EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS140-00067 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Namalwa 
Coordinate
chr1:27851130-27854330 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr1:27852196-27852207GGGGGCGGGGC-6.02
KLF4MA0039.3chr1:27851763-27851774GCAGGGTGTGG-6.62
KLF5MA0599.1chr1:27852197-27852207GGGGCGGGGC-6.02
RAXMA0718.1chr1:27853940-27853950GCCAATTAAC+6.02
ZfxMA0146.2chr1:27853008-27853022CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 60             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00861chr1:27851541-27852977Adrenal_Gland
SE_00861chr1:27853064-27856551Adrenal_Gland
SE_01588chr1:27851667-27852913Aorta
SE_01588chr1:27853024-27856416Aorta
SE_02913chr1:27852117-27852998Bladder
SE_02913chr1:27853029-27853768Bladder
SE_02913chr1:27853779-27856486Bladder
SE_03261chr1:27851469-27852003Brain_Angular_Gyrus
SE_03261chr1:27852144-27852985Brain_Angular_Gyrus
SE_03261chr1:27853018-27854286Brain_Angular_Gyrus
SE_03939chr1:27851360-27856639Brain_Anterior_Caudate
SE_05196chr1:27845131-27856743Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05814chr1:27851280-27857037Brain_Hippocampus_Middle
SE_06945chr1:27851713-27856861Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07770chr1:27844238-27856992Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08936chr1:27853875-27854195Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_14757chr1:27847180-27856512CD4_Memory_Primary_7pool
SE_23188chr1:27851765-27852951Colon_Crypt_1
SE_23188chr1:27853067-27856318Colon_Crypt_1
SE_24033chr1:27851838-27852930Colon_Crypt_2
SE_24033chr1:27853008-27856068Colon_Crypt_2
SE_24711chr1:27851838-27852958Colon_Crypt_3
SE_24711chr1:27852995-27856128Colon_Crypt_3
SE_25901chr1:27851311-27854052Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26518chr1:27843507-27857767Esophagus
SE_27625chr1:27843691-27857024Fetal_Intestine
SE_28547chr1:27843416-27856986Fetal_Intestine_Large
SE_29557chr1:27851401-27857219Fetal_Muscle
SE_31031chr1:27846218-27856799Fetal_Thymus
SE_31394chr1:27851685-27856492Gastric
SE_33477chr1:27843634-27857256H2171
SE_34367chr1:27851619-27856496HCT-116
SE_34755chr1:27851482-27853680HeLa
SE_35950chr1:27851452-27856846HMEC
SE_36974chr1:27851246-27857216HSMMtube
SE_39896chr1:27851416-27854518K562
SE_40593chr1:27844098-27856916Left_Ventricle
SE_42106chr1:27851385-27856839Lung
SE_46630chr1:27853027-27856644Ovary
SE_48058chr1:27851374-27856986Psoas_Muscle
SE_48567chr1:27851486-27856669Right_Atrium
SE_49444chr1:27851837-27852956Right_Ventricle
SE_49444chr1:27853005-27856479Right_Ventricle
SE_50130chr1:27851462-27856597Sigmoid_Colon
SE_51091chr1:27848905-27857215Skeletal_Muscle
SE_51984chr1:27852168-27852877Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51984chr1:27853101-27854429Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52467chr1:27851531-27856685Small_Intestine
SE_54527chr1:27845490-27857100Stomach_Smooth_Muscle
SE_55184chr1:27851525-27852958Thymus
SE_55184chr1:27852985-27856342Thymus
SE_57160chr1:27853973-27855699VACO_400
SE_62007chr1:27846487-27856737Toledo
SE_62718chr1:27801410-27856116Tonsil
SE_63223chr1:27848362-27856425GLC16
SE_63746chr1:27852092-27852881HSMM
SE_63746chr1:27853001-27854443HSMM
SE_65253chr1:27851688-27857320Pancreatic_islets
SE_66890chr1:27843634-27857256H2171
SE_68682chr1:27851683-27856350H9
Enhancer Sequence
GAGTTACCTG TATGAGTCTT GCCTGTAGGT TGTGTGTGCA GTTGTGTGTA TTTGTGGAGC 60
AGTGAATATT AGGAAGCTGT TCACATGTGC GGTTGTGTAT TTTGGGGGAT TAGGTTATAT 120
GTGTCGTTCT TTTTGGATGG AGTTTCACTC TTGTCACCCA GGCTGGAGTG TAGTGTCAGG 180
ATCCCGGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCTG AGTTCAAGCA ATTCTCGTGT CTCAGCCTCC 240
CGAGTAGCTG GGATCACAGG TGTGTGCCAC CACGCCTGGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 300
GAGACGGGGT TTTGCCATGT TGCCCAGGCT GGTCTTGAAC TCCTGGCCTC AAGTGATCTG 360
TCCACCTCGA CCTCCCAAAG GGCTGCGATC ACAGGTGCGA GCCACCGTGC CTGGCCTATA 420
TTTGTGGTTC TTAAGGCTAT ACTTTATTTT TTATTTTTTG TTTATTGTCA AACTTCCCCT 480
GTCAGAATGT AAACTCTATT AGGACTGAAA TTTTTATCTA TTTTGCTAAC TATTTTGCTA 540
ATCTATTCCT AGTGTCCAGA ATAGGGCCCA ACACTTAGTA GGCACTGTAT ACATATTTCT 600
CCAATGAATG ATGAATGAAA GTGTGCATGC TTGGCAGGGT GTGGGAAGTG TGTTAGGTGT 660
ATGAATCGTG CGTGTGTGTC TGGGTGTGTG AATGGATAAA TTTTTTGTGT CTTGAGTGTG 720
TGAGGTTTCT AGCATAAGTG GCCTATGAAC CAAGTACGTG CACAGGTGCA TGTGTGTCTA 780
GGCGTGTGAC TGTGTACCTG AAGCTGGGCC ACGTCTGTGA GCATTGCACA CAACTGTGTG 840
CATGCACAGT TGTGTGTGCT TGTACATGGG GGTGGGAAGG CGCTGTCGGC TTCTCCCAGC 900
CTTCAGCACT CACTCAGCTT CACCCCAGGT CGCCTGCTGC GAAATGTCAG TGGCAGAGAA 960
GCTAAAAATA TCTGCTCTCC TCCTTCTGCT CACTGCTTGG GCTGATGGGA CTGTGGGGCC 1020
CCAGCCGGCC CCTTGGGCCC TGCGGGGAGG AGGAACTGCT GGATGAGGGG GCGGGGCACA 1080
GGGGAAGGAA GGGAGGCCCT CCTTCGTACA CACCCTTCCC CCTTTCCTCT TGGGCTCCAA 1140
AGCCAGGCTT CAGGCTCACC TCTTTCAGGA AGCCCTCAAG AACCCCCCAG GAGCTGTGTG 1200
TGTCTGTGTG TCTGTCTACC TGGCAAGGAG ATATGGCCCC CATCAGACTG GAGCTCCACA 1260
GAGCAGGTCT GTGCCTCTTC TGCCCATCCA GGGACTCCAG GGGACAGAGC TCTGTCTCCT 1320
TCAGGCCAGG GGCTCCCAGG GAAAAGGCTG GTGCTGTCTC CTCCCTAAGC CTGAGGGTTA 1380
CGGATGCAGC CCAGGCCAGA CAGGGCTTCA CTGGGCTCTG GTTCTGGGGC CACTAGGGCC 1440
CTCTGACCCC AGGGCAGATC TGCTGTGATG ATGAGCTTGT GGGTAGGGAG GAGTCTCAGC 1500
TCTGCCCACA CCACACCCTA GGCAGGCACG TGTTTGTGCT ATGGGTACTT GTGTGGGTGC 1560
AGGTGGGACA TGTCAGGGCC CGTGGTCCTC TGGGGACCTG TGCCTCTCCA CATGTCGGGC 1620
TCCTGCCTGC ATCAGTGGTG TCAGCGACTG CCTGCCTTGG GCACTGTGGT CAATCGGTAC 1680
AAGTTGAGTG TATTGTATGT TTCTCTGTGT TCTTTTTTTC TTTGGAGGGG GGGACGGAGT 1740
CTCGCTCTGA CACCTCCCGA GTAGCTGGGA CTACAGGCGT GTGCCACCAC ACCCGGCTAA 1800
TTTTTTGTAT TTTTAGTAGC AAGAGGGTTT CATCATGTTA GCCAGGATGG TCTCGATCTC 1860
CTGACCTCAG GTGATCTGCC CGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC 1920
CACCACACCC GACCTTCTCT GTGTTCTTGT GTGTGCACAT GGATGACTGT GTATGTGGGT 1980
TTCTGCCTTT CATTGTGCAG GCCTGCAGAT ACTAGCAGGG ATGGACTCTG CATTCATGTG 2040
GGAGTTGCTG ATGTCACCAT GGGGGGTTTC TGTTTGTGTG TCAATGTGCT CGGGTGTGTG 2100
TCTCTGTCAG AAGGTCAGTG CCTGTTTGTT CTGTGTATGG AGGTGTATGT AGGTGCATCT 2160
GTGTGTCAGT GTTTCAATTA CCATGTTTCT GTGTGTCTGT GTGTCTGTCT TCCTGGTTGT 2220
CATTATGTCT GCGGTACCTC CGTGCCTGTG TTGCGTGCCT AGGTCAGTTT GATTTTGCAG 2280
GTCTGTAGGG CCACGTGTCC CTCTGTATGT TGGTGTTTTC CATGTGGGTT GGAATCTGCC 2340
TCTGCTTTTC CTAATCTCCC ACCATTTCTG TGTGGAAGGC CTCAGGCATT GTGTGTGTGT 2400
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTATGTGT GTGTGTGTTC AGCAACTTTC CCCAGCCCCA 2460
CAGCCTGCAA CCCTGAGATC TGCTCTCCCA CTCTTTCTCC GTTGGACTTC AGGTGGGAGC 2520
TGAAGCAAAG AGGGCAGGCA GGCAGGGAGC CCACGACAGC CGGGGGCCGG GGCCAGGCTG 2580
CCACGAGGGC CCTACCTCAG CTTTCCTCCA AGCAAGCGCT AAGCCAGAGC CTCGGTTACA 2640
TGTAAACACC AGCTGTGTCA AGACGGCGCA GCTTCTTCTA GGTCAACAGA CAGCTGTGGG 2700
GTTGCTAGGC AACCGCCTGG CTCCCCCCTC CATTAGGCCC CCTCCCACTG CCTCTACCTG 2760
CAAACCCTCT GCTGGCTCCC CCCACGCCAG GATAGGCCTC ACCCCTCCGC GCCAATTAAC 2820
ACAGCGGGAC TGAGGGGGTA GGGGGTCAGG GCAGCTCCGG GACTGGAATC AAGGTATGAG 2880
GACGTATTAA CCCTTCACGT GCCACCACCC CCTCCACCTA GTCCTGGGGC ACTTCACACA 2940
CCCCTAACTT CACCAGTCAC TTTAGGGCCT GGAGTGATGA GGAGCACGTC CTGAGGGATG 3000
GGGACCCTCA GTGCAGCCAC AACCAGGACT GGAGAGACGC TGGAGGCAGA TGGCGCAGGG 3060
CTTGGTCAAG GCCTCTCCCC TCCCCAGCCA AGCCTGGGGG AAGGAAGGGT TAAATTCCCC 3120
CTTTATTTCC CCTGTCCCGC CCCCTCCCAG GACAACCACC CCATTTCCAG GGCAGCACCT 3180
GCGCTCCCAG CTGCCGTGCC 3200