA TGAAAACCCA GCTCTCCTCA GTTGCACTCT GCCTTTATCC 3720
ATCTTAATAC CCTGAATATA GACTGGCTTT CTTGTTTAGG CAACTCAGGA GTATCAAGGA 3780
AGTGTATGTG TGGCAGTGCT TTTGAATCCT CAGTGGGTCC TCCCCTATTG GAAATGAAGC 3840
TCTCCGCTAT TGTAGTGGAG CCACTGGAAG GCAATCCTTT GCTAGGCATT CACGCTGCTA 3900
TTTCTCAGTT TCCAGTCTCT AAGCCACTGG GTGCATGAAG GAAGTTTGCC AAAGAGTGCT 3960
GGCACCTTCA CAGCAGATGG GGAAGGAGCC AAGTAGGGAG CGAGCACCCC CTTTACCTTA 4020
GCGTTTACCA AATTCAGCAG CTCTTTCCAG TTCTTACAAG TTATTTATTT AAGGTTTTGT 4080
GTTTTAACTT CTTTGAGCTT TAGTTACCCT TATCAATTGA TTAAAAGTGG GATTGAGTTA 4140
GTATATAGTC TTACAGGTCT AAAAATTTTC ATTCCTTTTT GTTGTATTTT TGGTGAGTTT 4200
TTTTCAAGAT GAGAAACTCT TTATCAGGAA ACATTTGTTT AAAGCCAGTT ACATGATTAT 4260
ATATATTTTC TTAGCCTTGT ATGTGTCACC CAGTTATGAG CTTCTTGAAA ATAAGTTTCC 4320
ACTTCTCCCC CGGTGCCTAA AATAAGGACT TGTACAAAGC GTGTGCTCAT ATTTTTTTCT 4380
TAACACCAGA TTAGGAAGCA ACAAATTTGT ATAGATCATT TGACAGTATG TTCGGCCTGT 4440
TGTGTGGTTT GGGCAGATTT TTGGGTCTCT CTGGGACCAT GGCTTACTCC TTTGGAGGAT 4500
GCTAAAATCT CTTTATCTTG TCTCCTTCAC ATTATTGAGA ACTGCAAGCA AACTCTTTTT 4560
AGCATAGTTA GGAATTCAGG AAATAAATTG ATTTGTATTC TGTATTTCAA GATTCTCTAC 4620
TTCCTTTTTT AAAAATTATT TTTGTTACCA 4650